source: palm/trunk/SOURCE/data_output_3d.f90 @ 3768

Last change on this file since 3768 was 3766, checked in by raasch, 5 years ago

unused_variables removed, bugfix in im_define_netcdf_grid argument list, trim added to avoid truncation compiler warnings, save attribute added to local targets to avoid outlive pointer target warning, first argument removed from module_interface_rrd_*, file module_interface reformatted with respect to coding standards, bugfix in surface_data_output_rrd_local (variable k removed)

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 30.7 KB
RevLine 
[1682]1!> @file data_output_3d.f90
[2000]2!------------------------------------------------------------------------------!
[2696]3! This file is part of the PALM model system.
[1036]4!
[2000]5! PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the
6! terms of the GNU General Public License as published by the Free Software
7! Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later
8! version.
[1036]9!
10! PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11! WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12! A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13!
14! You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15! PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16!
[3655]17! Copyright 1997-2019 Leibniz Universitaet Hannover
[2000]18!------------------------------------------------------------------------------!
[1036]19!
[254]20! Current revisions:
[1106]21! ------------------
[3589]22!
23!
24! Former revisions:
25! -----------------
26! $Id: data_output_3d.f90 3766 2019-02-26 16:23:41Z raasch $
[3766]27! unused variables removed
28!
29! 3655 2019-01-07 16:51:22Z knoop
[3646]30! Bugfix: use time_since_reference_point instead of simulated_time (relevant
31! when using wall/soil spinup)
32!
33! 3637 2018-12-20 01:51:36Z knoop
[3637]34! Implementation of the PALM module interface
35!
36! 3589 2018-11-30 15:09:51Z suehring
[3582]37! Move the control parameter "salsa" from salsa_mod to control_parameters
38! (M. Kurppa)
39!
[3589]40! 3582 2018-11-29 19:16:36Z suehring
[3554]41! add variable description; rename variable 'if' into 'ivar'
42!
43! 3525 2018-11-14 16:06:14Z kanani
[3525]44! Changes related to clean-up of biometeorology (dom_dwd_user)
45!
46! 3467 2018-10-30 19:05:21Z suehring
[3467]47! Implementation of a new aerosol module salsa.
48!
49! 3448 2018-10-29 18:14:31Z kanani
[3448]50! Adjustment of biometeorology calls
51!
52! 3421 2018-10-24 18:39:32Z gronemeier
[3421]53! Renamed output variables
54!
55! 3419 2018-10-24 17:27:31Z gronemeier
[3405]56! bugfix: nx, ny are required in non-parallel case
57!
58! 3337 2018-10-12 15:17:09Z kanani
[3337]59! (from branch resler)
60! Add Biometeorology
61!
62! 3294 2018-10-01 02:37:10Z raasch
[3294]63! changes concerning modularization of ocean option
64!
65! 3274 2018-09-24 15:42:55Z knoop
[3274]66! Modularization of all bulk cloud physics code components
67!
68! 3241 2018-09-12 15:02:00Z raasch
[3241]69! unused variables and format statements removed
70!
71! 3049 2018-05-29 13:52:36Z Giersch
[3049]72! Error messages revised
73!
74! 3045 2018-05-28 07:55:41Z Giersch
[3045]75! Error message revised
76!
77! 3014 2018-05-09 08:42:38Z maronga
[3014]78! Added nzb_do and nzt_do for some modules for 3d output
79!
80! 3004 2018-04-27 12:33:25Z Giersch
[3004]81! Allocation checks implemented (averaged data will be assigned to fill values
82! if no allocation happened so far)
83!
84! 2967 2018-04-13 11:22:08Z raasch
[2967]85! bugfix: missing parallel cpp-directives added
86!
87! 2817 2018-02-19 16:32:21Z knoop
[2817]88! Preliminary gust module interface implemented
89!
90! 2766 2018-01-22 17:17:47Z kanani
[2766]91! Removed preprocessor directive __chem
92!
93! 2756 2018-01-16 18:11:14Z suehring
[2756]94! Fill values for 3D output of chemical species introduced.
95!
96! 2746 2018-01-15 12:06:04Z suehring
[2746]97! Move flag plant canopy to modules
98!
99! 2718 2018-01-02 08:49:38Z maronga
[2716]100! Corrected "Former revisions" section
101!
102! 2696 2017-12-14 17:12:51Z kanani
103! Change in file header (GPL part)
[2696]104! Implementation of turbulence_closure_mod (TG)
105! Implementation of chemistry module (FK)
106! Set fill values at topography grid points or e.g. non-natural-type surface
107! in case of LSM output (MS)
108!
109! 2512 2017-10-04 08:26:59Z raasch
[2512]110! upper bounds of 3d output changed from nx+1,ny+1 to nx,ny
111! no output of ghost layer data
112!
113! 2292 2017-06-20 09:51:42Z schwenkel
[2292]114! Implementation of new microphysic scheme: cloud_scheme = 'morrison'
115! includes two more prognostic equations for cloud drop concentration (nc) 
116! and cloud water content (qc).
117!
118! 2233 2017-05-30 18:08:54Z suehring
[1552]119!
[2233]120! 2232 2017-05-30 17:47:52Z suehring
121! Adjustments to new topography concept
122!
[2210]123! 2209 2017-04-19 09:34:46Z kanani
124! Added plant canopy model output
125!
[2032]126! 2031 2016-10-21 15:11:58Z knoop
127! renamed variable rho to rho_ocean and rho_av to rho_ocean_av
128!
[2012]129! 2011 2016-09-19 17:29:57Z kanani
130! Flag urban_surface is now defined in module control_parameters,
131! changed prefix for urban surface model output to "usm_",
132! introduced control parameter varnamelength for LEN of trimvar.
133!
[2008]134! 2007 2016-08-24 15:47:17Z kanani
135! Added support for new urban surface model (temporary modifications of
136! SELECT CASE ( ) necessary, see variable trimvar)
137!
[2001]138! 2000 2016-08-20 18:09:15Z knoop
139! Forced header and separation lines into 80 columns
140!
[1981]141! 1980 2016-07-29 15:51:57Z suehring
142! Bugfix, in order to steer user-defined output, setting flag found explicitly
143! to .F.
144!
[1977]145! 1976 2016-07-27 13:28:04Z maronga
146! Output of radiation quantities is now done directly in the respective module
147!
[1973]148! 1972 2016-07-26 07:52:02Z maronga
149! Output of land surface quantities is now done directly in the respective module.
150! Unnecessary directive __parallel removed.
151!
[1961]152! 1960 2016-07-12 16:34:24Z suehring
153! Scalar surface flux added
154!
[1851]155! 1849 2016-04-08 11:33:18Z hoffmann
156! prr moved to arrays_3d
157!
[1823]158! 1822 2016-04-07 07:49:42Z hoffmann
159! prr vertical dimensions set to nzb_do to nzt_do. Unused variables deleted.
160!
[1809]161! 1808 2016-04-05 19:44:00Z raasch
162! test output removed
163!
[1784]164! 1783 2016-03-06 18:36:17Z raasch
165! name change of netcdf routines and module + related changes
166!
[1746]167! 1745 2016-02-05 13:06:51Z gronemeier
168! Bugfix: test if time axis limit exceeds moved to point after call of check_open
169!
[1692]170! 1691 2015-10-26 16:17:44Z maronga
171! Added output of radiative heating rates for RRTMG
172!
[1683]173! 1682 2015-10-07 23:56:08Z knoop
174! Code annotations made doxygen readable
175!
[1586]176! 1585 2015-04-30 07:05:52Z maronga
177! Added support for RRTMG
178!
[1552]179! 1551 2015-03-03 14:18:16Z maronga
[1551]180! Added suppport for land surface model and radiation model output. In the course
181! of this action, the limits for vertical loops have been changed (from nzb and
182! nzt+1 to nzb_do and nzt_do, respectively in order to allow soil model output).
183! Moreover, a new vertical grid zs was introduced.
[1329]184!
[1360]185! 1359 2014-04-11 17:15:14Z hoffmann
186! New particle structure integrated.
187!
[1354]188! 1353 2014-04-08 15:21:23Z heinze
189! REAL constants provided with KIND-attribute
190!
[1329]191! 1327 2014-03-21 11:00:16Z raasch
192! parts concerning avs output removed,
193! -netcdf output queries
194!
[1321]195! 1320 2014-03-20 08:40:49Z raasch
[1320]196! ONLY-attribute added to USE-statements,
197! kind-parameters added to all INTEGER and REAL declaration statements,
198! kinds are defined in new module kinds,
199! old module precision_kind is removed,
200! revision history before 2012 removed,
201! comment fields (!:) to be used for variable explanations added to
202! all variable declaration statements
[674]203!
[1319]204! 1318 2014-03-17 13:35:16Z raasch
205! barrier argument removed from cpu_log,
206! module interfaces removed
207!
[1309]208! 1308 2014-03-13 14:58:42Z fricke
209! Check, if the limit of the time dimension is exceeded for parallel output
210! To increase the performance for parallel output, the following is done:
211! - Update of time axis is only done by PE0
212!
[1245]213! 1244 2013-10-31 08:16:56Z raasch
214! Bugfix for index bounds in case of 3d-parallel output
215!
[1116]216! 1115 2013-03-26 18:16:16Z hoffmann
217! ql is calculated by calc_liquid_water_content
218!
[1107]219! 1106 2013-03-04 05:31:38Z raasch
220! array_kind renamed precision_kind
221!
[1077]222! 1076 2012-12-05 08:30:18Z hoffmann
223! Bugfix in output of ql
224!
[1054]225! 1053 2012-11-13 17:11:03Z hoffmann
226! +nr, qr, prr, qc and averaged quantities
227!
[1037]228! 1036 2012-10-22 13:43:42Z raasch
229! code put under GPL (PALM 3.9)
230!
[1035]231! 1031 2012-10-19 14:35:30Z raasch
232! netCDF4 without parallel file support implemented
233!
[1008]234! 1007 2012-09-19 14:30:36Z franke
235! Bugfix: missing calculation of ql_vp added
236!
[1]237! Revision 1.1  1997/09/03 06:29:36  raasch
238! Initial revision
239!
240!
241! Description:
242! ------------
[1682]243!> Output of the 3D-arrays in netCDF and/or AVS format.
[1]244!------------------------------------------------------------------------------!
[1682]245 SUBROUTINE data_output_3d( av )
246 
[1]247
[1320]248    USE arrays_3d,                                                             &
[3766]249        ONLY:  d_exner, e, p, pt, q, ql, ql_c, ql_v, s, tend, u, v, vpt, w
[3274]250
[1]251    USE averaging
[3274]252
253    USE basic_constants_and_equations_mod,                                     &
254        ONLY:  lv_d_cp
255
256    USE bulk_cloud_model_mod,                                                  &
[3637]257        ONLY:  bulk_cloud_model
[3274]258
[1320]259    USE control_parameters,                                                    &
[3766]260        ONLY:  do3d, do3d_no, do3d_time_count, io_blocks, io_group,            &
261               land_surface, message_string, ntdim_3d, nz_do3d, psolver,       &
262               time_since_reference_point, urban_surface, varnamelength
[3274]263
[1320]264    USE cpulog,                                                                &
265        ONLY:  log_point, cpu_log
[2817]266
[3405]267#if defined( __parallel )
[1320]268    USE indices,                                                               &
[3241]269        ONLY:  nbgp, nxl, nxlg, nxr, nxrg, nyn, nyng, nys, nysg, nzb, nzt,     &
270               wall_flags_0
[3405]271#else
272    USE indices,                                                               &
273        ONLY:  nbgp, nx, nxl, nxlg, nxr, nxrg, ny, nyn, nyng, nys, nysg, nzb,  &
274               nzt, wall_flags_0
275#endif
[3274]276
[1320]277    USE kinds
[3274]278
[1551]279    USE land_surface_model_mod,                                                &
[2232]280        ONLY: lsm_data_output_3d, nzb_soil, nzt_soil
[1551]281
[3637]282    USE module_interface,                                                      &
283        ONLY:  module_interface_data_output_3d
284
[1783]285#if defined( __netcdf )
286    USE NETCDF
287#endif
288
289    USE netcdf_interface,                                                      &
[2696]290        ONLY:  fill_value, id_set_3d, id_var_do3d, id_var_time_3d, nc_stat,    &
[1783]291               netcdf_data_format, netcdf_handle_error
[3294]292
[1320]293    USE particle_attributes,                                                   &
[1359]294        ONLY:  grid_particles, number_of_particles, particles,                 &
295               particle_advection_start, prt_count
[3637]296
[1]297    USE pegrid
298
[1585]299    USE radiation_model_mod,                                                   &
[3637]300        ONLY:  nzub, nzut
[1585]301
[2696]302    USE turbulence_closure_mod,                                                &
303        ONLY:  tcm_data_output_3d
304
[2007]305    USE urban_surface_mod,                                                     &
[2696]306        ONLY:  usm_data_output_3d
[1585]307
[2007]308
[1]309    IMPLICIT NONE
310
[3554]311    INTEGER(iwp) ::  av        !< flag for (non-)average output
[2696]312    INTEGER(iwp) ::  flag_nr   !< number of masking flag
[3554]313    INTEGER(iwp) ::  i         !< loop index
314    INTEGER(iwp) ::  ivar      !< variable index
315    INTEGER(iwp) ::  j         !< loop index
316    INTEGER(iwp) ::  k         !< loop index
317    INTEGER(iwp) ::  n         !< loop index
[1682]318    INTEGER(iwp) ::  nzb_do    !< vertical lower limit for data output
319    INTEGER(iwp) ::  nzt_do    !< vertical upper limit for data output
[1]320
[3554]321    LOGICAL      ::  found     !< true if output variable was found
322    LOGICAL      ::  resorted  !< true if variable is resorted
[1]323
[3554]324    REAL(wp)     ::  mean_r    !< mean particle radius
325    REAL(wp)     ::  s_r2      !< sum( particle-radius**2 )
326    REAL(wp)     ::  s_r3      !< sum( particle-radius**3 )
[1]327
[3554]328    REAL(sp), DIMENSION(:,:,:), ALLOCATABLE ::  local_pf  !< output array
[1]329
[3554]330    REAL(wp), DIMENSION(:,:,:), POINTER ::  to_be_resorted  !< pointer to array which shall be output
[1]331
[2011]332    CHARACTER (LEN=varnamelength) ::  trimvar  !< TRIM of output-variable string
[2007]333
[1]334!
335!-- Return, if nothing to output
336    IF ( do3d_no(av) == 0 )  RETURN
337
338    CALL cpu_log (log_point(14),'data_output_3d','start')
339
340!
341!-- Open output file.
[2512]342!-- For classic or 64bit netCDF output on more than one PE, each PE opens its
343!-- own file and writes the data of its subdomain in binary format. After the
344!-- run, these files are combined to one NetCDF file by combine_plot_fields.
[1031]345!-- For netCDF4/HDF5 output, data is written in parallel into one file.
[1327]346    IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[2967]347#if defined( __parallel )
[1327]348       CALL check_open( 30 )
[2967]349#endif
[1327]350       IF ( myid == 0 )  CALL check_open( 106+av*10 )
[493]351    ELSE
[1327]352       CALL check_open( 106+av*10 )
[493]353    ENDIF
[1]354
355!
[1745]356!-- For parallel netcdf output the time axis must be limited. Return, if this
357!-- limit is exceeded. This could be the case, if the simulated time exceeds
358!-- the given end time by the length of the given output interval.
359    IF ( netcdf_data_format > 4 )  THEN
360       IF ( do3d_time_count(av) + 1 > ntdim_3d(av) )  THEN
[3646]361          WRITE ( message_string, * ) 'Output of 3d data is not given at t=',               &
362                                      time_since_reference_point, 's because the maximum ', & 
363                                      'number of output time levels is ',                   &
[1745]364                                      'exceeded.'
365          CALL message( 'data_output_3d', 'PA0387', 0, 1, 0, 6, 0 )
366          CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
367          RETURN
368       ENDIF
369    ENDIF
370
371!
[1031]372!-- Update the netCDF time axis
[1308]373!-- In case of parallel output, this is only done by PE0 to increase the
374!-- performance.
[1]375#if defined( __netcdf )
[1308]376    do3d_time_count(av) = do3d_time_count(av) + 1
377    IF ( myid == 0 )  THEN
[1327]378       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_time_3d(av),           &
379                               (/ time_since_reference_point /),            &
380                               start = (/ do3d_time_count(av) /),           &
381                               count = (/ 1 /) )
[1783]382       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 376 )
[1]383    ENDIF
384#endif
385
386!
387!-- Loop over all variables to be written.
[3554]388    ivar = 1
[1]389
[3554]390    DO  WHILE ( do3d(av,ivar)(1:1) /= ' ' )
[2007]391
[1]392!
[3637]393!--    Initiate found flag and resorting flag
394       found = .FALSE.
395       resorted = .FALSE.
396!
397!--    Temporary solution to account for data output within the new urban
[2007]398!--    surface model (urban_surface_mod.f90), see also SELECT CASE ( trimvar ).
[1]399!--    Store the array chosen on the temporary array.
[3637]400       nzb_do   = nzb
401       nzt_do   = nz_do3d
402
[3554]403       trimvar = TRIM( do3d(av,ivar) )
[1551]404!
405!--    Allocate a temporary array with the desired output dimensions.
[2512]406       ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]407!
408!--    Before each output, set array local_pf to fill value
409       local_pf = fill_value
410!
411!--    Set masking flag for topography for not resorted arrays
412       flag_nr = 0
[1551]413
[2007]414       SELECT CASE ( trimvar )
[1]415
416          CASE ( 'e' )
417             IF ( av == 0 )  THEN
418                to_be_resorted => e
419             ELSE
[3004]420                IF ( .NOT. ALLOCATED( e_av ) ) THEN
421                   ALLOCATE( e_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
422                   e_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
423                ENDIF
[1]424                to_be_resorted => e_av
425             ENDIF
426
[3421]427          CASE ( 'thetal' )
[771]428             IF ( av == 0 )  THEN
429                to_be_resorted => pt
430             ELSE
[3004]431                IF ( .NOT. ALLOCATED( lpt_av ) ) THEN
432                   ALLOCATE( lpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
433                   lpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
434                ENDIF
[771]435                to_be_resorted => lpt_av
436             ENDIF
437
[1]438          CASE ( 'p' )
439             IF ( av == 0 )  THEN
[727]440                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p, nbgp )
[1]441                to_be_resorted => p
442             ELSE
[3004]443                IF ( .NOT. ALLOCATED( p_av ) ) THEN
444                   ALLOCATE( p_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
445                   p_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
446                ENDIF
[727]447                IF ( psolver /= 'sor' )  CALL exchange_horiz( p_av, nbgp )
[1]448                to_be_resorted => p_av
449             ENDIF
450
451          CASE ( 'pc' )  ! particle concentration (requires ghostpoint exchange)
452             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]453                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]454                   tend = prt_count
455                ELSE
456                   tend = 0.0_wp
457                ENDIF
[2512]458                DO  i = nxl, nxr
459                   DO  j = nys, nyn
[1551]460                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]461                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
462                      ENDDO
463                   ENDDO
464                ENDDO
465                resorted = .TRUE.
466             ELSE
[3004]467                IF ( .NOT. ALLOCATED( pc_av ) ) THEN
468                   ALLOCATE( pc_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
469                   pc_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
470                ENDIF
[1]471                to_be_resorted => pc_av
472             ENDIF
473
[1359]474          CASE ( 'pr' )  ! mean particle radius (effective radius)
[1]475             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]476                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]477                   DO  i = nxl, nxr
478                      DO  j = nys, nyn
[1551]479                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]480                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
481                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
482                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
483                            s_r2 = 0.0_wp
484                            s_r3 = 0.0_wp
485                            DO  n = 1, number_of_particles
486                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
487                                  s_r2 = s_r2 + particles(n)%radius**2 * &
488                                         particles(n)%weight_factor
489                                  s_r3 = s_r3 + particles(n)%radius**3 * &
490                                         particles(n)%weight_factor
491                               ENDIF
492                            ENDDO
493                            IF ( s_r2 > 0.0_wp )  THEN
494                               mean_r = s_r3 / s_r2
495                            ELSE
496                               mean_r = 0.0_wp
497                            ENDIF
498                            tend(k,j,i) = mean_r
[1]499                         ENDDO
500                      ENDDO
501                   ENDDO
[1359]502                ELSE
503                   tend = 0.0_wp
504                ENDIF
[2512]505                DO  i = nxl, nxr
506                   DO  j = nys, nyn
[1551]507                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]508                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
509                      ENDDO
510                   ENDDO
511                ENDDO
512                resorted = .TRUE.
513             ELSE
[3004]514                IF ( .NOT. ALLOCATED( pr_av ) ) THEN
515                   ALLOCATE( pr_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
516                   pr_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
517                ENDIF
[1]518                to_be_resorted => pr_av
519             ENDIF
520
[3421]521          CASE ( 'theta' )
[1]522             IF ( av == 0 )  THEN
[3274]523                IF ( .NOT. bulk_cloud_model ) THEN
[1]524                   to_be_resorted => pt
525                ELSE
[2512]526                   DO  i = nxl, nxr
527                      DO  j = nys, nyn
[1551]528                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[3274]529                            local_pf(i,j,k) = pt(k,j,i) + lv_d_cp *            &
530                                                          d_exner(k) *         &
[1]531                                                          ql(k,j,i)
532                         ENDDO
533                      ENDDO
534                   ENDDO
535                   resorted = .TRUE.
536                ENDIF
537             ELSE
[3004]538                IF ( .NOT. ALLOCATED( pt_av ) ) THEN
539                   ALLOCATE( pt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
540                   pt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
541                ENDIF
[1]542                to_be_resorted => pt_av
543             ENDIF
544
545          CASE ( 'q' )
546             IF ( av == 0 )  THEN
547                to_be_resorted => q
548             ELSE
[3004]549                IF ( .NOT. ALLOCATED( q_av ) ) THEN
550                   ALLOCATE( q_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
551                   q_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
552                ENDIF
[1]553                to_be_resorted => q_av
554             ENDIF
[691]555
[1053]556          CASE ( 'ql' )
557             IF ( av == 0 )  THEN
[1115]558                to_be_resorted => ql
[1053]559             ELSE
[3004]560                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_av ) ) THEN
561                   ALLOCATE( ql_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
562                   ql_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
563                ENDIF
[1115]564                to_be_resorted => ql_av
[1053]565             ENDIF
566
[1]567          CASE ( 'ql_c' )
568             IF ( av == 0 )  THEN
569                to_be_resorted => ql_c
570             ELSE
[3004]571                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_c_av ) ) THEN
572                   ALLOCATE( ql_c_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
573                   ql_c_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
574                ENDIF
[1]575                to_be_resorted => ql_c_av
576             ENDIF
577
578          CASE ( 'ql_v' )
579             IF ( av == 0 )  THEN
580                to_be_resorted => ql_v
581             ELSE
[3004]582                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_v_av ) ) THEN
583                   ALLOCATE( ql_v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
584                   ql_v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
585                ENDIF
[1]586                to_be_resorted => ql_v_av
587             ENDIF
588
589          CASE ( 'ql_vp' )
590             IF ( av == 0 )  THEN
[3646]591                IF ( time_since_reference_point >= particle_advection_start )  THEN
[1359]592                   DO  i = nxl, nxr
593                      DO  j = nys, nyn
[1551]594                         DO  k = nzb_do, nzt_do
[1359]595                            number_of_particles = prt_count(k,j,i)
596                            IF (number_of_particles <= 0)  CYCLE
597                            particles => grid_particles(k,j,i)%particles(1:number_of_particles)
598                            DO  n = 1, number_of_particles
599                               IF ( particles(n)%particle_mask )  THEN
600                                  tend(k,j,i) =  tend(k,j,i) +                 &
601                                                 particles(n)%weight_factor /  &
602                                                 prt_count(k,j,i)
603                               ENDIF
604                            ENDDO
[1007]605                         ENDDO
606                      ENDDO
607                   ENDDO
[1359]608                ELSE
609                   tend = 0.0_wp
610                ENDIF
[2512]611                DO  i = nxl, nxr
612                   DO  j = nys, nyn
[1551]613                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1007]614                         local_pf(i,j,k) = tend(k,j,i)
615                      ENDDO
616                   ENDDO
617                ENDDO
618                resorted = .TRUE.
[1]619             ELSE
[3004]620                IF ( .NOT. ALLOCATED( ql_vp_av ) ) THEN
621                   ALLOCATE( ql_vp_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
622                   ql_vp_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
623                ENDIF
[1]624                to_be_resorted => ql_vp_av
625             ENDIF
626
627          CASE ( 'qv' )
628             IF ( av == 0 )  THEN
[2512]629                DO  i = nxl, nxr
630                   DO  j = nys, nyn
[1551]631                      DO  k = nzb_do, nzt_do
[1]632                         local_pf(i,j,k) = q(k,j,i) - ql(k,j,i)
633                      ENDDO
634                   ENDDO
635                ENDDO
636                resorted = .TRUE.
637             ELSE
[3004]638                IF ( .NOT. ALLOCATED( qv_av ) ) THEN
639                   ALLOCATE( qv_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
640                   qv_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
641                ENDIF
[1]642                to_be_resorted => qv_av
643             ENDIF
644
645          CASE ( 's' )
646             IF ( av == 0 )  THEN
[1960]647                to_be_resorted => s
[1]648             ELSE
[3004]649                IF ( .NOT. ALLOCATED( s_av ) ) THEN
650                   ALLOCATE( s_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
651                   s_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
652                ENDIF
[355]653                to_be_resorted => s_av
[1]654             ENDIF
[691]655
[1]656          CASE ( 'u' )
[2696]657             flag_nr = 1
[1]658             IF ( av == 0 )  THEN
659                to_be_resorted => u
660             ELSE
[3004]661                IF ( .NOT. ALLOCATED( u_av ) ) THEN
662                   ALLOCATE( u_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
663                   u_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
664                ENDIF
[1]665                to_be_resorted => u_av
666             ENDIF
667
668          CASE ( 'v' )
[2696]669             flag_nr = 2
[1]670             IF ( av == 0 )  THEN
671                to_be_resorted => v
672             ELSE
[3004]673                IF ( .NOT. ALLOCATED( v_av ) ) THEN
674                   ALLOCATE( v_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
675                   v_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
676                ENDIF
[1]677                to_be_resorted => v_av
678             ENDIF
679
[3421]680          CASE ( 'thetav' )
[1]681             IF ( av == 0 )  THEN
682                to_be_resorted => vpt
683             ELSE
[3004]684                IF ( .NOT. ALLOCATED( vpt_av ) ) THEN
685                   ALLOCATE( vpt_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
686                   vpt_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
687                ENDIF
[1]688                to_be_resorted => vpt_av
689             ENDIF
690
691          CASE ( 'w' )
[2696]692             flag_nr = 3
[1]693             IF ( av == 0 )  THEN
694                to_be_resorted => w
695             ELSE
[3004]696                IF ( .NOT. ALLOCATED( w_av ) ) THEN
697                   ALLOCATE( w_av(nzb:nzt+1,nysg:nyng,nxlg:nxrg) )
698                   w_av = REAL( fill_value, KIND = wp )
699                ENDIF
[1]700                to_be_resorted => w_av
701             ENDIF
702
703          CASE DEFAULT
[1972]704
[3637]705             IF ( .NOT. found )  THEN
706                CALL tcm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf,   &
[3274]707                                         nzb_do, nzt_do )
708                resorted = .TRUE.
709             ENDIF
710
[3637]711!
712!--          Quantities of other modules
713             IF ( .NOT. found )  THEN
714                CALL module_interface_data_output_3d(                          &
715                        av, trimvar, found, local_pf,                          &
716                        fill_value, resorted, nzb_do, nzt_do                   &
717                     )
[3294]718             ENDIF
719
[1972]720!
[3637]721!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
722             IF ( .NOT. found  .AND.  urban_surface  .AND.  trimvar(1:4) == 'usm_' )  THEN
723!
724!--             For urban model quantities, it is required to re-allocate local_pf
725                nzb_do = nzub
726                nzt_do = nzut
[1972]727
728                DEALLOCATE ( local_pf )
[2512]729                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[2696]730                local_pf = fill_value
[1972]731
[3637]732                CALL usm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf,         &
733                                         nzb_do, nzt_do )
[1972]734                resorted = .TRUE.
[1976]735
736!
737!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
738                IF ( .NOT. found )  THEN
739                   nzb_do = nzb
740                   nzt_do = nz_do3d
741
742                   DEALLOCATE ( local_pf )
[3637]743                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
[1976]744                ENDIF
745
[1972]746             ENDIF
747
[3637]748!
749!--          Temporary workaround: ToDo: refactor local_pf allocation
750             IF ( .NOT. found  .AND.  land_surface )  THEN
751!
752!--             For soil model quantities, it is required to re-allocate local_pf
753                nzb_do = nzb_soil
754                nzt_do = nzt_soil
[1976]755
[3637]756                DEALLOCATE ( local_pf )
757                ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
758                local_pf = fill_value
[2817]759
[3637]760                CALL lsm_data_output_3d( av, trimvar, found, local_pf )
[2696]761                resorted = .TRUE.
762
[3467]763!
[3637]764!--             If no soil model variable was found, re-allocate local_pf
765                IF ( .NOT. found )  THEN
766                   nzb_do = nzb
767                   nzt_do = nz_do3d
[2209]768
[3637]769                   DEALLOCATE ( local_pf )
770                   ALLOCATE( local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do) )
771                ENDIF
[3448]772
[1972]773             ENDIF
[1]774
[254]775             IF ( .NOT. found )  THEN
[1320]776                message_string =  'no output available for: ' //               &
[3554]777                                  TRIM( do3d(av,ivar) )
[254]778                CALL message( 'data_output_3d', 'PA0182', 0, 0, 0, 6, 0 )
[1]779             ENDIF
780
781       END SELECT
782
783!
784!--    Resort the array to be output, if not done above
785       IF ( .NOT. resorted )  THEN
[2512]786          DO  i = nxl, nxr
787             DO  j = nys, nyn
[1551]788                DO  k = nzb_do, nzt_do
[2696]789                   local_pf(i,j,k) = MERGE(                                    &
790                                      to_be_resorted(k,j,i),                   &
791                                      REAL( fill_value, KIND = wp ),           &
792                                      BTEST( wall_flags_0(k,j,i), flag_nr ) )
[1]793                ENDDO
794             ENDDO
795          ENDDO
796       ENDIF
797
798!
[1327]799!--    Output of the 3D-array
800#if defined( __parallel )
801       IF ( netcdf_data_format < 5 )  THEN
[1]802!
[1327]803!--       Non-parallel netCDF output. Data is output in parallel in
804!--       FORTRAN binary format here, and later collected into one file by
805!--       combine_plot_fields
806          IF ( myid == 0 )  THEN
807             WRITE ( 30 )  time_since_reference_point,                   &
808                           do3d_time_count(av), av
[1]809          ENDIF
[1327]810          DO  i = 0, io_blocks-1
811             IF ( i == io_group )  THEN
[2512]812                WRITE ( 30 )  nxl, nxr, nys, nyn, nzb_do, nzt_do
[1551]813                WRITE ( 30 )  local_pf(:,:,nzb_do:nzt_do)
[1327]814             ENDIF
[1972]815
[1327]816             CALL MPI_BARRIER( comm2d, ierr )
[1972]817
[1327]818          ENDDO
[559]819
[1327]820       ELSE
[646]821#if defined( __netcdf )
[493]822!
[1327]823!--       Parallel output in netCDF4/HDF5 format.
[2512]824!          IF ( nxr == nx  .AND.  nyn /= ny )  THEN
[3554]825!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]826!                               local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
827!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
828!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
829!          ELSEIF ( nxr /= nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
[3554]830!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]831!                               local_pf(nxl:nxr,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),    &
832!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
833!                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
834!          ELSEIF ( nxr == nx  .AND.  nyn == ny )  THEN
[3554]835!             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[2512]836!                             local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do  ),  &
837!                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
838!                count = (/ nxr-nxl+2, nyn-nys+2, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
839!          ELSE
[3554]840             nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),  &
[1551]841                                 local_pf(nxl:nxr,nys:nyn,nzb_do:nzt_do),    &
842                start = (/ nxl+1, nys+1, nzb_do+1, do3d_time_count(av) /),  &
843                count = (/ nxr-nxl+1, nyn-nys+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[2512]844!          ENDIF
[1783]845          CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 386 )
[646]846#endif
[1327]847       ENDIF
[1]848#else
849#if defined( __netcdf )
[3554]850       nc_stat = NF90_PUT_VAR( id_set_3d(av), id_var_do3d(av,ivar),        &
[1551]851                         local_pf(nxl:nxr+1,nys:nyn+1,nzb_do:nzt_do),        &
[1327]852                         start = (/ 1, 1, 1, do3d_time_count(av) /),     &
[2512]853                         count = (/ nx+1, ny+1, nzt_do-nzb_do+1, 1 /) )
[1783]854       CALL netcdf_handle_error( 'data_output_3d', 446 )
[1]855#endif
856#endif
857
[3554]858       ivar = ivar + 1
[1]859
860!
[1551]861!--    Deallocate temporary array
862       DEALLOCATE ( local_pf )
[1]863
[1551]864    ENDDO
[1]865
[1318]866    CALL cpu_log( log_point(14), 'data_output_3d', 'stop' )
[1]867
868 END SUBROUTINE data_output_3d
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.