Index: palm/trunk/DOC/app/chapter_4.1.html
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+++ palm/trunk/DOC/app/chapter_4.1.html	(revision 153)
@@ -1,9 +1,14 @@
 <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
-<html><head>
-
-
-
-
-
+<html>
+<head>
+
+
+
+
+
+
+
+  
+  
   
   
@@ -15,10 +20,19 @@
 
 
+
+
   
   
   
   
-  <title>PALM chapter 4.1</title></head>
+  
+  
+  <title>PALM chapter 4.1</title>
+</head>
+
+
 <body>
+
+
 
 
@@ -32,4 +46,6 @@
 
 
+
+
 <br>
 
@@ -37,4 +53,6 @@
 
 
+
+
 <table style="text-align: left; width: 100%;" border="1" cellpadding="2" cellspacing="2">
 
@@ -42,4 +60,6 @@
 
 
+
+
  <tbody>
 
@@ -48,4 +68,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -53,4 +75,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><font size="4"><b>Parameter name</b></font></td>
 
@@ -59,4 +83,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><font size="4"><b>Type</b></font></td>
 
@@ -65,4 +91,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -70,4 +98,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><b><font size="4">Default</font></b> <br>
 
@@ -75,4 +105,6 @@
 
 
+
+
  <b><font size="4">value</font></b></p>
 
@@ -80,4 +112,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -86,4 +120,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><font size="4"><b>Explanation</b></font></td>
 
@@ -92,4 +128,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -97,4 +135,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -102,4 +142,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -107,4 +149,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="adjust_mixing_length"></a><b>adjust_mixing_length</b></p>
 
@@ -113,4 +157,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -118,4 +164,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -124,4 +172,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">.F.</span></td>
 
@@ -129,5 +179,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -140,5 +194,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -162,5 +220,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -175,4 +237,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -193,4 +259,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -198,4 +266,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -203,4 +273,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -209,4 +281,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -214,4 +288,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="alpha_surface"></a><b>alpha_surface</b></p>
 
@@ -220,4 +296,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -225,4 +303,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R<br>
 
@@ -230,4 +310,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -236,4 +318,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">0.0</span><br>
 
@@ -241,4 +325,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -247,5 +333,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -258,5 +348,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -276,4 +370,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -281,5 +377,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -295,4 +395,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -307,4 +411,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -312,4 +418,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -318,4 +426,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -323,4 +433,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -328,4 +440,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_e_b"></a><b>bc_e_b</b></p>
 
@@ -333,4 +447,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -339,4 +455,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -344,4 +462,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'neumann'</span></td>
 
@@ -350,5 +470,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -361,5 +485,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -386,5 +514,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -398,4 +530,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -404,4 +538,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -409,4 +545,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -414,4 +552,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -419,4 +559,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_lr"></a><b>bc_lr</b></p>
 
@@ -425,4 +567,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -430,4 +574,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -436,5 +582,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'cyclic'</span></td>
+
+
 
 
@@ -448,4 +598,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -454,4 +606,6 @@
 
 
+
+
 By default, a cyclic boundary condition is used along x.<br>
 
@@ -459,5 +613,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -477,5 +635,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -495,5 +657,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -510,5 +676,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -532,5 +702,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -544,4 +718,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -549,5 +725,9 @@
 
 
+
+
  <span style="font-weight: bold;">Note:</span><br>
+
+
 
 
@@ -564,4 +744,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -569,4 +751,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -574,4 +758,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -579,4 +765,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_ns"></a><b>bc_ns</b></p>
 
@@ -585,4 +773,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -590,4 +780,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -596,5 +788,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'cyclic'</span></td>
+
+
 
 
@@ -608,4 +804,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -614,4 +812,6 @@
 
 
+
+
 By default, a cyclic boundary condition is used along y.<br>
 
@@ -619,5 +819,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -638,4 +842,6 @@
 
 
+
+
  <a href="#bc_lr">bc_lr</a>).<br>
 
@@ -643,5 +849,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -661,5 +871,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -673,4 +887,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -679,4 +895,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -684,4 +902,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -689,4 +909,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_p_b"></a><b>bc_p_b</b></p>
 
@@ -694,4 +916,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -700,4 +924,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -705,4 +931,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'neumann'</span></td>
 
@@ -711,5 +939,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -722,5 +954,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -747,5 +983,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -766,4 +1006,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -771,4 +1013,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -776,4 +1020,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -781,4 +1027,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -786,4 +1034,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_p_t"></a><b>bc_p_t</b></p>
 
@@ -792,4 +1042,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -797,4 +1049,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -803,4 +1057,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'dirichlet'</span></td>
 
@@ -809,5 +1065,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -820,5 +1080,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -832,5 +1096,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -848,4 +1116,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -854,4 +1124,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -859,4 +1131,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -864,4 +1138,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -869,4 +1145,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_pt_b"></a><b>bc_pt_b</b></p>
 
@@ -875,4 +1153,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -880,4 +1160,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C*20</td>
 
@@ -886,4 +1168,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'dirichlet'</span></td>
 
@@ -892,5 +1176,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -903,5 +1191,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -920,4 +1212,6 @@
 
 
+
+
 When a constant surface sensible heat flux is used (<a href="#surface_heatflux">surface_heatflux</a>), <b>bc_pt_b</b>
 = <span style="font-style: italic;">'neumann'</span>
@@ -928,4 +1222,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -938,4 +1236,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -943,4 +1243,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -948,4 +1250,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -953,4 +1257,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -958,4 +1264,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="pc_pt_t"></a><b>bc_pt_t</b></p>
 
@@ -964,4 +1272,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -969,4 +1279,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -975,4 +1287,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'initial_ gradient'</span></td>
 
@@ -981,5 +1295,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -992,5 +1310,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1013,4 +1335,6 @@
 
 
+
+
 Using this value (assumed constant during the
 run) the temperature boundary values are calculated as&nbsp; </p>
@@ -1020,4 +1344,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -1029,5 +1357,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -1041,5 +1373,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1051,5 +1387,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1058,4 +1398,6 @@
       <p style="font-style: normal;">(up to k=nz the prognostic
 equation for the temperature is solved).<br>
+
+
 
 
@@ -1071,4 +1413,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -1077,4 +1421,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -1082,4 +1428,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1087,4 +1435,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -1092,4 +1442,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_q_b"></a><b>bc_q_b</b></p>
 
@@ -1098,4 +1450,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -1103,4 +1457,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -1109,4 +1465,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'dirichlet'</span></td>
 
@@ -1115,5 +1473,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -1126,5 +1488,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1143,4 +1509,6 @@
 
 
+
+
 When a constant surface latent heat flux is used (<a href="#surface_waterflux">surface_waterflux</a>), <b>bc_q_b</b>
 = <span style="font-style: italic;">'neumann'</span>
@@ -1152,4 +1520,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -1157,4 +1527,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -1162,4 +1534,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1167,4 +1541,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -1172,4 +1548,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_q_t"></a><b>bc_q_t</b></p>
 
@@ -1178,5 +1556,9 @@
 
 
+
+
       </td>
+
+
 
 
@@ -1189,4 +1571,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'neumann'</span></td>
 
@@ -1195,5 +1579,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -1206,5 +1594,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1226,4 +1618,6 @@
 
 
+
+
 Using this value (assumed constant during the run) the humidity
 boundary values
@@ -1233,5 +1627,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1243,5 +1641,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -1254,5 +1656,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1264,5 +1670,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1275,4 +1685,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -1280,4 +1692,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -1285,4 +1699,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1291,4 +1707,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -1296,4 +1714,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_s_b"></a><b>bc_s_b</b></p>
 
@@ -1301,4 +1721,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -1307,4 +1729,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -1312,4 +1736,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'dirichlet'</span></td>
 
@@ -1318,5 +1744,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -1329,5 +1759,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1347,4 +1781,6 @@
 
 
+
+
 When a constant surface concentration flux is used (<a href="#surface_scalarflux">surface_scalarflux</a>), <b>bc_s_b</b>
 = <span style="font-style: italic;">'neumann'</span>
@@ -1356,4 +1792,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -1361,4 +1799,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -1366,4 +1806,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1371,4 +1813,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -1376,4 +1820,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_s_t"></a><b>bc_s_t</b></p>
 
@@ -1382,4 +1828,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -1387,4 +1835,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -1393,4 +1843,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'neumann'</span></td>
 
@@ -1399,5 +1851,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -1410,5 +1866,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1429,4 +1889,6 @@
 
 
+
+
 Using this value (assumed constant during the run) the concentration
 boundary values
@@ -1436,5 +1898,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1446,5 +1912,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -1457,5 +1927,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1467,5 +1941,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1479,4 +1957,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -1484,4 +1964,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -1489,4 +1971,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1494,4 +1978,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="bc_sa_t"></a><span style="font-weight: bold;">bc_sa_t</span></td>
 
@@ -1499,4 +1985,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -1504,4 +1992,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'neumann'</span></td>
 
@@ -1509,4 +1999,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -1514,4 +2006,6 @@
       
       
+      
+      
       <p style="font-style: normal;">Top boundary condition of the salinity.&nbsp; </p>
 
@@ -1519,5 +2013,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1529,4 +2027,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -1541,5 +2043,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -1555,4 +2061,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -1560,4 +2068,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -1565,4 +2075,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -1570,4 +2082,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -1575,4 +2089,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_uv_b"></a><b>bc_uv_b</b></p>
 
@@ -1581,4 +2097,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -1586,4 +2104,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -1592,4 +2112,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'dirichlet'</span></td>
 
@@ -1598,5 +2120,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -1609,5 +2135,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1628,5 +2158,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1638,5 +2172,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -1649,5 +2187,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1659,5 +2201,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1675,4 +2221,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -1680,4 +2228,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -1685,4 +2235,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1690,4 +2242,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -1695,4 +2249,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="bc_uv_t"></a><b>bc_uv_t</b></p>
 
@@ -1701,4 +2257,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -1706,4 +2264,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -1712,4 +2272,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'dirichlet'</span></td>
 
@@ -1718,5 +2280,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -1729,5 +2295,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -1748,4 +2318,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -1757,4 +2331,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -1762,4 +2338,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -1767,4 +2345,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1772,4 +2352,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="bottom_salinityflux"></a><span style="font-weight: bold;">bottom_salinityflux</span></td>
 
@@ -1777,4 +2359,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -1782,4 +2366,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">0.0</span></td>
 
@@ -1787,4 +2373,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -1792,4 +2380,6 @@
       
       
+      
+      
       <p>Kinematic salinity flux near the surface (in psu m/s).&nbsp;</p>
 
@@ -1797,5 +2387,9 @@
 
 
+
+
 This parameter only comes into effect for ocean runs (see parameter <a href="chapter_4.1.html#ocean">ocean</a>).
+      
+      
       
       
@@ -1810,4 +2404,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -1815,4 +2411,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -1820,4 +2418,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -1825,4 +2425,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -1831,4 +2433,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="building_height"></a>building_height</span></td>
 
@@ -1837,4 +2441,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -1842,5 +2448,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">50.0</span></td>
+
+
 
 
@@ -1853,5 +2463,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -1867,4 +2481,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -1872,4 +2488,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1877,4 +2495,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="building_length_x"></a>building_length_x</span></td>
 
@@ -1883,4 +2503,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -1888,5 +2510,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">50.0</span></td>
+
+
 
 
@@ -1899,5 +2525,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -1916,4 +2546,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -1921,4 +2553,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1926,4 +2560,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="building_length_y"></a>building_length_y</span></td>
 
@@ -1932,4 +2568,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -1937,5 +2575,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">50.0</span></td>
+
+
 
 
@@ -1948,5 +2590,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -1964,4 +2610,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -1969,4 +2617,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -1974,4 +2624,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="building_wall_left"></a>building_wall_left</span></td>
 
@@ -1980,4 +2632,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -1985,5 +2639,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">building centered in x-direction</span></td>
+
+
 
 
@@ -1998,5 +2656,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -2015,5 +2677,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -2029,4 +2695,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2034,4 +2702,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -2040,4 +2710,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="building_wall_south"></a>building_wall_south</span></td>
 
@@ -2046,4 +2718,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -2051,5 +2725,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;"></span><span style="font-style: italic;">building centered in y-direction</span></td>
+
+
 
 
@@ -2064,5 +2742,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -2081,5 +2763,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -2095,4 +2781,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2100,10 +2788,34 @@
 
 
- <tr><td><a name="canopy_mode"></a><span style="font-weight: bold;">canopy_mode</span></td><td>C * 20</td><td><span style="font-style: italic;">'block'</span></td><td>Canopy mode.<br><br><font color="#000000">
+
+
+ <tr>
+
+      <td><a name="canopy_mode"></a><span style="font-weight: bold;">canopy_mode</span></td>
+
+      <td>C * 20</td>
+
+      <td><span style="font-style: italic;">'block'</span></td>
+
+      <td>Canopy mode.<br>
+
+      <br>
+
+      <font color="#000000">
 Besides using the default value, that will create a horizontally
 homogeneous plant canopy that extends over the total horizontal
 extension of the model domain, the user may add code to the user
 interface subroutine <a href="chapter_3.5.1.html#user_init_plant_canopy">user_init_plant_canopy</a>
-to allow further canopy&nbsp;modes. <br><br>The setting of <a href="#canopy_mode">canopy_mode</a> becomes only active, if&nbsp;<a href="#plant_canopy">plant_canopy</a> has been set <span style="font-style: italic;">.T.</span> and a non-zero <a href="#drag_coefficient">drag_coefficient</a> has been defined.</font></td></tr><tr>
+to allow further canopy&nbsp;modes. <br>
+
+      <br>
+
+The setting of <a href="#canopy_mode">canopy_mode</a> becomes only active, if&nbsp;<a href="#plant_canopy">plant_canopy</a> has been set <span style="font-style: italic;">.T.</span> and a non-zero <a href="#drag_coefficient">drag_coefficient</a> has been defined.</font></td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+
 
 
@@ -2117,4 +2829,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2122,4 +2836,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L<br>
 
@@ -2127,4 +2843,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -2133,4 +2851,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">.F.</span><br>
 
@@ -2138,5 +2858,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -2150,4 +2874,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -2156,5 +2882,7 @@
 
 
-<span style="font-weight: bold;"></span><span style="font-family: monospace;"></span>
+
+
+      <span style="font-weight: bold;"></span><span style="font-family: monospace;"></span>
 
 
@@ -2174,5 +2902,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -2188,4 +2920,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2193,4 +2927,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2198,4 +2934,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -2203,4 +2941,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -2208,4 +2948,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="cloud_physics"></a><b>cloud_physics</b></p>
 
@@ -2214,4 +2956,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2219,4 +2963,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L<br>
 
@@ -2224,4 +2970,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -2230,4 +2978,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">.F.</span></td>
 
@@ -2235,5 +2985,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -2242,4 +2996,6 @@
       <p>Parameter to switch
 on the condensation scheme.&nbsp; </p>
+
+
 
 
@@ -2261,5 +3017,9 @@
 
 
+
+
  <b><br>
+
+
 
 
@@ -2275,4 +3035,6 @@
 
 
+
+
 Detailed information about the condensation scheme is given in the
 description of the <a href="http://www.muk.uni-hannover.de/%7Eraasch/PALM-1/Dokumentationen/Cloud_physics/wolken.pdf">cloud
@@ -2282,5 +3044,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -2295,4 +3061,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2300,4 +3068,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2305,4 +3075,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -2310,4 +3082,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="conserve_volume_flow"></a>conserve_volume_flow</span></td>
 
@@ -2316,4 +3090,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -2321,5 +3097,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">.F.</span></td>
+
+
 
 
@@ -2332,5 +3112,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -2347,4 +3131,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2352,4 +3138,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2357,6 +3145,38 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
+      <td><a name="cthf"></a><span style="font-weight: bold;">cthf</span></td>
+
+      <td>R</td>
+
+      <td><span style="font-style: italic;">0.0</span></td>
+
+      <td>Average heat flux that is prescribed at the top of the plant canopy.<br>
+
+
+      <br>
+
+
+If <a href="../../../../../DEVELOPER_VERSION/chapter_4.1_adjusted.html#plant_canopy">plant_canopy</a> is set <span style="font-style: italic;">.T.</span>, the user can prescribe a heat flux at the top of the plant canopy.<br>
+
+
+It is assumed that solar radiation penetrates the canopy and warms the
+foliage which, in turn, warms the air in contact with it. <br>
+
+
+Note: Instead of using the value prescribed by <a href="../../../../../DEVELOPER_VERSION/chapter_4.1_adjusted.html#surface_heatflux">surface_heatflux</a>,
+the near surface heat flux is determined from an exponential function
+that is dependent on the cumulative leaf_area_index (Shaw and Schumann
+(1992, Boundary Layer Meteorol., 61, 47-64)).</td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+
+
 
 
@@ -2367,4 +3187,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="cut_spline_overshoot"></a><b>cut_spline_overshoot</b></p>
 
@@ -2373,4 +3195,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2378,4 +3202,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -2384,4 +3210,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">.T.</span></td>
 
@@ -2389,5 +3217,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -2401,5 +3233,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2425,5 +3261,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2439,4 +3279,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2444,4 +3286,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2449,4 +3293,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -2454,4 +3300,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -2459,4 +3307,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="damp_level_1d"></a><b>damp_level_1d</b></p>
 
@@ -2465,4 +3315,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2470,4 +3322,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -2476,4 +3330,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">zu(nz+1)</span></td>
 
@@ -2482,5 +3338,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -2494,5 +3354,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2515,4 +3379,6 @@
 
 
+
+
 This parameter only comes into effect if the 1d-model is switched on
 for
@@ -2524,4 +3390,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -2529,4 +3397,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -2534,4 +3404,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2539,4 +3411,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -2544,4 +3418,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><a name="dissipation_1d"></a><span style="font-weight: bold;">dissipation_1d</span><br>
 
@@ -2550,4 +3426,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2555,4 +3433,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C*20<br>
 
@@ -2561,4 +3441,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2566,4 +3448,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'as_in_3d_</span><br style="font-style: italic;">
 
@@ -2571,4 +3455,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">model'</span><br>
 
@@ -2576,5 +3462,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -2589,5 +3479,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -2601,5 +3495,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -2615,4 +3513,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2620,4 +3520,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2626,5 +3528,25 @@
 
 
-    <tr><td><a name="drag_coefficient"></a><span style="font-weight: bold;">drag_coefficient</span></td><td>R</td><td><span style="font-style: italic;">0.0</span></td><td>Drag coefficient used in the plant canopy model.<br><br>This parameter has to be non-zero, if the parameter <a href="#plant_canopy">plant_canopy</a> is set <span style="font-style: italic;">.T.</span>.</td></tr><tr>
+
+
+    <tr>
+
+      <td><a name="drag_coefficient"></a><span style="font-weight: bold;">drag_coefficient</span></td>
+
+      <td>R</td>
+
+      <td><span style="font-style: italic;">0.0</span></td>
+
+      <td>Drag coefficient used in the plant canopy model.<br>
+
+      <br>
+
+This parameter has to be non-zero, if the parameter <a href="#plant_canopy">plant_canopy</a> is set <span style="font-style: italic;">.T.</span>.</td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+
 
 
@@ -2636,4 +3558,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="dt"></a><b>dt</b></p>
 
@@ -2641,4 +3565,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -2647,4 +3573,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -2652,4 +3580,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">variable</span></td>
 
@@ -2658,5 +3588,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -2669,5 +3603,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2683,5 +3621,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2699,5 +3641,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2710,4 +3656,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -2715,5 +3663,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2726,4 +3678,8 @@
 
 
+
+
+        
+        
         
         
@@ -2736,5 +3692,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2746,5 +3706,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2759,5 +3723,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2772,4 +3740,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -2777,5 +3747,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2805,4 +3779,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -2811,4 +3787,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -2816,4 +3794,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -2821,4 +3801,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -2826,4 +3808,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="dt_pr_1d"></a><b>dt_pr_1d</b></p>
 
@@ -2832,4 +3816,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2837,4 +3823,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -2843,4 +3831,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">9999999.9</span></td>
 
@@ -2849,5 +3839,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -2861,5 +3855,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2877,4 +3875,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2882,4 +3882,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2887,4 +3889,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -2892,4 +3896,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -2897,4 +3903,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="dt_run_control_1d"></a><b>dt_run_control_1d</b></p>
 
@@ -2903,4 +3911,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2908,4 +3918,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -2914,4 +3926,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">60.0</span></td>
 
@@ -2919,5 +3933,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -2931,5 +3949,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -2946,4 +3968,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2951,4 +3975,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -2956,4 +3982,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -2961,4 +3989,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -2966,4 +3996,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="dx"></a><b>dx</b></p>
 
@@ -2972,4 +4004,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -2977,4 +4011,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -2983,4 +4019,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">1.0</span></td>
 
@@ -2988,5 +4026,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -2999,5 +4041,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3010,4 +4056,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3020,4 +4070,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -3026,4 +4078,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -3031,4 +4085,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -3036,4 +4092,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -3041,4 +4099,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="dy"></a><b>dy</b></p>
 
@@ -3047,4 +4107,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -3052,4 +4114,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -3058,4 +4122,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">1.0</span></td>
 
@@ -3063,5 +4129,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -3074,5 +4144,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3084,4 +4158,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3094,4 +4172,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -3100,4 +4180,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -3105,4 +4187,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -3110,4 +4194,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -3115,4 +4201,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="dz"></a><b>dz</b></p>
 
@@ -3121,4 +4209,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -3126,4 +4216,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -3132,4 +4224,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><br>
 
@@ -3137,4 +4231,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -3142,5 +4238,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -3153,5 +4253,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3165,4 +4269,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -3170,5 +4276,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3184,4 +4294,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -3189,5 +4301,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3202,4 +4318,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3211,5 +4331,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -3222,4 +4346,6 @@
 
 
+
+
 zu(1) = dz * 0.5</p>
 
@@ -3227,5 +4353,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3237,5 +4367,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3248,5 +4382,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3258,5 +4396,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -3269,5 +4411,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3279,4 +4425,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -3284,4 +4432,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -3290,4 +4440,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -3295,4 +4447,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="dz_max"></a><span style="font-weight: bold;">dz_max</span></td>
 
@@ -3300,4 +4454,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -3305,5 +4461,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">9999999.9</span></td>
+
+
 
 
@@ -3316,5 +4476,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -3330,4 +4494,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -3335,4 +4501,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -3341,4 +4509,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -3346,4 +4516,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="dz_stretch_factor"></a><b>dz_stretch_factor</b></p>
 
@@ -3352,4 +4524,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -3357,4 +4531,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -3363,4 +4539,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">1.08</span></td>
 
@@ -3368,5 +4546,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -3380,5 +4562,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3393,4 +4579,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -3398,4 +4586,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -3404,4 +4594,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -3409,4 +4601,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -3414,4 +4608,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="dz_stretch_level"></a><b>dz_stretch_level</b></p>
 
@@ -3420,4 +4616,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -3425,4 +4623,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -3431,4 +4631,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">100000.0</span><br>
 
@@ -3436,4 +4638,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -3442,5 +4646,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -3454,5 +4662,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3467,5 +4679,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3477,5 +4693,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -3489,4 +4709,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3498,5 +4722,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3510,5 +4738,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3520,5 +4752,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -3533,4 +4769,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3538,4 +4778,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3549,4 +4793,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3554,4 +4802,8 @@
 
 
+
+
+        
+        
         
         
@@ -3560,4 +4812,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3567,4 +4823,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -3572,4 +4830,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -3578,20 +4838,30 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="e_init"></a>e_init</span></td>
 
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">0.0</span></td>
 
 
 
+
+
       <td>Initial subgrid-scale TKE in m<sup>2</sup>s<sup>-2</sup>.<br>
 
@@ -3600,5 +4870,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -3610,8 +4884,12 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -3619,4 +4897,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="e_min"></a>e_min</span></td>
 
@@ -3625,4 +4905,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -3630,5 +4912,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">0.0</span></td>
+
+
 
 
@@ -3642,5 +4928,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -3655,4 +4945,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -3661,4 +4953,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -3666,4 +4960,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -3671,4 +4967,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="end_time_1d"></a><b>end_time_1d</b></p>
 
@@ -3677,4 +4975,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -3682,4 +4982,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -3688,4 +4990,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">864000.0</span><br>
 
@@ -3693,4 +4997,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -3699,5 +5005,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -3710,5 +5020,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3728,4 +5042,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -3733,4 +5049,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -3738,4 +5056,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -3743,4 +5063,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -3748,4 +5070,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="fft_method"></a><b>fft_method</b></p>
 
@@ -3754,4 +5078,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -3759,4 +5085,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -3765,4 +5093,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'system-</span><br style="font-style: italic;">
 
@@ -3770,4 +5100,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">specific'</span></td>
 
@@ -3776,5 +5108,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -3787,4 +5123,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -3792,5 +5130,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3798,4 +5140,6 @@
       
       <p><br>
+
+
 
 
@@ -3812,4 +5156,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3817,4 +5165,6 @@
       
       <p><br>
+
+
 
 
@@ -3830,4 +5180,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -3835,5 +5187,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3848,4 +5204,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3861,5 +5221,9 @@
 
 
+
+
  </p>
+
+
 
 
@@ -3876,4 +5240,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -3881,4 +5247,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -3886,4 +5254,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -3891,4 +5261,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="galilei_transformation"></a><b>galilei_transformation</b></p>
 
@@ -3897,4 +5269,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -3902,4 +5276,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -3908,5 +5284,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>.F.</i></td>
+
+
 
 
@@ -3922,4 +5302,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -3947,5 +5331,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -3962,4 +5350,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -3967,4 +5357,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -3973,4 +5365,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -3978,4 +5372,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -3983,4 +5379,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="grid_matching"></a><b>grid_matching</b></p>
 
@@ -3989,4 +5387,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -3994,4 +5394,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 6</td>
 
@@ -4000,5 +5402,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'match'</span></td>
+
+
 
 
@@ -4012,5 +5418,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -4031,5 +5441,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -4049,5 +5463,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -4062,4 +5480,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -4067,5 +5487,9 @@
 
 
+
+
  <b>Note:</b><br>
+
+
 
 
@@ -4080,4 +5504,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -4086,4 +5512,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -4091,4 +5519,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><a name="inflow_disturbance_begin"></a><b>inflow_disturbance_<br>
 
@@ -4097,4 +5527,6 @@
 
 
+
+
 begin</b></td>
 
@@ -4102,4 +5534,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">I</td>
 
@@ -4108,4 +5542,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">MIN(10,</span><br style="font-style: italic;">
 
@@ -4113,5 +5549,9 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">nx/2 or ny/2)</span></td>
+
+
 
 
@@ -4126,5 +5566,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -4143,4 +5587,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -4148,4 +5594,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -4153,4 +5601,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><a name="inflow_disturbance_end"></a><b>inflow_disturbance_<br>
 
@@ -4159,4 +5609,6 @@
 
 
+
+
 end</b></td>
 
@@ -4164,4 +5616,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">I</td>
 
@@ -4170,4 +5624,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">MIN(100,</span><br style="font-style: italic;">
 
@@ -4175,4 +5631,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">3/4*nx or</span><br style="font-style: italic;">
 
@@ -4180,5 +5638,9 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">3/4*ny)</span></td>
+
+
 
 
@@ -4192,5 +5654,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -4209,4 +5675,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -4214,4 +5682,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -4219,4 +5689,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -4224,4 +5696,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="initializing_actions"></a><b>initializing_actions</b></p>
 
@@ -4230,4 +5704,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -4235,4 +5711,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 100</td>
 
@@ -4241,4 +5719,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><br>
 
@@ -4246,4 +5726,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -4251,5 +5733,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -4262,5 +5748,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4276,5 +5766,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4287,5 +5781,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4297,5 +5795,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -4322,5 +5824,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4332,5 +5838,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4343,4 +5853,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -4352,5 +5866,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -4371,5 +5889,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4381,5 +5903,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4391,4 +5917,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -4403,4 +5933,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -4413,5 +5947,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4438,5 +5976,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4449,5 +5991,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4459,5 +6005,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -4482,4 +6032,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -4491,5 +6045,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4506,5 +6064,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4516,4 +6078,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -4521,4 +6085,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -4527,4 +6093,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -4532,4 +6100,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -4537,4 +6107,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="km_constant"></a><b>km_constant</b></p>
 
@@ -4543,4 +6115,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -4548,4 +6122,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -4554,4 +6130,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>variable<br>
 
@@ -4560,4 +6138,6 @@
 
 
+
+
 (computed from TKE)</i></td>
 
@@ -4565,5 +6145,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -4577,5 +6161,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4594,4 +6182,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -4599,4 +6189,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -4604,4 +6196,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -4609,4 +6203,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -4614,4 +6210,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="km_damp_max"></a><b>km_damp_max</b></p>
 
@@ -4620,4 +6218,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -4625,5 +6225,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
+
+
 
 
@@ -4633,4 +6237,6 @@
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">0.5*(dx
 or dy)</span></td>
+
+
 
 
@@ -4644,5 +6250,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -4664,5 +6274,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -4683,5 +6297,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -4695,4 +6313,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -4700,9 +6320,40 @@
 
 
- <tr><td><a name="lad_surface"></a><span style="font-weight: bold;">lad_surface</span></td><td>R</td><td><span style="font-style: italic;">0.0</span></td><td>Surface value of the leaf area density (in m<sup>2</sup>/m<sup>3</sup>).<br><br>This
+
+
+ <tr>
+
+      <td><a name="lad_surface"></a><span style="font-weight: bold;">lad_surface</span></td>
+
+      <td>R</td>
+
+      <td><span style="font-style: italic;">0.0</span></td>
+
+      <td>Surface value of the leaf area density (in m<sup>2</sup>/m<sup>3</sup>).<br>
+
+      <br>
+
+This
 parameter assigns the value of the leaf area density <span style="font-weight: bold;">lad</span> at the surface (k=0)<b>.</b> Starting from this value,
 the leaf area density profile is constructed with <a href="chapter_4.1.html#lad_vertical_gradient">lad_vertical_gradient</a>
 and <a href="chapter_4.1.html#lad_vertical_gradient_level">lad_vertical_gradient_level
-      </a>.</td></tr><tr><td><a name="lad_vertical_gradient"></a><span style="font-weight: bold;">lad_vertical_gradient</span></td><td>R (10)</td><td><span style="font-style: italic;">10 * 0.0</span></td><td>Gradient(s) of the leaf area density (in&nbsp;m<sup>2</sup>/m<sup>4</sup>).<br><br><p>This leaf area density gradient
+      </a>.</td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+      <td><a name="lad_vertical_gradient"></a><span style="font-weight: bold;">lad_vertical_gradient</span></td>
+
+      <td>R (10)</td>
+
+      <td><span style="font-style: italic;">10 * 0.0</span></td>
+
+      <td>Gradient(s) of the leaf area density (in&nbsp;m<sup>2</sup>/m<sup>4</sup>).<br>
+
+      <br>
+
+      
+      <p>This leaf area density gradient
 holds starting from the height&nbsp;
 level defined by <a href="chapter_4.1.html#lad_vertical_gradient_level">lad_vertical_gradient_level</a>
@@ -4712,8 +6363,53 @@
 = <i>0.0</i>) can be assigned. The leaf area density at the surface is
 assigned via <a href="chapter_4.1.html#lad_surface">lad_surface</a>.&nbsp;
-      </p></td></tr><tr><td><a name="lad_vertical_gradient_level"></a><span style="font-weight: bold;">lad_vertical_gradient_level</span></td><td>R (10)</td><td><span style="font-style: italic;">10 * 0.0</span></td><td>Height level from which on the&nbsp;gradient
+      </p>
+
+      </td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+      <td><a name="lad_vertical_gradient_level"></a><span style="font-weight: bold;">lad_vertical_gradient_level</span></td>
+
+      <td>R (10)</td>
+
+      <td><span style="font-style: italic;">10 * 0.0</span></td>
+
+      <td>Height level from which on the&nbsp;gradient
 of the leaf area density defined by <a href="chapter_4.1.html#lad_vertical_gradient">lad_vertical_gradient_level</a>
-is effective (in m).<br><br>The height levels have to be assigned in ascending order. The
-default values result in a leaf area density that is constant with height uup to the top of the plant canopy layer defined by <a href="#pch_index">pch_index</a>. For the piecewise construction of temperature profiles see <a href="chapter_4.1.html#lad_vertical_gradient">lad_vertical_gradient</a>.</td></tr><tr>
+is effective (in m).<br>
+
+      <br>
+
+The height levels have to be assigned in ascending order. The
+default values result in a leaf area density that is constant with height uup to the top of the plant canopy layer defined by <a href="#pch_index">pch_index</a>. For the piecewise construction of temperature profiles see <a href="chapter_4.1.html#lad_vertical_gradient">lad_vertical_gradient</a>.</td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+      <td><a name="leaf_surface_concentration"></a><b>leaf_surface_concentration</b></td>
+
+      <td>R</td>
+
+      <td><i>0.0</i></td>
+
+      <td>Concentration of a passive scalar at the surface of a leaf (in K m/s).<br>
+
+
+      <br>
+
+
+This parameter is only of importance in cases in that both, <a href="../../../../../DEVELOPER_VERSION/chapter_4.1_adjusted.html#plant_canopy">plant_canopy</a> and <a href="../../../../../DEVELOPER_VERSION/chapter_4.1_adjusted.html#passive_scalar">passive_scalar</a>, are set <span style="font-style: italic;">.T.</span>.
+The value of the concentration of a passive scalar at the surface of a
+leaf is required for the parametrisation of the sources and sinks of
+scalar concentration due to the canopy.</td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+
 
 
@@ -4726,4 +6422,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="long_filter_factor"></a><b>long_filter_factor</b></p>
 
@@ -4732,4 +6430,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -4737,4 +6437,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -4743,4 +6445,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -4749,5 +6453,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -4760,4 +6468,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -4765,5 +6475,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4771,4 +6485,6 @@
       
       <p><br>
+
+
 
 
@@ -4788,4 +6504,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -4793,5 +6511,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -4812,4 +6534,6 @@
 
 
+
+
 Filter factors with values &gt; <i>0.01</i> also
 reduce the amplitudes
@@ -4821,4 +6545,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -4826,4 +6552,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -4831,4 +6559,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -4836,4 +6566,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="loop_optimization"></a><span style="font-weight: bold;">loop_optimization</span></td>
 
@@ -4841,4 +6573,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">C*16</td>
 
@@ -4846,4 +6580,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">see right</span></td>
 
@@ -4851,4 +6587,6 @@
 
 
+
+
       <td>Method used to optimize loops for solving the prognostic equations .<br>
 
@@ -4856,5 +6594,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -4871,4 +6613,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -4876,4 +6620,6 @@
 
 
+
+
 The default behaviour can be changed by setting either <span style="font-weight: bold;">loop_optimization</span> = <span style="font-style: italic;">'vector'</span> or <span style="font-weight: bold;">loop_optimization</span> = <span style="font-style: italic;">'cache'</span>.</td>
 
@@ -4881,4 +6627,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -4886,4 +6634,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -4892,4 +6642,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="mixing_length_1d"></a><span style="font-weight: bold;">mixing_length_1d</span><br>
 
@@ -4898,4 +6650,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -4903,4 +6657,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C*20<br>
 
@@ -4909,4 +6665,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -4914,4 +6672,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'as_in_3d_</span><br style="font-style: italic;">
 
@@ -4919,4 +6679,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">model'</span><br>
 
@@ -4924,5 +6686,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -4936,5 +6702,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -4948,5 +6718,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -4963,4 +6737,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -4968,4 +6744,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -4973,4 +6751,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -4978,4 +6758,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -4983,4 +6765,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="humidity"></a><b>humidity</b></p>
 
@@ -4989,4 +6773,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -4994,4 +6780,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -5000,4 +6788,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>.F.</i></td>
 
@@ -5006,5 +6796,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -5018,4 +6812,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -5023,5 +6819,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -5038,5 +6838,9 @@
 
 
+
+
       </p>
+
+
 
 
@@ -5051,4 +6855,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5057,4 +6863,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -5062,4 +6870,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -5067,4 +6877,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="momentum_advec"></a><b>momentum_advec</b></p>
 
@@ -5073,4 +6885,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -5078,4 +6892,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 10</td>
 
@@ -5084,4 +6900,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>'pw-scheme'</i></td>
 
@@ -5090,5 +6908,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -5101,4 +6923,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -5107,4 +6931,6 @@
 
 
+
+
 The user can choose between the following schemes:<br>
 
@@ -5113,4 +6939,6 @@
 
 
+
+
 &nbsp;<br>
 
@@ -5118,4 +6946,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -5123,4 +6953,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">'pw-scheme'</span><br>
 
@@ -5129,4 +6961,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -5134,5 +6968,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -5143,4 +6981,6 @@
 Williams (1970, J. Comp. Phys., 6,
 392-405) with central differences in the form C3 is used.<br>
+
+
 
 
@@ -5157,4 +6997,6 @@
 
 
+
+
  </div>
 
@@ -5162,5 +7004,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -5172,5 +7018,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -5183,4 +7033,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -5188,5 +7040,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -5215,5 +7071,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -5234,4 +7094,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -5239,5 +7101,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -5254,5 +7120,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -5272,4 +7142,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5278,4 +7150,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -5283,4 +7157,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5288,4 +7164,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><a name="netcdf_precision"></a><span style="font-weight: bold;">netcdf_precision</span><br>
 
@@ -5294,4 +7172,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -5299,4 +7179,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C*20<br>
 
@@ -5305,4 +7187,6 @@
 
 
+
+
 (10)<br>
 
@@ -5310,4 +7194,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5315,4 +7201,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">single preci-</span><br style="font-style: italic;">
 
@@ -5320,4 +7208,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">sion for all</span><br style="font-style: italic;">
 
@@ -5325,4 +7215,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">output quan-</span><br style="font-style: italic;">
 
@@ -5330,4 +7222,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">tities</span><br>
 
@@ -5335,5 +7229,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -5347,5 +7245,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -5361,6 +7263,10 @@
 
 
+
+
 Accuracy for the different output data (cross sections, 3d-volume data,
 spectra, etc.) can be set independently.<br>
+
+
 
 
@@ -5376,4 +7282,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -5382,4 +7290,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -5391,4 +7303,6 @@
 
 
+
+
  <tbody>
 
@@ -5397,4 +7311,6 @@
 
 
+
+
           <tr>
 
@@ -5402,4 +7318,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'xy'</span><br>
 
@@ -5407,4 +7325,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5413,4 +7333,6 @@
 
 
+
+
             <td style="vertical-align: top;">horizontal cross section<br>
 
@@ -5419,4 +7341,6 @@
 
 
+
+
             </td>
 
@@ -5424,4 +7348,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5429,4 +7355,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5434,4 +7362,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'xz'</span><br>
 
@@ -5439,5 +7369,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -5451,4 +7385,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5456,4 +7392,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5461,4 +7399,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5466,4 +7406,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'yz'</span><br>
 
@@ -5471,5 +7413,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -5483,4 +7429,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5488,4 +7436,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5493,4 +7443,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5498,4 +7450,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'2d'</span><br>
 
@@ -5503,4 +7457,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5509,4 +7465,6 @@
 
 
+
+
             <td style="vertical-align: top;">all cross sections<br>
 
@@ -5515,4 +7473,6 @@
 
 
+
+
             </td>
 
@@ -5520,4 +7480,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5525,4 +7487,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5530,4 +7494,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'3d'</span><br>
 
@@ -5535,4 +7501,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5541,4 +7509,6 @@
 
 
+
+
             <td style="vertical-align: top;">volume data<br>
 
@@ -5546,4 +7516,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5552,4 +7524,6 @@
 
 
+
+
           </tr>
 
@@ -5557,4 +7531,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5562,4 +7538,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'pr'</span><br>
 
@@ -5567,4 +7545,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5573,4 +7553,6 @@
 
 
+
+
             <td style="vertical-align: top;">vertical profiles<br>
 
@@ -5579,4 +7561,6 @@
 
 
+
+
             </td>
 
@@ -5584,4 +7568,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5589,4 +7575,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5594,4 +7582,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'ts'</span><br>
 
@@ -5599,5 +7589,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -5611,4 +7605,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5616,4 +7612,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5621,4 +7619,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5626,4 +7626,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'sp'</span><br>
 
@@ -5631,4 +7633,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5637,4 +7641,6 @@
 
 
+
+
             <td style="vertical-align: top;">spectra<br>
 
@@ -5642,4 +7648,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5648,4 +7656,6 @@
 
 
+
+
           </tr>
 
@@ -5653,4 +7663,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5658,4 +7670,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'prt'</span><br>
 
@@ -5663,4 +7677,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5669,4 +7685,6 @@
 
 
+
+
             <td style="vertical-align: top;">particles<br>
 
@@ -5674,4 +7692,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5680,4 +7700,6 @@
 
 
+
+
           </tr>
 
@@ -5685,4 +7707,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5690,4 +7714,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'all'</span><br>
 
@@ -5695,4 +7721,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5701,4 +7729,6 @@
 
 
+
+
             <td style="vertical-align: top;">all output quantities<br>
 
@@ -5707,4 +7737,6 @@
 
 
+
+
             </td>
 
@@ -5712,4 +7744,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5717,5 +7751,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -5727,4 +7765,6 @@
       
       
+      
+      
       </table>
 
@@ -5732,4 +7772,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -5737,5 +7779,9 @@
 
 
+
+
  <span style="font-weight: bold;">Example:</span><br>
+
+
 
 
@@ -5750,4 +7796,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5755,4 +7803,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5761,4 +7811,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -5766,4 +7818,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -5771,4 +7825,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="npex"></a><b>npex</b></p>
 
@@ -5776,4 +7832,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5782,4 +7840,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">I</td>
 
@@ -5787,4 +7847,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><br>
 
@@ -5792,4 +7854,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5797,5 +7861,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -5810,5 +7878,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -5843,4 +7915,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -5858,4 +7934,6 @@
 
 
+
+
 Additionally, the specification of <span style="font-weight: bold;">npex</span>
 and <span style="font-weight: bold;">npey</span>
@@ -5868,4 +7946,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5873,4 +7953,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5878,4 +7960,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -5883,4 +7967,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -5888,4 +7974,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="npey"></a><b>npey</b></p>
 
@@ -5894,4 +7982,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -5899,4 +7989,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">I</td>
 
@@ -5905,4 +7997,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><br>
 
@@ -5910,4 +8004,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5915,5 +8011,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -5928,5 +8028,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -5938,4 +8042,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -5943,4 +8049,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -5949,4 +8057,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -5954,4 +8064,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -5959,4 +8071,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="nsor_ini"></a><b>nsor_ini</b></p>
 
@@ -5965,4 +8079,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -5970,4 +8086,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">I</td>
 
@@ -5976,4 +8094,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>100</i></td>
 
@@ -5982,5 +8102,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -5993,5 +8117,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6018,4 +8146,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -6024,4 +8154,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -6029,4 +8161,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -6034,4 +8168,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -6039,4 +8175,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="nx"></a><b>nx</b></p>
 
@@ -6045,4 +8183,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6050,4 +8190,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">I</td>
 
@@ -6056,4 +8198,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><br>
 
@@ -6061,4 +8205,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -6066,5 +8212,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -6077,5 +8227,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6092,5 +8246,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6110,4 +8268,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -6120,4 +8282,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -6125,4 +8289,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -6130,4 +8296,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -6136,4 +8304,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -6141,4 +8311,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="ny"></a><b>ny</b></p>
 
@@ -6147,4 +8319,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6152,4 +8326,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">I</td>
 
@@ -6158,4 +8334,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><br>
 
@@ -6163,4 +8341,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -6168,5 +8348,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -6179,5 +8363,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6195,4 +8383,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -6211,4 +8403,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -6221,4 +8417,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -6226,4 +8424,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -6231,4 +8431,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -6237,4 +8439,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -6242,4 +8446,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="nz"></a><b>nz</b></p>
 
@@ -6248,4 +8454,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6253,4 +8461,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">I</td>
 
@@ -6259,4 +8469,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><br>
 
@@ -6264,4 +8476,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -6269,5 +8483,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -6280,5 +8498,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6303,5 +8525,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6319,4 +8545,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -6324,4 +8552,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -6329,4 +8559,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -6334,4 +8566,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="ocean"></a><span style="font-weight: bold;">ocean</span></td>
 
@@ -6339,4 +8573,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -6344,4 +8580,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">.F.</span></td>
 
@@ -6349,4 +8587,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">Parameter to switch on&nbsp;ocean runs.<br>
 
@@ -6354,4 +8594,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -6359,4 +8601,6 @@
 
 
+
+
 By default PALM is configured to simulate&nbsp;atmospheric flows. However, starting from version 3.3, <span style="font-weight: bold;">ocean</span> = <span style="font-style: italic;">.T.</span> allows&nbsp;simulation of ocean turbulent flows. Setting this switch has several effects:<br>
 
@@ -6364,4 +8608,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -6369,4 +8615,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -6378,4 +8628,6 @@
 
 
+
+
         <li>An additional prognostic equation for salinity is solved.</li>
 
@@ -6383,5 +8635,9 @@
 
 
+
+
         <li>Potential temperature in buoyancy and stability-related terms is replaced by potential density.</li>
+
+
 
 
@@ -6396,4 +8652,6 @@
 
 
+
+
 So far, only the initial hydrostatic pressure is entered into this equation.</li>
 
@@ -6401,4 +8659,6 @@
 
 
+
+
         <li>z=0 (sea surface) is assumed at the model top (vertical grid index <span style="font-family: Courier New,Courier,monospace;">k=nzt</span> on the w-grid), with negative values of z indicating the depth.</li>
 
@@ -6406,4 +8666,6 @@
 
 
+
+
         <li>Initial profiles are constructed (e.g. from <a href="#pt_vertical_gradient">pt_vertical_gradient</a> / <a href="#pt_vertical_gradient_level">pt_vertical_gradient_level</a>) starting from the sea surface, using surface values&nbsp;given by <a href="#pt_surface">pt_surface</a>, <a href="#sa_surface">sa_surface</a>, <a href="#ug_surface">ug_surface</a>, and <a href="#vg_surface">vg_surface</a>.</li>
 
@@ -6411,4 +8673,6 @@
 
 
+
+
         <li>Zero salinity flux is used as default boundary condition at the bottom of the sea.</li>
 
@@ -6416,4 +8680,6 @@
 
 
+
+
         <li>If switched on, random perturbations are by default imposed to the upper model domain from zu(nzt*2/3) to zu(nzt-3).</li>
 
@@ -6421,4 +8687,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -6430,4 +8700,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -6435,4 +8707,6 @@
 
 
+
+
 Relevant parameters to be exclusively used for steering ocean runs are <a href="#bc_sa_t">bc_sa_t</a>, <a href="#bottom_salinityflux">bottom_salinityflux</a>, <a href="#sa_surface">sa_surface</a>, <a href="#sa_vertical_gradient">sa_vertical_gradient</a>, <a href="#sa_vertical_gradient_level">sa_vertical_gradient_level</a>, and <a href="#top_salinityflux">top_salinityflux</a>.<br>
 
@@ -6440,4 +8714,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -6445,4 +8721,6 @@
 
 
+
+
 Section <a href="chapter_4.2.2.html">4.4.2</a> gives an example for appropriate settings of these and other parameters neccessary for ocean runs.<br>
 
@@ -6450,4 +8728,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -6455,6 +8735,10 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;">ocean</span> = <span style="font-style: italic;">.T.</span> does not allow settings of <a href="#timestep_scheme">timestep_scheme</a> = <span style="font-style: italic;">'leapfrog'</span> or <span style="font-style: italic;">'leapfrog+euler'</span> as well as <a href="#scalar_advec">scalar_advec</a> = <span style="font-style: italic;">'ups-scheme'</span>.<span style="font-weight: bold;"></span><br>
 
+
+
       </td>
 
@@ -6462,4 +8746,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -6467,4 +8753,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -6472,4 +8760,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -6477,4 +8767,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="omega"></a><b>omega</b></p>
 
@@ -6483,4 +8775,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6488,4 +8782,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -6494,4 +8790,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>7.29212E-5</i></td>
 
@@ -6500,5 +8798,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -6512,5 +8814,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6525,5 +8831,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6536,4 +8846,8 @@
 
 
+
+
+        
+        
         
         
@@ -6546,4 +8860,6 @@
 
 
+
+
 f* = 2.0 * <b>omega</b> * cos(<a href="#phi">phi</a>)</p>
 
@@ -6552,4 +8868,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -6561,4 +8881,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -6566,4 +8888,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -6571,4 +8895,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -6576,4 +8902,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -6581,4 +8909,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="outflow_damping_width"></a><b>outflow_damping_width</b></p>
 
@@ -6587,4 +8917,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6592,5 +8924,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">I</td>
+
+
 
 
@@ -6605,4 +8941,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">Width of
 the damping range in the vicinity of the outflow (gridpoints).<br>
@@ -6612,5 +8950,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -6631,4 +8973,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -6637,4 +8981,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -6642,4 +8988,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -6647,4 +8995,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="overshoot_limit_e"></a><b>overshoot_limit_e</b></p>
 
@@ -6653,4 +9003,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6658,4 +9010,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -6664,4 +9018,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -6670,5 +9026,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -6683,5 +9043,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6699,4 +9063,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -6709,4 +9077,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6714,4 +9084,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -6719,4 +9091,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -6724,4 +9098,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -6729,4 +9105,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="overshoot_limit_pt"></a><b>overshoot_limit_pt</b></p>
 
@@ -6735,4 +9113,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6740,4 +9120,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -6746,4 +9128,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -6752,5 +9136,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -6765,4 +9153,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -6775,5 +9167,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6786,4 +9182,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6791,4 +9189,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -6796,4 +9196,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -6801,4 +9203,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -6806,4 +9210,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="overshoot_limit_u"></a><b>overshoot_limit_u</b></p>
 
@@ -6812,4 +9218,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6817,4 +9225,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -6823,5 +9233,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
+
+
 
 
@@ -6837,4 +9251,6 @@
       
       
+      
+      
       <p>For further information see <a href="#overshoot_limit_e">overshoot_limit_e</a>.&nbsp;
       </p>
@@ -6843,5 +9259,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6854,4 +9274,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6859,4 +9281,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -6864,4 +9288,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -6869,4 +9295,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -6874,4 +9302,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="overshoot_limit_v"></a><b>overshoot_limit_v</b></p>
 
@@ -6880,4 +9310,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6885,4 +9317,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -6891,4 +9325,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -6897,5 +9333,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -6910,5 +9350,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6921,5 +9365,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6932,4 +9380,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6937,4 +9387,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -6942,4 +9394,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -6947,4 +9401,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -6952,4 +9408,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="overshoot_limit_w"></a><b>overshoot_limit_w</b></p>
 
@@ -6958,4 +9416,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -6963,4 +9423,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -6969,4 +9431,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -6975,5 +9439,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -6988,5 +9456,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -6999,5 +9471,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7010,4 +9486,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7015,4 +9493,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7020,4 +9500,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -7025,4 +9507,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -7030,4 +9514,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="passive_scalar"></a><b>passive_scalar</b></p>
 
@@ -7036,4 +9522,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7041,4 +9529,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -7047,4 +9537,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>.F.</i></td>
 
@@ -7053,5 +9545,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7065,4 +9561,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -7070,5 +9568,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7086,5 +9588,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7092,4 +9598,6 @@
       
       <p><b>Note:</b> <br>
+
+
 
 
@@ -7105,4 +9613,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7110,4 +9620,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7115,5 +9627,25 @@
 
 
- <tr><td><a name="pch_index"></a><span style="font-weight: bold;">pch_index</span></td><td>I</td><td><span style="font-style: italic;">0</span></td><td>Grid point index (scalar) of the upper boundary of the plant canopy layer.<br><br>Above <span style="font-weight: bold;">pch_index</span> the arrays of leaf area density and drag_coeffient are automatically set to zero in case of <a href="#plant_canopy">plant_canopy</a> = .T.. Up to <span style="font-weight: bold;">pch_index</span> a leaf area density profile can be prescribed by using the parameters <a href="#lad_surface">lad_surface</a>, <a href="#lad_vertical_gradient">lad_vertical_gradient</a> and <a href="#lad_vertical_gradient_level">lad_vertical_gradient_level</a>.</td></tr><tr>
+
+
+ <tr>
+
+      <td><a name="pch_index"></a><span style="font-weight: bold;">pch_index</span></td>
+
+      <td>I</td>
+
+      <td><span style="font-style: italic;">0</span></td>
+
+      <td>Grid point index (scalar) of the upper boundary of the plant canopy layer.<br>
+
+      <br>
+
+Above <span style="font-weight: bold;">pch_index</span> the arrays of leaf area density and drag_coeffient are automatically set to zero in case of <a href="#plant_canopy">plant_canopy</a> = .T.. Up to <span style="font-weight: bold;">pch_index</span> a leaf area density profile can be prescribed by using the parameters <a href="#lad_surface">lad_surface</a>, <a href="#lad_vertical_gradient">lad_vertical_gradient</a> and <a href="#lad_vertical_gradient_level">lad_vertical_gradient_level</a>.</td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+
 
 
@@ -7125,4 +9657,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="phi"></a><b>phi</b></p>
 
@@ -7131,4 +9665,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7136,4 +9672,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -7142,4 +9680,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>55.0</i></td>
 
@@ -7148,5 +9688,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7159,5 +9703,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7172,4 +9720,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7177,4 +9727,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7182,9 +9734,37 @@
 
 
- <tr><td><a name="plant_canopy"></a><span style="font-weight: bold;">plant_canopy</span></td><td>L</td><td><span style="font-style: italic;">.F.</span></td><td>Switch for the plant_canopy_model.<br><br>If <span style="font-weight: bold;">plant_canopy</span> is set <span style="font-style: italic;">.T.</span>, the plant canopy model of Watanabe (2004, BLM 112, 307-341) is used. <br>The
+
+
+ <tr>
+
+      <td><a name="plant_canopy"></a><span style="font-weight: bold;">plant_canopy</span></td>
+
+      <td>L</td>
+
+      <td><span style="font-style: italic;">.F.</span></td>
+
+      <td>Switch for the plant_canopy_model.<br>
+
+      <br>
+
+If <span style="font-weight: bold;">plant_canopy</span> is set <span style="font-style: italic;">.T.</span>, the plant canopy model of Watanabe (2004, BLM 112, 307-341) is used. <br>
+
+The
 impact of a plant canopy on a turbulent flow is considered by an
 additional drag term in the momentum equations and an additional sink
 term in the prognostic equation for the subgrid-scale TKE. These
-additional terms are dependent on the leaf drag coefficient (see <a href="#drag_coefficient">drag_coefficient</a>) and the leaf area density (see <a href="#lad_surface">lad_surface</a>, <a href="#lad_vertical_gradient">lad_vertical_gradient</a>, <a href="#lad_vertical_gradient_level">lad_vertical_gradient_level</a>). <br>By default, a horizontally homogeneous plant canopy is prescribed, if&nbsp; <span style="font-weight: bold;">plant_canopy</span> is set <span style="font-style: italic;">.T.</span>. However, the user can define other types of plant canopies (see <a href="#canopy_mode">canopy_mode</a>).<br><br><span style="font-weight: bold;">plant_canopy</span> = <span style="font-style: italic;">.T. </span>is only allowed together with a non-zero <a href="#drag_coefficient">drag_coefficient</a>.</td></tr><tr>
+additional terms are dependent on the leaf drag coefficient (see <a href="#drag_coefficient">drag_coefficient</a>) and the leaf area density (see <a href="#lad_surface">lad_surface</a>, <a href="#lad_vertical_gradient">lad_vertical_gradient</a>, <a href="#lad_vertical_gradient_level">lad_vertical_gradient_level</a>). <br>
+
+By default, a horizontally homogeneous plant canopy is prescribed, if&nbsp; <span style="font-weight: bold;">plant_canopy</span> is set <span style="font-style: italic;">.T.</span>. However, the user can define other types of plant canopies (see <a href="#canopy_mode">canopy_mode</a>).<br>
+
+      <br>
+
+      <span style="font-weight: bold;">plant_canopy</span> = <span style="font-style: italic;">.T. </span>is only allowed together with a non-zero <a href="#drag_coefficient">drag_coefficient</a>.</td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+
 
 
@@ -7196,4 +9776,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="prandtl_layer"></a><b>prandtl_layer</b></p>
 
@@ -7202,4 +9784,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7207,4 +9791,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -7213,4 +9799,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>.T.</i></td>
 
@@ -7219,5 +9807,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7230,5 +9822,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7249,5 +9845,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7267,4 +9867,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -7277,4 +9881,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7282,4 +9888,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7287,4 +9895,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -7292,4 +9902,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -7297,4 +9909,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="precipitation"></a><b>precipitation</b></p>
 
@@ -7303,4 +9917,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7308,4 +9924,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -7314,4 +9932,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">.F.</span></td>
 
@@ -7319,5 +9939,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7330,4 +9954,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -7335,5 +9961,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7351,4 +9981,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -7360,4 +9994,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7365,4 +10001,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7371,4 +10009,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -7376,4 +10016,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="pt_reference"></a><span style="font-weight: bold;">pt_reference</span></td>
 
@@ -7381,5 +10023,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
+
+
 
 
@@ -7392,4 +10038,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">Reference
 temperature to be used in all buoyancy terms (in K).<br>
@@ -7398,5 +10046,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -7410,4 +10062,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -7415,4 +10069,6 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
 
@@ -7420,4 +10076,6 @@
 
 
+
+
 In case of ocean runs (see <a href="chapter_4.1.html#ocean">ocean</a>), always a reference temperature is used in the buoyancy terms with a default value of <span style="font-weight: bold;">pt_reference</span> = <a href="#pt_surface">pt_surface</a>.</td>
 
@@ -7425,4 +10083,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -7430,4 +10090,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -7435,4 +10097,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -7440,4 +10104,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="pt_surface"></a><b>pt_surface</b></p>
 
@@ -7446,4 +10112,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7451,4 +10119,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -7457,4 +10127,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>300.0</i></td>
 
@@ -7463,5 +10135,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7474,5 +10150,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7491,4 +10171,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -7496,4 +10180,6 @@
       
       <p><span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
+
+
 
 
@@ -7509,4 +10195,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7514,4 +10202,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7519,4 +10209,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -7524,5 +10216,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7535,4 +10231,6 @@
 
 
+
+
  <b>_change</b></p>
 
@@ -7540,4 +10238,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7545,4 +10245,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -7550,4 +10252,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">0.0</span><br>
 
@@ -7555,4 +10259,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7561,5 +10267,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7574,5 +10284,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7588,4 +10302,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7593,4 +10309,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7598,4 +10316,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -7603,4 +10323,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -7608,4 +10330,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="pt_vertical_gradient"></a><b>pt_vertical_gradient</b></p>
 
@@ -7614,4 +10338,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7619,4 +10345,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R (10)</td>
 
@@ -7625,4 +10353,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>10 * 0.0</i></td>
 
@@ -7631,5 +10361,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7644,5 +10378,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7666,5 +10404,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7676,5 +10418,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7686,5 +10432,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -7698,4 +10448,6 @@
 
 
+
+
         <b>pt_vertical_gradient_level</b> = <i>500.0</i>,
         <i>1000.0</i>,</p>
@@ -7704,5 +10456,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7714,5 +10470,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7732,4 +10492,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -7737,4 +10501,6 @@
       
       <p><span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
+
+
 
 
@@ -7749,4 +10515,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7754,4 +10522,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7759,4 +10529,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -7764,5 +10536,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7775,4 +10551,6 @@
 
 
+
+
  <b>_level</b></p>
 
@@ -7780,4 +10558,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7785,4 +10565,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R (10)</td>
 
@@ -7790,5 +10572,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7802,4 +10588,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -7807,4 +10595,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7812,5 +10602,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
+      
+      
       
       
@@ -7824,5 +10618,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7838,5 +10636,9 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
+
+
 
 
@@ -7849,4 +10651,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7854,4 +10658,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -7859,4 +10665,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -7864,4 +10672,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="q_surface"></a><b>q_surface</b></p>
 
@@ -7870,4 +10680,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7875,4 +10687,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -7881,4 +10695,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -7887,5 +10703,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7898,5 +10718,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7915,4 +10739,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -7920,4 +10746,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -7925,4 +10753,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -7930,5 +10760,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7941,4 +10775,6 @@
 
 
+
+
  <b>_change</b></p>
 
@@ -7946,4 +10782,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7951,4 +10789,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R<br>
 
@@ -7956,4 +10796,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -7961,4 +10803,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -7967,5 +10811,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -7980,5 +10828,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -7995,4 +10847,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8000,4 +10854,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -8005,4 +10861,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -8010,4 +10868,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8015,4 +10875,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="q_vertical_gradient"></a><b>q_vertical_gradient</b></p>
 
@@ -8021,4 +10883,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8026,4 +10890,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R (10)</td>
 
@@ -8032,4 +10898,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>10 * 0.0</i></td>
 
@@ -8038,5 +10906,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8050,5 +10922,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8073,4 +10949,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -8082,5 +10962,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8092,5 +10976,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -8104,4 +10992,6 @@
 
 
+
+
         <b>q_vertical_gradient_level</b> = <i>500.0</i>,
         <i>1000.0</i>,</p>
@@ -8110,5 +11000,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8116,4 +11010,6 @@
       
       </ul>
+
+
 
 
@@ -8135,4 +11031,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -8140,4 +11038,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -8145,5 +11045,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8156,4 +11060,6 @@
 
 
+
+
  <b>_level</b></p>
 
@@ -8161,4 +11067,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -8166,4 +11074,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R (10)</td>
 
@@ -8171,5 +11081,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8182,4 +11096,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -8187,5 +11103,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8199,5 +11119,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8215,4 +11139,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8220,4 +11146,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -8225,4 +11153,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -8230,4 +11160,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8235,4 +11167,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="radiation"></a><b>radiation</b></p>
 
@@ -8241,4 +11175,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8246,4 +11182,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -8252,4 +11190,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>.F.</i></td>
 
@@ -8258,5 +11198,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8270,5 +11214,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8285,4 +11233,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -8290,4 +11240,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -8295,4 +11247,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -8300,4 +11254,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8305,4 +11261,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="random_generator"></a><b>random_generator</b></p>
 
@@ -8311,4 +11269,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8316,4 +11276,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -8322,4 +11284,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8327,4 +11291,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><i>'numerical</i><br>
 
@@ -8333,4 +11299,6 @@
 
 
+
+
       <i>recipes'</i></p>
 
@@ -8338,4 +11306,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -8343,5 +11313,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8355,4 +11329,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -8360,5 +11336,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8377,5 +11357,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -8393,4 +11377,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -8398,5 +11384,9 @@
 
 
+
+
  <span style="font-weight: bold;">Note:</span><br>
+
+
 
 
@@ -8410,4 +11400,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -8416,4 +11408,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -8421,4 +11415,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8426,4 +11422,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="random_heatflux"></a><b>random_heatflux</b></p>
 
@@ -8432,4 +11430,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8437,4 +11437,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -8443,4 +11445,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>.F.</i></td>
 
@@ -8449,5 +11453,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8462,5 +11470,9 @@
 
 
+
+
  </p>
+
+
 
 
@@ -8483,5 +11495,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -8501,4 +11517,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -8506,4 +11524,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -8511,4 +11531,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8516,4 +11538,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="rif_max"></a><b>rif_max</b></p>
 
@@ -8522,4 +11546,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8527,4 +11553,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -8533,4 +11561,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>1.0</i></td>
 
@@ -8539,5 +11569,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8550,5 +11584,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8573,4 +11611,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -8578,4 +11618,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -8583,4 +11625,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -8588,4 +11632,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8593,4 +11639,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="rif_min"></a><b>rif_min</b></p>
 
@@ -8599,4 +11647,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8604,4 +11654,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -8610,4 +11662,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>- 5.0</i></td>
 
@@ -8616,5 +11670,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8627,5 +11685,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8640,4 +11702,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -8645,4 +11709,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -8650,4 +11716,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -8655,4 +11723,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8660,4 +11730,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="roughness_length"></a><b>roughness_length</b></p>
 
@@ -8666,4 +11738,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8671,4 +11745,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -8677,4 +11753,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.1</i></td>
 
@@ -8683,5 +11761,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -8694,5 +11776,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8708,4 +11794,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8713,4 +11801,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -8718,4 +11808,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -8723,4 +11815,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="sa_surface"></a><span style="font-weight: bold;">sa_surface</span></td>
 
@@ -8728,4 +11822,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -8733,4 +11829,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">35.0</span></td>
 
@@ -8738,4 +11836,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8743,4 +11843,6 @@
       
       
+      
+      
       <p>Surface salinity (in psu).&nbsp;</p>
 
@@ -8748,5 +11850,9 @@
 
 
+
+
 This parameter only comes into effect for ocean runs (see parameter <a href="chapter_4.1.html#ocean">ocean</a>).
+      
+      
       
       
@@ -8763,4 +11869,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8768,4 +11876,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -8773,4 +11883,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -8778,4 +11890,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="sa_vertical_gradient"></a><span style="font-weight: bold;">sa_vertical_gradient</span></td>
 
@@ -8783,4 +11897,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R(10)</td>
 
@@ -8788,4 +11904,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">10 * 0.0</span></td>
 
@@ -8793,5 +11911,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">
+      
+      
       
       
@@ -8804,5 +11926,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8814,4 +11940,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -8834,5 +11964,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8844,5 +11978,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8854,4 +11992,8 @@
 
 
+
+
+        
+        
         
         
@@ -8865,4 +12007,6 @@
 
 
+
+
         <b>sa_vertical_gradient_level</b> = <i>-500.0</i>,
 -<i>1000.0</i>,</p>
@@ -8871,4 +12015,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -8880,5 +12028,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8896,4 +12048,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8901,4 +12055,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -8906,4 +12062,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -8911,4 +12069,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="sa_vertical_gradient_level"></a><span style="font-weight: bold;">sa_vertical_gradient_level</span></td>
 
@@ -8916,4 +12076,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R(10)</td>
 
@@ -8921,4 +12083,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">10 * 0.0</span></td>
 
@@ -8926,5 +12090,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">
+      
+      
       
       
@@ -8937,5 +12105,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -8947,4 +12119,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -8960,4 +12136,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8965,4 +12143,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -8970,4 +12150,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -8975,4 +12157,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -8980,4 +12164,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="scalar_advec"></a><b>scalar_advec</b></p>
 
@@ -8986,4 +12172,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -8991,4 +12179,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 10</td>
 
@@ -8997,4 +12187,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>'pw-scheme'</i></td>
 
@@ -9003,5 +12195,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -9014,5 +12210,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9025,4 +12225,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -9030,5 +12232,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9041,4 +12247,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -9046,5 +12254,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9055,4 +12267,6 @@
 Williams (1970, J. Comp. Phys., 6,
 392-405) with central differences in the form C3 is used.<br>
+
+
 
 
@@ -9069,4 +12283,6 @@
 
 
+
+
  </div>
 
@@ -9074,4 +12290,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -9079,5 +12297,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9090,4 +12312,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -9095,5 +12319,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9124,5 +12352,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -9137,4 +12369,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -9143,4 +12377,6 @@
 
 
+
+
       </div>
 
@@ -9148,4 +12384,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">'ups-scheme'</span><br>
 
@@ -9154,4 +12392,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -9179,5 +12421,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9198,5 +12444,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9213,4 +12463,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -9218,5 +12470,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9236,5 +12492,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -9249,4 +12509,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -9254,6 +12516,30 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
+      <td><a name="scalar_exchange_coefficient"></a><b>scalar_exchange_coefficient</b></td>
+
+      <td>R</td>
+
+      <td><span style="font-style: italic;">0.0</span></td>
+
+      <td>Scalar exchange coefficient for a leaf (dimensionless).<br>
+
+
+      <br>
+
+
+This parameter is only of importance in cases in that both, <a href="../../../../../DEVELOPER_VERSION/chapter_4.1_adjusted.html#plant_canopy">plant_canopy</a> and <a href="../../../../../DEVELOPER_VERSION/chapter_4.1_adjusted.html#passive_scalar">passive_scalar</a>, are set <span style="font-style: italic;">.T.</span>.
+The value of the scalar exchange coefficient is required for the parametrisation of the sources and sinks of
+scalar concentration due to the canopy.</td>
+
+    </tr>
+
+    <tr>
+
+
+
 
 
@@ -9264,4 +12550,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="statistic_regions"></a><b>statistic_regions</b></p>
 
@@ -9270,4 +12558,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9275,4 +12565,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">I</td>
 
@@ -9281,4 +12573,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0</i></td>
 
@@ -9287,5 +12581,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -9301,5 +12599,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9324,4 +12626,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -9342,4 +12648,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -9364,4 +12674,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -9369,4 +12681,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -9374,4 +12688,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -9379,4 +12695,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -9384,4 +12702,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="surface_heatflux"></a><b>surface_heatflux</b></p>
 
@@ -9390,4 +12710,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9395,4 +12717,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -9401,4 +12725,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">no prescribed<br>
 
@@ -9407,4 +12733,6 @@
 
 
+
+
 heatflux<br>
 
@@ -9412,4 +12740,6 @@
 
 
+
+
  </span></td>
 
@@ -9417,5 +12747,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -9428,5 +12762,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9453,4 +12791,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -9472,5 +12814,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9490,4 +12836,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -9501,4 +12851,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9506,4 +12858,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -9511,4 +12865,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -9516,4 +12872,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -9521,4 +12879,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="surface_pressure"></a><b>surface_pressure</b></p>
 
@@ -9527,4 +12887,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9532,4 +12894,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -9538,4 +12902,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>1013.25</i></td>
 
@@ -9544,5 +12910,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -9551,4 +12921,6 @@
       <p>Atmospheric
 pressure at the surface (in hPa).&nbsp; </p>
+
+
 
 
@@ -9567,4 +12939,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -9572,4 +12946,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -9577,4 +12953,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -9582,4 +12960,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="surface_scalarflux"></a><b>surface_scalarflux</b></p>
 
@@ -9588,4 +12968,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9593,4 +12975,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -9599,4 +12983,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -9605,5 +12991,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -9617,4 +13007,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -9636,4 +13030,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -9641,5 +13037,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9660,4 +13060,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9665,4 +13067,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -9670,4 +13074,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -9675,4 +13081,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -9680,4 +13088,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="surface_waterflux"></a><b>surface_waterflux</b></p>
 
@@ -9686,4 +13096,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9691,4 +13103,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -9697,4 +13111,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -9703,5 +13119,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -9714,5 +13134,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9735,4 +13159,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -9740,5 +13166,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9758,4 +13188,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9763,4 +13195,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -9768,4 +13202,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -9773,4 +13209,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -9778,4 +13216,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="s_surface"></a><b>s_surface</b></p>
 
@@ -9784,4 +13224,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9789,4 +13231,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -9795,4 +13239,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -9801,5 +13247,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -9813,5 +13263,9 @@
 
 
+
+
       </p>
+
+
 
 
@@ -9828,4 +13282,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -9833,4 +13289,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -9838,5 +13296,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
+      
+      
       
       
@@ -9849,4 +13311,6 @@
 
 
+
+
  <b>_change</b></p>
 
@@ -9854,4 +13318,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -9859,4 +13325,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -9864,4 +13332,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -9870,5 +13340,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -9883,4 +13357,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -9897,4 +13375,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9902,4 +13382,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -9907,4 +13389,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -9912,4 +13396,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -9917,4 +13403,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="s_vertical_gradient"></a><b>s_vertical_gradient</b></p>
 
@@ -9923,4 +13411,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -9928,4 +13418,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R (10)</td>
 
@@ -9934,4 +13426,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>10 * 0</i><i>.0</i></td>
 
@@ -9940,5 +13434,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -9953,5 +13451,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -9975,4 +13477,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -9981,4 +13485,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -9990,5 +13498,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10000,5 +13512,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+        
+        
         
         
@@ -10012,4 +13528,6 @@
 
 
+
+
         <b>s_vertical_gradient_level</b> = <i>500.0</i>,
         <i>1000.0</i>,</p>
@@ -10018,5 +13536,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10028,5 +13550,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10048,4 +13574,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -10053,4 +13581,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -10058,4 +13588,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -10063,5 +13595,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -10074,4 +13610,6 @@
 
 
+
+
  <b>level</b></p>
 
@@ -10079,4 +13617,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -10084,4 +13624,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R (10)</td>
 
@@ -10089,5 +13631,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -10100,4 +13646,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -10105,5 +13653,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -10117,5 +13669,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10134,4 +13690,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -10139,4 +13697,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -10144,4 +13704,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -10149,4 +13711,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -10154,4 +13718,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="timestep_scheme"></a><b>timestep_scheme</b></p>
 
@@ -10160,4 +13726,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -10165,4 +13733,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">C * 20</td>
 
@@ -10171,4 +13741,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -10176,4 +13748,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><i>'runge</i><br>
 
@@ -10182,4 +13756,6 @@
 
 
+
+
       <i>kutta-3'</i></p>
 
@@ -10187,4 +13763,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -10192,5 +13770,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -10204,5 +13786,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10215,4 +13801,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -10220,5 +13808,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10231,4 +13823,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -10236,5 +13830,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10243,4 +13841,6 @@
       <div style="margin-left: 40px;">Third order
 Runge-Kutta scheme.<br>
+
+
 
 
@@ -10257,4 +13857,6 @@
 
 
+
+
  </div>
 
@@ -10262,5 +13864,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10273,4 +13879,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -10278,5 +13886,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10290,4 +13902,6 @@
 
 
+
+
 For special features see <b>timestep_scheme</b> = '<i>runge-kutta-3'</i>.<br>
 
@@ -10296,4 +13910,6 @@
 
 
+
+
       </div>
 
@@ -10301,4 +13917,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -10306,4 +13924,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;"><span style="font-style: italic;">'leapfrog'</span><br>
 
@@ -10312,4 +13932,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -10317,5 +13939,9 @@
 
 
+
+
  </span> 
+      
+      
       
       
@@ -10324,4 +13950,6 @@
       <div style="margin-left: 40px;">Second
 order leapfrog scheme.<br>
+
+
 
 
@@ -10344,4 +13972,6 @@
 
 
+
+
 The leapfrog scheme must not be used together with the upstream-spline
 scheme for calculating the advection (see <a href="#scalar_advec">scalar_advec</a>
@@ -10352,4 +13982,6 @@
 
 
+
+
  </div>
 
@@ -10357,4 +13989,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -10363,4 +13997,6 @@
 
 
+
+
       <span style="font-style: italic;">'</span><span style="font-style: italic;"><span style="font-style: italic;">leapfrog+euler'</span><br>
 
@@ -10369,4 +14005,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -10374,5 +14012,9 @@
 
 
+
+
  </span> 
+      
+      
       
       
@@ -10391,4 +14033,6 @@
 
 
+
+
       </div>
 
@@ -10396,4 +14040,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -10401,4 +14047,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-style: italic;">'euler'</span><br>
 
@@ -10407,4 +14055,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -10412,5 +14062,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10419,4 +14073,6 @@
       <div style="margin-left: 40px;">First order
 Euler scheme.&nbsp; <br>
+
+
 
 
@@ -10434,4 +14090,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -10439,5 +14097,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -10451,4 +14113,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -10456,4 +14120,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -10461,4 +14127,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -10466,4 +14134,6 @@
 
 
+
+
  <td style="text-align: left; vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="topography"></a></span><span style="font-weight: bold;">topography</span></td>
 
@@ -10472,4 +14142,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">C * 40</td>
 
@@ -10477,4 +14149,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">'flat'</span></td>
 
@@ -10482,4 +14156,6 @@
 
 
+
+
  <td>
       
@@ -10487,4 +14163,6 @@
       
       
+      
+      
       <p>Topography mode.&nbsp; </p>
 
@@ -10492,5 +14170,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10503,4 +14185,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -10508,5 +14192,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10518,4 +14206,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -10524,4 +14214,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10533,5 +14227,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10544,4 +14242,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -10549,5 +14249,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10561,5 +14265,11 @@
 
 
-The building size and location can be specified with the parameters <a href="#building_height">building_height</a>, <a href="#building_length_x">building_length_x</a>, <a href="#building_length_y">building_length_y</a>, <a href="#building_wall_left">building_wall_left</a> and <a href="#building_wall_south">building_wall_south</a>.<br><font color="#000000">Due to the staggered grid the building will be displaced by -0.5 <a href="chapter_4.1.html#dx">dx</a> in x-direction and -0.5 <a href="chapter_4.1.html#dy">dy</a> in y-direction.</font></div>
+
+
+The building size and location can be specified with the parameters <a href="#building_height">building_height</a>, <a href="#building_length_x">building_length_x</a>, <a href="#building_length_y">building_length_y</a>, <a href="#building_wall_left">building_wall_left</a> and <a href="#building_wall_south">building_wall_south</a>.<br>
+
+      <font color="#000000">Due to the staggered grid the building will be displaced by -0.5 <a href="chapter_4.1.html#dx">dx</a> in x-direction and -0.5 <a href="chapter_4.1.html#dy">dy</a> in y-direction.</font></div>
+
+
 
 
@@ -10572,4 +14282,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><span style="font-style: italic;">'read_from_file'</span><br>
 
@@ -10578,4 +14290,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -10583,5 +14297,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -10590,4 +14308,6 @@
       <div style="margin-left: 40px;">Flow around
 arbitrary topography.<br>
+
+
 
 
@@ -10598,5 +14318,9 @@
 information</font></font><font color="#000000">
 in m. These data&nbsp;<span style="font-style: italic;"></span>must
-exactly match the horizontal grid.<br>Due to the staggered grid the topography will be displaced by -0.5 <a href="#dx">dx</a> in x-direction and -0.5 <a href="#dy">dy</a> in y-direction.</font> </div>
+exactly match the horizontal grid.<br>
+
+Due to the staggered grid the topography will be displaced by -0.5 <a href="#dx">dx</a> in x-direction and -0.5 <a href="#dy">dy</a> in y-direction.</font> </div>
+
+
 
 
@@ -10604,4 +14328,6 @@
 
  <span style="font-style: italic;"><br>
+
+
 
 
@@ -10610,5 +14336,7 @@
  </span><font color="#000000">
 Alternatively, the user may add code to the user interface subroutine <a href="chapter_3.5.1.html#user_init_grid">user_init_grid</a>
-to allow further topography modes. Again, </font><font color="#000000">due to the staggered grid the topography will be displaced by -0.5 <a href="chapter_4.1.html#dx">dx</a> in x-direction and -0.5 <a href="chapter_4.1.html#dy">dy</a> in y-direction.</font><br><font color="#000000">
+to allow further topography modes. Again, </font><font color="#000000">due to the staggered grid the topography will be displaced by -0.5 <a href="chapter_4.1.html#dx">dx</a> in x-direction and -0.5 <a href="chapter_4.1.html#dy">dy</a> in y-direction.</font><br>
+
+      <font color="#000000">
 
 
@@ -10616,4 +14344,6 @@
 
  <br>
+
+
 
 
@@ -10634,5 +14364,9 @@
 
 
+
+
       <font color="#000000"><br>
+
+
 
 
@@ -10647,4 +14381,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -10652,4 +14388,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -10657,4 +14395,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="top_heatflux"></a><span style="font-weight: bold;">top_heatflux</span></td>
 
@@ -10662,4 +14402,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -10667,4 +14409,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">no prescribed<br>
 
@@ -10673,4 +14417,6 @@
 
 
+
+
 heatflux</span></td>
 
@@ -10678,5 +14424,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">
+      
+      
       
       
@@ -10690,4 +14440,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10707,4 +14461,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10712,4 +14470,6 @@
       
       <p><span style="font-weight: bold;">Note:</span><br>
+
+
 
 
@@ -10724,4 +14484,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10734,4 +14498,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10745,4 +14513,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -10750,4 +14520,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -10755,4 +14527,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -10760,4 +14534,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="top_momentumflux_u"></a><span style="font-weight: bold;">top_momentumflux_u</span></td>
 
@@ -10765,4 +14541,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -10770,4 +14548,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">no prescribed momentumflux</span></td>
 
@@ -10775,4 +14555,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">Momentum flux along x at the top boundary (in m2/s2).<br>
 
@@ -10780,4 +14562,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10792,4 +14578,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10797,4 +14587,6 @@
       
       <p><span style="font-weight: bold;">Notes:</span><br>
+
+
 
 
@@ -10809,4 +14601,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10822,5 +14618,9 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;"></span>
+      
+      
       
       
@@ -10833,4 +14633,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10842,4 +14646,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -10847,4 +14653,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -10852,4 +14660,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -10857,4 +14667,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="top_momentumflux_v"></a><span style="font-weight: bold;">top_momentumflux_v</span></td>
 
@@ -10862,4 +14674,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -10867,4 +14681,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">no prescribed momentumflux</span></td>
 
@@ -10872,4 +14688,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">Momentum flux along y at the top boundary (in m2/s2).<br>
 
@@ -10877,4 +14695,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10889,4 +14711,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10894,4 +14720,6 @@
       
       <p><span style="font-weight: bold;">Notes:</span><br>
+
+
 
 
@@ -10906,4 +14734,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10919,5 +14751,9 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;"></span>
+      
+      
       
       
@@ -10930,4 +14766,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10939,4 +14779,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -10944,4 +14786,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -10949,4 +14793,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -10954,4 +14800,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="top_salinityflux"></a><span style="font-weight: bold;">top_salinityflux</span></td>
 
@@ -10959,4 +14807,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -10964,4 +14814,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">no prescribed<br>
 
@@ -10970,4 +14822,6 @@
 
 
+
+
 salinityflux</span></td>
 
@@ -10975,5 +14829,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">
+      
+      
       
       
@@ -10987,4 +14845,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -10996,4 +14858,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11012,4 +14878,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11017,4 +14887,6 @@
       
       <p><span style="font-weight: bold;">Note:</span><br>
+
+
 
 
@@ -11029,4 +14901,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11039,4 +14915,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11044,4 +14922,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -11049,4 +14929,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -11054,4 +14936,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -11059,4 +14943,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="ug_surface"></a><span style="font-weight: bold;">ug_surface</span></p>
 
@@ -11065,4 +14951,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11070,4 +14958,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R<br>
 
@@ -11075,4 +14965,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -11081,4 +14973,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">0.0</span><br>
 
@@ -11086,5 +14980,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -11099,5 +14997,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -11108,4 +15010,6 @@
 wind (ug) at the surface (k=0). Starting from this value, the initial
 vertical profile of the <br>
+
+
 
 
@@ -11130,4 +15034,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -11135,5 +15041,9 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
+
+
 
 
@@ -11148,4 +15058,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -11153,4 +15065,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -11159,4 +15073,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -11164,4 +15080,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -11169,4 +15087,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="ug_vertical_gradient"></a><span style="font-weight: bold;">ug_vertical_gradient</span></p>
 
@@ -11175,4 +15095,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11180,4 +15102,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R(10)<br>
 
@@ -11186,5 +15110,9 @@
 
 
+
+
       </td>
+
+
 
 
@@ -11197,5 +15125,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -11209,5 +15141,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -11228,4 +15164,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -11233,5 +15171,9 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
+
+
 
 
@@ -11246,4 +15188,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -11252,4 +15196,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -11257,4 +15203,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -11262,4 +15210,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -11267,4 +15217,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="ug_vertical_gradient_level"></a><span style="font-weight: bold;">ug_vertical_gradient_level</span></p>
 
@@ -11273,4 +15225,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11278,4 +15232,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R(10)<br>
 
@@ -11284,5 +15240,9 @@
 
 
+
+
       </td>
+
+
 
 
@@ -11295,5 +15255,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -11307,5 +15271,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -11320,4 +15288,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -11325,4 +15295,6 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
 
@@ -11330,4 +15302,6 @@
 
 
+
+
 In case of ocean runs&nbsp;(see <a href="chapter_4.1.html#ocean">ocean</a>), the (negative) height levels have to be assigned in descending order.</td>
 
@@ -11335,4 +15309,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -11340,4 +15316,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -11345,4 +15323,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -11350,4 +15330,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="ups_limit_e"></a><b>ups_limit_e</b></p>
 
@@ -11356,4 +15338,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11361,4 +15345,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -11367,4 +15353,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -11373,5 +15361,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -11387,5 +15379,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -11401,4 +15397,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11411,4 +15411,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -11416,4 +15418,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -11421,4 +15425,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -11426,4 +15432,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -11431,4 +15439,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="ups_limit_pt"></a><b>ups_limit_pt</b></p>
 
@@ -11437,4 +15447,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11442,4 +15454,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -11448,4 +15462,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -11454,5 +15470,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -11468,5 +15488,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -11476,4 +15500,6 @@
 upstream-spline scheme is
 switched on (see <a href="#scalar_advec">scalar_advec</a>).<br>
+
+
 
 
@@ -11498,4 +15524,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -11503,5 +15531,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -11524,4 +15556,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11534,5 +15570,9 @@
 
 
+
+
       </p>
+
+
 
 
@@ -11547,4 +15587,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -11552,4 +15594,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -11557,4 +15601,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -11562,4 +15608,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="ups_limit_u"></a><b>ups_limit_u</b></p>
 
@@ -11568,4 +15616,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11573,4 +15623,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -11579,4 +15631,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -11585,5 +15639,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -11599,4 +15657,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11612,5 +15674,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -11623,4 +15689,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11628,4 +15696,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -11633,4 +15703,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -11638,4 +15710,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -11643,4 +15717,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="ups_limit_v"></a><b>ups_limit_v</b></p>
 
@@ -11649,4 +15725,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11654,4 +15732,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -11660,4 +15740,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -11666,5 +15748,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -11680,4 +15766,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11693,5 +15783,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -11704,4 +15798,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11709,4 +15805,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -11714,4 +15812,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -11719,4 +15819,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -11724,4 +15826,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="ups_limit_w"></a><b>ups_limit_w</b></p>
 
@@ -11730,4 +15834,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11735,4 +15841,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R</td>
 
@@ -11741,4 +15849,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>0.0</i></td>
 
@@ -11747,5 +15857,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -11761,4 +15875,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11774,5 +15892,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -11785,4 +15907,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11790,4 +15914,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -11795,4 +15921,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -11800,4 +15928,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -11805,4 +15935,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="use_surface_fluxes"></a><b>use_surface_fluxes</b></p>
 
@@ -11811,4 +15943,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11816,4 +15950,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -11822,4 +15958,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>.F.</i></td>
 
@@ -11828,5 +15966,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -11840,4 +15982,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -11846,4 +15990,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11868,4 +16016,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -11874,4 +16024,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11886,5 +16040,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -11904,4 +16062,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11909,4 +16069,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -11914,4 +16076,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -11919,4 +16083,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><a name="use_top_fluxes"></a><span style="font-weight: bold;">use_top_fluxes</span></td>
 
@@ -11924,4 +16090,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -11929,4 +16097,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">.F.</span></td>
 
@@ -11934,5 +16104,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -11946,4 +16120,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11960,4 +16138,8 @@
 
 
+
+
+      
+      
       
       
@@ -11970,4 +16152,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -11975,4 +16159,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -11980,4 +16166,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -11986,4 +16174,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -11991,4 +16181,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="use_ug_for_galilei_tr"></a><b>use_ug_for_galilei_tr</b></p>
 
@@ -11997,4 +16189,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -12002,4 +16196,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -12008,4 +16204,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>.T.</i></td>
 
@@ -12014,5 +16212,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -12026,4 +16228,6 @@
 
 
+
+
  </p>
 
@@ -12031,5 +16235,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -12046,4 +16254,6 @@
 
 
+
+
       </p>
 
@@ -12051,5 +16261,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -12067,4 +16281,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -12072,4 +16288,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -12077,4 +16295,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -12082,4 +16302,6 @@
 
 
+
+
       <td align="left" valign="top"><a name="use_upstream_for_tke"></a><span style="font-weight: bold;">use_upstream_for_tke</span></td>
 
@@ -12087,4 +16309,6 @@
 
 
+
+
       <td align="left" valign="top">L</td>
 
@@ -12092,5 +16316,9 @@
 
 
+
+
       <td align="left" valign="top"><span style="font-style: italic;">.F.</span></td>
+
+
 
 
@@ -12103,5 +16331,9 @@
 
 
+
+
       <br>
+
+
 
 
@@ -12123,4 +16355,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -12128,4 +16362,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -12134,4 +16370,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -12139,4 +16377,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="vg_surface"></a><span style="font-weight: bold;">vg_surface</span></p>
 
@@ -12145,4 +16385,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -12150,4 +16392,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R<br>
 
@@ -12155,4 +16399,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -12161,4 +16407,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">0.0</span><br>
 
@@ -12166,5 +16414,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -12179,5 +16431,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -12188,4 +16444,6 @@
 wind (vg) at the surface (k=0). Starting from this value, the initial
 vertical profile of the <br>
+
+
 
 
@@ -12215,4 +16473,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -12220,5 +16480,9 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
+
+
 
 
@@ -12233,4 +16497,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -12238,4 +16504,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -12243,4 +16511,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"> 
       
@@ -12248,4 +16518,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="vg_vertical_gradient"></a><span style="font-weight: bold;">vg_vertical_gradient</span></p>
 
@@ -12254,4 +16526,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -12259,4 +16533,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R(10)<br>
 
@@ -12265,5 +16541,9 @@
 
 
+
+
       </td>
+
+
 
 
@@ -12276,5 +16556,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -12288,5 +16572,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -12311,4 +16599,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -12316,5 +16606,9 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
+
+
 
 
@@ -12330,4 +16624,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -12335,4 +16631,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -12340,4 +16638,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -12345,4 +16645,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="vg_vertical_gradient_level"></a><span style="font-weight: bold;">vg_vertical_gradient_level</span></p>
 
@@ -12351,4 +16653,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -12356,4 +16660,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">R(10)<br>
 
@@ -12362,5 +16668,9 @@
 
 
+
+
       </td>
+
+
 
 
@@ -12373,5 +16683,9 @@
 
 
+
+
  </td>
+
+
 
 
@@ -12385,5 +16699,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -12398,4 +16716,6 @@
 
 
+
+
       <br>
 
@@ -12403,4 +16723,6 @@
 
 
+
+
       <span style="font-weight: bold;">Attention:</span><br>
 
@@ -12408,4 +16730,6 @@
 
 
+
+
 In case of ocean runs&nbsp;(see <a href="chapter_4.1.html#ocean">ocean</a>), the (negative) height levels have to be assigned in descending order.</td>
 
@@ -12414,4 +16738,6 @@
 
 
+
+
     </tr>
 
@@ -12419,4 +16745,6 @@
 
 
+
+
  <tr>
 
@@ -12424,4 +16752,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">
       
@@ -12429,4 +16759,6 @@
       
       
+      
+      
       <p><a name="wall_adjustment"></a><b>wall_adjustment</b></p>
 
@@ -12435,4 +16767,6 @@
 
 
+
+
       </td>
 
@@ -12440,4 +16774,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;">L</td>
 
@@ -12446,4 +16782,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"><i>.T.</i></td>
 
@@ -12452,5 +16790,9 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;"> 
+      
+      
       
       
@@ -12465,5 +16807,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -12475,4 +16821,8 @@
 typically affects only the
 first grid points above the bottom boundary.</p>
+
+
+      
+      
       <p>In case of&nbsp; a non-flat <a href="chapter_4.1.html#topography">topography</a> the respective horizontal distance from vertical walls is used.</p>
 
@@ -12480,4 +16830,6 @@
 
 
+
+
  </td>
 
@@ -12485,4 +16837,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -12491,4 +16845,6 @@
 
 
+
+
     <tr>
 
@@ -12496,4 +16852,6 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-weight: bold;"><a name="wall_heatflux"></a>wall_heatflux</span></td>
 
@@ -12502,4 +16860,6 @@
 
 
+
+
       <td style="vertical-align: top;">R(5)</td>
 
@@ -12507,5 +16867,9 @@
 
 
+
+
  <td style="vertical-align: top;"><span style="font-style: italic;">5 * 0.0</span></td>
+
+
 
 
@@ -12519,4 +16883,6 @@
 
 
+
+
  <br>
 
@@ -12524,5 +16890,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+      
+      
       
       
@@ -12535,4 +16905,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-weight: bold;">wall_heatflux(1)&nbsp;&nbsp;&nbsp;
       </span>left face<br>
@@ -12541,4 +16913,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-weight: bold;">wall_heatflux(2)&nbsp;&nbsp;&nbsp;
       </span>right face<br>
@@ -12547,4 +16921,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-weight: bold;">wall_heatflux(3)&nbsp;&nbsp;&nbsp;
       </span>south face<br>
@@ -12553,4 +16929,6 @@
 
 
+
+
  <span style="font-weight: bold;">wall_heatflux(4)&nbsp;&nbsp;&nbsp;
       </span>north face</div>
@@ -12559,5 +16937,9 @@
 
 
+
+
  <br>
+
+
 
 
@@ -12577,4 +16959,6 @@
 
 
+
+
  </tr>
 
@@ -12582,5 +16966,9 @@
 
 
- 
+
+
+ 
+  
+  
   
   
@@ -12593,4 +16981,6 @@
 
 
+
+
 <br>
 
@@ -12599,4 +16989,6 @@
 
 
+
+
 <p style="line-height: 100%;"><br>
 
@@ -12604,5 +16996,9 @@
 
 
+
+
 <font color="#000080"><font color="#000080"><a href="chapter_4.0.html"><font color="#000080"><img name="Grafik1" src="left.gif" align="bottom" border="2" height="32" width="32"></font></a><a href="index.html"><font color="#000080"><img name="Grafik2" src="up.gif" align="bottom" border="2" height="32" width="32"></font></a><a href="chapter_4.2.html"><font color="#000080"><img name="Grafik3" src="right.gif" align="bottom" border="2" height="32" width="32"></font></a></font></font></p>
+
+
 
 
@@ -12617,4 +17013,6 @@
 
 
+
+
 <br>
 
@@ -12622,4 +17020,6 @@
 
 
+
+
 <br>
 
@@ -12628,3 +17028,6 @@
 
 
-</body></html>
+
+
+</body>
+</html>
