source: palm/trunk/UTIL/combine_plot_fields.f90 @ 424

Last change on this file since 424 was 226, checked in by raasch, 15 years ago

preparations for the next release

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 26.6 KB
Line 
1 PROGRAM combine_plot_fields
2
3!------------------------------------------------------------------------------!
4! Actual revisions:
5! -----------------
6!
7!
8! Former revisions:
9! -----------------
10! $Id: combine_plot_fields.f90 226 2009-02-02 07:39:34Z raasch $
11!
12! 210 2008-11-06 08:54:02Z raasch
13! Size of pf3d adjusted to the required output size (1 gridpoint less, along
14! all three dimensions), because output of a subset of the data
15! (pf3d(nxa:nxe...) in the NF90_PUT_VAR statement caused segmentation fault
16! with the INTEL compiler.
17! Subdomain data are read into temporary arrays pf_tmp/pf3d_tmp in order to
18! avoid INTEL compiler warnings about (automatic) creation of temporary arrays
19! Bugfix: three misplaced #endif directives
20!
21! 114 2007-10-10 00:03:15Z raasch
22! Bugfix: model_string needed a default value
23!
24! Aug 07    Loop for processing of output by coupled runs, id_string does not
25!           contain modus any longer
26!
27! 18/01/06  Output of time-averaged data
28!
29! 25/05/05  Errors removed
30!
31! 26/04/05  Output in NetCDF format, iso2d and avs output only if parameter
32!           file exists
33!
34! 31/10/01  All comments and messages translated into English
35!
36! 23/02/99  Keine Bearbeitung komprimierter 3D-Daten
37! Ursprungsversion vom 28/07/97
38!
39!
40! Description:
41! ------------
42! This routine combines data of the PALM-subdomains into one file. In PALM
43! every processor element opens its own file and writes 2D- or 3D-binary-data
44! into it (different files are opened for xy-, xz-, yz-cross-sections and
45! 3D-data). For plotting or analyzing these PE-data have to be collected and
46! to be put into single files, which is done by this routine.
47! Output format is NetCDF. Additionally, a data are output in a binary format
48! readable by ISO2D-software (cross-sections) and by AVS (3D-data).
49!
50! This routine must be compiled with:
51! decalpha:
52!    f95 -cpp -D__netcdf -fast -r8 -I/usr/local/netcdf-3.5.1/include
53!    -L/usr/local/netcdf-3.5.1/lib -lnetcdf
54! IBM-Regatta:
55!    xlf95 -qsuffix=cpp=f90 -WF,-D__netcdf -qrealsize=8 -q64 -qmaxmem=-1 -Q
56!    -I /aws/dataformats/netcdf-3.6.0-p1/64-32/include-64
57!    -L/aws/dataformats/netcdf-3.6.0-p1/64-32/lib -lnetcdf -O3
58! IBM-Regatta KISTI:
59!    xlf95 -qsuffix=cpp=f90 -WF,-D__netcdf -qrealsize=8 -q64 -qmaxmem=-1 -Q
60!    -I /applic/netcdf64/src/f90
61!    -L/applic/lib/NETCDF64 -lnetcdf -O3
62! IBM-Regatta Yonsei (gfdl5):
63!    xlf95 -qsuffix=cpp=f90 -WF,-D__netcdf -qrealsize=8 -q64 -qmaxmem=-1 -Q
64!    -I /usr1/users/raasch/pub/netcdf-3.6.0-p1/include
65!    -L/usr1/users/raasch/pub/netcdf-3.6.0-p1/lib -lnetcdf -O3
66! IMUK:
67!    ifort combine...f90 -o combine...x
68!    -cpp -D__netcdf -I /muksoft/packages/netcdf/linux/include -axW -r8 -nbs
69!    -Vaxlib -L /muksoft/packages/netcdf/linux/lib -lnetcdf
70! NEC-SX6:
71!    sxf90 combine...f90 -o combine...x
72!    -I /pool/SX-6/netcdf/netcdf-3.6.0-p1/include  -C hopt -Wf '-A idbl4'
73!    -D__netcdf -L/pool/SX-6/netcdf/netcdf-3.6.0-p1/lib -lnetcdf
74! Sun Fire X4600
75!    pgf95 combine...f90 -o combine...x
76!    -Mpreprocess -D__netcdf -I /home/usr5/mkanda/netcdf-3.6.1/src/f90 -r8
77!    -fast -L/home/usr5/mkanda/netcdf-3.6.1/src/libsrc -lnetcdf
78! FIMM:
79!    ifort combine...f90 -o combine...x
80!    -axW -cpp -openmp -r8 -nbs -convert little_endian -D__netcdf
81!    -I /local/netcdf/include -Vaxlib -L/local/netcdf/lib -lnetcdf
82!------------------------------------------------------------------------------!
83
84#if defined( __netcdf )
85    USE netcdf
86#endif
87
88    IMPLICIT NONE
89
90!
91!-- Local variables
92    CHARACTER (LEN=2)    ::  modus, model_string
93    CHARACTER (LEN=4)    ::  id_string
94    CHARACTER (LEN=10)   ::  dimname, var_name
95    CHARACTER (LEN=40)   ::  filename
96
97    CHARACTER (LEN=2000), DIMENSION(0:1) ::  var_list
98
99    INTEGER, PARAMETER ::  spk = SELECTED_REAL_KIND( 6 )
100
101    INTEGER ::  av, danz, i, id,             &
102                j, k, model, models, nc_stat, nxa, nxag, nxe, nxeg, nya,   &
103                nyag, nye, nyeg, nza, nzag, nze, nzeg, pos, time_step, xa, xe, &
104                xxa, xxe, ya, ye, yya, yye, za, ze, zza, zze
105
106    INTEGER, DIMENSION(0:1) ::  current_level, current_var, fanz, id_set, &
107         id_var_time, num_var
108
109    INTEGER, DIMENSION(4) ::  id_dims_loc
110
111    INTEGER, DIMENSION(0:1,4) ::  id_dims
112
113    INTEGER, DIMENSION(0:1,1000) ::  id_var, levels
114
115    LOGICAL ::  avs_output, compressed, found, iso2d_output, netcdf_output, &
116                netcdf_0, netcdf_1
117
118    REAL ::  dx, simulated_time
119    REAL, DIMENSION(:),   ALLOCATABLE   ::  eta, ho, hu
120    REAL, DIMENSION(:,:), ALLOCATABLE   ::  pf, pf_tmp
121    REAL(spk), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  pf3d, pf3d_tmp
122
123    PRINT*, ''
124    PRINT*, ''
125    PRINT*, '*** combine_plot_fields ***'
126
127!
128!-- Find out if a coupled run has been carried out
129    INQUIRE( FILE='COUPLING_PORT_OPENED', EXIST=found )
130    IF ( found )  THEN
131       models = 2
132       PRINT*, '    coupled run'
133    ELSE
134       models = 1
135       PRINT*, '    uncoupled run'
136    ENDIF
137
138!
139!-- Do everything for each model
140    DO model = 1, models
141!
142!--    Set the model string used to identify the filenames
143       model_string = ''
144       IF ( models == 2 )  THEN
145          PRINT*, ''
146          PRINT*, '*** combine_plot_fields ***'
147          IF ( model == 2 )  THEN
148             model_string = '_O'
149             PRINT*, '    now combining ocean data'
150             PRINT*, '    ========================'
151          ELSE
152             PRINT*, '    now combining atmosphere data'
153             PRINT*, '    ============================='
154          ENDIF
155       ENDIF
156!
157!--    2D-arrays for ISO2D
158!--    Main loop for the three different cross-sections, starting with
159!--    xy-section
160       modus = 'XY'
161       PRINT*, ''
162       DO  WHILE ( modus == 'XY'  .OR.  modus == 'XZ'  .OR.  modus == 'YZ' )
163!
164!--       Check, if file from PE0 exists. If it does not exist, PALM did not
165!--       create any output for this cross-section.
166          danz = 0
167          WRITE (id_string,'(I4.4)')  danz
168          INQUIRE ( &
169               FILE='PLOT2D_'//modus//TRIM( model_string )//'_'//id_string, &
170               EXIST=found )
171!
172!--       Find out the number of files (equal to the number of PEs which
173!--       have been used in PALM) and open them
174          DO  WHILE ( found )
175
176             OPEN ( danz+110, &
177                  FILE='PLOT2D_'//modus//TRIM( model_string )//'_'//id_string, &
178                  FORM='UNFORMATTED' )
179             danz = danz + 1
180             WRITE (id_string,'(I4.4)')  danz
181             INQUIRE ( &
182                  FILE='PLOT2D_'//modus//TRIM( model_string )//'_'//id_string, &
183                  EXIST=found )
184
185          ENDDO
186
187!
188!--       Inquire whether an iso2d parameter file exists
189          INQUIRE( FILE='PLOT2D_'//modus//'_GLOBAL'//TRIM( model_string ), &
190               EXIST=iso2d_output )
191
192!
193!--       Inquire whether a NetCDF file exists
194          INQUIRE( FILE='DATA_2D_'//modus//'_NETCDF'//TRIM( model_string ), &
195               EXIST=netcdf_0 )
196
197!
198!--       Inquire whether a NetCDF file for time-averaged data exists
199          INQUIRE( FILE='DATA_2D_'//modus//'_AV_NETCDF'//TRIM( model_string ),&
200               EXIST=netcdf_1 )
201
202          IF ( netcdf_0  .OR.  netcdf_1 )  THEN
203             netcdf_output = .TRUE.
204          ELSE
205             netcdf_output = .FALSE.
206          ENDIF
207
208!
209!--       Info-output
210          PRINT*, ''
211          PRINT*, '*** combine_plot_fields ***'
212#if defined( __netcdf )
213          IF ( netcdf_output )  PRINT*, '    NetCDF output enabled'
214#else
215          IF ( netcdf_output )  THEN
216             PRINT*, '--- Sorry, no NetCDF support on this host'
217             netcdf_output = .FALSE.
218          ENDIF
219#endif
220          IF ( danz /= 0 )  THEN
221             PRINT*, '    ',modus,'-section:  ', danz, ' file(s) found'
222          ELSE
223             PRINT*, '    no ', modus, '-section data available'
224          ENDIF
225
226          IF ( netcdf_output  .AND.  danz /= 0 )  THEN
227#if defined( __netcdf )
228             DO  av = 0, 1
229
230                IF ( av == 0  .AND.  .NOT.  netcdf_0 )  CYCLE
231                IF ( av == 1  .AND.  .NOT.  netcdf_1 )  CYCLE
232
233!
234!--             Open NetCDF dataset
235                IF ( av == 0 )  THEN
236                   filename = 'DATA_2D_'//modus//'_NETCDF' &
237                        //TRIM( model_string )
238                ELSE
239                   filename = 'DATA_2D_'//modus//'_AV_NETCDF' &
240                        //TRIM( model_string )
241                ENDIF
242                nc_stat = NF90_OPEN( filename, NF90_WRITE, id_set(av) )
243                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 1 )
244
245!
246!--             Get the list of variables (order of variables corresponds with
247!--             the order of data on the binary file)
248                var_list(av) = ' '    ! GET_ATT does not assign trailing blanks
249                nc_stat = NF90_GET_ATT( id_set(av), NF90_GLOBAL, 'VAR_LIST', &
250                     var_list(av) )
251                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 2 )
252
253!
254!--             Inquire id of the time coordinate variable
255                nc_stat = NF90_INQ_VARID( id_set(av), 'time', id_var_time(av) )
256                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 3 )
257
258!
259!--             Count number of variables; there is one more semicolon in the
260!--             string than variable names
261                num_var(av) = -1
262                DO  i = 1, LEN( var_list(av) )
263                   IF ( var_list(av)(i:i) == ';' )  num_var(av) = num_var(av) +1
264                ENDDO
265
266!
267!--             Extract the variable names from the list and inquire their
268!--             NetCDF IDs
269                pos = INDEX( var_list(av), ';' )
270!
271!--             Loop over all variables
272                DO  i = 1, num_var(av)
273
274!
275!--                Extract variable name from list
276                   var_list(av) = var_list(av)(pos+1:)
277                   pos = INDEX( var_list(av), ';' )
278                   var_name = var_list(av)(1:pos-1)
279
280!
281!--                Get variable ID from name
282                   nc_stat = NF90_INQ_VARID( id_set(av), TRIM( var_name ), &
283                        id_var(av,i) )
284                   IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 4 )
285
286!
287!--                Get number of x/y/z levels for that variable
288                   nc_stat = NF90_INQUIRE_VARIABLE( id_set(av), id_var(av,i), &
289                        dimids = id_dims_loc )
290                   IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 5 )
291                   id_dims(av,:) = id_dims_loc
292
293!
294!--                Inquire dimension ID
295                   DO  j = 1, 4
296                      nc_stat = NF90_INQUIRE_DIMENSION( id_set(av), &
297                           id_dims(av,j), dimname, levels(av,i) )
298                      IF ( nc_stat /= NF90_NOERR ) CALL handle_netcdf_error( 6 )
299
300                      IF ( modus == 'XY' .AND. INDEX(dimname, 'z') /= 0 )  EXIT
301                      IF ( modus == 'XZ' .AND. INDEX(dimname, 'y') /= 0 )  EXIT
302                      IF ( modus == 'YZ' .AND. INDEX(dimname, 'x') /= 0 )  EXIT
303                   ENDDO
304
305                ENDDO
306
307             ENDDO   ! av = 0, 1
308
309#endif
310          ENDIF
311
312!
313!--       Read the arrays, as long as the end of the file is reached
314          fanz          =         0
315          current_level =         1
316          current_var   = 999999999
317
318          DO  WHILE ( danz /= 0 )
319
320!
321!--          Loop over all files (reading data of the subdomains)
322             DO  id = 0, danz-1
323!
324!--             File from PE0 contains special information at the beginning,
325!--             concerning the lower and upper indices of the total-domain used
326!--             in PALM (nxag, nxeg, nyag, nyeg) and the lower and upper indices
327!--             of the array to be writte by this routine (nxa, nxe, nya,
328!--             nye). Usually in the horizontal directions nxag=-1 and nxa=0
329!--             while all other variables have the same value (i.e. nxeg=nxe).
330!--             Allocate necessary arrays, open the output file and write
331!--             the coordinate informations needed by ISO2D.
332                IF ( id == 0  .AND.  fanz(0) == 0  .AND.  fanz(1) == 0 )  THEN
333                   READ ( id+110 )  nxag, nxeg, nyag, nyeg
334                   READ ( id+110 )  nxa, nxe, nya, nye
335                   ALLOCATE ( eta(nya:nye), ho(nxa:nxe), hu(nxa:nxe), &
336                        pf(nxag:nxeg,nyag:nyeg) )
337                   READ ( id+110 )  dx, eta, hu, ho
338
339                   IF ( iso2d_output )  THEN
340                      OPEN ( 2, FILE='PLOT2D_'//modus//TRIM( model_string ), &
341                           FORM='UNFORMATTED' )
342                      WRITE ( 2 )  dx, eta, hu, ho
343                   ENDIF
344                ENDIF
345!
346!--             Read output time
347                IF ( netcdf_output  .AND.  id == 0 )  THEN
348                   IF ( netcdf_1 )  THEN
349                      READ ( id+110, END=998 )  simulated_time, time_step, av
350                   ELSE
351!
352!--                   For compatibility with earlier PALM versions
353                      READ ( id+110, END=998 )  simulated_time, time_step
354                      av = 0
355                   ENDIF
356                ENDIF
357!
358!--             Read subdomain indices
359                READ ( id+110, END=998 )  xa, xe, ya, ye
360!
361!--             IF the PE made no output (in case that no part of the
362!--             cross-section is situated on this PE), indices have the
363!--             value -1
364                IF ( .NOT. ( xa == -1  .AND.  xe == -1  .AND. &
365                             ya == -1  .AND.  ye == -1 ) )  THEN
366!
367!--                Read the subdomain grid-point values
368                   ALLOCATE( pf_tmp(xa:xe,ya:ye) )
369                   READ ( id+110 )  pf_tmp
370                   pf(xa:xe,ya:ye) = pf_tmp
371                   DEALLOCATE( pf_tmp )
372                ENDIF
373                IF ( id == 0 )  fanz(av) = fanz(av) + 1
374
375             ENDDO
376!
377!--          Write the data of the total domain cross-section
378             IF ( iso2d_output )  WRITE ( 2 )  pf(nxa:nxe,nya:nye)
379       
380!
381!--          Write same data in NetCDF format
382             IF ( netcdf_output )  THEN
383#if defined( __netcdf )
384!
385!--             Check if a new time step has begun; if yes write data to time
386!--             axis
387                IF ( current_var(av) > num_var(av) )  THEN
388                   current_var(av) = 1
389                   nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av), id_var_time(av), &
390                        (/ simulated_time /),        &
391                        start = (/ time_step /),     &
392                        count = (/ 1 /) )
393                   IF ( nc_stat /= NF90_NOERR ) CALL handle_netcdf_error( 7 )
394                ENDIF
395
396!
397!--             Now write the data; this is mode dependent
398                SELECT CASE ( modus )
399
400                   CASE ( 'XY' )
401                      nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av),                      &
402                                           id_var(av,current_var(av)),         &
403                                           pf(nxa:nxe,nya:nye),                &
404                             start = (/ 1, 1, current_level(av), time_step /), &
405                                      count = (/ nxe-nxa+1, nye-nya+1, 1, 1 /) )
406                      IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 8)
407                 
408                   CASE ( 'XZ' )
409                      nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av),                      &
410                                           id_var(av,current_var(av)),         &
411                                           pf(nxa:nxe,nya:nye),                &
412                             start = (/ 1, current_level(av), 1, time_step /), &
413                                      count = (/ nxe-nxa+1, 1, nye-nya+1, 1 /) )
414                      IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 9)
415
416                   CASE ( 'YZ' )
417                      nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av),                      &
418                                           id_var(av,current_var(av)),         &
419                                           pf(nxa:nxe,nya:nye),                &
420                             start = (/ current_level(av), 1, 1, time_step /), &
421                                      count = (/ 1, nxe-nxa+1, nye-nya+1, 1 /) )
422                      IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error(10)
423
424                END SELECT
425
426!
427!--             Data is written, check if max level is reached
428                current_level(av) = current_level(av) + 1
429                IF ( current_level(av) > levels(av,current_var(av)) )  THEN
430                   current_level(av) = 1
431                   current_var(av)   = current_var(av) + 1
432                ENDIF
433
434#endif
435             ENDIF
436
437          ENDDO
438
439998       IF ( danz /= 0 )  THEN
440!
441!--          Print the number of the arrays processed
442             WRITE (*,'(16X,I4,A)')  fanz(0)+fanz(1), ' array(s) processed'
443             IF ( fanz(1) /= 0 )  THEN
444                WRITE (*,'(16X,I4,A)')  fanz(1), ' array(s) are time-averaged'
445             ENDIF
446
447!
448!--          Close all files and deallocate arrays
449             DO  id = 0, danz-1
450                CLOSE ( id+110 )
451             ENDDO
452             CLOSE ( 2 )
453             DEALLOCATE ( eta, ho, hu, pf )
454          ENDIF
455
456!
457!--       Close the NetCDF file
458          IF ( netcdf_output  .AND.  danz /= 0 )  THEN
459#if defined( __netcdf )
460             IF ( netcdf_0 )  THEN
461                nc_stat = NF90_CLOSE( id_set(0) )
462                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 11 )
463             ENDIF
464             IF ( netcdf_1 )  THEN
465                nc_stat = NF90_CLOSE( id_set(1) )
466                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 12 )
467             ENDIF
468#endif
469          ENDIF
470
471!
472!--       Choose the next cross-section
473          SELECT CASE ( modus )
474             CASE ( 'XY' )
475                modus = 'XZ'
476             CASE ( 'XZ' )
477                modus = 'YZ'
478             CASE ( 'YZ' )
479                modus = 'no'
480          END SELECT
481
482       ENDDO
483
484
485!
486!--    Combine the 3D-arrays
487
488!
489!--    Inquire whether an avs fld file exists
490       INQUIRE( FILE='PLOT3D_FLD'//TRIM( model_string ), EXIST=avs_output )
491
492!
493!--    Inquire whether a NetCDF file exists
494       INQUIRE( FILE='DATA_3D_NETCDF'//TRIM( model_string ), EXIST=netcdf_0 )
495
496!
497!--    Inquire whether a NetCDF file for time-averaged data exists
498       INQUIRE( FILE='DATA_3D_AV_NETCDF'//TRIM( model_string ), EXIST=netcdf_1 )
499
500       IF ( netcdf_0  .OR.  netcdf_1 )  THEN
501          netcdf_output = .TRUE.
502       ELSE
503          netcdf_output = .FALSE.
504       ENDIF
505
506!
507!--    Check, if file from PE0 exists
508       danz = 0
509       WRITE (id_string,'(I4.4)')  danz
510       INQUIRE ( &
511            FILE='PLOT3D_DATA'//TRIM( model_string )//'_'//TRIM( id_string ),  &
512            EXIST=found )
513
514!
515!--    Combination only works, if data are not compressed. In that case,
516!--    PALM created a flag file (PLOT3D_COMPRESSED)
517       INQUIRE ( FILE='PLOT3D_COMPRESSED'//TRIM( model_string ), &
518            EXIST=compressed )
519
520!
521!--    Find out the number of files and open them
522       DO  WHILE ( found  .AND.  .NOT. compressed )
523
524          OPEN ( danz+110, &
525               FILE='PLOT3D_DATA'//TRIM( model_string )//'_'//TRIM(id_string), &
526               FORM='UNFORMATTED')
527          danz = danz + 1
528          WRITE (id_string,'(I4.4)')  danz
529          INQUIRE ( &
530               FILE='PLOT3D_DATA'//TRIM( model_string )//'_'//TRIM(id_string), &
531               EXIST=found )
532
533       ENDDO
534
535!
536!--    Info-output
537       PRINT*, ' '
538       PRINT*, '*** combine_plot_fields ***'
539#if defined( __netcdf )
540       IF ( netcdf_output )  PRINT*, '    NetCDF output enabled'
541#else
542       IF ( netcdf_output )  THEN
543          PRINT*, '--- Sorry, no NetCDF support on this host'
544          netcdf_output = .FALSE.
545       ENDIF
546#endif
547       IF ( danz /= 0 )  THEN
548          PRINT*, '    3D-data:     ', danz, ' file(s) found'
549       ELSE
550          IF ( found .AND. compressed )  THEN
551             PRINT*, '+++ no 3D-data processing, since data are compressed'
552          ELSE
553             PRINT*, '    no 3D-data file available'
554          ENDIF
555       ENDIF
556
557       IF ( netcdf_output  .AND.  danz /= 0 )  THEN
558#if defined( __netcdf )
559          DO  av = 0, 1
560
561             IF ( av == 0  .AND.  .NOT.  netcdf_0 )  CYCLE
562             IF ( av == 1  .AND.  .NOT.  netcdf_1 )  CYCLE
563
564!
565!--          Open NetCDF dataset
566             IF ( av == 0 )  THEN
567                filename = 'DATA_3D_NETCDF'//TRIM( model_string )
568             ELSE
569                filename = 'DATA_3D_AV_NETCDF'//TRIM( model_string )
570             ENDIF
571             nc_stat = NF90_OPEN( filename, NF90_WRITE, id_set(av) )
572             IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 13 )
573
574
575!
576!--          Get the list of variables (order of variables corresponds with the
577!--          order of data on the binary file)
578             var_list(av) = ' '    ! GET_ATT does not assign trailing blanks
579             nc_stat = NF90_GET_ATT( id_set(av), NF90_GLOBAL, 'VAR_LIST', &
580                  var_list(av) )
581             IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 14 )
582
583!
584!--          Inquire id of the time coordinate variable
585             nc_stat = NF90_INQ_VARID( id_set(av), 'time', id_var_time(av) )
586             IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 15 )
587
588!
589!--          Count number of variables; there is one more semicolon in the
590!--          string than variable names
591             num_var(av) = -1
592             DO  i = 1, LEN( var_list(av) )
593                IF ( var_list(av)(i:i) == ';' )  num_var(av) = num_var(av) + 1
594             ENDDO
595
596!
597!--          Extract the variable names from the list and inquire their NetCDF
598!--          IDs
599             pos = INDEX( var_list(av), ';' )
600!
601!--          Loop over all variables
602             DO  i = 1, num_var(av)
603
604!
605!--             Extract variable name from list
606                var_list(av) = var_list(av)(pos+1:)
607                pos = INDEX( var_list(av), ';' )
608                var_name = var_list(av)(1:pos-1)
609
610!
611!--             Get variable ID from name
612                nc_stat = NF90_INQ_VARID( id_set(av), TRIM( var_name ), &
613                     id_var(av,i) )
614                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 16 )
615
616             ENDDO
617
618          ENDDO    ! av=0,1
619
620#endif
621       ENDIF
622
623!
624!--    Read arrays, until the end of the file is reached
625       current_var = 999999999
626       fanz = 0
627       DO  WHILE ( danz /= 0 )
628
629!
630!--       Loop over all files
631          DO  id = 0, danz-1
632!
633!--          File from PE0 contains special information at the beginning,
634!--          concerning the lower and upper indices of the total-domain used in
635!--          PALM (nxag, nxeg, nyag, nyeg, nzag, nzeg) and the lower and upper
636!--          indices of the array to be written by this routine (nxa, nxe, nya,
637!--          nye, nza, nze). Usually nxag=-1 and nxa=0, nyag=-1 and nya=0,
638!--          nzeg=nz and nze=nz_plot3d.
639!--          Allocate necessary array and open the output file.
640             IF ( id == 0  .AND.  fanz(0) == 0  .AND.  fanz(1) == 0 )  THEN
641                READ ( id+110 )  nxag, nxeg, nyag, nyeg, nzag, nzeg
642                READ ( id+110 )  nxa, nxe, nya, nye, nza, nze
643                ALLOCATE ( pf3d(nxa:nxe,nya:nye,nza:nze) )
644                IF ( avs_output )  THEN
645                   OPEN ( 2, FILE='PLOT3D_DATA'//TRIM( model_string ), &
646                        FORM='UNFORMATTED' )
647                ENDIF
648             ENDIF
649
650!
651!--          Read output time
652             IF ( netcdf_output  .AND.  id == 0 )  THEN
653                IF ( netcdf_1 )  THEN
654                   READ ( id+110, END=999 )  simulated_time, time_step, av
655                ELSE
656!
657!--                For compatibility with earlier PALM versions
658                   READ ( id+110, END=999 )  simulated_time, time_step
659                   av = 0
660                ENDIF
661             ENDIF
662
663!
664!--          Read subdomain indices and grid point values
665             READ ( id+110, END=999 )  xa, xe, ya, ye, za, ze
666             ALLOCATE( pf3d_tmp(xa:xe,ya:ye,za:ze) )
667             READ ( id+110 )  pf3d_tmp
668
669             xxa = MAX( nxa, xa )
670             xxe = MIN( nxe, xe )
671             yya = MAX( nya, ya )
672             yye = MIN( nye, ye )
673             zza = MAX( nza, za )
674             zze = MIN( nze, ze )
675             DO  k = zza, zze
676                DO  j = yya, yye
677                   DO  i = xxa, xxe
678                      pf3d(i,j,k) = pf3d_tmp(i,j,k)
679                   ENDDO
680                ENDDO
681             ENDDO
682
683             DEALLOCATE( pf3d_tmp )
684             IF ( id == 0 )  fanz(av) = fanz(av) + 1
685
686          ENDDO
687
688!
689!--       Write data of the total domain
690          IF ( avs_output )  WRITE ( 2 )  pf3d(nxa:nxe,nya:nye,nza:nze)
691       
692!
693!--       Write same data in NetCDF format
694          IF ( netcdf_output )  THEN
695#if defined( __netcdf )
696!
697!--          Check if a new time step has begun; if yes write data to time axis
698             IF ( current_var(av) > num_var(av) )  THEN
699                current_var(av) = 1
700                nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av), id_var_time(av), &
701                                     (/ simulated_time /),&
702                                     start = (/ time_step /), count = (/ 1 /) )
703                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR ) CALL handle_netcdf_error( 17 )
704             ENDIF
705
706!
707!--          Now write the data
708             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av), id_var(av,current_var(av)), &
709                                     pf3d, start = (/ 1, 1, 1, time_step /), &
710                              count = (/ nxe-nxa+1, nye-nya+1, nze-nza+1, 1 /) )
711             IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 18 )
712
713             current_var(av) = current_var(av) + 1
714
715#endif
716          ENDIF
717
718       ENDDO
719
720999    IF ( danz /= 0 )  THEN
721!
722!--       Print the number of arrays processed
723          WRITE (*,'(16X,I4,A)')  fanz(0)+fanz(1), ' array(s) processed'
724          IF ( fanz(1) /= 0 )  THEN
725             WRITE (*,'(16X,I4,A)')  fanz(1), ' array(s) are time-averaged'
726          ENDIF
727!
728!--       Close all files and deallocate array
729          DO  id = 0, danz-1
730             CLOSE ( id+110 )
731          ENDDO
732          CLOSE ( 2 )
733          DEALLOCATE ( pf3d )
734!
735!--       Close the NetCDF file
736          IF ( netcdf_output )  THEN
737#if defined( __netcdf )
738             IF ( netcdf_0 )  THEN
739                nc_stat = NF90_CLOSE( id_set(0) )
740                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 19 )
741             ENDIF
742             IF ( netcdf_1 )  THEN
743                nc_stat = NF90_CLOSE( id_set(1) )
744                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 20 )
745             ENDIF
746#endif
747          ENDIF
748       ENDIF
749
750    ENDDO  ! models
751
752
753 CONTAINS
754
755
756    SUBROUTINE handle_netcdf_error( errno )
757!
758!--    Prints out a text message corresponding to the current NetCDF status
759
760       IMPLICIT NONE
761
762       INTEGER, INTENT(IN) ::  errno
763
764#if defined( __netcdf )
765       IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  THEN
766          PRINT*, '+++ combine_plot_fields  netcdf: ', av, errno, &
767                  TRIM( nf90_strerror( nc_stat ) )
768       ENDIF
769#endif
770
771    END SUBROUTINE handle_netcdf_error
772
773
774 END PROGRAM combine_plot_fields
775
776
777
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.