source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 4798

Last change on this file since 4798 was 4769, checked in by suehring, 4 years ago

Keep 32-bit output for netcdf_data_output < 5

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 26.6 KB
RevLine 
[1682]1!> @file data_output_3d.f90
[4559]2!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
[2696]3! This file is part of the PALM model system.
[1036]4!
[4559]5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU General
6! Public License as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
7! (at your option) any later version.
[1036]8!
[4559]9! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the
10! implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General
11! Public License for more details.
[1036]12!
[4559]13! You should have received a copy of the GNU General Public License along with PALM. If not, see
14! <http://www.gnu.org/licenses/>.
[1036]15!
[4360]16! Copyright 1997-2020 Leibniz Universitaet Hannover
[4559]17!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
[1036]18!
[254]19! Current revisions:
[1106]20! ------------------
[4768]21!
22!
[3589]23! Former revisions:
24! -----------------
25! $Id: data_output_3d.f90 4769 2020-11-03 13:51:23Z schwenkel $
[4769]26! Keep 32-bit output for netcdf_data_output < 5
27!
28! 4768 2020-11-02 19:11:23Z suehring
[4768]29! Enable 3D data output also with 64-bit precision
30!
31! 4559 2020-06-11 08:51:48Z raasch
[4559]32! file re-formatted to follow the PALM coding standard
33!
34! 4457 2020-03-11 14:20:43Z raasch
[4457]35! use statement for exchange horiz added
[4559]36!
[4457]37! 4444 2020-03-05 15:59:50Z raasch
[4444]38! bugfix: cpp-directives for serial mode added
[4559]39!
[4444]40! 4360 2020-01-07 11:25:50Z suehring
[4559]41! Introduction of wall_flags_total_0, which currently sets bits based on static topography
42! information used in wall_flags_static_0
43!
[4346]44! 4329 2019-12-10 15:46:36Z motisi
[4329]45! Renamed wall_flags_0 to wall_flags_static_0
[4559]46!
[4329]47! 4182 2019-08-22 15:20:23Z scharf
[4182]48! Corrected "Former revisions" section
[4559]49!
[4182]50! 4162 2019-08-16 05:54:29Z raasch
[4162]51! bugfix for r4155
[4559]52!
[4162]53! 4155 2019-08-14 06:25:18Z raasch
[4155]54! bugfix for 3d-output in serial mode (ghost points must not be written)
[4559]55!
[4155]56! 4127 2019-07-30 14:47:10Z suehring
[4559]57! Adjustment for top boundary index for plant-canopy model outputs (merge from branch resler)
58!
[4127]59! 4048 2019-06-21 21:00:21Z knoop
[4048]60! Moved tcm_data_output_3d to module_interface
[4559]61!
[4048]62! 4039 2019-06-18 10:32:41Z suehring
[4039]63! modularize diagnostic output
[4559]64!
[4039]65! 3994 2019-05-22 18:08:09Z suehring
[3994]66! output of turbulence intensity added
[4559]67!
[3994]68! 3987 2019-05-22 09:52:13Z kanani
[3987]69! Introduce alternative switch for debug output during timestepping
[4559]70!
[3987]71! 3885 2019-04-11 11:29:34Z kanani
[4559]72! Changes related to global restructuring of location messages and introduction of additional debug
73! messages
74!
[3885]75! 3814 2019-03-26 08:40:31Z pavelkrc
[3766]76! unused variables removed
[4559]77!
[3766]78! 3655 2019-01-07 16:51:22Z knoop
[4559]79! Bugfix: use time_since_reference_point instead of simulated_time (relevant when using wall/soil
80!         spinup)
[3582]81!
[4182]82! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
83! Initial revision
84!
85!
[1]86! Description:
87! ------------
[1682]88!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
[4559]89!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
[1682]90 SUBROUTINE data_output_3d( av )
[1]91
[4559]92
93    USE arrays_3d,                                                                                 &
[3766]94        ONLY:  d_exner, e, p, pt, q, ql, ql_c, ql_v, s, tend, u, v, vpt, w
[3274]95
[1]96    USE averaging
[3274]97
[4559]98    USE basic_constants_and_equations_mod,                                                         &
[3274]99        ONLY:  lv_d_cp
100
[4559]101    USE bulk_cloud_model_mod,                                                                      &
[3637]102        ONLY:  bulk_cloud_model
[3274]103
[4559]104    USE control_parameters,                                                                        &
105        ONLY:  debug_output_timestep, do3d, do3d_no, do3d_time_count, land_surface, message_string,&
106               ntdim_3d, nz_do3d, plant_canopy, psolver, time_since_reference_point, urban_surface,&
[4127]107               varnamelength
[3274]108
[4444]109#if defined( __parallel )
[4559]110    USE control_parameters,                                                                        &
[4444]111        ONLY:  io_blocks, io_group
112#endif
113
[4559]114    USE cpulog,                                                                                    &
115        ONLY: cpu_log, log_point
[2817]116
[4559]117    USE exchange_horiz_mod,                                                                        &
[4457]118        ONLY:  exchange_horiz
119
[4559]120    USE indices,                                                                                   &
121        ONLY:  nbgp, nxl, nxlg, nxr, nxrg, nyn, nyng, nys, nysg, nzb, nzt, wall_flags_total_0
[4444]122
123#if ! defined( __parallel )
[4559]124    USE indices,                                                                                   &
[4444]125        ONLY:  nx, ny
[3405]126#endif
[3274]127
[1320]128    USE kinds
[3274]129
[4559]130    USE land_surface_model_mod,                                                                    &
[2232]131        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
[1551]132
[4559]133    USE module_interface,                                                                          &
[3637]134        ONLY:  module_interface_data_output_3d
135
[1783]136#if defined( __netcdf )
137    USE NETCDF
138#endif
139
[4559]140    USE netcdf_interface,                                                                          &
141        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat, netcdf_data_format,    &
142               netcdf_handle_error
[3294]143
[4559]144    USE particle_attributes,                                                                       &
145        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles, particle_advection_start, prt_count
[3637]146
[1]147    USE pegrid
148
[4559]149    USE plant_canopy_model_mod,                                                                    &
[4127]150        ONLY:  pch_index
151
[4559]152    USE radiation_model_mod,                                                                       &
[3814]153        ONLY:  nz_urban_b, nz_urban_t
[1585]154
[4559]155    USE urban_surface_mod,                                                                         &
[2696]156        ONLY:  usm_data_output_3d
[1585]157
[2007]158
[1]159    IMPLICIT NONE
160
[3554]161    INTEGER(iwp) ::  av        !< flag for (non-)average output
[2696]162    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
[3554]163    INTEGER(iwp) ::  i         !< loop index
164    INTEGER(iwp) ::  ivar      !< variable index
165    INTEGER(iwp) ::  j         !< loop index
166    INTEGER(iwp) ::  k         !< loop index
167    INTEGER(iwp) ::  n         !< loop index
[1682]168    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
169    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
[1]170
[3554]171    LOGICAL      ::  found     !< true if output variable was found
172    LOGICAL      ::  resorted  !< true if variable is resorted
[1]173
[3554]174    REAL(wp)     ::  mean_r    !< mean particle radius
175    REAL(wp)     ::  s_r2      !< sum( particle-radius**2 )
176    REAL(wp)     ::  s_r3      !< sum( particle-radius**3 )
[1]177
[4768]178    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !< output array
[1]179
[4559]180    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !< pointer to array which shall be
181                                                            !< output
[1]182
[2011]183    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
[2007]184
[1]185!
186!-- Return, if nothing to output
187    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
188
[3987]189    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'start' )
[3885]190
[1]191    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
192
193!
194!-- Open output file.
[4559]195!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its own file and writes
196!-- the data of its subdomain in binary format. After the run, these files are combined to one
197!-- NetCDF file by combine_plot_fields.
[1031]198!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
[1327]199    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[2967]200#if defined( __parallel )
[1327]201       CALL check_open( 30 )
[2967]202#endif
[1327]203       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
[493]204    ELSE
[1327]205       CALL check_open( 106+av*10 )
[493]206    ENDIF
[1]207
208!
[4559]209!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this limit is exceeded.
210!-- This could be the case, if the simulated time exceeds the given end time by the length of the
211!-- given output interval.
[1745]212    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
213       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
[4559]214          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',                      &
215                                      time_since_reference_point, 's because the maximum ',        &
216                                      'number of output time levels is ',                          &
[1745]217                                      'exceeded.'
218          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
219          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
220          RETURN
221       ENDIF
222    ENDIF
223
224!
[4559]225!-- Update the netCDF time axis.
226!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the performance.
[1]227#if defined( __netcdf )
[1308]228    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
229    IF ( myid == 0 )  THEN
[4559]230       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),                                  &
231                               (/ time_since_reference_point /),                                   &
232                               start = (/ do3d_time_count(av) /),                                  &
[1327]233                               count = (/ 1 /) )
[1783]234       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
[1]235    ENDIF
236#endif
237
238!
239!-- Loop over all variables to be written.
[3554]240    ivar = 1
[1]241
[3554]242    DO  WHILE ( do3d(av,ivar)(1:1) /= ' ' )
[2007]243
[1]244!
[3637]245!--    Initiate found flag and resorting flag
246       found = .FALSE.
247       resorted = .FALSE.
[4127]248       trimvar = TRIM( do3d(av,ivar) )
249
[3637]250!
[4559]251!--    Temporary solution to account for data output within the new urban surface model
252!--    (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
[1]253!--    Store the array chosen on the temporary array.
[3637]254       nzb_do   = nzb
[4127]255!
[4559]256!--    Set top index for 3D output. Note in case of plant-canopy model these index is determined by
257!--    pch_index.
[4127]258       IF ( plant_canopy  .AND.  trimvar(1:4) == 'pcm_' )  THEN
259          nzt_do   = pch_index
260       ELSE
261          nzt_do   = nz_do3d
262       ENDIF
[3637]263
[1551]264!
265!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
[2512]266       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]267!
268!--    Before each output, set array local_pf to fill value
[4768]269       local_pf = REAL( fill_value, KIND=wp )
[2696]270!
271!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
272       flag_nr = 0
[1551]273
[2007]274       SELECT CASE ( trimvar )
[1]275
276          CASE ( 'e' )
277             IF ( av == 0 )  THEN
278                to_be_resorted => e
279             ELSE
[4559]280                IF ( .NOT. ALLOCATED( e_av ) )  THEN
[3004]281                   ALLOCATE( e_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
282                   e_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
283                ENDIF
[1]284                to_be_resorted => e_av
285             ENDIF
286
[3421]287          CASE ( 'thetal' )
[771]288             IF ( av == 0 )  THEN
289                to_be_resorted => pt
290             ELSE
[4559]291                IF ( .NOT. ALLOCATED( lpt_av ) )  THEN
[3004]292                   ALLOCATE( lpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
293                   lpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
294                ENDIF
[771]295                to_be_resorted => lpt_av
296             ENDIF
297
[1]298          CASE ( 'p' )
299             IF ( av == 0 )  THEN
[727]300                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
[1]301                to_be_resorted => p
302             ELSE
[4559]303                IF ( .NOT. ALLOCATED( p_av ) )  THEN
[3004]304                   ALLOCATE( p_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
305                   p_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
306                ENDIF
[727]307                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
[1]308                to_be_resorted => p_av
309             ENDIF
310
311          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
312             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]313                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]314                   tend = prt_count
315                ELSE
316                   tend = 0.0_wp
317                ENDIF
[2512]318                DO  i = nxl, nxr
319                   DO  j = nys, nyn
[1551]320                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]321                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
322                      ENDDO
323                   ENDDO
324                ENDDO
325                resorted = .TRUE.
326             ELSE
[4559]327                IF ( .NOT. ALLOCATED( pc_av ) )  THEN
[3004]328                   ALLOCATE( pc_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
329                   pc_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
330                ENDIF
[1]331                to_be_resorted => pc_av
332             ENDIF
333
[1359]334          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
[1]335             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]336                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]337                   DO  i = nxl, nxr
338                      DO  j = nys, nyn
[1551]339                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]340                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
[4559]341                            IF ( number_of_particles <= 0 )  CYCLE
[1359]342                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
343                            s_r2 = 0.0_wp
344                            s_r3 = 0.0_wp
345                            DO  n = 1, number_of_particles
346                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
[4559]347                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * particles(n)%weight_factor
348                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * particles(n)%weight_factor
[1359]349                               ENDIF
350                            ENDDO
351                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
352                               mean_r = s_r3 / s_r2
353                            ELSE
354                               mean_r = 0.0_wp
355                            ENDIF
356                            tend(k,j,i) = mean_r
[1]357                         ENDDO
358                      ENDDO
359                   ENDDO
[1359]360                ELSE
361                   tend = 0.0_wp
362                ENDIF
[2512]363                DO  i = nxl, nxr
364                   DO  j = nys, nyn
[1551]365                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]366                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
367                      ENDDO
368                   ENDDO
369                ENDDO
370                resorted = .TRUE.
371             ELSE
[4559]372                IF ( .NOT. ALLOCATED( pr_av ) )  THEN
[3004]373                   ALLOCATE( pr_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
374                   pr_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
375                ENDIF
[1]376                to_be_resorted => pr_av
377             ENDIF
378
[3421]379          CASE ( 'theta' )
[1]380             IF ( av == 0 )  THEN
[4559]381                IF ( .NOT. bulk_cloud_model )  THEN
[1]382                   to_be_resorted => pt
383                ELSE
[2512]384                   DO  i = nxl, nxr
385                      DO  j = nys, nyn
[1551]386                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[4559]387                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + lv_d_cp * d_exner(k) * ql(k,j,i)
[1]388                         ENDDO
389                      ENDDO
390                   ENDDO
391                   resorted = .TRUE.
392                ENDIF
393             ELSE
[4559]394                IF ( .NOT. ALLOCATED( pt_av ) )  THEN
[3004]395                   ALLOCATE( pt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
396                   pt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
397                ENDIF
[1]398                to_be_resorted => pt_av
399             ENDIF
400
401          CASE ( 'q' )
402             IF ( av == 0 )  THEN
403                to_be_resorted => q
404             ELSE
[4559]405                IF ( .NOT. ALLOCATED( q_av ) )  THEN
[3004]406                   ALLOCATE( q_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
407                   q_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
408                ENDIF
[1]409                to_be_resorted => q_av
410             ENDIF
[691]411
[1053]412          CASE ( 'ql' )
413             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]414                to_be_resorted => ql
[1053]415             ELSE
[4559]416                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_av ) )  THEN
[3004]417                   ALLOCATE( ql_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
418                   ql_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
419                ENDIF
[1115]420                to_be_resorted => ql_av
[1053]421             ENDIF
422
[1]423          CASE ( 'ql_c' )
424             IF ( av == 0 )  THEN
425                to_be_resorted => ql_c
426             ELSE
[4559]427                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_c_av ) )  THEN
[3004]428                   ALLOCATE( ql_c_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
429                   ql_c_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
430                ENDIF
[1]431                to_be_resorted => ql_c_av
432             ENDIF
433
434          CASE ( 'ql_v' )
435             IF ( av == 0 )  THEN
436                to_be_resorted => ql_v
437             ELSE
[4559]438                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_v_av ) )  THEN
[3004]439                   ALLOCATE( ql_v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
440                   ql_v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
441                ENDIF
[1]442                to_be_resorted => ql_v_av
443             ENDIF
444
445          CASE ( 'ql_vp' )
446             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]447                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]448                   DO  i = nxl, nxr
449                      DO  j = nys, nyn
[1551]450                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]451                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
452                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
453                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
454                            DO  n = 1, number_of_particles
455                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
[4559]456                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                                     &
457                                                 particles(n)%weight_factor / prt_count(k,j,i)
[1359]458                               ENDIF
459                            ENDDO
[1007]460                         ENDDO
461                      ENDDO
462                   ENDDO
[1359]463                ELSE
464                   tend = 0.0_wp
465                ENDIF
[2512]466                DO  i = nxl, nxr
467                   DO  j = nys, nyn
[1551]468                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1007]469                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
470                      ENDDO
471                   ENDDO
472                ENDDO
473                resorted = .TRUE.
[1]474             ELSE
[4559]475                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_vp_av ) )  THEN
[3004]476                   ALLOCATE( ql_vp_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
477                   ql_vp_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
478                ENDIF
[1]479                to_be_resorted => ql_vp_av
480             ENDIF
481
482          CASE ( 'qv' )
483             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]484                DO  i = nxl, nxr
485                   DO  j = nys, nyn
[1551]486                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]487                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
488                      ENDDO
489                   ENDDO
490                ENDDO
491                resorted = .TRUE.
492             ELSE
[4559]493                IF ( .NOT. ALLOCATED( qv_av ) )  THEN
[3004]494                   ALLOCATE( qv_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
495                   qv_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
496                ENDIF
[1]497                to_be_resorted => qv_av
498             ENDIF
499
500          CASE ( 's' )
501             IF ( av == 0 )  THEN
[1960]502                to_be_resorted => s
[1]503             ELSE
[4559]504                IF ( .NOT. ALLOCATED( s_av ) )  THEN
[3004]505                   ALLOCATE( s_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
506                   s_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
507                ENDIF
[355]508                to_be_resorted => s_av
[1]509             ENDIF
[691]510
[1]511          CASE ( 'u' )
[2696]512             flag_nr = 1
[1]513             IF ( av == 0 )  THEN
514                to_be_resorted => u
515             ELSE
[4559]516                IF ( .NOT. ALLOCATED( u_av ) )  THEN
[3004]517                   ALLOCATE( u_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
518                   u_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
519                ENDIF
[1]520                to_be_resorted => u_av
521             ENDIF
522
523          CASE ( 'v' )
[2696]524             flag_nr = 2
[1]525             IF ( av == 0 )  THEN
526                to_be_resorted => v
527             ELSE
[4559]528                IF ( .NOT. ALLOCATED( v_av ) )  THEN
[3004]529                   ALLOCATE( v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
530                   v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
531                ENDIF
[1]532                to_be_resorted => v_av
533             ENDIF
534
[3421]535          CASE ( 'thetav' )
[1]536             IF ( av == 0 )  THEN
537                to_be_resorted => vpt
538             ELSE
[4559]539                IF ( .NOT. ALLOCATED( vpt_av ) )  THEN
[3004]540                   ALLOCATE( vpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
541                   vpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
542                ENDIF
[1]543                to_be_resorted => vpt_av
544             ENDIF
545
546          CASE ( 'w' )
[2696]547             flag_nr = 3
[1]548             IF ( av == 0 )  THEN
549                to_be_resorted => w
550             ELSE
[4559]551                IF ( .NOT. ALLOCATED( w_av ) )  THEN
[3004]552                   ALLOCATE( w_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
553                   w_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
554                ENDIF
[1]555                to_be_resorted => w_av
556             ENDIF
557
558          CASE DEFAULT
[3637]559!
560!--          Quantities of other modules
561             IF ( .NOT. found )  THEN
[4559]562                CALL module_interface_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf, fill_value,    &
563                                                      resorted, nzb_do, nzt_do                     &
564                                                    )
[3294]565             ENDIF
566
[1972]567!
[3637]568!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
569             IF ( .NOT. found  .AND.  urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
570!
571!--             For urban model quantities, it is required to re-allocate local_pf
[3814]572                nzb_do = nz_urban_b
573                nzt_do = nz_urban_t
[1972]574
575                DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]576                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]577                local_pf = fill_value
[1972]578
[4559]579                CALL usm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf, nzb_do, nzt_do )
[1972]580                resorted = .TRUE.
[1976]581
582!
583!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
584                IF ( .NOT. found )  THEN
585                   nzb_do = nzb
586                   nzt_do = nz_do3d
587
588                   DEALLOCATE ( local_pf )
[3637]589                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[1976]590                ENDIF
591
[1972]592             ENDIF
593
[3637]594!
595!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
596             IF ( .NOT. found  .AND.  land_surface )  THEN
597!
598!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
599                nzb_do = nzb_soil
600                nzt_do = nzt_soil
[1976]601
[3637]602                DEALLOCATE ( local_pf )
603                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
604                local_pf = fill_value
[2817]605
[3637]606                CALL lsm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf )
[2696]607                resorted = .TRUE.
608
[3467]609!
[3637]610!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
611                IF ( .NOT. found )  THEN
612                   nzb_do = nzb
613                   nzt_do = nz_do3d
[2209]614
[3637]615                   DEALLOCATE ( local_pf )
616                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
617                ENDIF
[3448]618
[1972]619             ENDIF
[1]620
[254]621             IF ( .NOT. found )  THEN
[4559]622                message_string =  'no output available for: ' // TRIM( do3d(av,ivar) )
[254]623                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
[1]624             ENDIF
625
626       END SELECT
627
628!
629!--    Resort the array to be output, if not done above
630       IF ( .NOT. resorted )  THEN
[2512]631          DO  i = nxl, nxr
632             DO  j = nys, nyn
[1551]633                DO  k = nzb_do, nzt_do
[4559]634                   local_pf(i,j,k) = MERGE( to_be_resorted(k,j,i),                                 &
635                                            REAL( fill_value, KIND = wp ),                         &
636                                            BTEST( wall_flags_total_0(k,j,i), flag_nr ) )
[1]637                ENDDO
638             ENDDO
639          ENDDO
640       ENDIF
641
642!
[1327]643!--    Output of the 3D-array
644#if defined( __parallel )
645       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[1]646!
[4559]647!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in FORTRAN binary format here, and
648!--       later collected into one file by combine_plot_fields
[1327]649          IF ( myid == 0 )  THEN
[4559]650             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point, do3d_time_count(av), av
[1]651          ENDIF
[1327]652          DO  i = 0, io_blocks-1
653             IF ( i == io_group )  THEN
[2512]654                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
[4769]655                WRITE ( 30 )  REAL( local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do), KIND = sp )
[1327]656             ENDIF
[1972]657
[1327]658             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
[1972]659
[1327]660          ENDDO
[559]661
[1327]662       ELSE
[646]663#if defined( __netcdf )
[493]664!
[1327]665!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
[2512]666!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
[3554]667!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]668!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
669!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
670!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
671!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
[3554]672!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]673!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
674!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
675!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
676!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
[3554]677!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]678!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
679!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
680!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
681!          ELSE
[4768]682!
683!--       Call for parallel runs
684          nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),                             &
685                                   local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),                        &
686                                   start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),      &
687                                   count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /)          &
688                                 )
[2512]689!          ENDIF
[1783]690          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
[646]691#endif
[1327]692       ENDIF
[1]693#else
694#if defined( __netcdf )
[4768]695!
696!--    Call for non-parallel runs
[4559]697       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),                                &
698                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),                            &
699                               start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),                         &
700                               count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1783]701       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
[1]702#endif
703#endif
704
[3554]705       ivar = ivar + 1
[1]706
707!
[1551]708!--    Deallocate temporary array
709       DEALLOCATE ( local_pf )
[1]710
[1551]711    ENDDO
[1]712
[1318]713    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
[1]714
[3987]715    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'end' )
[3885]716
[3987]717
[1]718 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.