source: palm/trunk/UTIL/combine_plot_fields.f90 @ 3997

Last change on this file since 3997 was 3241, checked in by raasch, 3 years ago

various changes to avoid compiler warnings (mainly removal of unused variables)

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 30.0 KB
Line 
1 PROGRAM combine_plot_fields
2
3!------------------------------------------------------------------------------!
4! This file is part of the PALM model system.
5!
6! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
7! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
8! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
9! version.
10!
11! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
12! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
13! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
14!
15! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
16! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
17!
18! Copyright 1997-2018  Leibniz Universitaet Hannover
19!------------------------------------------------------------------------------!
20!
21! Current revisions:
22! -----------------
23!
24!
25! Former revisions:
26! -----------------
27! $Id: combine_plot_fields.f90 3241 2018-09-12 15:02:00Z eckhard $
28! unused variables removed
29!
30! 2718 2018-01-02 08:49:38Z maronga
31! Corrected "Former revisions" section
32!
33! 2696 2017-12-14 17:12:51Z kanani
34! Change in file header (GPL part)
35!
36! 2669 2017-12-06 16:03:27Z raasch
37! data of 3d-nest runs are completely processed now
38!
39! 2523 2017-10-05 14:42:47Z kanani
40! Increased LEN for CHARACTER variable var_name, equal to the value in PALM
41!
42! 2512 2017-10-04 08:26:59Z raasch
43! PALM output does not contain ghost layer data any more
44! avs- and iso2d-related parts removed, handling of compressed data removed
45!
46! 2365 2017-08-21 14:59:59Z kanani
47! Vertical grid nesting implemented (SadiqHuq)
48!
49! 1809 2016-04-05 20:13:28Z raasch
50!
51! 1808 2016-04-05 19:44:00Z raasch
52! cpu measurements are done with standard FORTRAN routine on every machine
53!
54! 1551 2015-03-03 14:18:16Z maronga
55! Adjustments for data output of soil model quantities
56!
57! 1468 2014-09-24 14:06:57Z maronga
58! Adapted for use on up to 6-digit processor cores (not tested)
59!
60! 1394 2014-05-06 10:17:31Z keck
61! KIND-attribute added to all INTEGER and REAL declaration statements
62!
63! 1046 2012-11-09 14:38:45Z maronga
64! code put under GPL (PALM 3.9)
65!
66! 691 2011-03-04 08:45:30Z maronga
67! Bugfix: check for precursor ocean runs, removed typo
68!
69! 493 2010-03-01 08:30:24Z raasch
70! Exit in case of already complete NetCDF data (due to parallel output in PALM)
71! cpu measurements included
72!
73! 210 2008-11-06 08:54:02Z raasch
74! Size of pf3d adjusted to the required output size (1 gridpoint less, along
75! all three dimensions), because output of a subset of the data
76! (pf3d(nxa:nxe...) in the NF90_PUT_VAR statement caused segmentation fault
77! with the INTEL compiler.
78! Subdomain data are read into temporary arrays pf_tmp/pf3d_tmp in order to
79! avoid INTEL compiler warnings about (automatic) creation of temporary arrays
80! Bugfix: three misplaced #endif directives
81!
82! 114 2007-10-10 00:03:15Z raasch
83! Bugfix: model_string needed a default value
84!
85! Aug 07    Loop for processing of output by coupled runs, id_string does not
86!           contain modus any longer
87!
88! 18/01/06  Output of time-averaged data
89!
90! 25/05/05  Errors removed
91!
92! 26/04/05  Output in NetCDF format, iso2d and avs output only if parameter
93!           file exists
94!
95! 31/10/01  All comments and messages translated into English
96!
97! 23/02/99  Keine Bearbeitung komprimierter 3D-Daten
98! Ursprungsversion vom 28/07/97
99!
100!
101! Description:
102! ------------
103! This routine combines data of the PALM-subdomains into one file. In PALM
104! every processor element opens its own file and writes 2D- or 3D-binary-data
105! into it (different files are opened for xy-, xz-, yz-cross-sections and
106! 3D-data). For plotting or analyzing these PE-data have to be collected and
107! to be put into single files, which is done by this routine.
108! Output format is NetCDF. Additionally, a data are output in a binary format
109! readable by ISO2D-software (cross-sections) and by AVS (3D-data).
110!------------------------------------------------------------------------------!
111
112#if defined( __netcdf )
113    USE netcdf
114#endif
115
116    IMPLICIT NONE
117
118!
119!-- Local variables
120    CHARACTER (LEN=2)    ::  modus
121    CHARACTER (LEN=4)    ::  model_string
122    CHARACTER (LEN=6)    ::  id_string
123    CHARACTER (LEN=30)   ::  dimname, var_name
124    CHARACTER (LEN=40)   ::  filename
125
126    CHARACTER (LEN=2000), DIMENSION(0:1) ::  var_list
127
128    INTEGER, PARAMETER ::  iwp = 4, spk = SELECTED_REAL_KIND( 6 ), wp = 8
129
130    INTEGER(iwp) ::  av, danz, i, id, j, k, model, models, nc_stat,            &
131                     nxa, nxe, nya, nye,               &
132                     nza, nze, pos, time_step, xa, xe, xxa, xxe, ya, ya_do,    &
133                     ya_tot, ye, ye_do, ye_tot, yya, yye, za, ze
134
135    INTEGER(8)                        ::  count, count_rate
136
137    INTEGER(iwp), DIMENSION(0:1)      ::  current_level, current_var,          &
138                                          fanz, id_set, id_var_time, num_var
139    INTEGER(iwp), DIMENSION(4)        ::  id_dims_loc
140    INTEGER(iwp), DIMENSION(0:1,4)    ::  id_dims
141    INTEGER(iwp), DIMENSION(0:1,1000) ::  id_var, levels
142
143    LOGICAL  ::  found, nest3d, netcdf_output, netcdf_parallel, netcdf_0,      &
144                 netcdf_1, vnest
145
146    REAL(wp) ::  cpu_start_time, cpu_end_time, simulated_time
147    REAL(wp),  DIMENSION(:,:), ALLOCATABLE   ::  pf, pf_tmp
148    REAL(spk), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  pf3d, pf3d_tmp
149
150
151
152    PRINT*, ''
153    PRINT*, ''
154    PRINT*, '*** combine_plot_fields ***'
155
156!
157!-- Find out if a coupled or nested run has been carried out
158    INQUIRE( FILE='COUPLING_PORT_OPENED', EXIST=found )
159    INQUIRE( FILE='VNESTING_PORT_OPENED', EXIST=vnest )
160    INQUIRE( FILE='3DNESTING', EXIST=nest3d )
161    IF ( found )  THEN
162       models = 2
163       PRINT*, '    coupled run'
164    ELSEIF ( vnest )  THEN
165       models = 2
166       PRINT*, '    Vertically nested grid coupling'
167    ELSEIF ( nest3d )  THEN
168       OPEN( 90, FILE='3DNESTING', FORM='FORMATTED' )
169       READ ( 90, '(I2)' )  models
170       CLOSE ( 90 )
171       PRINT*, '    3d-nest run'
172       PRINT*, '    number of nest domains = ', models
173    ELSE
174       models = 1
175       PRINT*, '    uncoupled run'
176    ENDIF
177
178!
179!-- Find out if a precursor ocean run has been carried out
180    INQUIRE( FILE='PRECURSOR_OCEAN', EXIST=found )
181    IF ( found )  THEN
182       model_string = '_O'
183       PRINT*, '    precursor ocean run'
184    ELSE
185       model_string = ''
186    ENDIF
187
188!
189!-- Do everything for each model
190    DO model = 1, models
191!
192!--    Set the model string used to identify the filenames
193       IF ( found  .OR.  vnest )  THEN
194          PRINT*, ''
195          IF ( model == 2 )  THEN
196             IF ( vnest )  THEN
197                model_string = '_N'
198                PRINT*, '    now combining FINE data'
199                PRINT*, '    ========================'
200             ELSE
201                model_string = '_O'
202                PRINT*, '    now combining ocean data'
203                PRINT*, '    ========================'
204             ENDIF
205          ELSE
206             IF ( vnest )  THEN
207                PRINT*, '    now combining COARSE data'
208                PRINT*, '    ============================='
209             ELSE
210                PRINT*, '    now combining atmosphere data'
211                PRINT*, '    ============================='
212             ENDIF
213          ENDIF
214       ELSEIF ( nest3d )  THEN
215          PRINT*, ''
216          PRINT*, '--> processing nest id = ', model
217          IF ( model == 1 )  THEN
218             model_string = ''
219          ELSE
220             WRITE( model_string, '(A2,I2.2)' )  '_N', model
221          ENDIF
222       ENDIF
223!
224!--    2D-arrays for ISO2D
225!--    Main loop for the three different cross-sections, starting with
226!--    xy-section
227       modus = 'XY'
228       PRINT*, ''
229       DO  WHILE ( modus == 'XY'  .OR.  modus == 'XZ'  .OR.  modus == 'YZ' )
230!
231!--       Take current time
232          CALL SYSTEM_CLOCK( count, count_rate )
233          cpu_start_time = REAL( count ) / REAL( count_rate )
234
235          netcdf_parallel = .FALSE.
236!
237!--       Check, if file from PE0 exists. If it does not exist, PALM did not
238!--       create any output for this cross-section.
239          danz = 0
240          WRITE (id_string,'(I6.6)')  danz
241          INQUIRE ( &
242               FILE='PLOT2D_'//modus//TRIM( model_string )//'_'//id_string, &
243               EXIST=found )
244!
245!--       Find out the number of files (equal to the number of PEs which
246!--       have been used in PALM) and open them
247          DO  WHILE ( found )
248
249             OPEN ( danz+110, &
250                  FILE='PLOT2D_'//modus//TRIM( model_string )//'_'//id_string, &
251                  FORM='UNFORMATTED' )
252             danz = danz + 1
253             WRITE (id_string,'(I6.6)')  danz
254             INQUIRE ( &
255                  FILE='PLOT2D_'//modus//TRIM( model_string )//'_'//id_string, &
256                  EXIST=found )
257
258          ENDDO
259
260!
261!--       Inquire whether a NetCDF file exists
262          INQUIRE( FILE='DATA_2D_'//modus//'_NETCDF'//TRIM( model_string ), &
263               EXIST=netcdf_0 )
264
265!
266!--       Inquire whether a NetCDF file for time-averaged data exists
267          INQUIRE( FILE='DATA_2D_'//modus//'_AV_NETCDF'//TRIM( model_string ),&
268               EXIST=netcdf_1 )
269
270          IF ( netcdf_0  .OR.  netcdf_1 )  THEN
271             netcdf_output = .TRUE.
272!
273!--          Inquire whether the NetCDF file is already complete (parallel
274!--          output)
275             INQUIRE( FILE='NO_COMBINE_PLOT_FIELDS_'//modus, &
276                      EXIST=netcdf_parallel )
277             IF ( netcdf_parallel )  THEN
278                netcdf_parallel = .TRUE.
279             ELSE
280                netcdf_parallel = .FALSE.
281             ENDIF
282          ELSE
283             netcdf_output = .FALSE.
284          ENDIF
285
286!
287!--       Info-output
288          PRINT*, ''
289#if defined( __netcdf )
290          IF ( netcdf_output )  THEN
291             IF ( netcdf_parallel )  THEN
292             PRINT*, '    NetCDF ' // modus // '-data are in one file ', &
293                          '(NetCDF4-format) - merging not neccessary'
294             ELSE
295                PRINT*, '    NetCDF output enabled'
296             ENDIF
297          ENDIF
298#else
299          IF ( netcdf_output )  THEN
300             PRINT*, '--- Sorry, no NetCDF support on this host'
301             netcdf_output = .FALSE.
302          ENDIF
303#endif
304          IF ( .NOT. netcdf_parallel )  THEN
305             IF ( danz /= 0 )  THEN
306                PRINT*, '    ',modus,'-section:  ', danz, ' file(s) found'
307             ELSE
308                PRINT*, '    no ', modus, '-section data available'
309             ENDIF
310          ENDIF
311
312          IF ( netcdf_output  .AND. .NOT. netcdf_parallel  .AND.  danz /= 0 ) &
313          THEN
314#if defined( __netcdf )
315             DO  av = 0, 1
316
317                IF ( av == 0  .AND.  .NOT.  netcdf_0 )  CYCLE
318                IF ( av == 1  .AND.  .NOT.  netcdf_1 )  CYCLE
319
320!
321!--             Open NetCDF dataset
322                IF ( av == 0 )  THEN
323                   filename = 'DATA_2D_'//modus//'_NETCDF' &
324                        //TRIM( model_string )
325                ELSE
326                   filename = 'DATA_2D_'//modus//'_AV_NETCDF' &
327                        //TRIM( model_string )
328                ENDIF
329                nc_stat = NF90_OPEN( filename, NF90_WRITE, id_set(av) )
330                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 1 )
331
332!
333!--             Get the list of variables (order of variables corresponds with
334!--             the order of data on the binary file)
335                var_list(av) = ' '    ! GET_ATT does not assign trailing blanks
336                nc_stat = NF90_GET_ATT( id_set(av), NF90_GLOBAL, 'VAR_LIST', &
337                     var_list(av) )
338                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 2 )
339
340!
341!--             Inquire id of the time coordinate variable
342                nc_stat = NF90_INQ_VARID( id_set(av), 'time', id_var_time(av) )
343                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 3 )
344
345!
346!--             Count number of variables; there is one more semicolon in the
347!--             string than variable names
348                num_var(av) = -1
349                DO  i = 1, LEN( var_list(av) )
350                   IF ( var_list(av)(i:i) == ';' )  num_var(av) = num_var(av) +1
351                ENDDO
352
353!
354!--             Extract the variable names from the list and inquire their
355!--             NetCDF IDs
356                pos = INDEX( var_list(av), ';' )
357!
358!--             Loop over all variables
359                DO  i = 1, num_var(av)
360
361!
362!--                Extract variable name from list
363                   var_list(av) = var_list(av)(pos+1:)
364                   pos = INDEX( var_list(av), ';' )
365                   var_name = var_list(av)(1:pos-1)
366
367!
368!--                Get variable ID from name
369                   nc_stat = NF90_INQ_VARID( id_set(av), TRIM( var_name ), &
370                        id_var(av,i) )
371                   IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 4 )
372
373!
374!--                Get number of x/y/z levels for that variable
375                   nc_stat = NF90_INQUIRE_VARIABLE( id_set(av), id_var(av,i), &
376                        dimids = id_dims_loc )
377                   IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 5 )
378                   id_dims(av,:) = id_dims_loc
379
380!
381!--                Inquire dimension ID
382                   DO  j = 1, 4
383                      nc_stat = NF90_INQUIRE_DIMENSION( id_set(av), &
384                           id_dims(av,j), dimname, levels(av,i) )
385                      IF ( nc_stat /= NF90_NOERR ) CALL handle_netcdf_error( 6 )
386
387                      IF ( modus == 'XY' .AND. INDEX(dimname, 'z') /= 0 )  EXIT
388                      IF ( modus == 'XZ' .AND. INDEX(dimname, 'y') /= 0 )  EXIT
389                      IF ( modus == 'YZ' .AND. INDEX(dimname, 'x') /= 0 )  EXIT
390                   ENDDO
391
392                ENDDO
393
394             ENDDO   ! av = 0, 1
395
396#endif
397          ENDIF
398
399!
400!--       Read the arrays, as long as the end of the file is reached
401          IF ( .NOT. netcdf_parallel )  THEN
402
403             fanz          =         0
404             current_level =         1
405             current_var   = 999999999
406
407             DO  WHILE ( danz /= 0 )
408
409!
410!--             Loop over all files (reading data of the subdomains)
411                DO  id = 0, danz-1
412!
413!--                File from PE0 contains special information at the beginning,
414!--                concerning the lower and upper indices of the total-domain
415!--                used in PALM (nxa, nxe, nya, nye).
416!--                Allocate necessary arrays, open the output file and write
417!--                the coordinate informations needed by ISO2D.
418                   IF ( id == 0  .AND.  fanz(0) == 0  .AND.  fanz(1) == 0 ) THEN
419
420                      READ ( id+110 )  nxa, nxe, nya, nye
421                      ALLOCATE ( pf(nxa:nxe,nya:nye) )
422!
423!--                   Set actual domain bounds to total domain
424                      ya_do = nya
425                      ye_do = nye
426
427                   ENDIF
428!
429!--                Read output time
430                   IF ( netcdf_output  .AND.  id == 0 )  THEN
431                      READ ( id+110, END=998 )  simulated_time, time_step, av
432                   ENDIF
433!
434!--                Read subdomain indices
435                   READ ( id+110, END=998 )  xa, xe, ya, ye, ya_tot, ye_tot
436
437!
438!--                IF the PE made no output (in case that no part of the
439!--                cross-section is situated on this PE), indices have the
440!--                value -1
441                   IF ( .NOT. ( xa == -1  .AND.  xe == -1  .AND. &
442                                ya == -1  .AND.  ye == -1 ) )  THEN
443
444
445!
446!--                   Read the subdomain grid-point values
447                      ALLOCATE( pf_tmp(xa:xe,ya:ye) )
448                      READ ( id+110 )  pf_tmp
449!
450!--                   Calculate indices on atmospheric grid (e.g. for soil model
451!--                   quantities)
452                      IF ( ya /= ya_tot .OR. ye /= ye_tot )  THEN
453                         ye_do = ye - ya
454                         ya_do = ya
455                         pf(xa:xe,ya_do:ye_do) = pf_tmp
456                      ELSE
457                         ye_do = nye
458                         ya_do = nya
459                         pf(xa:xe,ya:ye) = pf_tmp
460                      ENDIF
461
462                      DEALLOCATE( pf_tmp )
463                   ENDIF
464                   IF ( id == 0 )  fanz(av) = fanz(av) + 1
465
466                ENDDO
467!
468!--             Write data in NetCDF format
469                IF ( netcdf_output )  THEN
470#if defined( __netcdf )
471!
472!--                Check if a new time step has begun; if yes write data to
473!--                time axis
474                   IF ( current_var(av) > num_var(av) )  THEN
475                      current_var(av) = 1
476                      nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av), id_var_time(av), &
477                                              (/ simulated_time /),        &
478                                              start = (/ time_step /),     &
479                                              count = (/ 1 /) )
480                      IF ( nc_stat /= NF90_NOERR ) CALL handle_netcdf_error( 7 )
481                   ENDIF
482
483!
484!--                Now write the data; this is mode dependent
485                   SELECT CASE ( modus )
486
487                      CASE ( 'XY' )
488                         nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av),                   &
489                                           id_var(av,current_var(av)),         &
490                                           pf(nxa:nxe,nya:nye),                &
491                             start = (/ 1, 1, current_level(av), time_step /), &
492                                      count = (/ nxe-nxa+1, nye-nya+1, 1, 1 /) )
493                         IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  THEN
494                            CALL handle_netcdf_error( 8 )
495                         ENDIF
496                 
497                      CASE ( 'XZ' )
498                         nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av),                   &
499                                           id_var(av,current_var(av)),         &
500                                           pf(nxa:nxe,ya_do:ye_do),            &
501                             start = (/ 1, current_level(av), 1, time_step /), &
502                                      count = (/ nxe-nxa+1, 1, ye_do-ya_do+1, 1 /) )
503                         IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  THEN
504                            CALL handle_netcdf_error( 9 )
505                         ENDIF
506
507                      CASE ( 'YZ' )
508                         nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av),                   &
509                                           id_var(av,current_var(av)),         &
510                                           pf(nxa:nxe,ya_do:ye_do),            &
511                             start = (/ current_level(av), 1, 1, time_step /), &
512                                      count = (/ 1, nxe-nxa+1, ye_do-ya_do+1, 1 /) )
513                         IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  THEN
514                            CALL handle_netcdf_error( 10 )
515                         ENDIF
516
517                   END SELECT
518
519!
520!--                Data is written, check if max level is reached
521                   current_level(av) = current_level(av) + 1
522                   IF ( current_level(av) > levels(av,current_var(av)) )  THEN
523                      current_level(av) = 1
524                      current_var(av)   = current_var(av) + 1
525                   ENDIF
526
527#endif
528                ENDIF
529
530             ENDDO
531
532          ENDIF
533
534998       IF ( danz /= 0  .AND.  .NOT. netcdf_parallel )  THEN
535!
536!--          Print the number of the arrays processed
537             WRITE (*,'(16X,I4,A)')  fanz(0)+fanz(1), ' array(s) processed'
538             IF ( fanz(1) /= 0 )  THEN
539                WRITE (*,'(16X,I4,A)')  fanz(1), ' array(s) are time-averaged'
540             ENDIF
541
542!
543!--          Close all files and deallocate arrays
544             DO  id = 0, danz-1
545                CLOSE ( id+110 )
546             ENDDO
547             CLOSE ( 2 )
548             DEALLOCATE ( pf )
549
550!
551!--          Close the NetCDF file
552             IF ( netcdf_output )  THEN
553#if defined( __netcdf )
554                IF ( netcdf_0 )  THEN
555                   nc_stat = NF90_CLOSE( id_set(0) )
556                   IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 11 )
557                ENDIF
558                IF ( netcdf_1 )  THEN
559                   nc_stat = NF90_CLOSE( id_set(1) )
560                   IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 12 )
561                ENDIF
562#endif
563             ENDIF
564          ENDIF
565
566!
567!--       Output required cpu time
568          IF ( danz /= 0  .AND.  .NOT. netcdf_parallel )  THEN
569             CALL SYSTEM_CLOCK( count, count_rate )
570             cpu_end_time = REAL( count ) / REAL( count_rate )
571             WRITE (*,'(5X,A,F9.3,A)')  'Required cpu-time: ', &
572                                        cpu_end_time-cpu_start_time, ' sec'
573          ENDIF
574
575!
576!--       Choose the next cross-section
577          SELECT CASE ( modus )
578             CASE ( 'XY' )
579                modus = 'XZ'
580             CASE ( 'XZ' )
581                modus = 'YZ'
582             CASE ( 'YZ' )
583                modus = 'no'
584          END SELECT
585
586       ENDDO
587
588
589!
590!--    Combine the 3D-arrays
591       netcdf_parallel = .FALSE.
592
593!
594!--    Info-output
595       PRINT*, ' '
596
597!
598!--    Take current time
599       CALL SYSTEM_CLOCK( count, count_rate )
600       cpu_start_time = REAL( count ) / REAL( count_rate )
601
602!
603!--    Inquire whether a NetCDF file exists
604       INQUIRE( FILE='DATA_3D_NETCDF'//TRIM( model_string ), EXIST=netcdf_0 )
605
606!
607!--    Inquire whether a NetCDF file for time-averaged data exists
608       INQUIRE( FILE='DATA_3D_AV_NETCDF'//TRIM( model_string ), EXIST=netcdf_1 )
609
610       IF ( netcdf_0  .OR.  netcdf_1 )  THEN
611          netcdf_output = .TRUE.
612!
613!--       Inquire whether the NetCDF file is already complete (parallel output)
614          INQUIRE( FILE='NO_COMBINE_PLOT_FIELDS_3D', EXIST=netcdf_parallel )
615          IF ( netcdf_parallel )  THEN
616             netcdf_parallel = .TRUE.
617          ELSE
618             netcdf_parallel = .FALSE.
619          ENDIF
620       ELSE
621          netcdf_output = .FALSE.
622       ENDIF
623
624!
625!--    Check, if file from PE0 exists; not neccessary in case of parallel
626!--    PALM output
627       IF ( .NOT. netcdf_parallel )  THEN
628          danz = 0
629          WRITE (id_string,'(I6.6)')  danz
630          INQUIRE ( &
631               FILE='PLOT3D_DATA'//TRIM( model_string )//'_'//TRIM( id_string ),  &
632               EXIST=found )
633       ELSE
634          found = .FALSE.
635       ENDIF
636
637!
638!--    Find out the number of files and open them
639       DO  WHILE ( found )
640
641          OPEN ( danz+110, &
642               FILE='PLOT3D_DATA'//TRIM( model_string )//'_'//TRIM(id_string), &
643               FORM='UNFORMATTED')
644          danz = danz + 1
645          WRITE (id_string,'(I6.6)')  danz
646          INQUIRE ( &
647               FILE='PLOT3D_DATA'//TRIM( model_string )//'_'//TRIM(id_string), &
648               EXIST=found )
649
650       ENDDO
651
652#if defined( __netcdf )
653       IF ( netcdf_output )  THEN
654          IF ( netcdf_parallel )  THEN
655             PRINT*, '    NetCDF data are in one file (NetCDF4-format)', &
656                          ' - merging not neccessary'
657          ELSE
658             PRINT*, '    NetCDF output enabled'
659          ENDIF
660       ENDIF
661#else
662       IF ( netcdf_output )  THEN
663          PRINT*, '--- Sorry, no NetCDF support on this host'
664          netcdf_output = .FALSE.
665       ENDIF
666#endif
667       IF ( .NOT. netcdf_parallel )  THEN
668          IF ( danz /= 0 )  THEN
669             PRINT*, '    3D-data:     ', danz, ' file(s) found'
670          ELSE
671             PRINT*, '    no 3D-data file available'
672          ENDIF
673       ENDIF
674
675       IF ( netcdf_output  .AND. .NOT. netcdf_parallel  .AND.  danz /= 0 )  THEN
676#if defined( __netcdf )
677          DO  av = 0, 1
678
679             IF ( av == 0  .AND.  .NOT.  netcdf_0 )  CYCLE
680             IF ( av == 1  .AND.  .NOT.  netcdf_1 )  CYCLE
681
682!
683!--          Open NetCDF dataset
684             IF ( av == 0 )  THEN
685                filename = 'DATA_3D_NETCDF'//TRIM( model_string )
686             ELSE
687                filename = 'DATA_3D_AV_NETCDF'//TRIM( model_string )
688             ENDIF
689             nc_stat = NF90_OPEN( filename, NF90_WRITE, id_set(av) )
690             IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 13 )
691
692
693!
694!--          Get the list of variables (order of variables corresponds with the
695!--          order of data on the binary file)
696             var_list(av) = ' '    ! GET_ATT does not assign trailing blanks
697             nc_stat = NF90_GET_ATT( id_set(av), NF90_GLOBAL, 'VAR_LIST', &
698                  var_list(av) )
699             IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 14 )
700
701!
702!--          Inquire id of the time coordinate variable
703             nc_stat = NF90_INQ_VARID( id_set(av), 'time', id_var_time(av) )
704             IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 15 )
705
706!
707!--          Count number of variables; there is one more semicolon in the
708!--          string than variable names
709             num_var(av) = -1
710             DO  i = 1, LEN( var_list(av) )
711                IF ( var_list(av)(i:i) == ';' )  num_var(av) = num_var(av) + 1
712             ENDDO
713
714!
715!--          Extract the variable names from the list and inquire their NetCDF
716!--          IDs
717             pos = INDEX( var_list(av), ';' )
718!
719!--          Loop over all variables
720             DO  i = 1, num_var(av)
721
722!
723!--             Extract variable name from list
724                var_list(av) = var_list(av)(pos+1:)
725                pos = INDEX( var_list(av), ';' )
726                var_name = var_list(av)(1:pos-1)
727
728!
729!--             Get variable ID from name
730                nc_stat = NF90_INQ_VARID( id_set(av), TRIM( var_name ), &
731                     id_var(av,i) )
732                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 16 )
733
734             ENDDO
735
736          ENDDO    ! av=0,1
737
738#endif
739       ENDIF
740
741!
742!--    Read arrays, until the end of the file is reached
743       IF ( .NOT. netcdf_parallel )  THEN
744
745          current_var = 999999999
746          fanz = 0
747          DO  WHILE ( danz /= 0 )
748
749!
750!--          Loop over all files
751             DO  id = 0, danz-1
752!
753!--             File from PE0 contains at the beginning the index bounds
754!--             of PALM's total domain.
755!--             Allocate the array for storing the total domain data
756                IF ( id == 0  .AND.  fanz(0) == 0  .AND.  fanz(1) == 0 )  THEN
757                   READ ( id+110 )  nxa, nxe, nya, nye, nza, nze
758                   ALLOCATE ( pf3d(nxa:nxe,nya:nye,nza:nze) )
759                ENDIF
760
761!
762!--             Read output time
763                IF ( netcdf_output  .AND.  id == 0 )  THEN
764                   IF ( netcdf_1 )  THEN
765                      READ ( id+110, END=999 )  simulated_time, time_step, av
766                   ELSE
767!
768!--                   For compatibility with earlier PALM versions
769                      READ ( id+110, END=999 )  simulated_time, time_step
770                      av = 0
771                   ENDIF
772                ENDIF
773
774!
775!--             Read subdomain indices and grid point values
776                READ ( id+110, END=999 )  xa, xe, ya, ye, za, ze
777                ALLOCATE( pf3d_tmp(xa:xe,ya:ye,za:ze) )
778                READ ( id+110 )  pf3d_tmp
779
780                xxa = MAX( nxa, xa )
781                xxe = MIN( nxe, xe )
782                yya = MAX( nya, ya )
783                yye = MIN( nye, ye )
784                DO  k = za, ze
785                   DO  j = yya, yye
786                      DO  i = xxa, xxe
787                         pf3d(i,j,k) = pf3d_tmp(i,j,k)
788                      ENDDO
789                   ENDDO
790                ENDDO
791
792                DEALLOCATE( pf3d_tmp )
793                IF ( id == 0 )  fanz(av) = fanz(av) + 1
794
795             ENDDO
796
797!
798!--          Write data of the total domain in NetCDF format
799             IF ( netcdf_output )  THEN
800#if defined( __netcdf )
801!
802!--             Check if a new time step has begun; if yes write data to time
803!--             axis
804                IF ( current_var(av) > num_var(av) )  THEN
805                   current_var(av) = 1
806                   nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av), id_var_time(av), &
807                                      (/ simulated_time /),&
808                                      start = (/ time_step /), count = (/ 1 /) )
809                   IF ( nc_stat /= NF90_NOERR ) CALL handle_netcdf_error( 17 )
810                ENDIF
811
812!
813!--             Now write the data
814                nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set(av), id_var(av,current_var(av)),&
815                                        pf3d(nxa:nxe,nya:nye,za:ze), start = (/ 1, 1, 1, time_step /),&
816                              count = (/ nxe-nxa+1, nye-nya+1, ze-za+1, 1 /) )
817                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 18 )
818
819                current_var(av) = current_var(av) + 1
820
821#endif
822             ENDIF
823
824          ENDDO
825
826       ENDIF
827
828999    IF ( danz /= 0  .AND.  .NOT. netcdf_parallel )  THEN
829!
830!--       Print the number of arrays processed
831          WRITE (*,'(16X,I4,A)')  fanz(0)+fanz(1), ' array(s) processed'
832          IF ( fanz(1) /= 0 )  THEN
833             WRITE (*,'(16X,I4,A)')  fanz(1), ' array(s) are time-averaged'
834          ENDIF
835!
836!--       Close all files and deallocate array
837          DO  id = 0, danz-1
838             CLOSE ( id+110 )
839          ENDDO
840          CLOSE ( 2 )
841          DEALLOCATE ( pf3d )
842!
843!--       Close the NetCDF file
844          IF ( netcdf_output )  THEN
845#if defined( __netcdf )
846             IF ( netcdf_0 )  THEN
847                nc_stat = NF90_CLOSE( id_set(0) )
848                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 19 )
849             ENDIF
850             IF ( netcdf_1 )  THEN
851                nc_stat = NF90_CLOSE( id_set(1) )
852                IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  CALL handle_netcdf_error( 20 )
853             ENDIF
854#endif
855          ENDIF
856
857!
858!--       Output required cpu time
859          CALL SYSTEM_CLOCK( count, count_rate )
860          cpu_end_time = REAL( count ) / REAL( count_rate )
861          WRITE (*,'(5X,A,F9.3,A)')  'Required cpu-time: ', &
862                                     cpu_end_time-cpu_start_time, ' sec'
863
864       ENDIF
865
866    ENDDO  ! models
867
868
869 CONTAINS
870
871
872    SUBROUTINE handle_netcdf_error( errno )
873!
874!--    Prints out a text message corresponding to the current NetCDF status
875
876       IMPLICIT NONE
877
878       INTEGER, INTENT(IN) ::  errno
879
880#if defined( __netcdf )
881       IF ( nc_stat /= NF90_NOERR )  THEN
882          PRINT*, '+++ combine_plot_fields  netcdf: ', av, errno, &
883                  TRIM( nf90_strerror( nc_stat ) )
884       ENDIF
885#endif
886
887    END SUBROUTINE handle_netcdf_error
888
889
890 END PROGRAM combine_plot_fields
891
892
893
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.