source: palm/trunk/SOURCE/write_3d_binary.f90 @ 110

Last change on this file since 110 was 110, checked in by raasch, 14 years ago

New:
---
Allows runs for a coupled atmosphere-ocean LES,
coupling frequency is controlled by new d3par-parameter dt_coupling,
the coupling mode (atmosphere_to_ocean or ocean_to_atmosphere) for the
respective processes is read from environment variable coupling_mode,
which is set by the mpiexec-command,
communication between the two models is done using the intercommunicator
comm_inter,
local files opened by the ocean model get the additional suffic "_O".
Assume saturation at k=nzb_s_inner(j,i) for atmosphere coupled to ocean.

A momentum flux can be set as top boundary condition using the new
inipar parameter top_momentumflux_u|v.

Non-cyclic boundary conditions can be used along all horizontal directions.

Quantities w*p* and w"e can be output as vertical profiles.

Initial profiles are reset to constant profiles in case that initializing_actions /= 'set_constant_profiles'. (init_rankine)

Optionally calculate km and kh from initial TKE e_init.

Changed:


Remaining variables iran changed to iran_part (advec_particles, init_particles).

In case that the presure solver is not called for every Runge-Kutta substep
(call_psolver_at_all_substeps = .F.), it is called after the first substep
instead of the last. In that case, random perturbations are also added to the
velocity field after the first substep.

Initialization of km,kh = 0.00001 for ocean = .T. (for ocean = .F. it remains 0.01).

Allow data_output_pr= q, wq, w"q", w*q* for humidity = .T. (instead of cloud_physics = .T.).

Errors:


Bugs from code parts for non-cyclic boundary conditions are removed: loops for
u and v are starting from index nxlu, nysv, respectively. The radiation boundary
condition is used for every Runge-Kutta substep. Velocity phase speeds for
the radiation boundary conditions are calculated for the first Runge-Kutta
substep only and reused for the further substeps. New arrays c_u, c_v, and c_w
are defined for this purpose. Several index errors are removed from the
radiation boundary condition code parts. Upper bounds for calculating
u_0 and v_0 (in production_e) are nxr+1 and nyn+1 because otherwise these
values are not available in case of non-cyclic boundary conditions.

+dots_num_palm in module user, +module netcdf_control in user_init (both in user_interface)

Bugfix: wrong sign removed from the buoyancy production term in the case use_reference = .T. (production_e)

Bugfix: Error message concerning output of particle concentration (pc) modified (check_parameters).

Bugfix: Rayleigh damping for ocean fixed.

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 12.2 KB
Line 
1 SUBROUTINE write_3d_binary
2
3!------------------------------------------------------------------------------!
4! Actual revisions:
5! -----------------
6!
7!
8! Former revisions:
9! -----------------
10! $Id: write_3d_binary.f90 110 2007-10-05 05:13:14Z raasch $
11!
12! 102 2007-07-27 09:09:17Z raasch
13! +uswst, uswst_m, vswst, vswst_m
14!
15! 96 2007-06-04 08:07:41Z raasch
16! +rho_av, sa, sa_av, saswsb, saswst
17!
18! 75 2007-03-22 09:54:05Z raasch
19! +precipitation_amount, precipitation_rate_av, rif_wall, u_m_l, u_m_r, etc.,
20! z0_av, moisture renamed humidity
21!
22! 19 2007-02-23 04:53:48Z raasch
23! +qswst, qswst_m, tswst, tswst_m
24!
25! RCS Log replace by Id keyword, revision history cleaned up
26!
27! Revision 1.21  2006/08/04 15:05:11  raasch
28! +iran, iran_part
29!
30! Revision 1.1  1998/03/18 20:20:21  raasch
31! Initial revision
32!
33!
34! Description:
35! ------------
36! Binary output of variables and arrays for restarts.
37!------------------------------------------------------------------------------!
38
39    USE arrays_3d
40    USE averaging
41    USE cloud_parameters
42    USE control_parameters
43    USE cpulog
44    USE indices
45    USE interfaces
46    USE particle_attributes
47    USE pegrid
48    USE profil_parameter
49    USE random_function_mod
50    USE statistics
51
52    IMPLICIT NONE
53
54    CHARACTER (LEN=10) ::  binary_version
55
56
57    CALL cpu_log( log_point(22), 'write_3d_binary', 'start' )
58
59    CALL check_open( 14 )
60   
61!
62!-- Write control parameters and other variables for restart.
63    CALL write_var_list
64
65!
66!-- Write arrays.
67    binary_version = '3.0'
68
69    WRITE ( 14 )  binary_version
70
71    WRITE ( 14 )  numprocs, myid, nxl, nxr, nys, nyn, nzb, nzt
72
73!
74!-- Attention: After changes to the following output commands the version number
75!-- ---------  of the variable binary_version must be changed!
76!--            Also, the list of arrays to be read in read_3d_binary must be
77!--            adjusted accordingly.
78
79    WRITE ( 14 )  'e                   ';  WRITE ( 14 )  e
80    IF ( ALLOCATED( e_av ) )  THEN
81       WRITE ( 14 )  'e_av                ';  WRITE ( 14 )  e_av
82    ENDIF
83    WRITE ( 14 )  'e_m                 ';  WRITE ( 14 )  e_m
84    WRITE ( 14 )  'iran                ';  WRITE ( 14 )  iran, iran_part
85    WRITE ( 14 )  'kh                  ';  WRITE ( 14 )  kh
86    IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
87       WRITE ( 14 )  'kh_m                ';  WRITE ( 14 )  kh_m
88    ENDIF
89    WRITE ( 14 )  'km                  ';  WRITE ( 14 )  km
90    IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
91       WRITE ( 14 )  'km_m                ';  WRITE ( 14 )  km_m
92    ENDIF
93    IF ( ALLOCATED( lwp_av ) )  THEN
94       WRITE ( 14 )  'lwp_av              ';  WRITE ( 14 )  lwp_av
95    ENDIF
96    WRITE ( 14 )  'p                   ';  WRITE ( 14 )  p
97    IF ( ALLOCATED( p_av ) )  THEN
98       WRITE ( 14 )  'p_av                ';  WRITE ( 14 )  p_av
99    ENDIF
100    IF ( ALLOCATED( pc_av ) )  THEN
101       WRITE ( 14 )  'pc_av               ';  WRITE ( 14 )  pc_av
102    ENDIF
103    IF ( ALLOCATED( pr_av ) )  THEN
104       WRITE ( 14 )  'pr_av               ';  WRITE ( 14 )  pr_av
105    ENDIF
106    IF ( ALLOCATED( precipitation_amount ) )  THEN
107       WRITE ( 14 )  'precipitation_amount';  WRITE ( 14 )  precipitation_amount
108    ENDIF
109    IF ( ALLOCATED( precipitation_rate_av ) )  THEN
110       WRITE ( 14 )  'precipitation_rate_a';  WRITE ( 14 )  &
111                                                           precipitation_rate_av
112    ENDIF
113    WRITE ( 14 )  'pt                  ';  WRITE ( 14 )  pt
114    IF ( ALLOCATED( pt_av ) )  THEN
115       WRITE ( 14 )  'pt_av               ';  WRITE ( 14 )  pt_av
116    ENDIF
117    WRITE ( 14 )  'pt_m                ';  WRITE ( 14 )  pt_m
118    IF ( humidity  .OR. passive_scalar )  THEN
119       WRITE ( 14 )  'q                   ';  WRITE ( 14 )  q
120       IF ( ALLOCATED( q_av ) )  THEN
121          WRITE ( 14 )  'q_av                ';  WRITE ( 14 )  q_av
122       ENDIF
123       WRITE ( 14 )  'q_m                 ';  WRITE ( 14 ) q_m
124       IF ( cloud_physics ) THEN
125          WRITE ( 14 )  'ql                  ';  WRITE ( 14 ) ql
126          IF ( ALLOCATED( ql_av ) )  THEN
127             WRITE ( 14 )  'ql_av               ';  WRITE ( 14 )  ql_av
128          ENDIF
129       ENDIF
130       WRITE ( 14 )  'qs                  ';  WRITE ( 14 ) qs
131       WRITE ( 14 )  'qsws                ';  WRITE ( 14 ) qsws
132       IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
133          WRITE ( 14 )  'qsws_m              ';  WRITE ( 14 ) qsws_m
134       ENDIF
135       WRITE ( 14 )  'qswst               ';  WRITE ( 14 ) qswst
136       IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
137          WRITE ( 14 )  'qswst_m             ';  WRITE ( 14 ) qswst_m
138       ENDIF
139    ENDIF
140    IF ( ocean )  THEN
141       IF ( ALLOCATED( rho_av ) )  THEN
142          WRITE ( 14 )  'rho_av              ';  WRITE ( 14 )  rho_av
143       ENDIF
144       WRITE ( 14 )  'sa                  ';  WRITE ( 14 )  sa
145       IF ( ALLOCATED( sa_av ) )  THEN
146          WRITE ( 14 )  'sa_av               ';  WRITE ( 14 )  sa_av
147       ENDIF
148       WRITE ( 14 )  'saswsb              ';  WRITE ( 14 )  saswsb
149       WRITE ( 14 )  'saswst              ';  WRITE ( 14 )  saswst
150    ENDIF
151    IF ( ALLOCATED( ql_c_av ) )  THEN
152       WRITE ( 14 )  'ql_c_av             ';  WRITE ( 14 )  ql_c_av
153    ENDIF
154    IF ( ALLOCATED( ql_v_av ) )  THEN
155       WRITE ( 14 )  'ql_v_av             ';  WRITE ( 14 )  ql_v_av
156    ENDIF
157    IF ( ALLOCATED( ql_vp_av ) )  THEN
158       WRITE ( 14 )  'ql_vp_av            ';  WRITE ( 14 )  ql_vp_av
159    ENDIF
160    IF ( ALLOCATED( qv_av ) )  THEN
161       WRITE ( 14 )  'qv_av               ';  WRITE ( 14 )  qv_av
162    ENDIF
163    WRITE ( 14 )  'random_iv           ';  WRITE ( 14 )  random_iv
164                                           WRITE ( 14 )  random_iy
165    WRITE ( 14 )  'rif                 ';  WRITE ( 14 )  rif
166    IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
167       WRITE ( 14 )  'rif_m               ';  WRITE ( 14 )  rif_m
168    ENDIF
169    IF ( topography /= 'flat' )  THEN
170       WRITE ( 14 )  'rif_wall            ';  WRITE ( 14 )  rif_wall
171    ENDIF
172    IF ( ALLOCATED( s_av ) )  THEN
173       WRITE ( 14 )  's_av                ';  WRITE ( 14 )  s_av
174    ENDIF
175    WRITE ( 14 )  'shf                 ';  WRITE ( 14 )  shf
176    IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
177       WRITE ( 14 )  'shf_m               ';  WRITE ( 14 )  shf_m
178    ENDIF
179    WRITE ( 14 )  'ts                  ';  WRITE ( 14 )  ts
180    IF ( ALLOCATED( ts_av ) )  THEN
181       WRITE ( 14 )  'ts_av               ';  WRITE ( 14 )  ts_av
182    ENDIF
183    WRITE ( 14 )  'tswst               ';  WRITE ( 14 )  tswst
184    IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
185       WRITE ( 14 )  'tswst_m             ';  WRITE ( 14 )  tswst_m
186    ENDIF
187    WRITE ( 14 )  'u                   ';  WRITE ( 14 )  u
188    IF ( ALLOCATED( u_av ) )  THEN
189       WRITE ( 14 )  'u_av                ';  WRITE ( 14 )  u_av
190    ENDIF
191    WRITE ( 14 )  'u_m                 ';  WRITE ( 14 )  u_m
192    IF ( ALLOCATED( u_m_l ) )  THEN
193       WRITE ( 14 )  'u_m_l               ';  WRITE ( 14 )  u_m_l
194    ENDIF
195    IF ( ALLOCATED( u_m_n ) )  THEN
196       WRITE ( 14 )  'u_m_n               ';  WRITE ( 14 )  u_m_n
197    ENDIF
198    IF ( ALLOCATED( u_m_r ) )  THEN
199       WRITE ( 14 )  'u_m_r               ';  WRITE ( 14 )  u_m_r
200    ENDIF
201    IF ( ALLOCATED( u_m_s ) )  THEN
202       WRITE ( 14 )  'u_m_s               ';  WRITE ( 14 )  u_m_s
203    ENDIF
204    WRITE ( 14 )  'us                  ';  WRITE ( 14 )  us
205    WRITE ( 14 )  'usws                ';  WRITE ( 14 )  usws
206    WRITE ( 14 )  'uswst               ';  WRITE ( 14 )  uswst
207    IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
208       WRITE ( 14 )  'usws_m              ';  WRITE ( 14 )  usws_m
209       WRITE ( 14 )  'uswst_m             ';  WRITE ( 14 )  uswst_m
210    ENDIF
211    IF ( ALLOCATED( us_av ) )  THEN
212       WRITE ( 14 )  'us_av               ';  WRITE ( 14 )  us_av
213    ENDIF
214    WRITE ( 14 )  'v                   ';  WRITE ( 14 )  v
215    WRITE ( 14 )  'volume_flow_area    ';  WRITE ( 14 )  volume_flow_area
216    WRITE ( 14 )  'volume_flow_initial ';  WRITE ( 14 )  volume_flow_initial
217    IF ( ALLOCATED( v_av ) )  THEN
218       WRITE ( 14 )  'v_av                ';  WRITE ( 14 )  v_av
219    ENDIF
220    WRITE ( 14 )  'v_m                 ';  WRITE ( 14 )  v_m
221    IF ( ALLOCATED( v_m_l ) )  THEN
222       WRITE ( 14 )  'v_m_l               ';  WRITE ( 14 )  v_m_l
223    ENDIF
224    IF ( ALLOCATED( v_m_n ) )  THEN
225       WRITE ( 14 )  'v_m_n               ';  WRITE ( 14 )  v_m_n
226    ENDIF
227    IF ( ALLOCATED( v_m_r ) )  THEN
228       WRITE ( 14 )  'v_m_r               ';  WRITE ( 14 )  v_m_r
229    ENDIF
230    IF ( ALLOCATED( v_m_s ) )  THEN
231       WRITE ( 14 )  'v_m_s               ';  WRITE ( 14 )  v_m_s
232    ENDIF
233    IF ( humidity )  THEN
234       WRITE ( 14 )  'vpt                 ';  WRITE ( 14 )  vpt
235       IF ( ALLOCATED( vpt_av ) )  THEN
236          WRITE ( 14 )  'vpt_av              ';  WRITE ( 14 )  vpt_av
237       ENDIF
238       IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
239          WRITE ( 14 )  'vpt_m               ';  WRITE ( 14 )  vpt_m
240       ENDIF
241    ENDIF
242    WRITE ( 14 )  'vsws                ';  WRITE ( 14 )  vsws
243    WRITE ( 14 )  'vswst               ';  WRITE ( 14 )  vswst
244    IF ( timestep_scheme(1:5) /= 'runge' )  THEN
245       WRITE ( 14 )  'vsws_m              ';  WRITE ( 14 )  vsws_m
246       WRITE ( 14 )  'vswst_m             ';  WRITE ( 14 )  vswst_m
247    ENDIF
248    WRITE ( 14 )  'w                   ';  WRITE ( 14 )  w
249    IF ( ALLOCATED( w_av ) )  THEN
250       WRITE ( 14 )  'w_av                ';  WRITE ( 14 )  w_av
251    ENDIF
252    WRITE ( 14 )  'w_m                 ';  WRITE ( 14 )  w_m
253    IF ( ALLOCATED( w_m_l ) )  THEN
254       WRITE ( 14 )  'w_m_l               ';  WRITE ( 14 )  w_m_l
255    ENDIF
256    IF ( ALLOCATED( w_m_n ) )  THEN
257       WRITE ( 14 )  'w_m_n               ';  WRITE ( 14 )  w_m_n
258    ENDIF
259    IF ( ALLOCATED( w_m_r ) )  THEN
260       WRITE ( 14 )  'w_m_r               ';  WRITE ( 14 )  w_m_r
261    ENDIF
262    IF ( ALLOCATED( w_m_s ) )  THEN
263       WRITE ( 14 )  'w_m_s               ';  WRITE ( 14 )  w_m_s
264    ENDIF
265    WRITE ( 14 )  'z0                  ';  WRITE ( 14 )  z0
266    IF ( ALLOCATED( z0_av ) )  THEN
267       WRITE ( 14 )  'z0_av               ';  WRITE ( 14 )  z0_av
268    ENDIF
269
270    WRITE ( 14 )  'cross_linecolors    ';  WRITE ( 14 )  cross_linecolors
271    WRITE ( 14 )  'cross_linestyles    ';  WRITE ( 14 )  cross_linestyles
272    WRITE ( 14 )  'cross_normalized_x  ';  WRITE ( 14 )  cross_normalized_x
273    WRITE ( 14 )  'cross_normalized_y  ';  WRITE ( 14 )  cross_normalized_y
274    WRITE ( 14 )  'cross_normx_factor  ';  WRITE ( 14 )  cross_normx_factor
275    WRITE ( 14 )  'cross_normy_factor  ';  WRITE ( 14 )  cross_normy_factor
276    WRITE ( 14 )  'cross_profiles      ';  WRITE ( 14 )  cross_profiles
277    WRITE ( 14 )  'cross_profile_n_coun'
278                  WRITE ( 14 )  cross_profile_number_count
279    WRITE ( 14 )  'cross_profile_number';  WRITE ( 14 )  cross_profile_numbers
280    WRITE ( 14 )  'cross_uxmax         ';  WRITE ( 14 )  cross_uxmax
281    WRITE ( 14 )  'cross_uxmax_computed';  WRITE ( 14 )  cross_uxmax_computed
282    WRITE ( 14 )  'cross_uxmax_normaliz';  WRITE ( 14 )  cross_uxmax_normalized
283    WRITE ( 14 )  'cross_uxmax_norm_com'
284                  WRITE ( 14 )  cross_uxmax_normalized_computed
285    WRITE ( 14 )  'cross_uxmin         ';  WRITE ( 14 )  cross_uxmin
286    WRITE ( 14 )  'cross_uxmin_computed';  WRITE ( 14 )  cross_uxmin_computed
287    WRITE ( 14 )  'cross_uxmin_normaliz';  WRITE ( 14 )  cross_uxmin_normalized
288    WRITE ( 14 )  'cross_uxmin_norm_com'
289                  WRITE ( 14 )  cross_uxmin_normalized_computed
290    WRITE ( 14 )  'cross_uymax         ';  WRITE ( 14 )  cross_uymax
291    WRITE ( 14 )  'cross_uymin         ';  WRITE ( 14 )  cross_uymin
292    WRITE ( 14 )  'cross_xtext         ';  WRITE ( 14 )  cross_xtext
293    WRITE ( 14 )  'dopr_crossindex     ';  WRITE ( 14 )  dopr_crossindex
294    WRITE ( 14 )  'dopr_time_count     ';  WRITE ( 14 )  dopr_time_count
295    WRITE ( 14 )  'hom_sum             ';  WRITE ( 14 )  hom_sum
296    WRITE ( 14 )  'profile_columns     ';  WRITE ( 14 )  profile_columns
297    WRITE ( 14 )  'profile_number      ';  WRITE ( 14 )  profile_number
298    WRITE ( 14 )  'profile_rows        ';  WRITE ( 14 )  profile_rows
299    IF ( ALLOCATED( spectrum_x ) )  THEN
300       WRITE ( 14 )  'spectrum_x          ';  WRITE ( 14 )  spectrum_x
301       WRITE ( 14 )  'spectrum_y          ';  WRITE ( 14 )  spectrum_y
302    ENDIF
303
304!
305!-- Write end label. Unit 14 is closed in the main program.
306    WRITE ( 14 )  '*** end ***         '
307
308
309    CALL cpu_log( log_point(22), 'write_3d_binary', 'stop' )
310
311
312 END SUBROUTINE write_3d_binary
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.