Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.csc_sisu @ 1873

Last change on this file since 1873 was 1446, checked in by maronga, 10 years ago

removed blanks from <> strings in .mrun.config files / adapted hlrn_watchdog for HLRN-III
File size: 11.3 KB
Line 
1#$Id: .mrun.config.lcxe6 1044 2012-11-07 10:30:58Z maronga $
2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5#%executable        $HOME/palm/current_version/MAKE_DEPOSITORY_parallel/palm
6%mainprog          palm.f90
7%base_directory    $HOME/palm/current_version
8%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
9%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
10%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
11%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
12%use_makefile      true
13#
14# Enter your own host below by adding another line containing in the second
15# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
16# third column the host identifier. Depending on your operating system, the
17# first characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
18# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
19#
20# The next line is just an example. Add your own line below or replace this line.
21%host_identifier   sisu-login*  lccrayf
22%host_identifier   clogin*      lccrayf
23#
24#
25# The next block contains all informations for compiling the PALM code
26# and for generating and running the PALM executable using MPI. Replace all
27# required paths (given in <>) by the respective paths valid on your host.
28# Also replace <hi> by your host identifier (see above) in each line!
29# Compilernames, cpp-options and compiler-options are assuming
30# an Intel-Compiler and mpich2 on this host! Please change
31# appropriately, if you are using a different compiler / MPI-Version.
32#
33%tmp_user_catalog    /wrk/<replace_by_your_sisu-username>               lccrayf parallel
34%tmp_data_catalog    /wrk/<replace_by_your_sisu-username>/restart_data  lccrayf parallel
35%compiler_name       crayftn                                            lccrayf parallel
36%compiler_name_ser   crayftn                                            lccrayf parallel
37%cpp_options         -e:Z:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__intel_openmp_bug lccrayf parallel
38%netcdf_inc          -I:/opt/cray/netcdf/4.2.1.1/cray/81/include  lccrayf parallel
39%netcdf_lib          -L/opt/cray/netcdf/4.2.1.1/cray/81/lib:-lnetcdff:-lnetcdf  lccrayf parallel
40%mopts               -j:4                                               lccrayf parallel
41%fopts               -em:-s:real64:-O2                                  lccrayf parallel
42%lopts               -em:-s:real64:-O2                                  lccrayf parallel
43%remote_username     <replace_by_your_sisu-username>                    lccrayf parallel
44%memory              1500                                               lccrayf parallel
45%login_init_cmd      .:/opt/modules/default/init/ksh\;:.:/etc/bash.bashrc.local\;:module:list  lccrayf parallel
46%modules             cray-netcdf                                        lccrayf parallel
47%create_executable_for_batch  true                                      lccrayf parallel
48#             
49%write_binary        true                             restart
50#
51#----------------------------------------------------------------------------
52# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
53#----------------------------------------------------------------------------
54#IC:
55#
56#----------------------------------------------------------------------------
57# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
58#----------------------------------------------------------------------------
59EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
60EC:pwd; ls -al
61#
62#----------------------------------------------------------------------------
63# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
64#----------------------------------------------------------------------------
65#
66# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
67OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
68OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
69#
70# Combine all particle information files
71OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
72#
73#----------------------------------------------------------------------------
74# List of input-files
75#----------------------------------------------------------------------------
76PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
77PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
78TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
79NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
80LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
81BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
82PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
83DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
84DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
85DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
86DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
87DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
88DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
89DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
90DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
91DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
92DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
93#
94#----------------------------------------------------------------------------
95# List of output-files
96#----------------------------------------------------------------------------
97BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
98PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
99#
100RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
101RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
102HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
103HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
104CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
105CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
106#
107DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
108DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
109DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
110DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
111DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
112DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
113DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
114DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
115DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
116DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
117DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
118DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
119DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
120DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
121DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
122DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
123DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
124DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
125DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
126DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
127DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
128DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
129DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
130DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
131DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
132DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
133DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
134DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
135DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
136DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
137DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
138DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
139DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
140DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
141DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
142DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
143DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
144DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
145DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
146DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
147DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
148DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
149DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
150DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
151DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
152DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
153DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
154DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
155DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
156DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
157DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
158DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
159DATA_PRT_NETCDF      out:loc:pe   prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
160DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
161DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
162#
163DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
164DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
165PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
166PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
167PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
168# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |