source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 4346

Last change on this file since 4346 was 4346, checked in by motisi, 23 months ago

Introduction of wall_flags_total_0, which currently sets bits based on static topography information used in wall_flags_static_0

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 25.8 KB
Line 
1!> @file data_output_3d.f90
2!------------------------------------------------------------------------------!
3! This file is part of the PALM model system.
4!
5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
17! Copyright 1997-2019 Leibniz Universitaet Hannover
18!------------------------------------------------------------------------------!
19!
20! Current revisions:
21! ------------------
22!
23!
24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: data_output_3d.f90 4346 2019-12-18 11:55:56Z motisi $
27! Introduction of wall_flags_total_0, which currently sets bits based on static
28! topography information used in wall_flags_static_0
29!
30! 4329 2019-12-10 15:46:36Z motisi
31! Renamed wall_flags_0 to wall_flags_static_0
32!
33! 4182 2019-08-22 15:20:23Z scharf
34! Corrected "Former revisions" section
35!
36! 4162 2019-08-16 05:54:29Z raasch
37! bugfix for r4155
38!
39! 4155 2019-08-14 06:25:18Z raasch
40! bugfix for 3d-output in serial mode (ghost points must not be written)
41!
42! 4127 2019-07-30 14:47:10Z suehring
43! Adjustment for top boundary index for plant-canopy model outputs
44! (merge from branch resler)
45!
46! 4048 2019-06-21 21:00:21Z knoop
47! Moved tcm_data_output_3d to module_interface
48!
49! 4039 2019-06-18 10:32:41Z suehring
50! modularize diagnostic output
51!
52! 3994 2019-05-22 18:08:09Z suehring
53! output of turbulence intensity added
54!
55! 3987 2019-05-22 09:52:13Z kanani
56! Introduce alternative switch for debug output during timestepping
57!
58! 3885 2019-04-11 11:29:34Z kanani
59! Changes related to global restructuring of location messages and introduction
60! of additional debug messages
61!
62! 3814 2019-03-26 08:40:31Z pavelkrc
63! unused variables removed
64!
65! 3655 2019-01-07 16:51:22Z knoop
66! Bugfix: use time_since_reference_point instead of simulated_time (relevant
67! when using wall/soil spinup)
68!
69! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
70! Initial revision
71!
72!
73! Description:
74! ------------
75!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
76!------------------------------------------------------------------------------!
77 SUBROUTINE data_output_3d( av )
78 
79
80    USE arrays_3d,                                                             &
81        ONLY:  d_exner, e, p, pt, q, ql, ql_c, ql_v, s, tend, u, v, vpt, w
82
83    USE averaging
84
85    USE basic_constants_and_equations_mod,                                     &
86        ONLY:  lv_d_cp
87
88    USE bulk_cloud_model_mod,                                                  &
89        ONLY:  bulk_cloud_model
90
91    USE control_parameters,                                                    &
92        ONLY:  debug_output_timestep,                                          &
93               do3d, do3d_no, do3d_time_count, io_blocks, io_group,            &
94               land_surface, message_string, ntdim_3d, nz_do3d, plant_canopy,  &
95               psolver, time_since_reference_point, urban_surface,             &
96               varnamelength
97
98    USE cpulog,                                                                &
99        ONLY:  log_point, cpu_log
100
101#if defined( __parallel )
102    USE indices,                                                               &
103        ONLY:  nbgp, nxl, nxlg, nxr, nxrg, nyn, nyng, nys, nysg, nzb, nzt,     &
104               wall_flags_total_0
105#else
106    USE indices,                                                               &
107        ONLY:  nbgp, nx, nxl, nxlg, nxr, nxrg, ny, nyn, nyng, nys, nysg, nzb,  &
108               nzt, wall_flags_total_0
109#endif
110
111    USE kinds
112
113    USE land_surface_model_mod,                                                &
114        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
115
116    USE module_interface,                                                      &
117        ONLY:  module_interface_data_output_3d
118
119#if defined( __netcdf )
120    USE NETCDF
121#endif
122
123    USE netcdf_interface,                                                      &
124        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat,    &
125               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
126
127    USE particle_attributes,                                                   &
128        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
129               particle_advection_start, prt_count
130
131    USE pegrid
132
133    USE plant_canopy_model_mod,                                                &
134        ONLY:  pch_index
135
136    USE radiation_model_mod,                                                   &
137        ONLY:  nz_urban_b, nz_urban_t
138
139    USE urban_surface_mod,                                                     &
140        ONLY:  usm_data_output_3d
141
142
143    IMPLICIT NONE
144
145    INTEGER(iwp) ::  av        !< flag for (non-)average output
146    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
147    INTEGER(iwp) ::  i         !< loop index
148    INTEGER(iwp) ::  ivar      !< variable index
149    INTEGER(iwp) ::  j         !< loop index
150    INTEGER(iwp) ::  k         !< loop index
151    INTEGER(iwp) ::  n         !< loop index
152    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
153    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
154
155    LOGICAL      ::  found     !< true if output variable was found
156    LOGICAL      ::  resorted  !< true if variable is resorted
157
158    REAL(wp)     ::  mean_r    !< mean particle radius
159    REAL(wp)     ::  s_r2      !< sum( particle-radius**2 )
160    REAL(wp)     ::  s_r3      !< sum( particle-radius**3 )
161
162    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !< output array
163
164    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !< pointer to array which shall be output
165
166    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
167
168!
169!-- Return, if nothing to output
170    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
171
172    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'start' )
173
174    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
175
176!
177!-- Open output file.
178!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its
179!-- own file and writes the data of its subdomain in binary format. After the
180!-- run, these files are combined to one NetCDF file by combine_plot_fields.
181!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
182    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
183#if defined( __parallel )
184       CALL check_open( 30 )
185#endif
186       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
187    ELSE
188       CALL check_open( 106+av*10 )
189    ENDIF
190
191!
192!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this
193!-- limit is exceeded. This could be the case, if the simulated time exceeds
194!-- the given end time by the length of the given output interval.
195    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
196       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
197          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',               &
198                                      time_since_reference_point, 's because the maximum ', & 
199                                      'number of output time levels is ',                   &
200                                      'exceeded.'
201          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
202          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
203          RETURN
204       ENDIF
205    ENDIF
206
207!
208!-- Update the netCDF time axis
209!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the
210!-- performance.
211#if defined( __netcdf )
212    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
213    IF ( myid == 0 )  THEN
214       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),           &
215                               (/ time_since_reference_point /),            &
216                               start = (/ do3d_time_count(av) /),           &
217                               count = (/ 1 /) )
218       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
219    ENDIF
220#endif
221
222!
223!-- Loop over all variables to be written.
224    ivar = 1
225
226    DO  WHILE ( do3d(av,ivar)(1:1) /= ' ' )
227
228!
229!--    Initiate found flag and resorting flag
230       found = .FALSE.
231       resorted = .FALSE.
232       trimvar = TRIM( do3d(av,ivar) )
233
234!
235!--    Temporary solution to account for data output within the new urban
236!--    surface model (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
237!--    Store the array chosen on the temporary array.
238       nzb_do   = nzb
239!
240!--    Set top index for 3D output. Note in case of plant-canopy model
241!--    these index is determined by pch_index.
242       IF ( plant_canopy  .AND.  trimvar(1:4) == 'pcm_' )  THEN
243          nzt_do   = pch_index
244       ELSE
245          nzt_do   = nz_do3d
246       ENDIF
247
248!
249!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
250       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
251!
252!--    Before each output, set array local_pf to fill value
253       local_pf = fill_value
254!
255!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
256       flag_nr = 0
257
258       SELECT CASE ( trimvar )
259
260          CASE ( 'e' )
261             IF ( av == 0 )  THEN
262                to_be_resorted => e
263             ELSE
264                IF ( .NOT. ALLOCATED( e_av ) ) THEN
265                   ALLOCATE( e_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
266                   e_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
267                ENDIF
268                to_be_resorted => e_av
269             ENDIF
270
271          CASE ( 'thetal' )
272             IF ( av == 0 )  THEN
273                to_be_resorted => pt
274             ELSE
275                IF ( .NOT. ALLOCATED( lpt_av ) ) THEN
276                   ALLOCATE( lpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
277                   lpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
278                ENDIF
279                to_be_resorted => lpt_av
280             ENDIF
281
282          CASE ( 'p' )
283             IF ( av == 0 )  THEN
284                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
285                to_be_resorted => p
286             ELSE
287                IF ( .NOT. ALLOCATED( p_av ) ) THEN
288                   ALLOCATE( p_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
289                   p_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
290                ENDIF
291                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
292                to_be_resorted => p_av
293             ENDIF
294
295          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
296             IF ( av == 0 )  THEN
297                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
298                   tend = prt_count
299                ELSE
300                   tend = 0.0_wp
301                ENDIF
302                DO  i = nxl, nxr
303                   DO  j = nys, nyn
304                      DO  k = nzb_do, nzt_do
305                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
306                      ENDDO
307                   ENDDO
308                ENDDO
309                resorted = .TRUE.
310             ELSE
311                IF ( .NOT. ALLOCATED( pc_av ) ) THEN
312                   ALLOCATE( pc_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
313                   pc_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
314                ENDIF
315                to_be_resorted => pc_av
316             ENDIF
317
318          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
319             IF ( av == 0 )  THEN
320                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
321                   DO  i = nxl, nxr
322                      DO  j = nys, nyn
323                         DO  k = nzb_do, nzt_do
324                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
325                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
326                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
327                            s_r2 = 0.0_wp
328                            s_r3 = 0.0_wp
329                            DO  n = 1, number_of_particles
330                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
331                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * &
332                                         particles(n)%weight_factor
333                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * &
334                                         particles(n)%weight_factor
335                               ENDIF
336                            ENDDO
337                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
338                               mean_r = s_r3 / s_r2
339                            ELSE
340                               mean_r = 0.0_wp
341                            ENDIF
342                            tend(k,j,i) = mean_r
343                         ENDDO
344                      ENDDO
345                   ENDDO
346                ELSE
347                   tend = 0.0_wp
348                ENDIF
349                DO  i = nxl, nxr
350                   DO  j = nys, nyn
351                      DO  k = nzb_do, nzt_do
352                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
353                      ENDDO
354                   ENDDO
355                ENDDO
356                resorted = .TRUE.
357             ELSE
358                IF ( .NOT. ALLOCATED( pr_av ) ) THEN
359                   ALLOCATE( pr_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
360                   pr_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
361                ENDIF
362                to_be_resorted => pr_av
363             ENDIF
364
365          CASE ( 'theta' )
366             IF ( av == 0 )  THEN
367                IF ( .NOT. bulk_cloud_model ) THEN
368                   to_be_resorted => pt
369                ELSE
370                   DO  i = nxl, nxr
371                      DO  j = nys, nyn
372                         DO  k = nzb_do, nzt_do
373                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + lv_d_cp *            &
374                                                          d_exner(k) *         &
375                                                          ql(k,j,i)
376                         ENDDO
377                      ENDDO
378                   ENDDO
379                   resorted = .TRUE.
380                ENDIF
381             ELSE
382                IF ( .NOT. ALLOCATED( pt_av ) ) THEN
383                   ALLOCATE( pt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
384                   pt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
385                ENDIF
386                to_be_resorted => pt_av
387             ENDIF
388
389          CASE ( 'q' )
390             IF ( av == 0 )  THEN
391                to_be_resorted => q
392             ELSE
393                IF ( .NOT. ALLOCATED( q_av ) ) THEN
394                   ALLOCATE( q_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
395                   q_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
396                ENDIF
397                to_be_resorted => q_av
398             ENDIF
399
400          CASE ( 'ql' )
401             IF ( av == 0 )  THEN
402                to_be_resorted => ql
403             ELSE
404                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_av ) ) THEN
405                   ALLOCATE( ql_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
406                   ql_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
407                ENDIF
408                to_be_resorted => ql_av
409             ENDIF
410
411          CASE ( 'ql_c' )
412             IF ( av == 0 )  THEN
413                to_be_resorted => ql_c
414             ELSE
415                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_c_av ) ) THEN
416                   ALLOCATE( ql_c_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
417                   ql_c_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
418                ENDIF
419                to_be_resorted => ql_c_av
420             ENDIF
421
422          CASE ( 'ql_v' )
423             IF ( av == 0 )  THEN
424                to_be_resorted => ql_v
425             ELSE
426                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_v_av ) ) THEN
427                   ALLOCATE( ql_v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
428                   ql_v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
429                ENDIF
430                to_be_resorted => ql_v_av
431             ENDIF
432
433          CASE ( 'ql_vp' )
434             IF ( av == 0 )  THEN
435                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
436                   DO  i = nxl, nxr
437                      DO  j = nys, nyn
438                         DO  k = nzb_do, nzt_do
439                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
440                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
441                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
442                            DO  n = 1, number_of_particles
443                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
444                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                 &
445                                                 particles(n)%weight_factor /  &
446                                                 prt_count(k,j,i)
447                               ENDIF
448                            ENDDO
449                         ENDDO
450                      ENDDO
451                   ENDDO
452                ELSE
453                   tend = 0.0_wp
454                ENDIF
455                DO  i = nxl, nxr
456                   DO  j = nys, nyn
457                      DO  k = nzb_do, nzt_do
458                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
459                      ENDDO
460                   ENDDO
461                ENDDO
462                resorted = .TRUE.
463             ELSE
464                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_vp_av ) ) THEN
465                   ALLOCATE( ql_vp_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
466                   ql_vp_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
467                ENDIF
468                to_be_resorted => ql_vp_av
469             ENDIF
470
471          CASE ( 'qv' )
472             IF ( av == 0 )  THEN
473                DO  i = nxl, nxr
474                   DO  j = nys, nyn
475                      DO  k = nzb_do, nzt_do
476                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
477                      ENDDO
478                   ENDDO
479                ENDDO
480                resorted = .TRUE.
481             ELSE
482                IF ( .NOT. ALLOCATED( qv_av ) ) THEN
483                   ALLOCATE( qv_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
484                   qv_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
485                ENDIF
486                to_be_resorted => qv_av
487             ENDIF
488
489          CASE ( 's' )
490             IF ( av == 0 )  THEN
491                to_be_resorted => s
492             ELSE
493                IF ( .NOT. ALLOCATED( s_av ) ) THEN
494                   ALLOCATE( s_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
495                   s_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
496                ENDIF
497                to_be_resorted => s_av
498             ENDIF
499
500          CASE ( 'u' )
501             flag_nr = 1
502             IF ( av == 0 )  THEN
503                to_be_resorted => u
504             ELSE
505                IF ( .NOT. ALLOCATED( u_av ) ) THEN
506                   ALLOCATE( u_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
507                   u_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
508                ENDIF
509                to_be_resorted => u_av
510             ENDIF
511
512          CASE ( 'v' )
513             flag_nr = 2
514             IF ( av == 0 )  THEN
515                to_be_resorted => v
516             ELSE
517                IF ( .NOT. ALLOCATED( v_av ) ) THEN
518                   ALLOCATE( v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
519                   v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
520                ENDIF
521                to_be_resorted => v_av
522             ENDIF
523
524          CASE ( 'thetav' )
525             IF ( av == 0 )  THEN
526                to_be_resorted => vpt
527             ELSE
528                IF ( .NOT. ALLOCATED( vpt_av ) ) THEN
529                   ALLOCATE( vpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
530                   vpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
531                ENDIF
532                to_be_resorted => vpt_av
533             ENDIF
534
535          CASE ( 'w' )
536             flag_nr = 3
537             IF ( av == 0 )  THEN
538                to_be_resorted => w
539             ELSE
540                IF ( .NOT. ALLOCATED( w_av ) ) THEN
541                   ALLOCATE( w_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
542                   w_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
543                ENDIF
544                to_be_resorted => w_av
545             ENDIF
546
547          CASE DEFAULT
548!
549!--          Quantities of other modules
550             IF ( .NOT. found )  THEN
551                CALL module_interface_data_output_3d(                          &
552                        av, trimvar, found, local_pf,                          &
553                        fill_value, resorted, nzb_do, nzt_do                   &
554                     )
555             ENDIF
556
557!
558!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
559             IF ( .NOT. found  .AND.  urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
560!
561!--             For urban model quantities, it is required to re-allocate local_pf
562                nzb_do = nz_urban_b
563                nzt_do = nz_urban_t
564
565                DEALLOCATE ( local_pf )
566                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
567                local_pf = fill_value
568
569                CALL usm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf,         &
570                                         nzb_do, nzt_do )
571                resorted = .TRUE.
572
573!
574!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
575                IF ( .NOT. found )  THEN
576                   nzb_do = nzb
577                   nzt_do = nz_do3d
578
579                   DEALLOCATE ( local_pf )
580                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
581                ENDIF
582
583             ENDIF
584
585!
586!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
587             IF ( .NOT. found  .AND.  land_surface )  THEN
588!
589!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
590                nzb_do = nzb_soil
591                nzt_do = nzt_soil
592
593                DEALLOCATE ( local_pf )
594                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
595                local_pf = fill_value
596
597                CALL lsm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf )
598                resorted = .TRUE.
599
600!
601!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
602                IF ( .NOT. found )  THEN
603                   nzb_do = nzb
604                   nzt_do = nz_do3d
605
606                   DEALLOCATE ( local_pf )
607                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
608                ENDIF
609
610             ENDIF
611
612             IF ( .NOT. found )  THEN
613                message_string =  'no output available for: ' //               &
614                                  TRIM( do3d(av,ivar) )
615                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
616             ENDIF
617
618       END SELECT
619
620!
621!--    Resort the array to be output, if not done above
622       IF ( .NOT. resorted )  THEN
623          DO  i = nxl, nxr
624             DO  j = nys, nyn
625                DO  k = nzb_do, nzt_do
626                   local_pf(i,j,k) = MERGE(                                    &
627                                      to_be_resorted(k,j,i),                   &
628                                      REAL( fill_value, KIND = wp ),           &
629                                      BTEST( wall_flags_total_0(k,j,i), flag_nr ) )
630                ENDDO
631             ENDDO
632          ENDDO
633       ENDIF
634
635!
636!--    Output of the 3D-array
637#if defined( __parallel )
638       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
639!
640!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in
641!--       FORTRAN binary format here, and later collected into one file by
642!--       combine_plot_fields
643          IF ( myid == 0 )  THEN
644             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point,                   &
645                           do3d_time_count(av), av
646          ENDIF
647          DO  i = 0, io_blocks-1
648             IF ( i == io_group )  THEN
649                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
650                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
651             ENDIF
652
653             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
654
655          ENDDO
656
657       ELSE
658#if defined( __netcdf )
659!
660!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
661!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
662!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
663!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
664!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
665!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
666!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
667!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
668!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
669!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
670!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
671!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
672!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
673!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
674!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
675!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
676!          ELSE
677             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
678                                 local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
679                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
680                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
681!          ENDIF
682          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
683#endif
684       ENDIF
685#else
686#if defined( __netcdf )
687       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),        &
688                         local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),          &
689                         start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),       &
690                         count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
691       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
692#endif
693#endif
694
695       ivar = ivar + 1
696
697!
698!--    Deallocate temporary array
699       DEALLOCATE ( local_pf )
700
701    ENDDO
702
703    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
704
705    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'end' )
706
707
708 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.