source: palm/trunk/SCRIPTS/subjob @ 181

Last change on this file since 181 was 181, checked in by raasch, 16 years ago

bugfixes + adjustments for SGI ICE system

  • Property svn:keywords set to Id
File size: 40.7 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# subjob - Plot-Shellskript         Version:  @(#)SUBJOB 1.0
3# $Id: subjob 181 2008-07-30 07:07:47Z raasch $
4
5     # Prozedur zum automatischen Generieren von Batch-Jobs, die unter NQS
6     # laufen sollen und deren Ergebnis (Dayfile) zum Job-generierenden
7     # Host zurueckgeschickt werden sollen
8
9
10     # letzte Aenderung:
11     # 29/06/94 - Siggi - Beginn mit Erstellung der Originalversion
12     # 08/07/94 - Siggi - Originalversion abgeschlossen (Version 1.0)
13     # 06/02/98 - Siggi - berte validiert
14     # 27/01/01 - Siggi - ground.yonsei.ac.kr validiert, Jobs zur T3E in Korea
15     #                    moeglich
16     # 08/02/01 - Siggi - alle subjob-Meldungen ins englische uebersetzt
17     # 25/05/02 - Siggi - Unterstuetzung des LoadLeveler
18     # 30/05/02 - Siggi - Validierung fuer ibm-Rechner in Seoul (nobel) sowie
19     #                    allgemeine Anpassungen fuer ibm-Rechner
20     # 15/10/02 - Siggi - Neue Default-Jobklasse (p_normal) fuer IBM in Seoul
21     #                    Ruecktransfer des Jobprotokolls fuer diese
22     #                    Maschine abgeschaltet
23     # 31/10/02 - Siggi - berni validiert
24     # 06/11/02 - Siggi - Neue Jobklassen auf ibmb und ibmh
25     # 08/11/02 - Siggi - quanero validiert
26     # 11/12/02 - Siggi - Notification fuer Transfer-Jobs abgeschaltet
27     # 23/01/03 - Siggi - hostname nobel changed to nobela
28     # 06/02/03 - Siggi - gregale validated
29     # 12/02/03 - Siggi - orkan and maestro validated
30     # 21/02/03 - Siggi - all nobel nodes in Seoul validated
31     # 12/03/03 - Siggi - nec at DKRZ validated
32     # 13/03/03 - Siggi - new nqs resource variable Memory
33     # 07/04/03 - Siggi - processor request option -c on nech needs tasks per
34     #                    node
35     # 11/04/03 - Siggi - network on ibms has attribute "shared"
36     # 31/07/03 - Siggi - nqs2 on nech implemented (provisional: -h nech2)
37     #                    cxxl added to ibmh
38     # 29/08/03 - Siggi - changes in job queues and communication system on
39     #                    ibms
40     # 24/10/03 - Siggi - using alternate hanni address 130.75.4.2
41     # 30/10/03 - Siggi - nech is not supported any more
42     # 10/11/03 - Siggi - nech2 renamed to nech
43     # 20/11/03 - Siggi - submit command on nech changed from qsub.test to qsub
44     # 29/03/04 - Siggi - ground not supported any more, gfdl3 validated
45     # 31/03/04 - Siggi - new option -N for node usage
46     # 12/04/04 - Siggi - scp2 instead of scp used for transfer from decalpha
47     #                    due to error in ssh installation (otherwise a prompt
48     #                    for the password appears)
49     # 23/07/04 - Siggi - changes due to the new berni configuration
50     #                    (federation switch)
51     # 01/09/04 - Gerald  new job-classes on hanni
52     # 08/09/04 - Siggi - hanni IP address changed to 130.75.4.10
53     # 23/11/04 - Siggi - new job class cdata on hanni and berni
54     # 03/12/04 - Siggi - notification on ibm switched of in case of
55     #                    delete_dayfile = true, node usage in cdev set to
56     #                    shared
57     # 16/02/05 - Gerald  hababai validated
58     # 29/03/05 - Micha - new job class channi on hanni
59     # 11/05/05 - Siggi - ConsumableMemory is now required as resource keyword
60     #                    on ibms
61     # 24/05/05 - Siggi - Default queue on ibms changed from p_normal_1.3 to
62     #                    p_normal
63     # 30/06/05 - Siggi - network changed for queue cdev from "us" to "ip"
64     # 12/07/05 - Siggi - in network.mpi on ibmh/ibmb "csss" changed to
65     #                    "sn_all", new job class cexp
66     # 08/09/05 - Siggi - IP-address of gfdl3 changed
67     # 31/10/05 - Siggi - new job class pp on hurricane, serial jobs on
68     #                    hurricane (with -X0)
69     # 01/11/05 - Siggi - missing queue for jobs submitted on nech (for nech)
70     #                    added
71     # 30/12/05 - Siggi - change of IP adresses in subnet 130.75.105
72     # 09/02/06 - Siggi - ibmy admitted
73     # 10/02/06 - Siggi - scp2 changed to /bin/scp on decalpha
74     # 13/04/06 - Siggi - ostria admitted
75     # 18/04/06 - Siggi - new option -O for OpenMP usage
76     # 24/05/06 - Siggi - lctit admitted, ftpjob renamed scpjob
77     # 25/07/06 - Siggi - gfdl5 (ibmy) admitted for submitting jobs
78     # 27/09/06 - Siggi - breg/hreg extended with berni/hanni
79     # 25/10/06 - Siggi - data_limit set to 1.76 GByte on hanni and berni
80     # 28/11/06 - Siggi - levanto admitted
81     # 13/02/07 - Siggi - hpmuk releated code removed
82     # 01/03/07 - Siggi - adjustments for RIAM machines gate and NEC-SX8 (n-sx)
83     # 12/04/07 - Siggi - option -f (filetransfer protocol) removed, scp only
84     # 27/07/07 - Siggi - autan admitted
85     # 03/08/07 - Marcus- lcfimm admitted
86     # 08/10/07 - Siggi - further job classes added for hanni (csoloh...)
87     # 15/10/07 - Siggi - preliminary adjustments for lctit based on Jin's
88     #                    suggestions
89     # 19/10/07 - Marcus- add new optional argument -g group_number
90     # 19/10/07 - Siggi - a ";" was missing in the last change done by Marcus
91     # 30/10/07 - Marcus- further adjustments for queues on lctit
92     # 15/05/08 - Siggi - adjustments for lcxt4 (Bergen Center for Computational
93     #                    Science)
94     # 14/07/08 - Siggi - adjustments for lcsgih
95
96
97    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
98 delete_dayfile=false
99 group_number=none
100 locat=normal
101 no_default_queue=none
102 no_submit=false
103 job_catalog="~/job_queue"
104 job_name=none
105 local_user=$LOGNAME
106 node_usage=shared
107 numprocs=1
108 punkte="..........................................................."
109 submcom=qsub
110 queue=default
111 remote_host=none
112 remote_user=""
113 verify=true
114
115 typeset  -i   cputime=memory=Memory=0  minuten  resttime  sekunden  stunden
116 typeset  -i   inumprocs  nodes=tasks_per_node=threads_per_task=1
117 typeset  -L20 spalte1
118 typeset  -R40 spalte2
119 typeset  -L60 spalte3
120
121
122
123    # FEHLERBEHANDLUNG
124    # BEI EXIT:
125 trap 'if [[ $locat != normal ]]
126       then
127          case  $locat  in
128             (option)  printf "\n  --> available optios can be displayed"
129                       printf " by typing:"
130                       printf "\n      \"subjob ?\" \n";;
131             (ftpcopy|parameter|scp|verify)  printf "\n";;
132             (*)       printf "\n  +++ unknown error"
133                       printf "\n      please inform S. Raasch!\n"
134          esac
135          [[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
136          printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
137       fi' exit
138
139
140    # BEI TERMINAL-BREAK:
141 trap '[[ -f $job_to_send ]]  &&  rm  $job_to_send
142       printf "\n\n+++ SUBJOB killed \n\n"
143       exit
144      ' 2
145
146
147
148
149    # LOKALEN HOSTNAMEN FESTSTELLEN
150 local_host=$(hostname)
151
152
153
154    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN VEREINBAREN BZW. PRUEFEN, OB LOKALER HOST
155    # UEBERHAUPT ZULAESSIG IST
156 case  $local_host  in
157     (atmos)                 local_addres=172.20.25.35;   local_host=lcide;;
158     (autan)                 local_addres=130.75.105.57;  local_host=lcmuk;;
159     (bora)                  local_addres=130.75.105.103; local_host=lcmuk;;
160     (breg*-en0|berni*-en0)  local_addres=130.73.230.10;  local_host=ibmb;;
161     (breva)                 local_addres=130.75.105.98;  local_host=lcmuk;;
162     (b01*)                  local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgih;;
163     (compute-*.local)       local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
164     (cs*)                   local_addres=136.172.44.131; local_host=nech;;
165     (elephanta)             local_addres=130.75.105.6;   local_host=lcmuk;;
166     (fimm.bccs.uib.no)      local_addres=172.20.4.2;     local_host=lcfimm;;
167     (gallego)               local_addres=130.75.105.10;  local_host=lcmuk;;
168     (gate|n-sx)             local_addres=133.5.178.11;   local_host=neck;;
169     (gfdl5)                 local_addres=165.132.26.58;  local_host=ibmy;;
170     (gfdl3.yonsei.ac.kr)    local_addres=165.132.26.56;  local_host=decalpha;;
171     (gregale)               local_addres=130.75.105.109; local_host=lcmuk;;
172     (hababai)               local_addres=130.75.105.108; local_host=lcmuk;;
173     (hexagon.bccs.uib.no)   local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
174     (hreg*-en0|hanni*-en0)  local_addres=130.75.4.10;    local_host=ibmh;;
175     (h01*)                  local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
176     (irifi)                 local_addres=130.75.105.104; local_host=lcmuk;;
177     (levanto)               local_addres=130.75.105.45;  local_host=lcmuk;;
178     (maestro)               local_addres=130.75.105.2;   local_host=lcmuk;;
179     (nid*)                  local_addres=129.177.20.113; local_host=lcxt4;;
180     (nobel*)                local_addres=150.183.5.101;  local_host=ibms;;
181     (orkan)                 local_addres=130.75.105.3;   local_host=lcmuk;;
182     (ostria)                local_addres=130.75.105.106; local_host=lcmuk;;
183     (quanero)               local_addres=130.75.105.107; local_host=lcmuk;;
184     (scirocco)              local_addres=172.20.25.41;   local_host=lcmuk;;
185     (service100)            local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
186     (sun1|sun2)             local_addres=130.75.6.1;     local_host=unics;;
187     (r1*)                   local_addres=130.75.4.102;   local_host=lcsgih;;
188     (r2*)                   local_addres=130.73.232.102; local_host=lcsgih;;
189     (tgg*)                  local_addres=172.17.75.161;  local_host=lctit;;
190     (vorias)                local_addres=172.20.25.43;   local_host=lcmuk;;
191     (*)                     printf "\n  +++ \"$local_host\" unknown";
192                             printf "\n      please inform S. Raasch!";
193                             locat=parameter; exit;;
194 esac
195
196
197
198    # REMOTE HOST DEFAULTMAESSIG = LOCAL HOST SETZEN
199 remote_host=$local_host
200
201
202
203
204    # PROZEDUROPTIONEN EINLESEN
205 while  getopts  :c:dDg:h:m:n:N:O:q:t:T:u:vX:  option
206 do
207   case  $option  in
208       (c)   job_catalog=$OPTARG;;
209       (d)   delete_dayfile=true;;
210       (D)   no_submit=true;;
211       (g)   group_number=$OPTARG;;
212       (h)   remote_host=$OPTARG;;
213       (m)   memory=$OPTARG;;
214       (n)   job_name=$OPTARG;;
215       (N)   node_usage=$OPTARG;;
216       (O)   threads_per_task=$OPTARG;;
217       (q)   no_default_queue=$OPTARG;;
218       (t)   cputime=$OPTARG;;
219       (T)   tasks_per_node=$OPTARG;;
220       (u)   remote_user=$OPTARG;;
221       (v)   verify=false;;
222       (X)   numprocs=$OPTARG;;
223       (\?)  printf "\n  +++ Option $OPTARG unknown \n";
224             locat=option; exit;;
225   esac
226 done
227
228
229    # JOBDATEINAMEN ALS NAECHSTES ARGUMENT HOLEN
230 shift OPTIND-1; file_to_send=$1
231
232
233    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
234 if [ "$1" = "?" ]
235 then
236   (printf "\n  *** subjob can be called as follows:\n"
237    printf "\n      subjob -c.. -d -D -h.. -m.. -q.. -t.. -u.. -v  <jobfile>\n"
238    printf "\n      Description of available options:\n"
239    printf "\n      Option  Description                         Default-Value"
240    printf "\n        -c    job-input- and output-catalog       ~/job_queue"
241    printf "\n        -d    no job-protocol will be created     ---"
242    printf "\n        -D    only the job-file will be created   ---"
243    printf "\n        -h    execution host, available hosts:    $remote_host"
244    printf "\n              ibm, ibmb, ibmh, ibms, ibmy, lcmuk,"
245    printf "\n              lctit, nech, neck, unics"
246    printf "\n        -m    memory demand per process in MByte  ---"
247    printf "\n        -n    jobname                             <jobdatei>"
248    printf "\n        -O    threads per task (for OpenMP usage) 1"
249    printf "\n        -q    job-queue to be used                default"
250    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds         ---"
251    printf "\n        -T    tasks per node (on parallel hosts)  ---"
252    printf "\n        -u    username on execution host          from .netrc"
253    printf "\n        -v    no prompt for confirmation          ---"
254    printf "\n        -X    # of processors (on parallel hosts) 1"
255    printf "\n "
256    printf "\n      The only possible positional parameter is <jobfile>:"
257    printf "\n      The complete NQS-job must be provided here."
258    printf "\n      <jobfile>=? creates this outline\n\n") | more
259    exit
260 fi
261
262
263
264    # PRUEFEN, OB JOBDATEI ANGEGEBEN WURDE UND OB SIE AUCH EXISTIERT
265 if [[ "$file_to_send" = "" ]]
266 then
267    printf "\n  +++ job-file missing"
268    locat=parameter; exit
269 else
270    if [[ -f $file_to_send ]]
271    then
272       true
273    else
274       printf "\n  +++ job-file: "
275       printf "\n           $file_to_send"
276       printf "\n      does not exist"
277       locat=parameter; exit
278    fi
279 fi
280
281
282
283    # FALLS KEIN JOBNAME ANGEGEBEN WURDE, WIRD JOBNAME = JOBDATEINAME
284    # GESETZT. VORAUSSETZUNG: JOBDATEINAME BEINHALTET KEINE PFADE
285 if [[ $job_name = none ]]
286 then
287    job_name=$file_to_send
288 fi
289 if [[ $(echo $job_name | grep -c "/") != 0 ]]
290 then
291    printf "\n  +++ job-file name: "
292    printf "\n           $job_name"
293    printf "\n      must not contain \"/\"-characters"
294    locat=parameter; exit
295 fi
296
297
298
299
300    # HOSTSPEZIFISCHE GROESSEN VEREINBAREN BZW. ABBRUCH BEI UNZULAESSIGEM HOST
301    # ODER WENN HOST NICHT ANGEGEBEN WURDE
302 if [[ $remote_host = none ]]
303 then
304    printf "\n  +++ host missing"
305    locat=option; exit
306 else
307    case  $remote_host  in
308        (ibm)    queue=p690_standard; remote_addres=134.76.99.81; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
309        (ibmb)   queue=cpar; remote_addres=130.73.230.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
310        (ibmh)   queue=cpar; remote_addres=130.75.4.10; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
311        (ibms)   queue=p_normal; remote_addres=150.183.5.101; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
312        (ibmy)   queue=parallel; remote_addres=165.132.26.58; submcom=/usr/lpp/LoadL/full/bin/llsubmit;;
313        (lcfimm) remote_addres=172.20.4.2; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
314        (lcsgib) remote_addres=130.73.232.102; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
315        (lcsgih) remote_addres=130.75.4.102; submcom=/opt/torque/bin/qsub;;
316        (lctit)  queue=lctit; remote_addres=172.17.75.161; submcom=/n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge;;
317        (lcxt4)  remote_addres=129.177.20.113; submcom=/opt/torque/2.3.0/bin/qsub;;
318        (nech)   qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=136.172.44.147; submcom="/usr/local/bin/qsub";;
319        (neck)   qsubmem=memsz_job; qsubtime=cputim_job; remote_addres=133.5.178.11; submcom="/usr/bin/nqsII/qsub";;
320        (vpp)    qsubmem=m; qsubtime=t; queue=vpp; remote_addres=130.75.4.130;;
321        (unics)  qsubmem=d; qsubtime=t; queue=unics; remote_addres=130.75.6.1;;
322        (*)      printf "\n  +++ hostname \"$remote_host\" not allowed";
323                 locat=parameter; exit;;
324    esac
325 fi
326
327
328    # EVTL. PRUEFEN, OB ANGEGEBENE QUEUE ZULAESSIG IST
329 if [[ $no_default_queue != none ]]
330 then
331    error=false
332    ndq=$no_default_queue
333    case  $remote_host  in
334        (ibm)    case  $ndq  in
335                     (p690_express|p690_standard|p690_long)  error=false;;
336                     (*)                                     error=true;;
337                 esac;;
338        (ibmb)   case  $ndq  in
339                     (cdata|cdev|cexp|c1|cshare|csolo|cspec) error=false;;
340                     (*)                                     error=true;;
341                 esac;;
342        (ibmh)   case  $ndq  in
343                     (cdata|cdev|cexp|channi|cxxl|c1|cshare|csolo|csoloh3h|csoloh6h|csoloh12h|csoloh1d|csoloh2d|cspec)  error=false;;
344                     (*)                                     error=true;;
345                 esac;;
346        (ibms)   case  $ndq  in
347                     (express|normal|p_express|p_normal|p_normal_1.3|p_normal_1.7|grand)     error=false;;
348                     (*)                                     error=true;;
349                 esac;;
350        (ibmy)   case  $ndq  in
351                     (parallel)                              error=false;;
352                     (*)                                     error=true;;
353                 esac;;
354        (lctit)  case  $ndq  in
355                     (novice|sla1|sla2|sla3|RAM64GB|RAM128GB)    error=false;;
356                     (*)                                     error=true;;
357                 esac;;
358        (t3eb)   case  $ndq  in
359                     (berte|p50|p100|p392|forfree|p25himem)  error=false;;
360                     (*)    error=true;;
361                 esac;;
362        (t3eh)   case  $ndq  in
363                     (para_t3e|em|k|l|lm|comp_t3e|c|p|ht)  error=false;;
364                     (*)    error=true;;
365                 esac;;
366        (t3ej2|t3ej5)  case  $ndq  in
367                     (low|normal|high)  error=false;;
368                     (*)    error=true;;
369                 esac;;
370        (t3es)  case  $ndq  in
371                     (batch|serial-4|pe4|p48|pe16|pe32|pe64|pe128)  error=false;;
372                     (*)    error=true;;
373                 esac;;
374        (unics)  case  $ndq  in
375                     (unics|ht)  error=false;;
376                     (*)         error=true;;
377                 esac;;
378    esac
379    if [[ $error = true ]]
380    then
381       printf "\n  +++ queue \"$no_default_queue\" on host \"$remote_host\" not allowed"
382       locat=parameter; exit
383    else
384       queue=$no_default_queue
385    fi
386 fi
387
388
389
390    # KNOTENNUTZUNG IN ENTWICKLERQUEUE MUSS SHARED SEIN
391 if [[ $node_usage != shared  &&  $queue = cdev ]]
392 then
393    node_usage=shared
394 fi
395
396
397
398    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT, ZEIT NACH STUNDEN, MINUTEN UND SEKUNDEN
399    # AUFTEILEN
400 done=false
401 while [[ $done = false ]]
402 do
403    if (( $cputime <= 0 ))
404    then
405       printf "\n  +++ wrong cpu-time or cpu-time missing"
406       printf "\n  >>> Please type cpu-time in seconds as INTEGER:"
407       printf "\n  >>> "
408       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
409    else
410       done=true
411    fi
412 done
413 if [[ $remote_host = nech ]]
414 then
415    if (( tasks_per_node != 0 ))
416    then
417       (( cputime = cputime * tasks_per_node ))
418    elif [[ $numprocs != 0 ]]
419    then
420       (( cputime = cputime * numprocs ))
421    fi
422 fi
423 (( stunden  = cputime / 3600 ))
424 (( resttime = cputime - stunden * 3600 ))
425 (( minuten  = resttime / 60 ))
426 (( sekunden = resttime - minuten * 60 ))
427 timestring=${stunden}:${minuten}:${sekunden}
428
429
430
431    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
432 done=false
433 while [[ $done = false ]]
434 do
435    if (( memory <= 0 ))
436    then
437       printf "\n  +++ wrong memory demand or memory demand missing"
438       printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
439       printf "\n  >>> "
440       read  memory  1>/dev/null  2>&1
441    else
442       done=true
443    fi
444 done
445
446 if [[ $remote_host = nech  ||  $remote_host = neck ]]
447 then
448    if (( tasks_per_node != 0 ))
449    then
450       (( Memory = memory * tasks_per_node / 1000 ))
451    elif [[ $numprocs != 0 ]]
452    then
453       (( Memory = memory * numprocs / 1000 ))
454    else
455       (( Memory = memory / 1000 ))
456    fi
457 fi
458
459
460    # SPEICHERBERECHNUNG BEI OPENMP-NUTZUNG
461 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
462 then
463    (( memory = memory * threads_per_task ))
464 fi
465
466
467    # BERECHNUNG DER ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN KNOTEN
468 if (( tasks_per_node != 0 ))
469 then
470    (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
471 fi
472
473
474
475    # HEADER-AUSGABE
476 if [[ $verify = true ]]
477 then
478    printf "\n\n"
479    printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
480    spalte1=SUBJOB;spalte2=$(date)
481    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
482    printf "|                                                              | \n"
483    printf "| values of parameters/options:                                | \n"
484    spalte1=local_host$punkte; spalte2=$punkte$local_host
485    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
486    spalte1=remote_host$punkte; spalte2=$punkte$remote_host
487    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
488    spalte1=queue$punkte; spalte2=$punkte$queue
489    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
490    spalte1=memory$punkte; spalte2="$punkte$memory mb"
491    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
492    spalte1=cputime$punkte; spalte2="$punkte$cputime sec"
493    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
494    spalte1=job_name$punkte; spalte2="$punkte$job_name"
495    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
496    printf "#--------------------------------------------------------------# \n\n"
497
498
499       # KONTROLLABFRAGE, OB ALLES O.K.
500    antwort="dummy"
501    while [[ $antwort != y  &&  $antwort != Y  &&  $antwort != n  &&  $antwort != N ]]
502    do
503       read antwort?" >>> continue (y/n) ? "
504    done
505    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
506    then
507       locat=verify; exit
508    fi
509    printf "\n"
510 fi
511
512
513
514    # ZUFALLSKENNUNG GENERIEREN UND JOBNAMEN AUF ZIELRECHNER BESTIMMEN
515 kennung=$RANDOM
516 job_on_remhost=${job_name}_${kennung}_$local_host
517 job_to_send=job_to_send_$kennung
518 if [[ $delete_dayfile = false ]]
519 then
520    remote_dayfile=${local_host}_${job_name}_result_$kennung
521    local_dayfile=${remote_host}_${job_name}
522 else
523    remote_dayfile=/dev/null
524    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
525    then
526       notification='# @ notification = never'
527    fi
528 fi
529
530
531
532    # QSUB- ODER LL-KOMMANDOS BZW. SKRIPTE  GENERIEREN
533 if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs != 0 ]]
534 then
535
536    if [[ $remote_host = ibmy ]]
537    then
538       consumable_memory=""
539    else
540       consumable_memory="ConsumableMemory($memory mb)"
541    fi
542    if [[ $queue = cdev ]]
543    then
544       data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
545       network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,ip"
546    else
547       if [[ $remote_host = ibms ]]
548       then
549          network_to_use="# @ network.mpi = csss,shared,us"
550       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
551       then
552          network_to_use=""
553       else
554          network_to_use="# @ network.mpi = sn_all,shared,us"
555          data_limit="# @ data_limit = 1.76gb"
556       fi
557    fi
558
559    cat > $job_to_send << %%END%%
560#!/bin/ksh
561
562# @ job_type = parallel
563# @ job_name = palm
564# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
565# @ resources = ConsumableCpus($threads_per_task) $consumable_memory
566# @ output = $remote_dayfile
567# @ error = $remote_dayfile
568# @ image_size = 50
569# @ class = $queue
570# @ environment = OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task; MP_SHARED_MEMORY=yes
571$network_to_use
572$data_limit
573$notification
574
575%%END%%
576
577    if (( nodes > 0 ))
578    then
579
580       cat >> $job_to_send << %%END%%
581# @ node = $nodes
582# @ tasks_per_node = $tasks_per_node
583# @ node_usage = $node_usage
584# @ queue
585
586%%END%%
587
588    else
589
590       if [[ $remote_host != ibmy ]]
591       then
592
593          cat >> $job_to_send << %%END%%
594# @ blocking = unlimited
595# @ total_tasks = $numprocs
596# @ node_usage = $node_usage
597# @ queue
598
599%%END%%
600
601       else
602
603          cat >> $job_to_send << %%END%%
604# @ node = 1
605# @ total_tasks = $numprocs
606# @ queue
607
608%%END%%
609
610       fi
611
612    fi
613
614 elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  &&  $numprocs = 0 ]]
615 then
616
617    cat > $job_to_send << %%END%%
618#!/bin/ksh
619
620# @ job_type = serial
621# @ node_usage = $node_usage
622# @ job_name = palm
623# @ wall_clock_limit = ${timestring},$timestring
624# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)
625# @ output = $remote_dayfile
626# @ error = $remote_dayfile
627# @ class = $queue
628$notification
629
630# @ queue
631
632%%END%%
633
634 elif [[ $remote_host = lcfimm ]]
635 then
636
637    if [[ $numprocs != 0 ]]
638    then
639       cat > $job_to_send << %%END%%
640#!/bin/ksh
641#PBS -N $job_name
642#PBS -A nersc
643#PBS -l walltime=$timestring
644#PBS -l nodes=${nodes}:ppn=$tasks_per_node
645#PBS -l pmem=${memory}mb
646#PBS -m abe
647#PBS -M igore@nersc.no
648#PBS -o $remote_dayfile
649#PBS -j oe
650mpd &
651
652%%END%%
653
654    else
655       cat > $job_to_send << %%END%%
656#!/bin/ksh
657#PBS -N $job_name
658#PBS -A nersc
659#PBS -l walltime=$timestring
660#PBS -l ncpus=1
661#PBS -l pmem=${memory}mb
662#PBS -m abe
663#PBS -M igore@nersc.no
664#PBS -o $remote_dayfile
665#PBS -j oe
666
667%%END%%
668
669    fi
670
671 elif [[ $remote_host = lcsgih  ||  $remote_host = lcsgib ]]
672 then
673
674    if [[ $numprocs != 0 ]]
675    then
676       cat > $job_to_send << %%END%%
677#!/bin/bash
678#PBS -N $job_name
679#PBS -l walltime=$timestring
680#PBS -l nodes=$nodes:ppn=${tasks_per_node}
681#PBS -l feature=$sgi_feature
682#PBS -l naccesspolicy=$node_usage
683#PBS -o $remote_dayfile
684#PBS -j oe
685
686. /usr/share/modules/init/bash
687module load mvapich/mvapich-0.9.9-intel
688# module load mvapich2/1.2-intel
689module load netcdf
690export LD_LIBRARY_PATH=/sw/intel/cce/10.1.015/lib:/sw/intel/fce/10.1.015/lib:/sw/dataformats/netcdf/3.6.2/lib:\$LD_LIBRARY_PATH
691echo ld_library_path=\$LD_LIBRARY_PATH
692
693%%END%%
694
695    else
696       cat > $job_to_send << %%END%%
697#PBS -S /bin/bash
698#PBS -N $job_name
699#PBS -l walltime=$timestring
700#PBS -l ncpus=1
701#PBS -o $remote_dayfile
702#PBS -e $remote_dayfile
703
704%%END%%
705
706    fi
707
708 elif [[ $remote_host = lcxt4 ]]
709 then
710
711    if [[ $numprocs != 0 ]]
712    then
713       cat > $job_to_send << %%END%%
714#!/bin/ksh
715#PBS -S /bin/ksh
716#PBS -N $job_name
717#PBS -A nersc
718#PBS -l walltime=$timestring
719#PBS -l mppwidth=${numprocs}
720#PBS -l mppnppn=${tasks_per_node}
721#PBS -m abe
722#PBS -M igore@nersc.no
723#PBS -o $remote_dayfile
724#PBS -e $remote_dayfile
725
726%%END%%
727
728    else
729       cat > $job_to_send << %%END%%
730#!/bin/ksh
731#PBS -S /bin/ksh
732#PBS -N $job_name
733#PBS -A nersc
734#PBS -l walltime=$timestring
735#PBS -l ncpus=1
736#PBS -l pmem=${memory}mb
737#PBS -m abe
738#PBS -M igore@nersc.no
739#PBS -o $remote_dayfile
740#PBS -e $remote_dayfile
741
742%%END%%
743
744    fi
745
746 elif [[ $remote_host = nech ]]
747 then
748
749    if (( nodes > 1 ))
750    then
751       cat > $job_to_send << %%END%%
752#!/bin/ksh
753#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
754#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
755#PBS -b $nodes
756#PBS -o $remote_dayfile
757#PBS -N palm
758#PBS -j o
759#PBS -T mpisx
760
761%%END%%
762
763    elif [[ $numprocs != 0 ]]
764    then
765       cat > $job_to_send << %%END%%
766#!/bin/ksh
767#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
768#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
769#PBS -o $remote_dayfile
770#PBS -N palm
771#PBS -j o
772
773%%END%%
774
775    else
776       cat > $job_to_send << %%END%%
777#!/bin/ksh
778#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
779#PBS -o $remote_dayfile
780#PBS -j o
781
782%%END%%
783
784    fi
785
786 elif [[ $remote_host = neck ]]
787 then
788
789    if (( nodes > 1 ))
790    then
791       cat > $job_to_send << %%END%%
792#!/bin/ksh
793#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
794#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
795#PBS -b $nodes
796#PBS -o $remote_dayfile
797#PBS -N palm
798#PBS -j o
799#PBS -T mpisx
800
801%%END%%
802
803    elif [[ $numprocs != 0 ]]
804    then
805       cat > $job_to_send << %%END%%
806#!/bin/ksh
807#PBS -q ${queue}
808#PBS -l cpunum_prc=$tasks_per_node,cputim_job=$cputime
809#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb
810#PBS -o $remote_dayfile
811#PBS -N palm
812#PBS -j o
813#PBS -T mpisx
814
815%%END%%
816
817    else
818       cat > $job_to_send << %%END%%
819#!/bin/ksh
820#PBS -l ${qsubmem}=${Memory}gb,${qsubtime}=$cputime
821#PBS -o $remote_dayfile
822#PBS -j o
823
824%%END%%
825
826    fi
827
828 elif [[ $remote_host = lctit ]]
829 then
830    cat > $job_to_send << %%END%%
831#!/bin/bash
832#$ -S /bin/bash
833cd $job_catalog
834export PATH=$PALM_BIN:\$PATH
835echo \$PATH
836
837%%END%%
838
839       # OPTIONEN FUER SUBMIT-KOMMANDO ZUSAMMENSTELLEN
840  #  submcom="$submcom  -N $job_name  -sgeout $remote_dayfile  -q default"
841    submcom="$submcom -g $group_number -N $job_name -rt 4320 -sgeout $remote_dayfile  -q $node_usage "
842
843 else
844
845    cat > $job_to_send << %%END%%
846# @\$-q ${queue}
847# @\$-l${qsubtime} $timestring
848# @\$-l${qsubmem} ${memory}mb
849# @\$-o $remote_dayfile
850# @\$-eo
851
852%%END%%
853
854 fi
855
856
857    # BEI RECHNUNG AUF REMOTE-MASCHINEN RUECKTRANSFER DES DAYFILES PER TRAP
858    # BEI EXIT VERANLASSEN
859    # VEKTORRECHNER MUSS EIGENEN JOB STARTEN, DA DORT NOHUP NICHT FUNKTIONIERT
860    # AUF IBM IN SEOUL IST RUECKTRANSFER ZUR ZEIT GENERELL NICHT MOEGLICH
861 if [[ $delete_dayfile = false  &&  $remote_host != $local_host ]]
862 then
863    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
864    echo "trap '"                               >>  $job_to_send
865    echo "set +vx"                              >>  $job_to_send
866    if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi  ||  $(echo $remote_host | cut -c1-3) = nec  ||  $remote_host = lctit ]]
867    then
868       if [[ $remote_host = ibmb  ||  $remote_host = ibmh ]]
869       then
870          return_queue=c1
871       elif [[ $remote_host = ibms ]]
872       then
873          return_queue=p_normal
874       elif [[ $remote_host = ibmy ]]
875       then
876          return_queue=serial
877       elif [[ $remote_host = lctit ]]
878       then
879          return_queue=sla3
880       elif [[ $remote_host = neck ]]
881       then
882          return_queue=S
883       else
884          return_queue=unknown
885       fi
886
887       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
888       then
889
890          echo "echo \"#!/bin/ksh\" >> scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
891          echo "echo \"# @ job_type = serial\" >> scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
892          echo "echo \"# @ job_name = transfer\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
893          echo "echo \"# @ resources = ConsumableCpus(1) ConsumableMemory(1 gb)\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
894          echo "echo \"# @ wall_clock_limit = 00:10:00,00:10:00\" >> scpjob.$kennung "  >>  $job_to_send
895          echo "echo \"# @ output = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
896          echo "echo \"# @ error = job_queue/last_job_transfer_protocol\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
897          echo "echo \"# @ class = $return_queue\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
898          echo "echo \"# @ image_size = 10\" >> scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
899          echo "echo \"# @ notification = never\" >> scpjob.$kennung" >>  $job_to_send
900
901          echo "echo \"# @ queue\" >> scpjob.$kennung"                >>  $job_to_send
902          echo "echo \" \" >> scpjob.$kennung"                        >>  $job_to_send
903
904          echo "echo \"set -x\" >> scpjob.$kennung"                   >>  $job_to_send
905          echo "echo \"batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \\\"$job_catalog\\\"  $local_dayfile\" >> scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
906          echo "echo \"exit\" >> scpjob.$kennung"                     >>  $job_to_send
907
908       elif [[ $remote_host = nech ]]
909       then
910          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
911          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
912          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
913          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
914          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
915          echo " "                                 >>  $job_to_send
916          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
917          echo "cd /pf/b/${remote_user}/job_queue" >>  $job_to_send
918          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
919          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
920          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
921
922       elif [[ $remote_host = neck ]]
923       then
924          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
925          echo "#PBS -q $return_queue"             >>  $job_to_send
926          echo "#PBS -l ${qsubmem}=1GB,${qsubtime}=100"  >>  $job_to_send
927          echo "#PBS -o last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
928          echo "#PBS -j o"                         >>  $job_to_send
929          echo " "                                 >>  $job_to_send
930          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
931          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
932          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
933          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
934
935       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
936       then
937          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
938          echo "#!/bin/bash"                             >>  $job_to_send
939          echo "#PBS -N job_protocol_transfer"           >>  $job_to_send
940          echo "#PBS -l walltime=00:02:00"               >>  $job_to_send
941          echo "#PBS -l nodes=1:ppn=1"                   >>  $job_to_send
942          echo "#PBS -l feature=xe"                      >>  $job_to_send
943          echo "#PBS -l naccesspolicy=shared"            >>  $job_to_send
944          echo "#PBS -o \$HOME/job_queue/last_job_transfer_protocol"      >>  $job_to_send
945          echo "#PBS -j oe"                        >>  $job_to_send
946          echo " "                                 >>  $job_to_send
947          echo ". /usr/share/modules/init/bash"    >>  $job_to_send
948          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
949          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
950          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
951          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
952
953       elif [[ $remote_host = lctit ]]
954       then
955          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"          >>  $job_to_send
956          echo "set -x"                                    >>  $job_to_send
957          echo "PATH=\$PATH:$job_catalog/../pub"           >>  $job_to_send
958          echo "cd $job_catalog"                           >>  $job_to_send
959          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  $remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
960          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
961          echo "%%END%%"                                   >>  $job_to_send
962
963       else
964
965          echo "cat > scpjob.$kennung << %%END%%"  >>  $job_to_send
966          echo "# @\\\$-q $return_queue"           >>  $job_to_send
967          echo "# @\\\$-l${qsubtime} 10"           >>  $job_to_send
968          echo "# @\\\$-l${qsubmem} 10mb"          >>  $job_to_send
969          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es ]]
970          then
971             echo "# @\$-l mpp_p=0"                >>  $job_to_send
972          fi
973          echo '# @\$-lF 10mb'                     >>  $job_to_send
974#          echo '# @\$-o /dev/null'                 >>  $job_to_send
975          echo '# @\$-o job_queue/last_job_transfer_protocol'    >>  $job_to_send
976          echo '# @\\\$-eo'                          >>  $job_to_send
977          echo " "                                 >>  $job_to_send
978          if [[ $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
979          then
980             echo "set +vx"                        >>  $job_to_send
981             echo ". .profile"                     >>  $job_to_send
982          fi
983          echo "set -x"                            >>  $job_to_send
984          echo "batch_scp  -d  -w 10  -u $local_user $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null"  >>  $job_to_send
985          echo "[[ \"\$for_subjob_to_do\" != \"\" ]]  &&  eval \$for_subjob_to_do"  >>  $job_to_send
986          echo "%%END%%"                           >>  $job_to_send
987       fi
988
989       if [[ $(echo $remote_host | cut -c1-3) = ibm ]]
990       then
991          echo "llsubmit  scpjob.$kennung"      >>  $job_to_send
992       elif [[ $(echo $remote_host | cut -c1-5) = lcsgi ]]
993       then
994          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
995          echo "msub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
996       elif [[ $remote_host = lctit ]]
997       then
998          echo "chmod  u+x  scpjob.$kennung"    >>  $job_to_send
999          echo "rm -rf ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol"  >>  $job_to_send
1000          echo "n1ge  -N jobtransfer  -q $return_queue  -sgeout ${job_catalog}/last_job_transfer_protocol  scpjob.$kennung"  >>  $job_to_send
1001          echo "sleep 10"                       >>  $job_to_send
1002       elif [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5 ]]
1003       then
1004          echo "qsub -J n  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1005       elif [[ $remote_host = t3es ]]
1006       then
1007          echo "qsub -J n  -s /bin/ksh  scpjob.$kennung"     >>  $job_to_send
1008       else
1009          echo "qsub  scpjob.$kennung"          >>  $job_to_send
1010       fi
1011       echo "rm  scpjob.$kennung"               >>  $job_to_send
1012       if [[ $remote_host = nech ]]
1013       then
1014          echo "cd -"                           >>  $job_to_send
1015       fi
1016    else
1017#       echo "ftpcopy  -d  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile"  >>  $job_to_send
1018       echo "nohup  ftpcopy  -d  -w 15  $local_addres  ${job_catalog}/$remote_dayfile  \"$job_catalog\"  $local_dayfile  >  /dev/null  &"  >>  $job_to_send
1019    fi
1020    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1021    echo "     ' exit"                          >>  $job_to_send
1022    echo "set -x"                               >>  $job_to_send
1023 fi
1024
1025
1026
1027    # EIGENTLICHE JOB-DATEI AN QSUB-KOMMANDOS ANHAENGEN
1028 cat  $file_to_send  >>  $job_to_send
1029
1030 if [[ $remote_host = ibm ]]
1031 then
1032    echo " "         >>  $job_to_send
1033    echo "exit"      >>  $job_to_send
1034 fi
1035 if [[ $remote_host = lctit ]]
1036 then
1037    echo " "                               >>  $job_to_send
1038    echo "rm ~/job_queue/$job_on_remhost"  >>  $job_to_send
1039 fi
1040
1041
1042
1043    # USER-NAME AUF ZIELRECHNER AUS .NETRC-DATEI ERMITTELN
1044 if [[ -z $remote_user ]]
1045 then
1046    if [[ $remote_host = t3eb  ||  $remote_host = t3eh  ||  $remote_host = t3ej2  ||  $remote_host = t3ej5  ||  $remote_host = t3es  ||  $remote_host = vpp ]]
1047    then
1048       grep  $remote_addres  ~/.netrc | read dum dum dum remote_user dum dum
1049    fi
1050 fi
1051
1052
1053
1054    # JOB AUF ZIELRECHNER TRANSFERIEREN BZW. INS JOBVERZEICHNIS KOPIEREN
1055 if [[ $no_submit = false ]]
1056 then
1057    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1058    then
1059       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> transfering job to \"$remote_host\"..."
1060       if [[ $remote_host = ibms  ||  $remote_host = ibmy ]]    # ssh on ibms cannot handle "~/"
1061       then
1062          job_catalog_save=$job_catalog
1063          job_catalog=job_queue
1064       elif [[ $remote_host = nech ]]
1065       then
1066          job_catalog_save=$job_catalog
1067          job_catalog=/hpf/b/${remote_user}/job_queue
1068       fi
1069       if [[ $local_host = decalpha ]]
1070       then
1071             # VERWENDUNG VON SCP AUF DECALPHA FRAGT FEHLERHAFTERWEISE
1072             # PASSWORT AB
1073          /bin/scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1074       elif [[ $remote_host = nech ]]
1075       then
1076             # DATEIEN KOENNEN NUR UEBER DEN ARCHIVE-SERVER DES DKRZ
1077             # TRANSFERIERT WERDEN
1078          scp  $job_to_send  ${remote_user}@136.172.44.205:${job_catalog}/$job_on_remhost
1079       else
1080          scp  $job_to_send  ${remote_user}@${remote_addres}:${job_catalog}/$job_on_remhost
1081       fi
1082       if [[ $? = 1 ]]
1083       then
1084          locat=scp; exit
1085       fi
1086       if [[ $remote_host = ibms ]]
1087       then
1088          job_catalog=$job_catalog_save
1089       fi
1090       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> finished\n"
1091    else
1092       eval  job_catalog=$job_catalog
1093       cp  $job_to_send  ${job_catalog}/$job_on_remhost
1094    fi
1095
1096
1097
1098       # NQS- BZW. LOADLEVELER-JOB STARTEN
1099    if [[ $remote_host != $local_host ]]
1100    then
1101       [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n >>> submitting job using \"qsub\"...\n"
1102       if [[ $remote_host != lctit ]]
1103       then
1104          ssh  $remote_addres  -l $remote_user  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost; rm $job_on_remhost"
1105       else
1106             # TIT ERLAUBT NUR DIE AUSFÜHRUNG GANZ BESTIMMTER KOMMANDOS
1107             # MIT SSH, DESHALB AUFRUF PER PIPE
1108             # UEBERGANGSWEISE CHECK, OB N1GE ENVIRONMENT WIRKLICH VERFUEGBAR
1109          print  "cd $job_catalog; chmod u+x $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1110          echo "first try" > send_protocol
1111          while [[ $(cat send_protocol | grep -c "Forwarding to N1GE") = 0 ]]
1112          do
1113             if [[ $(cat send_protocol | grep -c "first try") = 1 ]]
1114             then
1115                printf "\n trying to submit job to TIT cluster..."
1116             else
1117                printf "\n +++ failed ... trying to submit again ..."
1118             fi
1119             print  "cd $job_catalog; $submcom $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  >  send_protocol  2>&1
1120             cat send_protocol
1121          done
1122          sleep 10
1123          print  "cd $job_catalog;  rm $job_on_remhost"  |  ssh  $remote_addres  -l $remote_user  > /dev/null  2>&1
1124          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1125          rm  send_protocol
1126       fi
1127
1128       [[ $verify = true ]]  &&  printf " >>> o.k.\n"
1129    else
1130       cd  $job_catalog
1131       if [[ $(echo $local_host | cut -c1-3) = ibm ]]
1132       then
1133          eval  $submcom  $job_on_remhost
1134       elif [[  $local_host = lcfimm  ||  $local_host = lctit  ||  $localhost = lcxt4 ]]
1135       then
1136          eval  $submcom  $job_on_remhost
1137          echo "$submcom  $job_on_remhost"
1138          chmod  u+x  $job_on_remhost
1139       elif [[ $local_host = nech ]]
1140       then
1141          if [[ $queue = default ]]
1142          then
1143             eval  $submcom  $job_on_remhost 
1144          else
1145             eval  $submcom  -q $queue  $job_on_remhost 
1146          fi
1147       else
1148          qsub  $job_on_remhost
1149       fi
1150          # JOBFILE DARF AUF LCTIT NICHT GELOESCHT WERDEN!! GESCHIEHT ERST AM JOBENDE
1151       [[ $local_host != lctit ]]  &&  rm  $job_on_remhost
1152       cd  -  > /dev/null
1153    fi
1154 fi
1155
1156
1157
1158    # ABSCHLUSSARBEITEN
1159
1160 if [[ $no_submit = false ]]
1161 then
1162    rm  $job_to_send
1163 fi
1164 [[ $verify = true ]]  &&  printf "\n\n *** SUBJOB finished \n\n"
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.