source: palm/trunk/SCRIPTS/palm_wd @ 1983

Last change on this file since 1983 was 1754, checked in by maronga, 6 years ago

last commit documented

  • Property svn:executable set to *
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 39.4 KB
Line 
1#!/usr/bin/python
2# -*- coding: utf-8 -*-
3#--------------------------------------------------------------------------------#
4# This file is part of PALM.
5#
6# PALM is free software: you can redistribute it and/or modify it under the terms
7# of the GNU General Public License as published by the Free Software Foundation,
8# either version 3 of the License, or (at your option) any later version.
9#
10# PALM is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
11# WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR
12# A PARTICULAR PURPOSE.  See the GNU General Public License for more details.
13#
14# You should have received a copy of the GNU General Public License along with
15# PALM. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
16#
17# Copyright 1997-2015  Leibniz Universitaet Hannover
18#--------------------------------------------------------------------------------#
19#
20# Current revisions:
21# -----------------
22#
23#
24# Former revisions:
25# -----------------
26# $Id: palm_wd 1754 2016-02-22 13:50:22Z suehring $
27#
28# 1753 2016-02-22 13:49:49Z maronga
29# Bugfix: use of global variables is required after updating configuration file
30#
31# 1751 2016-02-15 07:44:16Z maronga
32# Bugfixes: runs on multiple hosts caused crash of the watchdog. Progress bar
33# occasionally showed wrong progress.
34# New: Hosts can be switched on/off and update_frequency can be modified via
35# File->Options. Security check for cancelation of jobs.
36#
37# 1618 2015-07-13 06:52:15Z maronga
38# Added steering via configuration file .wd.config, to be place in the local
39# palm directory. Watchdog save files are automatically created upon first start.
40#
41# 1613 2015-07-08 14:53:29Z maronga
42# Bugfix: tooltip for queuing name did not show up on first update.
43# New: added contect menu for showing the parameter file and the run control
44# output
45#
46# 1611 2015-07-07 12:23:22Z maronga
47# Initial revision
48#
49#
50# Description:
51# ------------
52# PALM watchdog client for monitoring batch jobs on a variety of hosts specified
53# by the user
54#
55# Instructions:
56# -------------
57# 1) Modify the header section of palm_wd
58# 2) Move .wd.olddata and .wd.newdata to your palm directory
59#    (e.g. /home/user/current_version/.wd.newdata etc.)
60# 3) Modify a copy of palm_wdd for each host to be monitored and move it to the
61#    respective hosts
62# 4) Start the client either from mrungui or from shell by "nohup palm_wd&"
63
64# To do:
65# ------
66# 1) Add "Options", "Help" and "Manual"
67# 2) Move user settings to a configuration file
68#------------------------------------------------------------------------------!
69
70import ConfigParser
71import datetime
72import os
73from PyQt4 import QtGui, QtCore, uic
74from PyQt4.QtCore import pyqtSlot,SIGNAL,SLOT
75import shutil
76import subprocess as sub
77import sys
78import time
79
80# Determine PALM directories
81try: 
82   devnull = open(os.devnull, 'w')
83   out = sub.check_output("echo $PALM_BIN", shell=True, stderr=sub.STDOUT)
84   palm_bin = out.rstrip()
85   palm_dir = out.split("palm")[0] + "palm/" + out.split("palm")[1].split("/")[1]
86   out = None
87except:   
88   print "Error. $PALM_BIN is not set."
89   raise SystemExit
90
91
92# Read configuration file
93# First check if the configuration file exists
94if ( os.path.exists(palm_dir + '/.wd.config') == False ):
95    print "Error. No configuration file .wd.config found in " + palm_dir
96    raise SystemExit     
97
98config = ConfigParser.RawConfigParser()
99config.read(palm_dir + '/.wd.config')
100
101description = []
102hostname = []
103username = []
104
105for i in range(0,len(config.sections())):
106
107    description_tmp = config.sections()[i]
108 
109    if ( description_tmp != 'Settings' ):
110     
111       if ( config.get(description_tmp, 'enabled') == 'true' ):
112          description.append(description_tmp)
113          hostname.append(config.get(description_tmp, 'hostname'))
114          username.append(config.get(description_tmp, 'username')) 
115    else:
116       update_frequency = int(config.get(description_tmp, 'update_frequency'))*60000
117
118# Check if .wd.olddata and .wd.newdata exist. Otherwise create the files
119if ( os.path.exists(palm_dir + '/.wd.olddata') == False ):
120   print "No .wd.olddata found. Creating..."
121   file1 = open(palm_dir + '/.wd.olddata', 'a')
122   file1.close()
123   
124
125if ( os.path.exists(palm_dir + '/.wd.newdata') == False ):
126   print "No .wd.newdata found. Creating..." 
127   file1 = open(palm_dir + '/.wd.newdata', 'a')
128   file1.close()
129
130# Dummy variables for the jobname and the progressbars
131jobname = ""
132timestamp = ""
133pbars = []
134job_data_list = []
135
136# Message box for showing RUN_CONTROL output
137class MessageBoxScroll(QtGui.QMessageBox):
138    def __init__(self):
139        QtGui.QMessageBox.__init__(self)
140        self.setSizeGripEnabled(True)
141
142    def event(self, e):
143        result = QtGui.QMessageBox.event(self, e)
144
145        self.setMinimumHeight(100)
146        self.setMaximumHeight(16777215)
147        self.setMinimumWidth(400)
148        self.setMaximumWidth(16777215)
149        self.setSizePolicy(QtGui.QSizePolicy.Expanding, QtGui.QSizePolicy.Expanding)
150
151        textEdit = self.findChild(QtGui.QTextEdit)
152        if textEdit != None :
153            textEdit.setMinimumHeight(800)
154            textEdit.setMaximumHeight(16777215)
155            textEdit.setMinimumWidth(1000)
156            textEdit.setMaximumWidth(16777215)
157            textEdit.setSizePolicy(QtGui.QSizePolicy.Expanding, QtGui.QSizePolicy.Expanding)
158            f = QtGui.QFont('not_a_font') #
159            f.setStyleHint(f.TypeWriter, f.PreferDefault)
160            textEdit.setFont(f)
161
162        return result
163
164
165# Message box for showing RUN_CONTROL output
166class OptionBox(QtGui.QDialog):
167    def __init__(self):
168     
169        super(OptionBox, self).__init__()
170     
171        uic.loadUi(palm_bin + '/palm_wd_files/wdoptions.ui', self)
172       
173        hostname = []
174        self.checkbox = []
175        j = -1
176        ypos = 0
177   
178        self.vbox = QtGui.QVBoxLayout(self)
179        self.vbox.setSpacing(0)
180        self.vbox.setMargin(0)       
181   
182        config.read(palm_dir + '/.wd.config')
183   
184        for i in range(0,len(config.sections())):
185
186           description_tmp = config.sections()[i]
187 
188           if ( description_tmp != 'Settings' ):
189              description.append(description_tmp)
190              hostname.append(config.get(description_tmp, 'hostname'))
191             
192              j = j + 1
193              self.checkbox.append(j)
194              self.checkbox[j] = QtGui.QCheckBox(description_tmp, self)   
195              ypos = ypos + 20
196              self.checkbox[j].move(10,0)
197              if ( config.get(description_tmp, 'enabled') == 'true' ):
198                 self.checkbox[j].toggle()
199                       
200              self.vbox.addWidget(self.checkbox[j])
201           else:
202              self.update_spin.setValue(int(config.get(description_tmp, 'update_frequency')))
203     
204        self.hostBox.setLayout(self.vbox)
205        self.hostBox.setGeometry(0, 0, 272, 50+ypos)
206        self.settingBox.setGeometry(281, 0, 214, 50+ypos)
207        self.ok.setGeometry(385, 50+ypos, 111, 24)
208        self.cancel.setGeometry(270, 50+ypos, 111, 24)
209       
210        self.setGeometry(0, 0, 500, 80+ypos)
211        self.show()
212       
213        return
214
215#   save updtes to file
216    def SaveAndClose(self):
217     
218       for i in range(0,len(self.checkbox)):
219         
220          if ( self.checkbox[i].checkState() == 0 ):
221             config.set(str(self.checkbox[i].text()),'enabled','false')
222          else:
223             config.set(str(self.checkbox[i].text()),'enabled','true')       
224       
225       config.set('Settings','update_frequency',self.update_spin.text()) 
226
227       with open(palm_dir + '/.wd.config', 'wb') as configfile:
228          config.write(configfile)
229
230
231       self.close()
232     
233       return
234
235
236
237# MainWindow class
238class Watchdog(QtGui.QMainWindow):
239   
240    def __init__(self):
241        super(Watchdog, self).__init__()
242       
243        self.InitUi()   
244       
245   
246    # Initialized MainWindow UI
247    def InitUi(self):
248
249        # Load predefined mainwindow
250        uic.loadUi(palm_bin + '/palm_wd_files/wd.ui', self)
251
252        # Resize columns and set number of rows to zero. Column 6 is hidden and
253        # contains the remote jobname (e.g. hannover.174610)
254        self.table.setColumnWidth(0,230)
255        self.table.setColumnWidth(1,80)
256        self.table.setColumnWidth(2,50)
257        self.table.setColumnWidth(3,80)     
258        self.table.setColumnWidth(4,180)
259        self.table.setColumnWidth(5,115)   
260        self.table.setColumnHidden(6, True)
261        self.table.setRowCount(0) 
262   
263        # Display MainWindow
264        self.show()
265        QtGui.QApplication.processEvents()
266
267        # Start refresh timer. On timeout perform update
268        self.timer = QtCore.QTimer(self)
269        self.timer.timeout.connect(self.Refresh)
270        self.timer.setSingleShot(False)
271        self.timer.start(update_frequency)
272
273        # The timetimer counts the time since last update
274        self.timetimer= QtCore.QElapsedTimer()
275        self.timetimer.start()
276
277        # The labeltimer induces the update of the remaining time in the UI
278        self.labeltimer = QtCore.QTimer(self)
279        self.labeltimer.timeout.connect(self.UpdateLabel)
280        self.labeltimer.setSingleShot(False)
281
282        # Update in the UI will be performed at each 1/10 of the update interval
283        self.labeltimer.start(update_frequency/10)   
284        self.label.setText("Next update in " + str(update_frequency/1000/60) + "min")
285
286        # Update the list now
287        self.Refresh()
288       
289
290    # Add a custom context menu
291    def OpenContextMenu(self, position):
292        menu = QtGui.QMenu()
293       
294        # "Show details" -> fetch details for the selected job
295        detailsjobAction = menu.addAction('Show job details')     
296        detailsjobAction.setStatusTip('Display detailed info for job')
297        detailsjobAction.triggered.connect(self.ShowDetails)
298
299        # "Show parameter file" -> show the contents of PARIN
300        parinAction = menu.addAction('Show parameter file')     
301        parinAction.setStatusTip('Display the parameter file of the job (e.g. PARIN / _p3d)')
302        parinAction.triggered.connect(self.ShowPARIN)
303       
304        rcAction = menu.addAction('Show run control file')     
305        rcAction.setStatusTip('Display the current run control file (e.g. RUN_CONTROL / _rc)')
306        rcAction.triggered.connect(self.ShowRC)
307       
308        # "Cancel job" -> remove job from queuing system
309        canceljobAction = menu.addAction('Cancel job')
310        canceljobAction.setStatusTip('Remove job from queueing system')
311        canceljobAction.triggered.connect(self.CancelJob)
312       
313        # "Force stop" -> force termination of job
314        stopjobAction = menu.addAction('Force stop')
315        stopjobAction.setStatusTip('Terminate job properly')
316        stopjobAction.triggered.connect(self.DoStop)
317   
318        # "Force restart" -> force rermination and restart of job
319        restartjobAction = menu.addAction('Force restart')
320        restartjobAction.setStatusTip('Terminate job properly and initiate restart')
321        restartjobAction.triggered.connect(self.DoRestart)
322 
323        # "Remove from list" -> remove a completed job from the list
324        removefromlistAction = menu.addAction('Remove from list')     
325        removefromlistAction.setStatusTip('Remove finished job')
326        removefromlistAction.triggered.connect(lambda: self.RemoveFromList(-1))     
327
328       
329        # Activate/deactive contect menu items based on the status of the runs
330        state = self.table.item(self.table.currentRow(),3).text()
331        if (state == "Canceled" or state == "Completed" or state == "Terminated"):
332            detailsjobAction.setEnabled(False)
333            canceljobAction.setEnabled(False) 
334            removefromlistAction.setEnabled(True) 
335        else:
336            detailsjobAction.setEnabled(True)
337            canceljobAction.setEnabled(True) 
338            removefromlistAction.setEnabled(False)   
339 
340        if ( state == "Running" ):
341            stopjobAction.setEnabled(True) 
342            restartjobAction.setEnabled(True)   
343            parinAction.setEnabled(True)
344            rcAction.setEnabled(True)         
345        else:
346            stopjobAction.setEnabled(False) 
347            restartjobAction.setEnabled(False)   
348            parinAction.setEnabled(False)
349            rcAction.setEnabled(False) 
350           
351        # Show the context menu
352        action = menu.exec_(self.table.mapToGlobal(position))
353
354
355    # Collecting watchdog data and display in the UI
356    def Refresh(self):
357     
358        # Use global variables
359        global pbars
360        global update_frequency
361
362        # Deactivate timer processes until update is finished
363        # QtGui.QApplication.processEvents() updates the UI whenever needed
364        self.labeltimer.stop() 
365        self.label.setText("Updating...") 
366        QtGui.QApplication.processEvents()
367        self.setEnabled(False)
368        QtGui.QApplication.processEvents()
369
370        # Get current timestamp
371        timestamp = datetime.datetime.now().strftime("%d/%m/%Y %H:%M")
372       
373        # Open an empty file for the watchdog data       
374        file = open(palm_dir + '/.wd.newdata', 'w')
375       
376 
377        # Set all required variables to their initial values. Sorting must be
378        # disabled.
379        self.table.setRowCount(0) 
380        self.table.setSortingEnabled(False)
381        i = -1
382        job_data_list = []
383        pbars = []
384       
385        # Scan all hosts in the variable hostname. For each host perform the
386        # update loop
387        for h in range(0,len(hostname)):
388         
389            # Perform ssh command
390            host    = username[h] + "@" + hostname[h]
391            ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, "/sw/tools/python/2.7.6/generic/bin/python palm_wdd queue " + username[h]],
392                           shell=False,
393                           stdout=sub.PIPE,
394                           stderr=sub.PIPE)
395            result = ssh.stdout.readlines()
396            result = filter(None, result)
397 
398 
399            # Delete all job data
400            job_data_tmp = []
401            job_data = []
402            job_data_n = []   
403            job_progress = 0
404
405            # In case of errors display error message
406            if ( len(result) < 1 ):
407                error = ssh.stderr.readlines()
408                if ( error != [] ):
409                    notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Collect data',"Error. An error occured during read of job data for user " + username[h] +" for host " + description[h] + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
410
411            # No error -> save job data
412            else:       
413
414                # Successively write to job_data
415                for j in range(0,len(result)):
416   
417                    job_data_tmp.append(j)
418                    job_data_tmp[j] = result[j].split(" ")
419                    job_data_tmp[j] = filter(None, job_data_tmp[j])
420 
421                    job_data.append(j)   
422                    job_data[j] = [job_data_tmp[j][0], description[h], job_data_tmp[j][2],                 
423                                   job_data_tmp[j][3], int(float(job_data_tmp[j][4])*100), job_data_tmp[j][5], 
424                                   job_data_tmp[j][1], job_data_tmp[j][6].rstrip()]
425                    job_data_n.append(j)
426                    job_data_n[j] = job_data_tmp[j][1]
427
428            del(result)
429
430
431
432            # Now read the data from the last update from file. These data are
433            # already in the prefered format
434            file2 = open(palm_dir + '/.wd.olddata', 'r')
435            result = file2.readlines()
436            file2.close()
437
438            job_data_old = []
439            job_data_old_n = []
440            k = -1
441            for j in range(0,len(result)):
442                if ( result[j].split()[1] == description[h] ):
443                    k = k + 1
444                    job_data_old.append(k)
445                    job_data_old[k] = result[j].split(" ")
446                    job_data_old[k] = filter(None, job_data_old[k])
447                    job_data_old[k] = [line.rstrip('\n') for line in job_data_old[k]]
448                    job_data_old_n.append(k)
449                    job_data_old_n[k] = job_data_old[k][6]
450
451            # Merge the job_data and job_data_old to find completed, new and
452            # still queued jobs     
453            if ( len(job_data_n) > 0 and len(job_data_old_n) > 0 ):
454               jobs_full  = list(set(job_data_old_n) | set(job_data_n))
455               jobs_known    = list(set(job_data_old_n) & set(job_data_n))
456               jobs_complete = set(job_data_old_n) - set(job_data_n)
457               jobs_new      = set(job_data_n) - set(job_data_old_n)
458            elif ( len(job_data_n) > 0 ):
459               jobs_full  = job_data_n
460               jobs_known    = []
461               jobs_new = job_data_n
462               jobs_complete = []
463            elif ( len(job_data_old_n) > 0 ):
464               jobs_full  = job_data_old_n
465               jobs_known    = []
466               jobs_new = []
467               jobs_complete = job_data_old_n   
468            else:
469               jobs_full  = []
470               jobs_known    = []         
471               jobs_new = []
472               jobs_complete = []
473
474            # Display all known jobs
475            to_display = [list(job_data_n).index(item) for item in list(jobs_known) if list(jobs_known) and list(job_data_n)]
476            for j in range(0,len(to_display)):
477                i = i + 1
478                self.table.insertRow(i)
479                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][0])
480                item.setToolTip("Queuing name: " + job_data[to_display[j]][6])
481                self.table.setItem(i, 0, item)           
482                self.table.setItem(i, 1, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][1])) 
483                self.table.setItem(i, 2, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][2]))   
484                self.table.setItem(i, 3, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][3]))
485                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][5])
486                item.setToolTip("Estimated job start: " + job_data[to_display[j]][7])               
487                self.table.setItem(i, 5, item) 
488                self.table.setItem(i, 6, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][6])) 
489                self.table.item(i,2).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
490                self.table.item(i,5).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
491                pbars.append(i)
492                pbars[i] = QtGui.QProgressBar(self)
493                pbars[i].setValue(int(job_data[to_display[j]][4])) 
494 
495                # Apply a color depending on the status of the job
496                if ( job_data[to_display[j]][3] == "Running" ):
497                    self.table.setCellWidget(i,4,pbars[i]) 
498                    self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
499                    self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
500                    self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
501                    self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
502                    self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
503                    self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
504                else:
505                    pbars[j].setEnabled(False)
506                    self.table.setCellWidget(i,4,pbars[i])
507                    self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
508                    self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
509                    self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
510                    self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
511                    self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
512                    self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
513               
514                # Save the job data to file
515                job_data_list.append(i)
516                job_data_list[i] = job_data[to_display[j]][0]
517               
518                printstring = str(job_data[to_display[j]][0]) + " " + \
519                              str(job_data[to_display[j]][1]) + " " + \
520                              str(job_data[to_display[j]][2]) + " " + \
521                              str(job_data[to_display[j]][3]) + " " + \
522                              str(job_data[to_display[j]][4]) + " " + \
523                              str(job_data[to_display[j]][5]) + " " + \
524                              str(job_data[to_display[j]][6]) + " " + \
525                              str(job_data[to_display[j]][7]) + "\n"
526                file.write(printstring)
527
528
529            # Display all new jobs
530            to_display = [list(job_data_n).index(item) for item in list(jobs_new) if list(jobs_new) and list(job_data_n)]
531            for j in range(0,len(to_display)):
532                i = i + 1
533                self.table.insertRow(i)
534                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][0])
535                item.setToolTip("Queuing name: " + job_data[to_display[j]][6])
536                self.table.setItem(i, 0, item)   
537                self.table.setItem(i, 1, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][1])) 
538                self.table.setItem(i, 2, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][2]))   
539                self.table.setItem(i, 3, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][3])) 
540                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][5])
541                item.setToolTip("Estimated job start: " + job_data[to_display[j]][7])               
542                self.table.setItem(i, 5, item) 
543                self.table.setItem(i, 6, QtGui.QTableWidgetItem(job_data[to_display[j]][6])) 
544                self.table.item(i,2).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
545                self.table.item(i,5).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
546               
547                pbars.append(i)
548                pbars[i] = QtGui.QProgressBar(self)
549                pbars[i].setValue(int(job_data[to_display[j]][4]))   
550
551                # Apply a color depending on the status of the job
552                if ( job_data[to_display[j]][3] == "Running" ):
553                    self.table.setCellWidget(i,4,pbars[i])           
554                    self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
555                    self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
556                    self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
557                    self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
558                    self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
559                    self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(255, 251, 168))
560                else:
561                    pbars[j].setEnabled(False)
562                    self.table.setCellWidget(i,4,pbars[i])
563                    self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
564                    self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
565                    self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
566                    self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
567                    self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
568                    self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(255, 112, 118))
569         
570                # Save job data to file
571                job_data_list.append(i)
572                job_data_list[i] = job_data[to_display[j]][0]
573               
574                printstring = str(job_data[to_display[j]][0]) + " " + \
575                              str(job_data[to_display[j]][1]) + " " + \
576                              str(job_data[to_display[j]][2]) + " " + \
577                              str(job_data[to_display[j]][3]) + " " + \
578                              str(job_data[to_display[j]][4]) + " " + \
579                              str(job_data[to_display[j]][5]) + " " + \
580                              str(job_data[to_display[j]][6]) + " " + \
581                              str(job_data[to_display[j]][7]) + "\n"
582                file.write(printstring)
583
584
585            # Display all completed/canceled/aborted jobs. The watchdog cannot
586            # distinguish why the job has been finished
587            to_display = [list(job_data_old_n).index(item) for item in list(jobs_complete) if list(jobs_complete) and list(job_data_old_n)]
588            for j in range(0,len(to_display)):
589                i = i + 1
590                self.table.insertRow(i)
591                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][0])
592                item.setToolTip("Queuing name: " + job_data_old[to_display[j]][6])
593                self.table.setItem(i, 0, item)         
594                self.table.setItem(i, 1, QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][1])) 
595                self.table.setItem(i, 2, QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][2]))   
596                self.table.setItem(i, 3, QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][3])) 
597                pbars.append(i)
598                pbars[j] = QtGui.QProgressBar(self)
599                pbars[j].setValue(int(job_data_old[to_display[j]][4])) 
600                pbars[j].setEnabled(False)
601                self.table.setCellWidget(i,4,pbars[j]) 
602                item = QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][5])
603                item.setToolTip("Estimated job start: " + job_data_old[to_display[j]][7])               
604                self.table.setItem(i, 5, item) 
605                self.table.setItem(i, 6, QtGui.QTableWidgetItem(job_data_old[to_display[j]][6])) 
606                self.table.item(i,2).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
607                self.table.item(i,5).setTextAlignment(QtCore.Qt.AlignRight)
608                self.table.setItem(i, 3, QtGui.QTableWidgetItem("Completed"))
609               
610                # Apply a color depending on the status of the job
611                self.table.item(i,0).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
612                self.table.item(i,1).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
613                self.table.item(i,2).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
614                self.table.item(i,3).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
615                self.table.item(i,5).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
616                self.table.item(i,6).setBackground(QtGui.QColor(172, 252, 175))
617
618         
619                # Save job data to file
620                job_data_list.append(i)
621                job_data_list[i] = job_data_old[to_display[j]][0]
622
623                printstring = str(job_data_old[to_display[j]][0]) + " " + \
624                              str(job_data_old[to_display[j]][1]) + " " + \
625                              str(job_data_old[to_display[j]][2]) + " " + \
626                              str(job_data_old[to_display[j]][3]) + " " + \
627                              str(job_data_old[to_display[j]][4]) + " " + \
628                              str(job_data_old[to_display[j]][5]) + " " + \
629                              str(job_data_old[to_display[j]][6]) + " " + \
630                              str(job_data_old[to_display[j]][7]) + "\n"
631                file.write(printstring)
632
633            del(jobs_complete)
634            del(jobs_new)
635            del(result)
636            del(job_data_old)
637            del(job_data_old_n)
638           
639        file.close()
640
641       
642        # Update is complete, sorting can thus be re-enabled               
643        self.table.setSortingEnabled(True) 
644
645        # Update the logfile
646        if ( os.path.isfile(palm_dir + '/.wd.newdata') ):
647            shutil.copy(palm_dir + '/.wd.newdata',palm_dir + '/.wd.olddata')
648
649        # Re-enable timer processes             
650        self.setEnabled(True)
651        self.label2.setText("Last update: " + timestamp)
652        self.label.setText("Update complete.")
653        self.timetimer.start()
654        self.timer.start(update_frequency)
655        self.labeltimer.start(update_frequency/10)
656        self.UpdateLabel()
657        QtGui.QApplication.processEvents()
658       
659    # Canceling selected job from table
660    def CancelJob(self):
661
662        # Return internal jobname
663        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
664 
665        # Check description of job in order to login on the correct host
666        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
667       
668        querybox = QtGui.QMessageBox()
669        querybox.setText("Attention!\nYou are trying to cancel a job. It will not be able to terminate properly.")
670        querybox.setInformativeText("Do you really want to cancel " + jobname + " on host " + descr + "?")
671        querybox.setStandardButtons(QtGui.QMessageBox.Yes | QtGui.QMessageBox.No)
672        querybox.setDefaultButton(QtGui.QMessageBox.No)
673        returnvalue = querybox.exec_()
674       
675        if ( returnvalue == QtGui.QMessageBox.Yes ):
676       
677           for h in range(0,len(description)):
678               if ( descr == description[h] ):
679                  host = username[h] + "@" + hostname[h]
680
681           ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, "/sw/tools/python/2.7.6/generic/bin/python palm_wdd cancel " + jobname],
682                              shell=False,
683                              stdout=sub.PIPE,
684                              stderr=sub.PIPE)
685           result = ssh.stdout.readlines()
686           result = filter(None, result)
687       
688           # In case of error display a warning message
689           if ( len(result) == 0 ):
690               error = ssh.stderr.readlines()
691               notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Cancel job',"Error. Could not cancel job " + jobname + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
692
693           # Otherwise inform the user and mark the job in the table
694           else:
695               self.table.setItem(self.table.currentRow(),3,QtGui.QTableWidgetItem("Canceled"))
696               notify = QtGui.QMessageBox.information(self,'Cancel job',"Job" + jobname + " canceled!\n\nServer message:\n" + ''.join(result))
697
698
699    # Show detailed information on job. For documentation see above
700    def ShowDetails(self):
701
702        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
703        descr   = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
704        for h in range(0,len(description)):
705            if ( descr == description[h] ):
706                host = username[h] + "@" + hostname[h]
707
708        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, "/sw/tools/python/2.7.6/generic/bin/python palm_wdd check " + jobname],
709                           shell=False,
710                           stdout=sub.PIPE,
711                           stderr=sub.PIPE)
712        result = ssh.stdout.readlines()
713        result = filter(None, result)
714
715        if ( len(result) == 0 ):
716            error = ssh.stderr.readlines()
717            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Show job details',"Error. Could not fetch job details for " + jobname + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
718        else:
719            notify = QtGui.QMessageBox.information(self,'Job details',"Details for job " + jobname + ":\n\n" + ''.join(result))
720
721
722    # Perform a forced stop on the job
723    def DoStop(self):
724
725        # Return internal jobname
726        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
727 
728        # Check description of job in order to login on the correct host
729        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
730        for h in range(0,len(description)):
731            if ( descr == description[h] ):
732                host = username[h] + "@" + hostname[h]
733                user = username[h]
734
735        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, "/sw/tools/python/2.7.6/generic/bin/python palm_wdd stop " + user + " " + jobname],
736                           shell=False,
737                           stdout=sub.PIPE,
738                           stderr=sub.PIPE)
739        result = ssh.stdout.readlines()
740        result = filter(None, result) 
741       
742        # In case of error display a warning message
743        if ( len(result) == 0 ):
744            error = ssh.stderr.readlines()
745            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Proper termination of job',"Error. Could not stop job " + jobname + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
746
747        # Otherwise inform the user and mark the job in the table
748        else:
749            self.table.setItem(self.table.currentRow(),3,QtGui.QTableWidgetItem("Terminated"))
750            notify = QtGui.QMessageBox.information(self,'Terminate job',"Termination of job " + jobname + " was initiated!\n\nServer message:\n" + ''.join(result))
751
752
753    # Perform a forced stop on the job
754    def DoRestart(self):
755
756        # Return internal jobname
757        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
758 
759        # Check description of job in order to login on the correct host
760        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
761        for h in range(0,len(description)):
762            if ( descr == description[h] ):
763                host = username[h] + "@" + hostname[h]
764                user = username[h]
765
766        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, "/sw/tools/python/2.7.6/generic/bin/python palm_wdd restart " + user + " " + jobname],
767                           shell=False,
768                           stdout=sub.PIPE,
769                           stderr=sub.PIPE)
770        result = ssh.stdout.readlines()
771        result = filter(None, result)
772       
773        # In case of error display a warning message
774        if ( len(result) == 0 ):
775            error = ssh.stderr.readlines()
776            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Proper termination of job',"Error. Could not stop job " + jobname + ".\n\nError message:\n" + ''.join(error))
777
778        # Otherwise inform the user and mark the job in the table
779        else:
780            self.table.setItem(self.table.currentRow(),3,QtGui.QTableWidgetItem("Terminated"))
781            notify = QtGui.QMessageBox.information(self,'Terminate job for restart',"Restart for job" + jobname + " was initiated!\n\nServer message:\n" + ''.join(result))
782           
783
784    # Read the PARIN file of the job
785    def ShowPARIN(self):
786
787        # Return internal jobname
788        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
789        jobrealname = self.table.item(self.table.currentRow(),0).text()     
790 
791        # Check description of job in order to login on the correct host
792        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
793        for h in range(0,len(description)):
794            if ( descr == description[h] ):
795                host = username[h] + "@" + hostname[h]
796                user = username[h]
797
798        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, "/sw/tools/python/2.7.6/generic/bin/python palm_wdd parin " + user + " " + jobname],
799                           shell=False,
800                           stdout=sub.PIPE,
801                           stderr=sub.PIPE)
802        result = ssh.stdout.readlines()
803        result = filter(None, result)
804       
805        # In case of error display a warning message
806        if ( len(result) == 0 ):
807            error = ssh.stderr.readlines()
808            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Showing parameter file',"Error. Could not fetch parameter file for job " + jobrealname + " (" + jobname + ").\n\nError message:\n" + ''.join(error))
809
810        # Otherwise inform the user and mark the job in the table
811        else:
812           mb = MessageBoxScroll()
813           mb.setText("Parameter file for job: " + jobrealname + "")
814           mb.setDetailedText(''.join(result))
815           mb.exec_()
816
817    # Read the PARIN file of the job
818    def ShowRC(self):
819
820        # Return internal jobname and real job name
821        jobname = self.table.item(self.table.currentRow(),6).text()
822        jobrealname = self.table.item(self.table.currentRow(),0).text()     
823 
824        # Check description of job in order to login on the correct host
825        descr = self.table.item(self.table.currentRow(),1).text()
826        for h in range(0,len(description)):
827            if ( descr == description[h] ):
828                host = username[h] + "@" + hostname[h]
829                user = username[h]
830
831        ssh = sub.Popen(["ssh", "%s" % host, "/sw/tools/python/2.7.6/generic/bin/python palm_wdd rc " + user + " " + jobname],
832                           shell=False,
833                           stdout=sub.PIPE,
834                           stderr=sub.PIPE)
835        result = ssh.stdout.readlines()
836        result = filter(None, result)
837       
838        # In case of error display a warning message
839        if ( len(result) == 0 ):
840            error = ssh.stderr.readlines()
841            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Showing run control',"Error. Could not fetch run control file for job " + jobrealname + "(" + jobname + ").\n\nError message:\n" + ''.join(error))
842
843        # Otherwise inform the user and mark the job in the table
844        else:
845           mb = MessageBoxScroll()
846           lastline = result[len(result)-2].split()[2]
847           mb.setText("Simulated time for job " + jobrealname + " is currently: " + lastline)
848           mb.setDetailedText(''.join(result))
849           mb.exec_()
850
851    # Remove a job from list - removes the current row from the table and from
852    # save file
853    def RemoveFromList(self, row):
854        if ( row == -1 ):
855            row = self.table.currentRow()
856
857        # Read data from save file
858        job_to_delete = self.table.item(row,6).text()
859        self.table.removeRow(row)
860        file = open(palm_dir + '/.wd.olddata', 'r')
861        result = file.readlines()
862        result = filter(None, result)
863        file.close()
864        file = open(palm_dir + '/.wd.olddata', 'w')
865       
866        job_data_old = []
867       
868        if ( len(result) == 0 ):
869            notify = QtGui.QMessageBox.warning(self,'Read from .wd.olddata',"Error message:\n\nCould not read from file. I/O error.")
870        else: 
871            # Save data in array job_data_old
872            for j in range(0,len(result)):
873                job_data_old.append(j)
874                job_data_old[j] = result[j].split(" ")
875                job_data_old[j] = filter(None, job_data_old[j])
876                job_data_old[j] = [line.rstrip('\n') for line in job_data_old[j]]
877               
878                # Check if line j is the selected job, if not -> save to file
879                if ( job_data_old[j][6] != job_to_delete ):
880                    printstring = str(job_data_old[j][0]) + " " + \
881                                  str(job_data_old[j][1]) + " " + \
882                                  str(job_data_old[j][2]) + " " + \
883                                  str(job_data_old[j][3]) + " " + \
884                                  str(job_data_old[j][4]) + " " + \
885                                  str(job_data_old[j][5]) + " " + \
886                                  str(job_data_old[j][6]) + " " + \
887                                  str(job_data_old[j][7]) + "\n"
888                    file.write(printstring)
889           
890        file.close() 
891
892    # Remove all completed jobs from list
893    def ClearList(self):
894     
895       num_of_lines = self.table.rowCount()
896       
897       # Delete all lines with completed/canceled jobs from list. The counter
898       # must decrease as the line numbers would be messed up otherwise
899       for j in range(num_of_lines-1,-1,-1): 
900           state = self.table.item(j,3).text()
901           if ( state == "Completed" or state == "Canceled" or state == "Terminated"):
902              self.RemoveFromList(j)
903         
904    # Update the label
905    def UpdateLabel(self):
906        remaining_time = (update_frequency - self.timetimer.elapsed()) / 1000 / 60
907        self.label.setText("Next update in " + str(remaining_time) + " min")
908       
909
910    # Enter Options menu
911    def Options(self):
912 
913#       disable mainwindow 
914        self.setEnabled(False)
915     
916#       show Options Dialog     
917        opt = OptionBox()
918        opt.exec_()
919
920        self.UpdateHosts()
921        self.setEnabled(True)
922
923# Update settings
924    def UpdateHosts(self):
925
926       global update_frequency
927       global description
928       global hostname
929       global username
930       
931       description = []
932       hostname = []
933       username = []
934
935       for i in range(0,len(config.sections())):
936
937          description_tmp = config.sections()[i]
938 
939          if ( description_tmp != 'Settings' ):
940     
941             if ( config.get(description_tmp, 'enabled') == 'true' ):
942                description.append(description_tmp)
943                hostname.append(config.get(description_tmp, 'hostname'))
944                username.append(config.get(description_tmp, 'username')) 
945          else:
946             update_frequency = int(config.get(description_tmp, 'update_frequency'))*60000
947
948
949# Main loop       
950def main():
951   
952    app = QtGui.QApplication(sys.argv)
953    res = Watchdog() 
954    sys.exit(app.exec_())
955
956
957if __name__ == '__main__':
958    main()   
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.