source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 4618

Last change on this file since 4618 was 4559, checked in by raasch, 4 years ago

files re-formatted to follow the PALM coding standard

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 26.3 KB
RevLine 
[1682]1!> @file data_output_3d.f90
[4559]2!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
[2696]3! This file is part of the PALM model system.
[1036]4!
[4559]5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms of the GNU General
6! Public License as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or
7! (at your option) any later version.
[1036]8!
[4559]9! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the
10! implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU General
11! Public License for more details.
[1036]12!
[4559]13! You should have received a copy of the GNU General Public License along with PALM. If not, see
14! <http://www.gnu.org/licenses/>.
[1036]15!
[4360]16! Copyright 1997-2020 Leibniz Universitaet Hannover
[4559]17!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
[1036]18!
[254]19! Current revisions:
[1106]20! ------------------
[3589]21!
22!
23! Former revisions:
24! -----------------
25! $Id: data_output_3d.f90 4559 2020-06-11 08:51:48Z raasch $
[4559]26! file re-formatted to follow the PALM coding standard
27!
28! 4457 2020-03-11 14:20:43Z raasch
[4457]29! use statement for exchange horiz added
[4559]30!
[4457]31! 4444 2020-03-05 15:59:50Z raasch
[4444]32! bugfix: cpp-directives for serial mode added
[4559]33!
[4444]34! 4360 2020-01-07 11:25:50Z suehring
[4559]35! Introduction of wall_flags_total_0, which currently sets bits based on static topography
36! information used in wall_flags_static_0
37!
[4346]38! 4329 2019-12-10 15:46:36Z motisi
[4329]39! Renamed wall_flags_0 to wall_flags_static_0
[4559]40!
[4329]41! 4182 2019-08-22 15:20:23Z scharf
[4182]42! Corrected "Former revisions" section
[4559]43!
[4182]44! 4162 2019-08-16 05:54:29Z raasch
[4162]45! bugfix for r4155
[4559]46!
[4162]47! 4155 2019-08-14 06:25:18Z raasch
[4155]48! bugfix for 3d-output in serial mode (ghost points must not be written)
[4559]49!
[4155]50! 4127 2019-07-30 14:47:10Z suehring
[4559]51! Adjustment for top boundary index for plant-canopy model outputs (merge from branch resler)
52!
[4127]53! 4048 2019-06-21 21:00:21Z knoop
[4048]54! Moved tcm_data_output_3d to module_interface
[4559]55!
[4048]56! 4039 2019-06-18 10:32:41Z suehring
[4039]57! modularize diagnostic output
[4559]58!
[4039]59! 3994 2019-05-22 18:08:09Z suehring
[3994]60! output of turbulence intensity added
[4559]61!
[3994]62! 3987 2019-05-22 09:52:13Z kanani
[3987]63! Introduce alternative switch for debug output during timestepping
[4559]64!
[3987]65! 3885 2019-04-11 11:29:34Z kanani
[4559]66! Changes related to global restructuring of location messages and introduction of additional debug
67! messages
68!
[3885]69! 3814 2019-03-26 08:40:31Z pavelkrc
[3766]70! unused variables removed
[4559]71!
[3766]72! 3655 2019-01-07 16:51:22Z knoop
[4559]73! Bugfix: use time_since_reference_point instead of simulated_time (relevant when using wall/soil
74!         spinup)
[3582]75!
[4182]76! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
77! Initial revision
78!
79!
[1]80! Description:
81! ------------
[1682]82!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
[4559]83!--------------------------------------------------------------------------------------------------!
[1682]84 SUBROUTINE data_output_3d( av )
[1]85
[4559]86
87    USE arrays_3d,                                                                                 &
[3766]88        ONLY:  d_exner, e, p, pt, q, ql, ql_c, ql_v, s, tend, u, v, vpt, w
[3274]89
[1]90    USE averaging
[3274]91
[4559]92    USE basic_constants_and_equations_mod,                                                         &
[3274]93        ONLY:  lv_d_cp
94
[4559]95    USE bulk_cloud_model_mod,                                                                      &
[3637]96        ONLY:  bulk_cloud_model
[3274]97
[4559]98    USE control_parameters,                                                                        &
99        ONLY:  debug_output_timestep, do3d, do3d_no, do3d_time_count, land_surface, message_string,&
100               ntdim_3d, nz_do3d, plant_canopy, psolver, time_since_reference_point, urban_surface,&
[4127]101               varnamelength
[3274]102
[4444]103#if defined( __parallel )
[4559]104    USE control_parameters,                                                                        &
[4444]105        ONLY:  io_blocks, io_group
106#endif
107
[4559]108    USE cpulog,                                                                                    &
109        ONLY: cpu_log, log_point
[2817]110
[4559]111    USE exchange_horiz_mod,                                                                        &
[4457]112        ONLY:  exchange_horiz
113
[4559]114    USE indices,                                                                                   &
115        ONLY:  nbgp, nxl, nxlg, nxr, nxrg, nyn, nyng, nys, nysg, nzb, nzt, wall_flags_total_0
[4444]116
117#if ! defined( __parallel )
[4559]118    USE indices,                                                                                   &
[4444]119        ONLY:  nx, ny
[3405]120#endif
[3274]121
[1320]122    USE kinds
[3274]123
[4559]124    USE land_surface_model_mod,                                                                    &
[2232]125        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
[1551]126
[4559]127    USE module_interface,                                                                          &
[3637]128        ONLY:  module_interface_data_output_3d
129
[1783]130#if defined( __netcdf )
131    USE NETCDF
132#endif
133
[4559]134    USE netcdf_interface,                                                                          &
135        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat, netcdf_data_format,    &
136               netcdf_handle_error
[3294]137
[4559]138    USE particle_attributes,                                                                       &
139        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles, particle_advection_start, prt_count
[3637]140
[1]141    USE pegrid
142
[4559]143    USE plant_canopy_model_mod,                                                                    &
[4127]144        ONLY:  pch_index
145
[4559]146    USE radiation_model_mod,                                                                       &
[3814]147        ONLY:  nz_urban_b, nz_urban_t
[1585]148
[4559]149    USE urban_surface_mod,                                                                         &
[2696]150        ONLY:  usm_data_output_3d
[1585]151
[2007]152
[1]153    IMPLICIT NONE
154
[3554]155    INTEGER(iwp) ::  av        !< flag for (non-)average output
[2696]156    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
[3554]157    INTEGER(iwp) ::  i         !< loop index
158    INTEGER(iwp) ::  ivar      !< variable index
159    INTEGER(iwp) ::  j         !< loop index
160    INTEGER(iwp) ::  k         !< loop index
161    INTEGER(iwp) ::  n         !< loop index
[1682]162    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
163    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
[1]164
[3554]165    LOGICAL      ::  found     !< true if output variable was found
166    LOGICAL      ::  resorted  !< true if variable is resorted
[1]167
[3554]168    REAL(wp)     ::  mean_r    !< mean particle radius
169    REAL(wp)     ::  s_r2      !< sum( particle-radius**2 )
170    REAL(wp)     ::  s_r3      !< sum( particle-radius**3 )
[1]171
[3554]172    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !< output array
[1]173
[4559]174    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !< pointer to array which shall be
175                                                            !< output
[1]176
[2011]177    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
[2007]178
[1]179!
180!-- Return, if nothing to output
181    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
182
[3987]183    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'start' )
[3885]184
[1]185    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
186
187!
188!-- Open output file.
[4559]189!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its own file and writes
190!-- the data of its subdomain in binary format. After the run, these files are combined to one
191!-- NetCDF file by combine_plot_fields.
[1031]192!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
[1327]193    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[2967]194#if defined( __parallel )
[1327]195       CALL check_open( 30 )
[2967]196#endif
[1327]197       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
[493]198    ELSE
[1327]199       CALL check_open( 106+av*10 )
[493]200    ENDIF
[1]201
202!
[4559]203!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this limit is exceeded.
204!-- This could be the case, if the simulated time exceeds the given end time by the length of the
205!-- given output interval.
[1745]206    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
207       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
[4559]208          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',                      &
209                                      time_since_reference_point, 's because the maximum ',        &
210                                      'number of output time levels is ',                          &
[1745]211                                      'exceeded.'
212          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
213          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
214          RETURN
215       ENDIF
216    ENDIF
217
218!
[4559]219!-- Update the netCDF time axis.
220!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the performance.
[1]221#if defined( __netcdf )
[1308]222    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
223    IF ( myid == 0 )  THEN
[4559]224       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),                                  &
225                               (/ time_since_reference_point /),                                   &
226                               start = (/ do3d_time_count(av) /),                                  &
[1327]227                               count = (/ 1 /) )
[1783]228       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
[1]229    ENDIF
230#endif
231
232!
233!-- Loop over all variables to be written.
[3554]234    ivar = 1
[1]235
[3554]236    DO  WHILE ( do3d(av,ivar)(1:1) /= ' ' )
[2007]237
[1]238!
[3637]239!--    Initiate found flag and resorting flag
240       found = .FALSE.
241       resorted = .FALSE.
[4127]242       trimvar = TRIM( do3d(av,ivar) )
243
[3637]244!
[4559]245!--    Temporary solution to account for data output within the new urban surface model
246!--    (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
[1]247!--    Store the array chosen on the temporary array.
[3637]248       nzb_do   = nzb
[4127]249!
[4559]250!--    Set top index for 3D output. Note in case of plant-canopy model these index is determined by
251!--    pch_index.
[4127]252       IF ( plant_canopy  .AND.  trimvar(1:4) == 'pcm_' )  THEN
253          nzt_do   = pch_index
254       ELSE
255          nzt_do   = nz_do3d
256       ENDIF
[3637]257
[1551]258!
259!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
[2512]260       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]261!
262!--    Before each output, set array local_pf to fill value
263       local_pf = fill_value
264!
265!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
266       flag_nr = 0
[1551]267
[2007]268       SELECT CASE ( trimvar )
[1]269
270          CASE ( 'e' )
271             IF ( av == 0 )  THEN
272                to_be_resorted => e
273             ELSE
[4559]274                IF ( .NOT. ALLOCATED( e_av ) )  THEN
[3004]275                   ALLOCATE( e_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
276                   e_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
277                ENDIF
[1]278                to_be_resorted => e_av
279             ENDIF
280
[3421]281          CASE ( 'thetal' )
[771]282             IF ( av == 0 )  THEN
283                to_be_resorted => pt
284             ELSE
[4559]285                IF ( .NOT. ALLOCATED( lpt_av ) )  THEN
[3004]286                   ALLOCATE( lpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
287                   lpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
288                ENDIF
[771]289                to_be_resorted => lpt_av
290             ENDIF
291
[1]292          CASE ( 'p' )
293             IF ( av == 0 )  THEN
[727]294                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
[1]295                to_be_resorted => p
296             ELSE
[4559]297                IF ( .NOT. ALLOCATED( p_av ) )  THEN
[3004]298                   ALLOCATE( p_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
299                   p_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
300                ENDIF
[727]301                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
[1]302                to_be_resorted => p_av
303             ENDIF
304
305          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
306             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]307                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]308                   tend = prt_count
309                ELSE
310                   tend = 0.0_wp
311                ENDIF
[2512]312                DO  i = nxl, nxr
313                   DO  j = nys, nyn
[1551]314                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]315                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
316                      ENDDO
317                   ENDDO
318                ENDDO
319                resorted = .TRUE.
320             ELSE
[4559]321                IF ( .NOT. ALLOCATED( pc_av ) )  THEN
[3004]322                   ALLOCATE( pc_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
323                   pc_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
324                ENDIF
[1]325                to_be_resorted => pc_av
326             ENDIF
327
[1359]328          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
[1]329             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]330                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]331                   DO  i = nxl, nxr
332                      DO  j = nys, nyn
[1551]333                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]334                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
[4559]335                            IF ( number_of_particles <= 0 )  CYCLE
[1359]336                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
337                            s_r2 = 0.0_wp
338                            s_r3 = 0.0_wp
339                            DO  n = 1, number_of_particles
340                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
[4559]341                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * particles(n)%weight_factor
342                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * particles(n)%weight_factor
[1359]343                               ENDIF
344                            ENDDO
345                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
346                               mean_r = s_r3 / s_r2
347                            ELSE
348                               mean_r = 0.0_wp
349                            ENDIF
350                            tend(k,j,i) = mean_r
[1]351                         ENDDO
352                      ENDDO
353                   ENDDO
[1359]354                ELSE
355                   tend = 0.0_wp
356                ENDIF
[2512]357                DO  i = nxl, nxr
358                   DO  j = nys, nyn
[1551]359                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]360                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
361                      ENDDO
362                   ENDDO
363                ENDDO
364                resorted = .TRUE.
365             ELSE
[4559]366                IF ( .NOT. ALLOCATED( pr_av ) )  THEN
[3004]367                   ALLOCATE( pr_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
368                   pr_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
369                ENDIF
[1]370                to_be_resorted => pr_av
371             ENDIF
372
[3421]373          CASE ( 'theta' )
[1]374             IF ( av == 0 )  THEN
[4559]375                IF ( .NOT. bulk_cloud_model )  THEN
[1]376                   to_be_resorted => pt
377                ELSE
[2512]378                   DO  i = nxl, nxr
379                      DO  j = nys, nyn
[1551]380                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[4559]381                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + lv_d_cp * d_exner(k) * ql(k,j,i)
[1]382                         ENDDO
383                      ENDDO
384                   ENDDO
385                   resorted = .TRUE.
386                ENDIF
387             ELSE
[4559]388                IF ( .NOT. ALLOCATED( pt_av ) )  THEN
[3004]389                   ALLOCATE( pt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
390                   pt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
391                ENDIF
[1]392                to_be_resorted => pt_av
393             ENDIF
394
395          CASE ( 'q' )
396             IF ( av == 0 )  THEN
397                to_be_resorted => q
398             ELSE
[4559]399                IF ( .NOT. ALLOCATED( q_av ) )  THEN
[3004]400                   ALLOCATE( q_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
401                   q_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
402                ENDIF
[1]403                to_be_resorted => q_av
404             ENDIF
[691]405
[1053]406          CASE ( 'ql' )
407             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]408                to_be_resorted => ql
[1053]409             ELSE
[4559]410                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_av ) )  THEN
[3004]411                   ALLOCATE( ql_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
412                   ql_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
413                ENDIF
[1115]414                to_be_resorted => ql_av
[1053]415             ENDIF
416
[1]417          CASE ( 'ql_c' )
418             IF ( av == 0 )  THEN
419                to_be_resorted => ql_c
420             ELSE
[4559]421                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_c_av ) )  THEN
[3004]422                   ALLOCATE( ql_c_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
423                   ql_c_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
424                ENDIF
[1]425                to_be_resorted => ql_c_av
426             ENDIF
427
428          CASE ( 'ql_v' )
429             IF ( av == 0 )  THEN
430                to_be_resorted => ql_v
431             ELSE
[4559]432                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_v_av ) )  THEN
[3004]433                   ALLOCATE( ql_v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
434                   ql_v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
435                ENDIF
[1]436                to_be_resorted => ql_v_av
437             ENDIF
438
439          CASE ( 'ql_vp' )
440             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]441                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]442                   DO  i = nxl, nxr
443                      DO  j = nys, nyn
[1551]444                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]445                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
446                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
447                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
448                            DO  n = 1, number_of_particles
449                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
[4559]450                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                                     &
451                                                 particles(n)%weight_factor / prt_count(k,j,i)
[1359]452                               ENDIF
453                            ENDDO
[1007]454                         ENDDO
455                      ENDDO
456                   ENDDO
[1359]457                ELSE
458                   tend = 0.0_wp
459                ENDIF
[2512]460                DO  i = nxl, nxr
461                   DO  j = nys, nyn
[1551]462                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1007]463                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
464                      ENDDO
465                   ENDDO
466                ENDDO
467                resorted = .TRUE.
[1]468             ELSE
[4559]469                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_vp_av ) )  THEN
[3004]470                   ALLOCATE( ql_vp_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
471                   ql_vp_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
472                ENDIF
[1]473                to_be_resorted => ql_vp_av
474             ENDIF
475
476          CASE ( 'qv' )
477             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]478                DO  i = nxl, nxr
479                   DO  j = nys, nyn
[1551]480                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]481                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
482                      ENDDO
483                   ENDDO
484                ENDDO
485                resorted = .TRUE.
486             ELSE
[4559]487                IF ( .NOT. ALLOCATED( qv_av ) )  THEN
[3004]488                   ALLOCATE( qv_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
489                   qv_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
490                ENDIF
[1]491                to_be_resorted => qv_av
492             ENDIF
493
494          CASE ( 's' )
495             IF ( av == 0 )  THEN
[1960]496                to_be_resorted => s
[1]497             ELSE
[4559]498                IF ( .NOT. ALLOCATED( s_av ) )  THEN
[3004]499                   ALLOCATE( s_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
500                   s_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
501                ENDIF
[355]502                to_be_resorted => s_av
[1]503             ENDIF
[691]504
[1]505          CASE ( 'u' )
[2696]506             flag_nr = 1
[1]507             IF ( av == 0 )  THEN
508                to_be_resorted => u
509             ELSE
[4559]510                IF ( .NOT. ALLOCATED( u_av ) )  THEN
[3004]511                   ALLOCATE( u_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
512                   u_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
513                ENDIF
[1]514                to_be_resorted => u_av
515             ENDIF
516
517          CASE ( 'v' )
[2696]518             flag_nr = 2
[1]519             IF ( av == 0 )  THEN
520                to_be_resorted => v
521             ELSE
[4559]522                IF ( .NOT. ALLOCATED( v_av ) )  THEN
[3004]523                   ALLOCATE( v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
524                   v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
525                ENDIF
[1]526                to_be_resorted => v_av
527             ENDIF
528
[3421]529          CASE ( 'thetav' )
[1]530             IF ( av == 0 )  THEN
531                to_be_resorted => vpt
532             ELSE
[4559]533                IF ( .NOT. ALLOCATED( vpt_av ) )  THEN
[3004]534                   ALLOCATE( vpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
535                   vpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
536                ENDIF
[1]537                to_be_resorted => vpt_av
538             ENDIF
539
540          CASE ( 'w' )
[2696]541             flag_nr = 3
[1]542             IF ( av == 0 )  THEN
543                to_be_resorted => w
544             ELSE
[4559]545                IF ( .NOT. ALLOCATED( w_av ) )  THEN
[3004]546                   ALLOCATE( w_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
547                   w_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
548                ENDIF
[1]549                to_be_resorted => w_av
550             ENDIF
551
552          CASE DEFAULT
[3637]553!
554!--          Quantities of other modules
555             IF ( .NOT. found )  THEN
[4559]556                CALL module_interface_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf, fill_value,    &
557                                                      resorted, nzb_do, nzt_do                     &
558                                                    )
[3294]559             ENDIF
560
[1972]561!
[3637]562!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
563             IF ( .NOT. found  .AND.  urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
564!
565!--             For urban model quantities, it is required to re-allocate local_pf
[3814]566                nzb_do = nz_urban_b
567                nzt_do = nz_urban_t
[1972]568
569                DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]570                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]571                local_pf = fill_value
[1972]572
[4559]573                CALL usm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf, nzb_do, nzt_do )
[1972]574                resorted = .TRUE.
[1976]575
576!
577!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
578                IF ( .NOT. found )  THEN
579                   nzb_do = nzb
580                   nzt_do = nz_do3d
581
582                   DEALLOCATE ( local_pf )
[3637]583                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[1976]584                ENDIF
585
[1972]586             ENDIF
587
[3637]588!
589!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
590             IF ( .NOT. found  .AND.  land_surface )  THEN
591!
592!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
593                nzb_do = nzb_soil
594                nzt_do = nzt_soil
[1976]595
[3637]596                DEALLOCATE ( local_pf )
597                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
598                local_pf = fill_value
[2817]599
[3637]600                CALL lsm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf )
[2696]601                resorted = .TRUE.
602
[3467]603!
[3637]604!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
605                IF ( .NOT. found )  THEN
606                   nzb_do = nzb
607                   nzt_do = nz_do3d
[2209]608
[3637]609                   DEALLOCATE ( local_pf )
610                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
611                ENDIF
[3448]612
[1972]613             ENDIF
[1]614
[254]615             IF ( .NOT. found )  THEN
[4559]616                message_string =  'no output available for: ' // TRIM( do3d(av,ivar) )
[254]617                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
[1]618             ENDIF
619
620       END SELECT
621
622!
623!--    Resort the array to be output, if not done above
624       IF ( .NOT. resorted )  THEN
[2512]625          DO  i = nxl, nxr
626             DO  j = nys, nyn
[1551]627                DO  k = nzb_do, nzt_do
[4559]628                   local_pf(i,j,k) = MERGE( to_be_resorted(k,j,i),                                 &
629                                            REAL( fill_value, KIND = wp ),                         &
630                                            BTEST( wall_flags_total_0(k,j,i), flag_nr ) )
[1]631                ENDDO
632             ENDDO
633          ENDDO
634       ENDIF
635
636!
[1327]637!--    Output of the 3D-array
638#if defined( __parallel )
639       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[1]640!
[4559]641!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in FORTRAN binary format here, and
642!--       later collected into one file by combine_plot_fields
[1327]643          IF ( myid == 0 )  THEN
[4559]644             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point, do3d_time_count(av), av
[1]645          ENDIF
[1327]646          DO  i = 0, io_blocks-1
647             IF ( i == io_group )  THEN
[2512]648                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
[1551]649                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
[1327]650             ENDIF
[1972]651
[1327]652             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
[1972]653
[1327]654          ENDDO
[559]655
[1327]656       ELSE
[646]657#if defined( __netcdf )
[493]658!
[1327]659!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
[2512]660!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
[3554]661!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]662!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
663!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
664!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
665!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
[3554]666!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]667!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
668!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
669!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
670!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
[3554]671!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]672!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
673!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
674!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
675!          ELSE
[4559]676             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),                          &
677                                     local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),                      &
678                                     start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),    &
679                                     count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /)        &
680                                   )
[2512]681!          ENDIF
[1783]682          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
[646]683#endif
[1327]684       ENDIF
[1]685#else
686#if defined( __netcdf )
[4559]687       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),                                &
688                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),                            &
689                               start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),                         &
690                               count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1783]691       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
[1]692#endif
693#endif
694
[3554]695       ivar = ivar + 1
[1]696
697!
[1551]698!--    Deallocate temporary array
699       DEALLOCATE ( local_pf )
[1]700
[1551]701    ENDDO
[1]702
[1318]703    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
[1]704
[3987]705    IF ( debug_output_timestep )  CALL debug_message( 'data_output_3d', 'end' )
[3885]706
[3987]707
[1]708 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.