Home


About us
PALM
PALM-4U
Installation
Release notes
Documentation
Getting Help
Gallery
Developers area

source: palm/trunk/SCRIPTS/.mrun.config.imuknb @ 1684

Last change on this file since 1684 was 1446, checked in by maronga, 10 years ago

removed blanks from <> strings in .mrun.config files / adapted hlrn_watchdog for HLRN-III
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 11.7 KB
RevLine 
[1434]1#$Id: .mrun.config.imuknb 1446 2014-08-07 10:08:56Z knoop $
[1433]2#column 1          column 2                                   column 3
3#name of variable  value of variable (~ must not be used)     scope
4#----------------------------------------------------------------------------
5%mainprog          palm.f90
6%base_directory    $HOME/palm/current_version
7%base_data         ~/palm/current_version/JOBS
8%source_path       $base_directory/trunk/SOURCE
9%add_source_path   $base_directory/USER_CODE/$fname
10%depository_path   $base_directory/MAKE_DEPOSITORY
11%use_makefile      true
12#
13# Enter your own host below by adding another line containing in the second
14# column your hostname (as provided by the unix command "hostname") and in the
15# third column the host identifier. Depending on your operating system, the
16# first characters of the host identifier should be "lc" (Linux cluster), "ibm"
17# (IBM-AIX), or "nec" (NEC-SX), respectively.
18#
19# The next line is just an example. Add your own line below or replace this line.
[1446]20%host_identifier   <replace_with_your_hostname>  lcmuknb
[1433]21#
22#
23# The next block contains all informations for compiling the PALM code
24# and for generating and running the PALM executable using MPI.
25# Compilernames, cpp-options and compiler-options are assuming
26# an Intel-Compiler and mpich2 on this host! Please change
27# appropriately, if you are using a different compiler / MPI-Version.
28#
29%remote_username   palm                                          lcmuknb parallel
30%tmp_user_catalog  /home/palm/tmp                                lcmuknb parallel
31%compiler_name     mpif90                                        lcmuknb parallel
32%compiler_name_ser ifort                                         lcmuknb parallel
33%cpp_options       -cpp:-D__mpi2:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__intel_compiler   lcmuknb parallel
34%netcdf_inc        -I:/opt/netcdf-3.6.3/include                  lcmuknb parallel
35%netcdf_lib        -L/opt/netcdf-3.6.3/lib64:-lnetcdf            lcmuknb parallel
36%mopts             -j:4                                          lcmuknb parallel
[1440]37%fopts             -fpe0:-O3:-xHost:-fp-model:source:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-diag-disable:8290,8291:-I:/opt/mpich2-1.5/include   lcmuknb parallel
38%lopts             -fpe0:-O3:-xHost:-fp-model:source:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-diag-disable:8290,8291:-L:/opt/mpich2-1.5/lib64     lcmuknb parallel
[1433]39#
40#
41%remote_username   palm                                          lcmuknb parallel trace
42%tmp_user_catalog  /home/palm/tmp                                lcmuknb parallel trace
43%compiler_name     mpif90                                        lcmuknb parallel trace
44%compiler_name_ser ifort                                         lcmuknb parallel trace
45%cpp_options       -cpp:-DMPI_REAL=MPI_DOUBLE_PRECISION:-DMPI_2REAL=MPI_2DOUBLE_PRECISION:-D__netcdf:-D__intel_compiler   lcmuknb parallel trace
46%netcdf_inc        -I:/opt/netcdf-3.6.3/include                  lcmuknb parallel trace
47%netcdf_lib        -L/opt/netcdf-3.6.3/lib64:-lnetcdf            lcmuknb parallel trace
48%mopts             -j:4                                          lcmuknb parallel trace
[1440]49%fopts             -C:-check:nooutput_conversion:-fpe0:-debug:-traceback:-g:-w:-O0:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs:-convert:little_endian  lcmuknb parallel trace
50%lopts             -C:-check:nooutput_conversion:-fpe0:-debug:-traceback:-g:-w:-O0:-ftz:-fno-alias:-no-prec-div:-no-prec-sqrt:-ip:-nbs                         lcmuknb parallel trace
[1433]51#
52#
53%write_binary                true                             restart
54#
55#----------------------------------------------------------------------------
56# INPUT-commands, executed before running PALM - lines must start with "IC:"
57#----------------------------------------------------------------------------
58#IC:
59#
60#----------------------------------------------------------------------------
61# ERROR-commands - executed when program terminates abnormally
62#----------------------------------------------------------------------------
63EC:[[ \$locat = execution ]]  &&  cat  RUN_CONTROL
64EC:pwd; ls -al
65#
66#----------------------------------------------------------------------------
67# OUTPUT-commands - executed when program terminates normally
68#----------------------------------------------------------------------------
69#
70# Combine 1D- and 3D-profile output (these files are not usable for plotting)
71OC:[[ -f LIST_PROFIL_1D     ]]  &&  cat  LIST_PROFIL_1D  >>  LIST_PROFILE
72OC:[[ -f LIST_PROFIL        ]]  &&  cat  LIST_PROFIL     >>  LIST_PROFILE
73#
74# Combine all particle information files
75OC:[[ -f PARTICLE_INFOS/_0000 ]]  &&  cat  PARTICLE_INFOS/* >> PARTICLE_INFO
76#
77#----------------------------------------------------------------------------
78# List of input-files
79#----------------------------------------------------------------------------
80PARIN                    in:job        d3#      $base_data/$fname/INPUT    _p3d
81PARIN                    in:job        d3f      $base_data/$fname/INPUT    _p3df
82TOPOGRAPHY_DATA          in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _topo
83NUDGING_DATA             in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _nudge
84LSF_DATA                 in:locopt     d3#:d3f  $base_data/$fname/INPUT    _lsf
85BININ                    in:loc:flpe   d3f      $base_data/$fname/RESTART  _d3d
86PARTICLE_RESTART_DATA_IN in:loc:flpe   prtf     $base_data/$fname/RESTART  _rprt
87DATA_1D_PR_NETCDF        in:locopt     prf      $base_data/$fname/OUTPUT   _pr     nc
88DATA_1D_SP_NETCDF        in:locopt     spf      $base_data/$fname/OUTPUT   _sp     nc
89DATA_1D_TS_NETCDF        in:locopt     tsf      $base_data/$fname/OUTPUT   _ts     nc
90DATA_1D_PTS_NETCDF       in:locopt     ptsf     $base_data/$fname/OUTPUT   _pts    nc
91DATA_2D_XY_NETCDF        in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy     nc
92DATA_2D_XY_AV_NETCDF     in:locopt     xyf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xy_av  nc
93DATA_2D_XZ_NETCDF        in:locopt     xzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _xz     nc
94DATA_2D_YZ_NETCDF        in:locopt     yzf      $base_data/$fname/OUTPUT   _yz     nc
95DATA_3D_NETCDF           in:locopt     3df      $base_data/$fname/OUTPUT   _3d     nc
96DATA_PRT_NETCDF          in:locopt:pe  prtf     $base_data/$fname/OUTPUT   _prt
97#
98#----------------------------------------------------------------------------
99# List of output-files
100#----------------------------------------------------------------------------
101BINOUT                    out:loc:flpe restart   $base_data/$fname/RESTART  _d3d
102PARTICLE_RESTART_DATA_OUT out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/RESTART  _rprt
103#
104RUN_CONTROL       out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
105RUN_CONTROL       out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _rc
106HEADER            out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _header
107HEADER            out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _header
108CPU_MEASURES      out:loc:tr   d3#     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
109CPU_MEASURES      out:loc:tra  d3f     $base_data/$fname/MONITORING  _cpu
110#
111DATA_1D_PR_NETCDF    out:loc:tr   pr#:prf   $base_data/$fname/OUTPUT  _pr     nc
112DATA_1D_SP_NETCDF    out:loc:tr   sp#:spf   $base_data/$fname/OUTPUT  _sp     nc
113DATA_1D_TS_NETCDF    out:loc:tr   ts#:tsf   $base_data/$fname/OUTPUT  _ts     nc
114DATA_1D_PTS_NETCDF   out:loc:tr   pts#:ptsf $base_data/$fname/OUTPUT  _pts    nc
115DATA_2D_XY_NETCDF    out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy     nc
116DATA_2D_XY_AV_NETCDF out:loc:tr   xy#:xyf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xy_av  nc
117DATA_2D_XZ_NETCDF    out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz     nc
118DATA_2D_XZ_AV_NETCDF out:loc:tr   xz#:xzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _xz_av  nc
119DATA_2D_YZ_NETCDF    out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz     nc
120DATA_2D_YZ_AV_NETCDF out:loc:tr   yz#:yzf   $base_data/$fname/OUTPUT  _yz_av  nc
121DATA_3D_NETCDF       out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d     nc
122DATA_3D_AV_NETCDF    out:loc:tr   3d#:3df   $base_data/$fname/OUTPUT  _3d_av  nc
123DATA_MASK_01_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01     nc
124DATA_MASK_01_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m01_av  nc
125DATA_MASK_02_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02     nc
126DATA_MASK_02_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m02_av  nc
127DATA_MASK_03_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03     nc
128DATA_MASK_03_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m03_av  nc
129DATA_MASK_04_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04     nc
130DATA_MASK_04_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m04_av  nc
131DATA_MASK_05_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05     nc
132DATA_MASK_05_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m05_av  nc
133DATA_MASK_06_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06     nc
134DATA_MASK_06_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m06_av  nc
135DATA_MASK_07_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07     nc
136DATA_MASK_07_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m07_av  nc
137DATA_MASK_08_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08     nc
138DATA_MASK_08_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m08_av  nc
139DATA_MASK_09_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09     nc
140DATA_MASK_09_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m09_av  nc
141DATA_MASK_10_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10     nc
142DATA_MASK_10_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m10_av  nc
143DATA_MASK_11_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11     nc
144DATA_MASK_11_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m11_av  nc
145DATA_MASK_12_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12     nc
146DATA_MASK_12_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m12_av  nc
147DATA_MASK_13_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13     nc
148DATA_MASK_13_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m13_av  nc
149DATA_MASK_14_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14     nc
150DATA_MASK_14_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m14_av  nc
151DATA_MASK_15_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15     nc
152DATA_MASK_15_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m15_av  nc
153DATA_MASK_16_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16     nc
154DATA_MASK_16_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m16_av  nc
155DATA_MASK_17_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17     nc
156DATA_MASK_17_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m17_av  nc
157DATA_MASK_18_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18     nc
158DATA_MASK_18_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m18_av  nc
159DATA_MASK_19_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19     nc
160DATA_MASK_19_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m19_av  nc
161DATA_MASK_20_NETCDF    out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20     nc
162DATA_MASK_20_AV_NETCDF out:loc:tr ma#:maf   $base_data/$fname/OUTPUT  _m20_av  nc
163DATA_PRT_NETCDF      out:loc:trpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT  _prt    nc
164DATA_DVR             out:loc:trpe dvr       $base_data/$fname/OUTPUT  _dvr
165#
166DVRP_LOG          out:loc:tr   dv#       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
167DVRP_LOG          out:loc:tra  dvf       $base_data/$fname/MONITORING  _dvrp_log
168PARTICLE_INFO     out:loc:tr   pt#       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
169PARTICLE_INFO     out:loc:tra  ptf       $base_data/$fname/MONITORING  _prt_info
170PARTICLE_DATA     out:loc:flpe prt#:prtf $base_data/$fname/OUTPUT      _prt_dat
171# A BLANK LINE MUST FOLLOW
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
  | Impressum | ©Leibniz Universität Hannover |