source: palm/tags/release-3.4a/SCRIPTS/mrun @ 2238

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prognostic_equations include the respective wall_*flux in the parameter list of
calls of diffusion_s. Same as before, only the values of wall_heatflux(0:4)
can be assigned. At present, wall_humidityflux, wall_qflux, wall_salinityflux,
wall_scalarflux are kept zero. diffusion_s uses the respective wall_*flux
instead of wall_heatflux. This update serves two purposes:

  • it avoids errors in calculations with humidity/scalar/salinity and prescribed

non-zero wall_heatflux,

  • it prepares PALM for a possible assignment of wall fluxes of

humidity/scalar/salinity in a future release.

Bugfix: assignment of fluxes at walls

Updates to documentation:
chapter_4.2.html#mode_dvrp
chapter_3.5.4.html#time_series

Default for mrun options -q and -n is "sla3" for lctit. Queues bes1 and bes2
removed. DOC/misc/Tsubame.html updated.

Modified default paths (/work/...) for lctit in .mrun.config.default

  • Property svn:keywords set to Rev
File size: 139.9 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# mrun - Plot-Shellskript
3# $Id: mrun 61 2007-03-12 05:42:06Z raasch $
4
5     # Prozedur zum Starten von Modellaeufen
6
7     # letzte Aenderung:
8     # 03/03/94 - Siggi - Entwicklungsbeginn
9     # 21/03/94 - Siggi - Entwicklungsabschluss (Version 1.0)
10     # 09/12/94 - Siggi - allexport unterbunden; statt dessen werden jetzt ein-
11     #                    zelne Variable exportiert. Dies ist noetig, weil an-
12     #                    sonsten irgendein Speicher ueberlaeuft und von mrun
13     #                    aufgerufene Programme (z.B. stageout) mit Fehlern
14     #                    abbrechen (too many arguments)
15     # 20/06/95 - Siggi - noclobber muss explizit abgeschaltet, da jetzt
16     #                    defaultmaessig im RRZN-Profile eingeschaltet
17     # 10/06/97 - Siggi - Zusaetzliche Option -C bei cpp, damit // nicht
18     #                    wegfallen
19     # 25/04/00 - Siggi - Version 1.5
20     #                    remote_addres und remote_user in return_addres bzw.
21     #                    return_username umbenannt, return_username wird dem
22     #                    mrun-Aufruf im Job ueber Option -U mitgegeben.
23     #                    Neue Variable remote_username, die beim interaktiven
24     #                    mrun-Aufruf zwingend ueber die neue Option -u oder
25     #                    in der Konfigurationsdatei angegeben werden muss.
26     # 08/02/01 - Siggi - Alle mrun-Meldungen ins englische uebersetzt,
27     #                    Version 1.7
28     # 05/05/02 - Siggi - Uebersetzungen mittels make-Mechanismus moeglich
29     # 21/11/02 - Siggi - ENV-Variable XLFRTEOPTS wird vor Ausfuehrung auf
30     #                    IBM gesetzt, um Record-Laenge der NAMELIST-Dateien,
31     #                    zu bestimmen; Praeprozessoroptionen haben nun alle
32     #                    die Form -Dtext=text, weil auf IBM sonst text durch
33     #                    die leere Zeichenkette ersetzt wird
34     # 01/08/03 - Siggi  - Test of implementing dvrp+1PE on ibm
35     # 07/01/04 - Siggi  - additional preprocessor directive for ibm included
36     #                     (-D$OMP=OMP) in order to avoid problems with
37     #                     OMP_NUM_THREADS
38     # 04/01/05 - Siggi  - archiving on hanni and berni is done in separate
39     #                     tar files, one for each node used
40     # 07/01/04 - Siggi  - old code for t3e, vpp and hpcs eliminated
41     # 09/01/05 - Siggi  - workaround for getting the IP address on gfdl3
42     # 17/01/05 - Siggi  - job for data transfer to local machine now within
43     #                     job class c1 (HLRN)
44     # 27/01/05 - Siggi  - IP address workaround for gfdl3 removed
45     # 28/01/05 - Siggi  - tar-filenames on $PERM (HLRN) now include the
46     #                     base filename and cycle number
47     # 16/02/05 - Gerald - hababai validated
48     # 14/03/05 - Siggi  - abort on NEC after first runtime error (F_ERRCNT)
49     # 29/03/05 - Marcus - berni*-en0 validated
50     # 21/04/05 - Siggi  - transfer-job-protocol for avs-data is no more stored
51     # 24/04/05 - Siggi  - netcdf support on lcmuk
52     # 25/04/05 - Siggi  - netcdf support on gfld3 (decalpha)
53     # 11/05/05 - Siggi  - files with non-numeric extensions (.xxx after cycle
54     #                     number) can now be used within interactive runs
55     # 12/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibm
56     # 13/05/05 - Siggi  - error in tar-filenames on $PERM (HLRN) removed
57     # 18/05/05 - Siggi  - netcdf support on nec
58     # 24/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibms
59     # 14/06/05 - Siggi  - sleep interval after submit of restart job increased
60     #                     to 30 seconds
61     # 28/06/05 - Siggi  - bora adjusted to new intel compiler (LD_LIBRARY_
62     #                     PATH is temporarily set)
63     # 07/09/05 - Siggi  - setting of MP_EAGER_LIMIT switched off because it
64     #                     caused warnings in the job protocol
65     # 20/10/05 - Siggi  - update of netcdf-version on decalpha (gfdl3)
66     # 25/10/05 - Siggi  - error in listing files for getting the cycle number
67     #                     removed
68     # 26/10/05 - Siggi  - new paths for dvrp-library, transfer of catalogs
69     #                     realized by file attribute trpe
70     # 28/10/05 - Siggi  - if existing, the file extension is output in case
71     #                     of missing input file - no job abort in case of
72     #                     missing input files with file extensions
73     #                     (preliminary solution)
74     # 31/10/05 - Siggi  - data transfer from nech now within seperate job
75     # 04/11/05 - Siggi  - netcdf 3.6.0-p1 on ibmh/ibmb
76     # 07/12/05 - Siggi  - gallego and elephanta admitted
77     # 30/12/05 - Siggi  - gfdl5 (ibmy) admitted
78     # 10/01/06 - Siggi  - cpp directive for NetCDF 64bit support
79     # 20/01/06 - Siggi  - cpp directive for ibmy
80     # 09/02/06 - Siggi  - ibmy admitted for batch mode
81     # 13/04/06 - Siggi  - ostria admitted
82     # 18/04/06 - Siggi  - usage of OpenMP implemented (additional option -O)
83     # 10/05/06 - Siggi  - environment variable XLSMPOPTS set on IBM for
84     #                     optimization of OpenMP runs (option stacksize is
85     #                     necessary for large gridpoint numbers because
86     #                     otherwise a segmentation fault occurs)
87     # 23/05/05 - Siggi  - lctit (SUN Fire X4600) admitted
88     # 21/08/06 - Siggi  - standard mrun path on scirocco is as on bora
89     # 23/08/06 - Siggi  - netcdf support for scirocco (notebook)
90     # 20/09/06 - Marcus - add DVRP library on nech
91     # 24/10/06 - Siggi  - Environment variables for PALM steering are written
92     #                     on local NAMELIST file ENVPAR
93     # 24/11/06 - Siggi  - levanto admitted, maestro switched to ifc 9.1
94     # 28/11/06 - Siggi  - call to interpret_config.x_levanto because of SuSe 10
95     # 06/02/07 - Siggi  - add DVRP library on lcmuk
96     # 07/02/07 - Siggi  - revision of source code handling, source code is
97     #                     now expected in directory given by source_path and
98     #                     not in the current working directory, source code
99     #                     files provided in add_source_path are allways
100     #                     compiled, source code to be compiled is allways
101     #                     sampled in SOURCES_FOR_RUN_$fname which is a
102     #                     subdirectory of the current working directory,
103     #                     -s TEST  changed to  -s WRITE_PERMIT  or -s WP,
104     #                     adapted for RIAM (neck)
105     #                     bugfix for cycle number of output file (extout)
106     #                     all hpmuk-related code removed
107     # 14/02/07 - Siggi  - dvrp support for neck added
108     # 28/02/07 - Siggi  - empty lines in configuration file are accepted
109     #                     mrun_path replaced by PALM_BIN,
110     #                     all machines are calling interpret_config.x
111     # 14/03/07 - Siggi  - fimm admitted, revision number added to terminal
112     #                     output
113     # 16/03/07 - Siggi  - adjustments for lctit
114     # 29/03/07 - Siggi  - global revision transfered to batch job by new
115     #                     option -G
116     # 30/03/07 - Siggi  - compilation "by hand" removed, cpp-directives/options
117     #                     + netcdf/dvrp-options are read from configuration
118     #                     file, host identifier (local_host) is read from
119     #                     config file, code related to ftp filetransfer
120     #                     removed (incl. option -f)
121     # 19/06/07 - Siggi  - time limit for cdata jobs increased
122     # 25/07/07 - Siggi  - two sets of executables can be started on lcmuk,
123     #                     if new option -Y (coupling) is given,
124     #                     output of executables to aout_output removed,
125     #                     messages are immediately written to stdout instead
126     # 03/08/07 - Marcus - add XOPT="-X $numprocs" for lcfimm
127     # 09/08/07 - Marcus - workaround on lcfimm to propagate environment
128     #                     variables out to the nodes in coupled mode -disabled-
129     # 13/08/07 - Marcus - start local restart jobs per ssh on lcfimm
130     # 28/08/07 - Marcus - completely remove workaround on lcfimm to propagate
131     #                     environment variables out to the nodes in coupled mode
132     # 15/10/07 - Siggi  - Preliminary adjustments for lctit, based on Jin's
133     #                     suggestions
134     # 19/10/07 - Marcus - further adjustments for lctit: add new optional
135     #                     argument -g group_number, admit all sla* node_usage
136     #                     queues
137     # 30/10/07 - Marcus - further adjustments for queues on lctit
138
139 
140    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
141
142 set +o allexport    # SICHERHEITSHALBER UNTERBINDEN, DA SONST EVTL. STAGEOUT
143                     # NICHT LAUEFT (TOO MANY ARGUMENTS - PROBLEM)
144 set +o noclobber    # EXISTIERENDE DATEIEN DUERFEN UEBERSCHRIEBEN WERDEN
145
146 AddFilenames=""
147 additional_conditions=""
148 add_source_path=""
149 afname=""
150 archive_save=true
151 archive_system=none
152 compiler_name=""
153 cond1=""
154 cond2="" 
155 config_file=.mrun.config
156 cpp_opts=""
157 cpp_options=""
158 cpumax=0
159 cpurest=0
160 delete_temporary_catalog=true
161 do_batch=false
162 do_compile=true
163 do_remote=false
164 do_stagein=true
165 do_stageout=true
166 do_trace=false
167 email_notification=""
168 exclude=""
169 executable=""
170 execution_error=false
171 fimm=false
172 fname=test
173 fromhost=""
174 global_revision=""
175 group_number=none
176 host=""
177 host_file=""
178 hp=""
179 ignore_archive_error=false
180 input_list=""
181 interpreted_config_file=""
182 job_on_file=""
183 keep_data_from_previous_run=false
184 localhost_realname=$(hostname)
185 local_compile=false
186 locat=normal
187 mainprog=""
188 makefile=""
189 mc=$0
190 while [[ $(echo $mc | grep -c "/") != 0 ]]
191 do
192    mc=`echo $mc | cut -f2- -d"/"`
193 done
194 module_files=""
195 mrun_script_name=$mc
196 netcdf_inc=""
197 netcdf_lib=""
198 netcdf_support=false
199 node_usage=default
200 numprocs=""
201 OOPT=""
202 openmp=false
203 output_list=""
204 package_list=""
205 punkte="..........................................................."
206 queue=none
207 read_from_config=""
208 restart_run=false
209 return_addres=$(nslookup `hostname` 2>&1 | grep "Address:" | tail -1 | awk '{print $2}')
210 if [[ $return_addres = 130.75.105.158 ]]
211 then
212    return_addres=172.20.25.41
213    echo "+++ WARNING: return_addres changed to $return_addres !!!!!"
214 fi
215# if [[ $return_addres = 210.117.65.1 ]]
216# if [[ $(nslookup `hostname` 2>&1 | grep -c 210.117.65.1) = 1 ]]
217# then
218#    [[ $localhost_realname = gfdl3.yonsei.ac.kr ]]  &&  return_addres=165.132.26.56
219# fi
220 return_password=""
221 return_username=$LOGNAME
222 remotecall=false
223 remote_username=""
224 run_coupled_model=false
225 run_mode=""
226 scirocco=false
227 store_on_archive_system=true
228 striche="  ----------------------------------------------------------------------------"
229 silent=false
230 source_list=""
231 source_path=SOURCE
232 tasks_per_node=""
233 threads_per_task=1
234 tmpcreate=false
235 tmp_data_catalog=""
236 transfer_problems=false
237 usern=$LOGNAME
238 working_directory=`pwd`
239 TOPT=""
240 XOPT=""
241 zeit=$( date | cut -c 12-19 )
242
243 typeset -i  iec=0 iic=0 iin=0 ioc=0 iout=0 memory=0 stagein_anz=0 stageout_anz=0
244 typeset -i  cputime i ii iii icycle inode ival jobges jobsek maxcycle minuten nodes pes sekunden tp1
245
246 typeset  -R30 calltime
247 typeset  -L20 spalte1
248 typeset  -L40 spalte2
249 typeset  -L60 spalte3
250 typeset  -L35 string1=`date`
251 typeset  -L12 string2=$usern
252 typeset  -L12 string3=$localhost_realname
253 typeset  -L12 string4
254 typeset  -L12 string5
255 typeset  -L30 version="MRUN  2.0 Rev$Rev: 129 $"
256
257
258
259    # EINZELNE VARIABLE FUER HAUPTPROGRAMM EXPORTIEREN
260 export  cpurest fname host localhost return_addres return_username remotecall tasks_per_node
261
262    # FOLGENDE VARIABLEN MUESSEN FUER DIE INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI
263    # EXPORTIERT WERDEN
264 export  afname config_file cpp_opts cpumax do_batch do_trace fname fromhost
265 export  group_number input_list memory numprocs output_list queue run_mode
266
267
268 
269    # FEHLERBEHANDLUNG
270    # BEI EXIT:
271 trap 'rm -rf  $working_directory/tmp_mrun
272       if [[ $locat != localhost ]]
273       then
274#          if [[ ! -f ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik ]]
275#          then
276#             cat  >  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik  <<  %STATEND%
277#MRUN-calls on $localhost
278#
279#date and time                      user        localhost   remotehost  termination mrun-command
280#--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
281#%STATEND%
282#             chmod  666  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
283#          fi
284#
285#             # EINTRAG IN DIE STATISTIK-DATEI
286#          string4=$host
287#          string5=$locat
288#          if [[ "$job_on_file" = ""  &&  $locat != control_c  &&  $locat != user_abort ]]
289#          then
290#             if [[ $do_batch = true ]]
291#             then
292#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mrun_com \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
293#             else
294#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mc \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
295#             fi
296#          fi
297          echo " " > /dev/null
298       fi
299
300       if [[ $locat != normal  &&  $locat != control_c  &&  $locat != local_compile ]]
301       then
302
303              # EVENTUELLE ERROR-KOMMANDOS ABARBEITEN
304          (( i = 0 ))
305          while (( i < iec ))
306          do
307             (( i = i + 1 ))
308             printf "\n  *** Execution of ERROR-command:\n"
309             printf "  >>> ${err_command[$i]}\n"
310             eval  ${err_command[$i]}
311          done
312          if [[ -n $interpreted_config_file ]]  then
313             rm -rf  $interpreted_config_file
314          fi
315          if [[ -n .mrun_environment ]]  then
316             rm -rf  .mrun_environment
317          fi
318          if [[ $tmpcreate = true ]]
319          then
320             printf "\n  *** Contents of \"$TEMPDIR\":\n"
321             ls -al; cd
322             [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
323          fi
324          if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
325          then
326             rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
327          fi
328          printf "\n\n+++ MRUN killed \n\n"
329       elif [[ $locat != control_c ]]
330       then
331          printf "\n\n --> all actions finished\n\n"
332          printf "     Bye, bye $usern !!\n\n"
333       fi' exit
334
335
336    # BEI TERMINAL-BREAK:
337 trap 'rm -rf  $working_directory/tmp_mrun
338       [[ $tmpcreate = true ]]  &&  (cd; rm -rf $TEMPDIR)
339       if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
340       then
341          rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
342       fi
343       printf "\n+++ MRUN killed by \"^C\" \n\n"
344       locat=control_c
345       exit
346      ' 2
347
348
349    # CHECK IF THE PATH FOR THE PALM BINARIES (SCRIPTS+UTILITY-PROGRAMS) HAS
350    # BEEN SET
351 if [[ "$PALM_BIN" = "" ]]
352 then
353    printf "\n  +++ environment variable PALM_BIN has not been set"
354    printf "\n      please set it to the directory where the PALM scripts are located"
355    locat=palm_bin; exit
356 fi
357
358
359
360    # SHELLSCRIPT-OPTIONEN EINLESEN UND KOMMANDO NEU ZUSAMMENSETZEN, FALLS ES
361    # FUER FOLGEJOBS BENOETIGT WIRD
362 while  getopts  :a:AbBc:Cd:D:Fg:G:h:H:i:IkK:m:M:n:o:Op:P:q:r:R:s:St:T:u:U:vxX:Y option
363 do
364   case  $option  in
365       (a)   afname=$OPTARG;;
366       (A)   store_on_archive_system=false; mc="$mc -A";;
367       (b)   do_batch=true; mc="$mc -b";;
368       (B)   delete_temporary_catalog=false; mc="$mc -B";;
369       (c)   config_file=$OPTARG; mc="$mc -c$OPTARG";;
370       (C)   restart_run=true; mc="$mc -C";;
371       (d)   fname=$OPTARG; mc="$mc -d$OPTARG";;
372       (D)   cpp_opts="$cpp_opts $OPTARG"; mc="$mc -D$OPTARG";;
373       (F)   job_on_file="-D"; mc="$mc -F";;
374       (g)   group_number=$OPTARG; mc="$mc -g$OPTARG";;
375       (G)   global_revision=$OPTARG; mc="$mc -G'$OPTARG'";;
376       (h)   host=$OPTARG; mc="$mc -h$OPTARG";;
377       (H)   fromhost=$OPTARG; mc="$mc -H$OPTARG";;
378       (i)   input_list=$OPTARG; mc="$mc -i'$OPTARG'";;
379       (I)   ignore_archive_error=true; mc="$mc -I";;
380       (k)   keep_data_from_previous_run=true; mc="$mc -k";;
381       (K)   additional_conditions="$OPTARG"; mc="$mc -K$OPTARG";;
382       (m)   memory=$OPTARG; mc="$mc -m$OPTARG";;
383       (M)   makefile=$OPTARG; mc="$mc -M$OPTARG";;
384       (n)   node_usage=$OPTARG; mc="$mc -n$OPTARG";; 
385       (o)   output_list=$OPTARG; mc="$mc -o'$OPTARG'";;
386       (O)   use_openmp=true; mc="$mc -O";;
387       (p)   package_list=$OPTARG; mc="$mc -p'$OPTARG'";;
388       (P)   return_password=$OPTARG; mc="$mc -P$OPTARG";;
389       (q)   queue=$OPTARG; mc="$mc -q$OPTARG";;
390       (r)   run_mode=$OPTARG; mc="$mc -r'$OPTARG'";;
391       (R)   remotecall=true;return_addres=$OPTARG; mc="$mc -R$OPTARG";;
392       (s)   source_list=$OPTARG; mc="$mc -s'$OPTARG'";;
393       (S)   read_from_config=false; mc="$mc -S";;
394       (t)   cpumax=$OPTARG; mc="$mc -t$OPTARG";;
395       (T)   tasks_per_node=$OPTARG; mc="$mc -T$OPTARG";;
396       (u)   remote_username=$OPTARG; mc="$mc -u$OPTARG";;
397       (U)   return_username=$OPTARG; mc="$mc -U$OPTARG";;
398       (v)   silent=true; mc="$mc -v";;
399       (x)   do_trace=true;set -x; mc="$mc -x";;
400       (X)   numprocs=$OPTARG; mc="$mc -X$OPTARG";;
401       (Y)   run_coupled_model=true; mc="$mc -Y";;
402       (\?)  printf "\n  +++ unknown option $OPTARG \n"
403             printf "\n  --> type \"$0 ?\" for available options \n"
404             locat=parameter;exit;;
405   esac
406 done
407
408
409    # EVTL. POSITIONSPARAMETER EINLESEN
410    # ZUR ZEIT GIBT ES NUR DEN PARAMETER ? (=KURZINFO)
411 shift OPTIND-1
412
413
414    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
415 if [[ "$1" = "?" ]]
416 then
417   (printf "\n  *** mrun can be called as follows:\n"
418    printf "\n      $mrun_script_name  -b -c.. -d.. -D.. -f.. -F -h.. -i.. -I -K.. -m.. -o.. -p.. -r.. -R -s.. -t.. -T.. -v -x -X..  <modus>\n"
419    printf "\n      Description of available options:\n"
420    printf "\n      Option  Description                              Default-Value"
421    printf "\n        -a    base name of input files                 equiv. -d"
422    printf "\n        -A    no archiving when using file-attribute fl"
423    printf "\n        -b    batch-job on local machine               ---"
424    printf "\n        -B    do not delete temporary directory at end ---"
425    printf "\n        -c    configuration file                       .mrun.config"
426    printf "\n        -d    base name of files attached to program   test"
427    printf "\n        -D    preprocessor(cpp)-directives             \"\" "
428    printf "\n        -F    create remote job file only              ---"
429    printf "\n        -h    execution host                           $localhost_realname"
430    printf "\n        -i    INPUT control list                       \"\" "
431    printf "\n        -I    archiving errors of previous batch-jobs"
432    printf "\n              will be ignored"
433    printf "\n        -k    keep data from previous run"
434    printf "\n        -K    additional conditions for controling"
435    printf "\n              usage of conditional code and"
436    printf "\n              env-variables in configuration file      \"\" "
437    printf "\n        -m    memory demand in MB (batch-jobs)         0 MB"
438    printf "\n        -M    Makefile name                            Makefile"
439    printf "\n        -n    node usage (shared/not_shared)           depending on -h"
440    printf "\n        -o    OUTPUT control list                      \"\" "
441    printf "\n        -O    use OpenMP                               ---"
442    printf "\n        -p    software package list                    \"\" "
443    printf "\n        -q    queue                                    \"$queue\" "
444    printf "\n        -r    run control list (combines -i -o)        \"\" "
445    printf "\n        -s    filenames of routines to be compiled     \"\" "
446    printf "\n              must end with .f, .f90, .F, or .c !"
447    printf "\n              use \"..\" for more than one file and wildcards"
448    printf "\n              -s TEST compiles all files with w-permit"
449    printf "\n        -S    config file interpreted by shellscript   ---"
450    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds (batch)      0"
451    printf "\n        -T    tasks per node                           depending on -h"
452    printf "\n        -u    username on remote machine               \"\" "
453    printf "\n        -v    no prompt for confirmation               ---"
454    printf "\n        -x    tracing of mrun for debug purposes       ---"
455    printf "\n        -X    # of processors (on parallel machines)   1"
456    printf "\n        -Y    run coupled model                        ---"
457    printf "\n "
458    printf "\n      Possible values of positional parameter <modus>:"
459    printf "\n        \"?\"       -  this outline \n\n") | more
460    exit
461 elif [[ "$1" != "" ]]
462 then
463    printf "\n  +++ positional parameter $1 unknown \n"
464    locat=parameter; exit
465 fi
466
467
468
469    # KURZE STARTMELDUNG
470 printf "\n*** $version "
471 printf "\n    will be executed.     Please wait ..."
472
473
474
475    # PRUEFEN, OB KONFIGURATIONS-DATEI VORHANDEN
476 if [[ ! -f $config_file ]]
477 then
478    printf "\n\n  +++ configuration file: "
479    printf "\n           $config_file"
480    printf "\n      does not exist"
481    locat=connect; exit 
482 fi
483
484
485    # HOST-IDENTIFIER (local_host) AUS KONFIGURATIONSDATEI BESTIMMEN
486 line=""
487 grep  "%host_identifier"  $config_file  >  tmp_mrun
488 while read line
489 do
490    if [[ "$line" != ""  ||  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
491    then
492       HOSTNAME=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
493       host_identifier=`echo $line | cut -d" " -s -f3`
494       if [[ $localhost_realname = $HOSTNAME ]]
495       then
496          localhost=$host_identifier
497          break
498       fi
499    fi
500 done < tmp_mrun
501
502 if [[ "$localhost" = "" ]]
503 then
504    printf "\n\n  +++ no host identifier found in configuration file \"$config_file\""
505    printf "\n      for local host \"$localhost_realname\"."
506    printf "\n      Please add line"
507    printf "\n      \"\%host_identifier $localhost_realname <identifier>\""
508    printf "\n      to the configuration file."
509    locat=localhost; exit
510 fi
511
512
513
514    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN SETZEN
515 case  $localhost_realname  in
516     (breg*-en0|berni*-en0)  archive_system=tivoli;;
517     (cs*)                   archive_system=ut;;
518     (fimm.bccs.uib.no)      fimm=true;;
519     (gate|n-sx)             PATH=$PALM_BIN:$PATH:/usr/bin/nqsII;;
520     (hreg*-en0|hanni*-en0)  archive_system=tivoli;;
521     (scirocco)              scirocco=true;;
522 esac
523
524
525 
526    # BASISNAME DER INPUT-DATEIEN GLEICH ALLGEMEINEM BASISNAMEN SETZEN,
527    # WENN NICHT VOM BENUTZER ANDERS BESTIMMT
528 [[ "$afname" = "" ]]  &&  afname=$fname
529
530
531    # EVTL. RUN-MODUS DEN I/O-LISTEN HINZUFUEGEN
532 if [[ "$run_mode" != "" ]]
533 then
534    input_list="$input_list $run_mode"
535    output_list="$output_list $run_mode"
536 fi
537
538
539    # RECHNERNAMEN ABSPEICHERN, VON DEM AUS JOB GESTARTET WIRD,
540    # ALLERDINGS NUR DANN, WENN NICHT PER OPTION -H BEREITS EIN WERT
541    # ZUGEWIESEN WURDE (MRUN MACHT DIES IMMER, WENN ES SELBST BATCH-JOBS
542    # STARTET)
543 if [[ "$fromhost" = "" ]]
544 then
545    fromhost=$localhost
546 fi
547
548
549     # PRUEFEN, OB MRUN NUR TESTWEISE AUF DER LOKALEN MASCHINE KOMPILIEREN SOLL
550 if [[ "$source_list" = LOCAL_COMPILE_TEST ]]
551 then
552    source_list=TEST
553    local_compile=true
554    host=$localhost
555 fi
556   
557
558    # PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
559    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
560    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
561    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
562 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
563 then
564    do_batch=true
565    do_remote=true
566    case  $host  in
567        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|nech|neck|lctit|unics)  true;;
568        (*)  printf "\n"
569             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
570             printf "\n      is not available"
571             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
572    esac
573 else
574    host=$localhost
575 fi
576
577
578     # ZUSATZBEDINGUNGEN (OPTION -K) AUSWERTEN
579 if [[ -n $additional_conditions ]]
580 then
581#    echo $additional_conditions | cut -d" " -f1-3 | read  cond1  cond2  dummy
582    cond1=`echo $additional_conditions | cut -d" " -f1`
583    cond2=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f2`
584    dummy=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f3`
585    if [[ -n $dummy ]]
586    then
587       printf "\n  +++ more than 2 additional conditions given for Option \"-K\""
588       locat=options; exit
589    fi
590 fi
591
592
593    # PRUEFEN, OB EVTL. BEI VORHERGEHENDEM LAUF (KETTENJOB) EINE
594    # ARCHIVIERUNG FEHLGESCHLAGEN IST
595 if [[ -f ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname ]]
596 then
597    if [[ $ignore_archive_error = false ]]
598    then
599       printf "\n  +++ data archiving of previous run failed"
600       printf "\n      see directory \~/job_queue on remote machine"
601       locat=archive; exit
602    else
603       printf "\n  +++ warning: data archiving in a previous run failed"
604       printf "\n      MRUN continues, trying to get backup copy"
605    fi
606 fi
607
608
609
610    # LESEN UND INTERPRETIEREN DER KONFIGURATIONS-DATEI VOM SHELLSCRIPT AUS
611    # VORUEBERGEHEND ZWINGEND AUF LINUX-RECHNERN
612 if [[ "$read_from_config" = false ]]
613 then
614
615    [[ $silent = false ]]  &&  printf "\n    Reading the configuration file... "
616    while  read zeile
617    do
618        [[ $silent = false ]]  &&  printf "."
619
620
621          # ZUERST EVENTUELL VORKOMMENDE ENVIRONMENT-VARIABLEN DURCH IHRE WERTE
622          # ERSETZEN
623       eval  zeile=\"$zeile\"
624
625
626          # INTERPRETATION DER ZEILE
627       if [[ "$(echo $zeile)" = "" ]]
628       then
629             # LEERZEILE, KEINE AKTION
630          continue
631
632       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "#" ]]
633       then
634
635             # ZEILE IST KOMMENTARZEILE
636          true
637
638       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "%" ]]
639       then
640
641             # ZEILE DEFINIERT ENVIRONMENT-VARIABLE
642          zeile=$(echo $zeile | cut -c2-)
643#          echo $zeile | cut -d" " -f1-5 | read  var  value  for_host  for_cond1  for_cond2
644          var=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
645          value=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
646          for_host=`echo $zeile | cut -d" " -s -f3`
647          for_cond1=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
648          for_cond2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
649
650          if [[ "$for_host" = ""  ||  ( "$for_host" = $host  &&  "$for_cond1" = "$cond1"  &&  "$for_cond2" = "$cond2" )  ||  $(echo "$input_list$output_list"|grep -c "$for_host") != 0 ]]
651          then
652
653                # BEI COMPILER- CPP- ODER LINKEROPTIONEN EVTL ":" DURCH " "
654                # ERSETZEN. "::" WIRD DURCH ":" ERSETZT.
655             value=`echo $value | sed 's/::/%DUM%/g' | sed 's/:/ /g' | sed 's/%DUM%/:/g'`
656
657
658                # ENVIRONMENT-VARIABLE WIRD WERT AUS KONFIGURATIONSDATEI
659                # ZUGEWIESEN, WENN SIE SELBST NOCH KEINEN WERT UEBER DIE
660                # ENTSPRECHENDE SCRIPT-OPTION ERHALTEN HAT. SOLCHE
661                # VARIABLEN HAETTEN DANN DEN WERT "" ODER IM INTEGER-FALL DEN
662                # WERT 0.  ALLGEMEINE REGEL ALSO: SCRIPT-OPTION GEHT UEBER
663                # KONFIGURATIONSDATEI
664             if [[ "$(eval echo \$$var)" = ""  ||  "$(eval echo \$$var)" = "0" ]]
665             then
666                eval  $var=\$value
667
668                   # EVTL. BILDSCHIRMAUSGABEN DER ENVIRONMENT-VARIABLEN
669                if [[ $do_trace = true ]]
670                then
671                   printf "\n*** ENVIRONMENT-VARIABLE $var = $value"
672                fi
673             fi
674
675                # WENN ENVIRONMENT-VARIABLE HOST VEREINBART, DANN SOFORT AUSWERTEN
676                # WERT VON do-remote WIRD BEI DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT
677                # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
678                # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
679             if [[ $var = host ]]
680             then
681                if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
682                then
683                   do_batch=true
684                   do_remote=true
685                   case  $host  in
686                       (ibm|ibms|ibmy|lctit|nech|neck|unics)  true;;
687                       (*)  printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
688                            printf "\n      is not available"
689                            locat=nqs; exit;;
690                   esac
691                else
692                   host=$localhost
693                fi
694             fi
695
696                # VOM BENUTZER DEFINIERTE ENVIRONMENT VARIABLEN MUESSEN PRINZIPIELL
697                # EXPORTIERT WERDEN, DA SIE VIELLEICHT IN WEITER UNTEN AUFZURUFEN-
698                # DEN PROGRAMMEN BENOETIGT WERDEN
699             export  $var
700          fi
701
702
703
704
705       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "EC:" ]]
706       then
707
708             # ZEILE DEFINIERT ERROR-KOMMANDO
709          (( iec = iec + 1 ))
710          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
711          err_command[$iec]="$zeile"
712
713       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "IC:" ]]
714       then
715
716             # ZEILE DEFINIERT INPUT-KOMMANDO
717          (( iic = iic + 1 ))
718          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
719          in_command[$iic]="$zeile"
720
721       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "OC:" ]]
722       then
723
724             # ZEILE DEFINIERT OUTPUT-KOMMANDO
725          (( ioc = ioc + 1 ))
726          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
727          out_command[$ioc]="$zeile"
728
729       else
730
731             # ZEILE DEFINIERT DATEIVERBINDUNG. EINLESEN DER DATEIEIGENSCHAFTEN
732             # s2a: in/out - Feld
733             # s2b: loc    - Feld (optional)
734             # s2c: tr/ar  - Feld (optional)
735#          echo $zeile | cut -d" " -f1-2 | read  s1  s2
736          s1=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
737          s2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
738          s2a=$(echo $s2 | cut -d":" -f1)
739          if [[ $(echo $s2 | grep -c ":") = 0 ]]
740          then
741             s2b=""
742             s2c=""
743          else
744#             echo $s2 | cut -d":" -f2-3 | sed 's/:/ /g' | read  s2b  s2c
745             s2b=`echo $s2 | cut -d":" -f2 | sed 's/:/ /g'`
746             s2c=`echo $s2 | cut -d":" -s -f3 | sed 's/:/ /g'`
747          fi
748#          echo $zeile | cut -d" " -f3-6 | read  s3  s4  s5  s6
749          s3=`echo $zeile | cut -d" " -f3`
750          s4=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
751          s5=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
752          s6=`echo $zeile | cut -d" " -s -f6`
753
754       
755             # ABSPEICHERN DER DATEIVERBINDUNG, FALLS IN INPUT- ODER OUTPUT-LIST
756             # VERMERKT. VARIABLE S3 KANN AUCH LISTE ENTHALTEN (FELDTRENNER ":")
757             # DATEIVERBINDUNG WIRD DANN NICHT ABGESPEICHERT UND GEPRUEFT, WENN
758             # PROGRAMMLAUF AUF REMOTE-MASCHINE ERFOLGT UND DATEI NUR LOKAL VOR-
759             # HANDEN SEIN MUSS (D.H. s2b = loc)
760          IFSALT="$IFS"; IFS="$IFS:"
761          if [[ "$s2a" = in  &&  ! ( $do_remote = true  &&  ( "$s2b" = loc  ||  "$s2b" = locopt ) ) ]]
762          then
763             found=false
764             for  actual  in  $input_list
765             do
766                for  formal  in  $s3
767                do
768                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-" ]]  &&  found=true
769                done
770             done
771             if [[ $found = true ]]
772             then
773                (( iin = iin + 1 ))
774                localin[$iin]=$s1; transin[$iin]=$s2b; actionin[$iin]=$s2c;
775                typein[$iin]=$s3; pathin[$iin]=$s4; endin[$iin]=$s5;
776                extin[$iin]=$s6
777             fi
778          elif [[ "$s2a" = out  &&  ! ( $do_remote = true  &&  "$s2b" = loc ) ]]
779          then
780             found=false
781             for  actual  in  $output_list
782             do
783                for  formal  in  $s3 
784                do
785                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-"  ]]  &&  found=true
786                done
787             done
788             if [[ $found = true ]]
789             then
790                (( iout = iout + 1 ))
791                localout[$iout]=$s1; actionout[$iout]=$s2c; typeout[$iout]=$s3;
792                pathout[$iout]=$s4; endout[$iout]=$s5; extout[$iout]=$s6
793             fi
794          elif [[ "$s2a" != in  &&  "$s2a" != out ]]
795          then
796             printf "\n  +++ I/O-attribute in configuration file $config_file has the invalid"
797             printf "\n      value \"$s2\". Only \"in\" and \"out\" are allowed!"
798             locat=connect; exit
799          fi
800          IFS="$IFSALT"
801       fi
802    done < $config_file
803
804 else
805
806
807       # INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI MITTELS FORTRAN 90 - PROGRAMM
808    [[ $silent = false ]]  &&  printf "..."
809    export  cond1 cond2 config_file do_remote do_trace input_list localhost output_list
810    export  interpreted_config_file=.icf.$RANDOM
811
812
813
814       # ENVIRONMENT-VARIABLEN FUER INTERPRET_CONFIG UEBER NAMELIST_DATEI ZUR
815       # VERFUEGUNG STELLEN
816    cat  >  .mrun_environment  <<  %%END%%
817 &mrun_environment  cond1 = '$cond1', cond2 = '$cond2',
818                    config_file = '$config_file', do_remote = '$do_remote',
819                    do_trace = '$do_trace', host = '$host',
820                    input_list = '$input_list', icf = '$interpreted_config_file',
821                    localhost = '$localhost', output_list = '$output_list' /
822
823%%END%%
824
825       # WERTE VON MRUN-OPTIONEN SICHERN UND DAMIT GEGEBENENFALLS SPAETER DIE
826       # IN DER KONFIGURAIONSDATEI ANGEGEBENEN WERTE UEBERSTEUERN
827    mrun_memory=$memory
828    mrun_group_number=$group_number
829    mrun_cpumax=$cpumax
830    mrun_numprocs=$numprocs
831
832    if [[ $localhost_realname = "gate" ]]
833    then
834       interpret_config_gate.x
835    else
836       interpret_config.x
837    fi
838    rm .mrun_environment
839
840
841       # AUSFUEHRUNG DER GENERIERTEN SHELL-KOMMANDOS IN DIESER SHELL
842    chmod  u+x  $interpreted_config_file
843    export PATH=$PATH:.
844    . $interpreted_config_file
845    rm  $interpreted_config_file
846
847
848       # OPTIONSWERTE UEBERSTEUERN KONFIGURATIONSDATEI
849    [[ $mrun_memory     != 0  ]]  &&  memory=$mrun_memory
850    [[ "$mrun_group_number" != "none" ]]  &&  group_number=$mrun_group_number
851    [[ $mrun_cpumax     != 0  ]]  &&  cpumax=$mrun_cpumax
852    [[ "$mrun_numprocs" != "" ]]  &&  numprocs=$mrun_numprocs
853
854 fi
855
856
857    # QUELLTEXTVERZEICHNIS AUF LOKALER MASCHINE AUS KONFIGURATIONSDATEI
858    # BESTIMMEN (WUERDE SONST EVTL. DAS VERZEICHNIS DES JEWEILS UNTER -h
859    # ANGEGEBENEN REMOTE-RECHNERS SEIN)
860    # BEI BATCH-JOBS SIND DIE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE SCHON KOMPLETT
861 if [[ "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
862 then
863
864       # ZUERST PRUEFEN, OB EIN GLOBALER QUELLTEXTPFAD FUER ALLE RECHNER
865       # VEREINBART WURDE
866    source_path=""
867    line=""
868    grep "%source_path" $config_file  >  tmp_mrun
869    while read line
870    do
871       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
872       then
873          if [[ "$(echo $line | cut -d" " -f3)" = "" ]]
874          then
875             global_source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
876          fi
877       fi
878    done  <  tmp_mrun
879
880    line=""
881    found=false
882    grep  " $localhost" $config_file | grep "%source_path"  >  tmp_mrun
883    while read line
884    do
885       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
886       then
887          if [[ $found = true ]]
888          then
889             printf "\n\n  +++ more than one source path found in configuration file"
890             printf "\n      for local host \"$localhost\" "
891             locat=source_path; exit
892          fi
893          source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
894          found=true
895       fi
896    done  <  tmp_mrun
897    rm  tmp_mrun
898
899    if [[ "$source_path" = "" ]]
900    then
901       if [[ "$global_source_path" != "" ]]
902       then
903          source_path=$global_source_path
904       else
905          printf "\n\n  +++ no source path found in configuration file"
906          printf "\n      for local host \"$localhost\" "
907          locat=source_path; exit
908       fi
909    fi
910    eval source_path=$source_path
911
912    if [[ ! -d $source_path ]]
913    then
914       printf "\n\n  +++ source path \"$source_path\" on local host"
915       printf "\n      \"$localhost\" does not exist"
916       locat=source_path; exit
917    fi
918
919 fi
920
921
922    # GLOBALE REVISIONSNUMMER ERMITTELN (FORTSETZUNGSLAEUFEN WIRD DIESE
923    # DURCH OPTION -G MITGETEILT)
924 if [[ "$global_revision" = "" ]]
925 then
926    global_revision=`svnversion $source_path  2>/dev/null`
927    global_revision="Rev: $global_revision"
928 fi
929
930
931    # NOCHMAL PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
932    # (HOST KANN IN KONFIGURATIONSDATEI ANDERS FESTGELEGT WORDEN SEIN)
933    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
934    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
935    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
936 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
937 then
938    do_batch=true
939    do_remote=true
940    case  $host  in
941        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|lctit|nech|neck|unics)  true;;
942        (*)  printf "\n"
943             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
944             printf "\n      is not available"
945             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
946    esac
947 else
948    host=$localhost
949 fi
950
951
952    # PRUEFUNG EINIGER PROZESSORZAHLANGABEN BEI RECHNUNGEN AUF PARALLELRECHNERN
953 if [[ "$cond1" = parallel  ||  "$cond2" = parallel ]]
954 then
955
956       # PRUEFEN, OB DIE ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN PES ANGEGEBEN WURDE
957    if [[ ! -n $numprocs ]]
958    then
959       printf "\n"
960       printf "\n  +++ option \"-K parallel\" requires additional specification"
961       printf "\n      of the number of processors to be used by"
962       printf "\n      mrun-option \"-X\" or by environment-variable"
963       printf "\n      \"numprocs\" in the configuration file"
964       locat=numprocs; (( iec = 0 )); exit 
965    fi
966
967       # PRUEFEN, OB DIE PROZESSORANZAHL PRO KNOTEN ANGEGEBEN WURDE (GGF.
968       # DEFAULT-WERT SETZEN) UND OB SIE EIN GANZZAHLIGER TEILER DER
969       # GESAMTPROZESSORANZAHL IST
970    if [[ $host = nech  ||  $host = neck  ||  $host = ibmh  ||  $host = ibmb  ||  $host = ibms ]]
971    then
972       [[ "$tasks_per_node" = "" ]]  &&  tasks_per_node=6
973       (( ival = $tasks_per_node ))
974       (( pes = numprocs ))
975#       if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics+1PE) = 1 ]]
976#       then
977#          (( pes = pes - 1 ))
978#       fi
979       (( ii = pes / ival ))
980       if (( pes - ii * ival > 0 ))
981       then
982          printf "\n"
983          printf "\n  +++ tasks per node (option \"-T\") must be an integral"
984          printf "\n      divisor of the total number of processors (option \"-X\")"
985          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
986          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
987       fi
988    fi
989
990       # IBMY HAT NUR EINEN KNOTEN
991    if [[ $host = ibmy ]]
992    then
993       if [[ "$tasks_per_node" != ""  &&  "$tasks_per_node" != "$numprocs" ]]
994       then
995          printf "\n"
996          printf "\n  +++ on ibmy, tasks per node (option \"-T\") must be equal to the"
997          printf "\n      total number of processors (option \"-X\")"
998          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
999          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
1000       fi
1001    fi
1002
1003       # FALLS OPENMP PARALLELISIERUNG VERWENDET WERDEN SOLL, ANZAHL VON THREADS
1004       # SETZEN UND ZAHL DER TASKS PRO KNOTEN AUF 1 SETZEN
1005    if [[ $use_openmp = true ]]
1006    then
1007       threads_per_task=$tasks_per_node
1008       tasks_per_node=1
1009    fi
1010    OOPT="-O $threads_per_task"
1011    TOPT="-T $tasks_per_node"
1012
1013       # GESAMTZAHL DER KNOTEN BESTIMMEN
1014    if [[ "$tasks_per_node" != "" ]]
1015    then
1016       (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
1017    fi
1018
1019       # PRUEFEN, OB NODE USAGE EINEN ERLAUBTEN WERT HAT BZW. DEN DEFAULT
1020       # SETZEN
1021    if [[ $node_usage = default ]]
1022    then
1023       if [[ $host = ibms ]]
1024       then
1025          node_usage=shared
1026       elif [[ $host = lctit ]]
1027       then
1028          node_usage=sla3
1029       else
1030          node_usage=not_shared
1031       fi
1032    fi
1033    if [[ $node_usage != shared  &&  $node_usage != not_shared  &&  "$(echo $node_usage | cut -c1-3)" != "sla"  &&  $node_usage != novice  ]]
1034    then
1035       printf "\n"
1036       printf "\n  +++ node usage (option \"-n\") is only allowed to be set"
1037       printf "\n      \"shared\" or \"not_shared\""
1038       locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
1039    fi
1040
1041 fi
1042
1043    # PRUEFEN, OB HOSTFILE EXISTIERT
1044 if [[ -n $hostfile ]]
1045 then
1046    if [[ ! -f $hostfile ]]
1047    then
1048       printf "\n"
1049       printf "\n  +++ hostfile \"$hostfile\" does not exist"
1050       locat=hostfile; exit
1051    fi
1052 fi
1053
1054    # PRUEFEN, OB RHOSTS DATEI EXISTIERT. GEGEBENENFALLS ANLEGEN BZW. ERWEITERN
1055 if [[ $host = ibmy  &&  $do_remote = false ]]
1056 then
1057    if [[ ! -f $HOME/.rhosts ]]
1058    then
1059       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >  $HOME/.rhosts
1060       printf "\n\n  *** file:"
1061       printf "\n           $HOME/.rhosts"
1062       printf "\n      was created\n"
1063    fi
1064    if [[ $(grep -c gfdl5.yonsei.ac.kr $HOME/.rhosts) = 0 ]]
1065    then
1066       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >>  $HOME/.rhosts
1067       printf "\n\n  *** file:"
1068       printf "\n           $HOME/.rhosts"
1069       printf "\n      was extended by the name of the current host\n"
1070    fi
1071 fi
1072
1073
1074
1075    # FALLS NICHT VORGEGEBEN, DEFAULT-QUEUE AUF DER ZIELMASCHINE FESTLEGEN
1076 if [[ $queue = none ]]
1077 then
1078    case  $host  in
1079        (ibmb)       if [[ $node_usage = shared ]]
1080                     then
1081                        queue=cshare
1082                     else
1083                        queue=csolo
1084                     fi;;
1085        (ibmh)       if [[ $node_usage = shared ]]
1086                     then
1087                        queue=cshare
1088                     else
1089                        queue=csolo
1090                     fi;;
1091        (ibmy)       queue=parallel;;
1092        (lctit)      queue=sla3;;
1093        (nech)       queue=none;;
1094        (neck)       queue=P;;
1095        (unics)      queue=unics;;
1096    esac
1097 fi
1098
1099
1100    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN DER INPUT-FILES BILDEN,
1101    # INPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1102    # ERMITTELN
1103 (( i = 0 ))
1104 while (( i < iin ))
1105 do
1106    (( i = i + 1 ))
1107    (( maxcycle = 0 ))
1108
1109       # NAMENSBILDUNG (EVTL. IST FESTER DATEINAME VORGEGEBEN)
1110    if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1111    then
1112       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1113                                                    # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1114       eval filename=${pathin[$i]}/${endin[$i]}
1115    else
1116       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1117                                                             # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1118       eval filename=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}
1119    fi
1120
1121       # PRUEFEN AUF VORHANDENSEIN
1122    if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1123          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1124          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1125    then
1126          # DATEIEN MIT EXTENSION (Z.B. NC) MUESSEN NICHT ZWINGEND VORHANDEN
1127          # SEIN, DESHALB IN SOLCHEN FAELLEN KEIN ABBRUCH. DIES IST NUR EINE
1128          # VORUEBERGEHENDE LOESUNG (OKT 05). NICHT ZWINGEND BENOETIGTE
1129          # EINGABEDATEIEN SOLLTEN EINE SPEZIELLE OPTION IN DER DATEI-
1130          # VERBINDUNGSANWEISUNG BEKOMMEN (Z.B. inopt?)
1131       if [[ "${transin[$i]}" != "locopt" ]]
1132       then
1133          printf "\n\n  +++ INPUT-file: "
1134          if [[ "${extin[$i]}" = "" ]]
1135          then
1136             printf "\n           $filename"
1137          else
1138             printf "\n           $filename.${extin[$i]}"
1139          fi
1140          printf "\n      does not exist\n"
1141          locat=input; exit
1142       else
1143          transin[$i]="unavailable"
1144       fi
1145    else
1146
1147          # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1148       ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1149       ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1150       while  read zeile
1151       do
1152          cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1153          if [[ "$cycle" = "$zeile" ]]
1154          then
1155             (( icycle = 0 ))
1156          elif [[ "$cycle" = "${extin[$i]}" ]]
1157          then
1158             (( icycle = 0 ))
1159          else
1160             (( icycle = $cycle ))
1161          fi
1162          if (( icycle > maxcycle ))
1163          then
1164             (( maxcycle = icycle ))
1165             file_to_be_used=$zeile
1166          fi
1167       done <filelist
1168       rm filelist
1169
1170          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN
1171       if (( maxcycle > 0 ))
1172       then
1173          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1174          then
1175             filename=${filename}.$maxcycle.${extin[$i]}
1176          else
1177             filename=${filename}.$maxcycle
1178          fi
1179       else
1180          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1181          then
1182             filename=${filename}.${extin[$i]}
1183          fi
1184       fi
1185       
1186          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1187          # DA SPAETER BEI RUECKSPEICHERN VOM ARCHIVSYSTEM EVTL. BENOETIGT
1188       absnamein[$i]=$filename
1189       if (( maxcycle > 0 ))
1190       then
1191          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1192          then
1193             frelin[$i]=${endin[$i]}.$maxcycle
1194          else
1195             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}.$maxcycle
1196          fi
1197       else
1198          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1199          then
1200             frelin[$i]=${endin[$i]}
1201          else
1202             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}
1203          fi
1204       fi
1205
1206    fi
1207 done
1208       
1209
1210    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN (OHNE $ ODER ~) DER OUTPUT-FILES BILDEN,
1211    # OUTPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1212    # ERMITTELN ODER, FALLS NICHT VORHANDEN, PRUEFEN, OB SIE SICH ANLEGEN LASSEN
1213    # DIESE AKTIONEN FINDEN NICHT STATT, WENN PROGRAMM AUF REMOTE-MASCHINE
1214    # RECHNET UND DATEI ANSCHLIESSEND TRANSFERIERT WERDEN SOLL!
1215 (( i = 0 ))
1216 while (( i < iout ))
1217 do
1218    (( i = i + 1 ))
1219    if [[ ! ( $fromhost != $localhost  &&  ( "${actionout[$i]}" = tr || "${actionout[$i]}" = tra || "${actionout[$i]}" = trpe ) ) ]]
1220    then
1221       if [[ "${actionout[$i]}" = tr  ||  "${actionout[$i]}" = trpe ]]
1222       then
1223          actionout[$i]=""
1224       elif [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
1225       then
1226          actionout[$i]=a
1227       fi
1228       (( maxcycle = 0 ))
1229       eval filename=${pathout[$i]}/${fname}${endout[$i]}
1230       eval catalogname=${pathout[$i]}
1231       if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1232             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1233             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1234       then
1235     
1236             # OUTPUT-DATEI NICHT VORHANDEN. PRUEFEN, OB ANLEGEN MOEGLICH.
1237          if  cat /dev/null > $filename 
1238          then
1239             rm  $filename
1240          else
1241
1242                # PRUEFEN, OB KATALOG VORHANDEN UND EVTL. DIESEN ANLEGEN
1243             if [[ ! -d $catalogname ]]
1244             then
1245                if  mkdir -p  $catalogname
1246                then
1247                   printf "\n\n  *** directory:"
1248                   printf "\n           $catalogname"
1249                   printf "\n      was created\n"
1250                else
1251                   printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1252                   printf "\n           $filename"
1253                   printf "\n      cannot be created, because directory does not exist"
1254                   printf "\n      and cannot be created either"
1255                   printf "\n"
1256                   locat=output  ; exit
1257                fi 2>/dev/null
1258             else
1259                printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1260                printf "\n           $filename"
1261                printf "\n      cannot be created, although directory exists"
1262                printf "\n"
1263                locat=output  ; exit
1264             fi
1265          fi 2>/dev/null
1266       else
1267
1268             # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1269          ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1270          ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1271          while  read zeile
1272          do
1273             cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1274             if [[ "$cycle" = "$zeile"  ||  "$cycle" = ${extout[$i]} ]]
1275             then
1276                (( icycle = 1 ))
1277             else
1278                (( icycle = $cycle + 1 ))
1279             fi
1280             if (( icycle > maxcycle ))
1281             then
1282                (( maxcycle = icycle ))
1283             fi
1284          done <filelist
1285          rm filelist
1286       fi
1287
1288          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN UND PRUEFEN, OB SICH
1289          # DATEI AUCH WIRKLICH ANLEGEN LAESST. IM APPEND-FALL MUSS AN DEN
1290          # HOECHSTEN VORHANDENEN ZYKLUS-ANGEHAENGT WERDEN. ANLAGEPRUEFUNG
1291          # IST DANN NATUERLICH NICHT ZULAESSIG BZW. MOEGLICH
1292       if [[ "${actionout[$i]}" != a ]]
1293       then
1294          if (( maxcycle > 0 ))
1295          then
1296             filename=${filename}.$maxcycle
1297             if  cat /dev/null > $filename 
1298             then
1299                rm  $filename
1300             else
1301                printf "\n  +++ OUTPUT-file:"
1302                printf "\n           $filename"
1303                printf "\n      cannot be created"
1304                locat=output  ; exit
1305             fi
1306          fi
1307       else
1308          (( maxcycle = maxcycle - 1 ))
1309          if (( maxcycle > 0 ))
1310          then
1311             filename=${filename}.$maxcycle
1312          fi
1313       fi
1314       
1315          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1316          # DA SPAETER BEI ABLAGE AUF ARCHIVSYSTEM BZW. FUER
1317          # DATEI OUTPUT_FILE_CONNECTIONS EVTL. BENOETIGT
1318       pathout[$i]=$filename
1319       if (( maxcycle > 0 ))
1320       then
1321          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}.$maxcycle
1322       else
1323          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}
1324       fi
1325
1326    fi
1327 done
1328
1329
1330     # DAS DVRP-PAKET ERFORDERT EINE ENTSPRECHENDE BIBLIOTHEK
1331 if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics) != 0 ]]
1332 then
1333    if [[ "$dvrp_inc" = "" ]]
1334    then
1335       printf "\n\n  +++ no value for \"dvrp_inc\" given in configuration file"
1336       printf "\n      This is required for the dvrp_graphics package.\n"
1337       locat=dvrp; exit
1338    fi
1339    if [[ "$dvrp_lib" = "" ]]
1340    then
1341       printf "\n\n  +++ no value for \"dvrp_lib\" given in configuration file"
1342       printf "\n      This is required for the dvrp_graphics package.\n"
1343       locat=dvrp; exit
1344    fi
1345 fi
1346
1347
1348     # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM ODER NUR EIN AUSFUEHRBARES
1349     # PROGRAMM VEREINBART WURDE (IN DIESEM FALL BRAUCHT IM WEITEREN NICHT
1350     # UEBERSETZT ZU WERDEN)
1351 if [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" = "" ]]
1352 then
1353    printf "\n  +++ neither main program nor executable defined"
1354    locat=source; exit
1355 elif [[ "$mainprog" != ""  &&  "$executable" != "" ]]
1356 then
1357    printf "\n  +++ main program as well as executable defined"
1358    locat=source; exit
1359 elif [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" != "" ]]
1360 then
1361    do_compile=false
1362 fi
1363
1364
1365    # ALLE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE ZUSAMMENSAMMELN
1366    # BEI BATCH-JOBS IST DIES NICHT NOETIG, WEIL DIE PROGRAMMTEILE BEREITS DURCH
1367    # DEN MRUN-AUFRUF ERMITTELT SIND, DER DEN BATCH-JOB GENERIERT HAT, UND
1368    # IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_... ABGELEGT SIND
1369 if [[ $do_compile = true  &&  "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
1370 then
1371
1372    [[ "$source_list" = LM ]]  &&  source_list=LOCALLY_MODIFIED
1373    [[ "$source_list" = WP ]]  &&  source_list=WRITE_PERMIT
1374
1375    if [[ $restart_run != true ]]
1376    then
1377       rm -rf  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1378       mkdir   SOURCES_FOR_RUN_$fname
1379    fi
1380
1381
1382       # EVTL. ZU UEBERSETZENDE PROGRAMMTEILE DADURCH BESTIMMEN, DASS GEPRUEFT
1383       # WIRD, WELCHE DATEIEN WRITE-PERMIT BESITZEN (DATEIEN SOLLTEN DESHALB
1384       # UNTER RCS-KONTROLLE STEHEN). MIT DER VARIABLEN EXCLUDE KOENNEN
1385       # BESTIMMTE DATEIEN GRUNDSAETZLICH VON DER UEBERSETZUNG AUSGESCHLOSSEN
1386       # WERDEN. DIES IST NUR BEI MANUELLEM START VON MRUN DURCH DEN BENUTZER
1387       # MOEGLICH, DA BEI AUTOMATISCHEN RESTARTS TEST DURCH DIE TATSAECHLICH
1388       # ZU UBERSETZENDEN DATEIEN ERSETZT IST.
1389       # ALLE ERMITTELTEN DATEIEN WERDEN IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_...
1390       # GESAMMELT
1391    if [[ "$source_list" = WRITE_PERMIT ]]
1392    then
1393
1394       source_list=""
1395       cd  $source_path
1396
1397
1398          # ALLE MOEGLICHEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1399       Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1400       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Names"
1401       Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1402       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1403       Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1404       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1405       Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1406       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1407       Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1408       [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1409
1410
1411          # DATEIEN MIT WRITE-PERMIT NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1412       for  dateiname  in  $Filenames
1413       do
1414          if [[ -w $dateiname ]]
1415          then
1416             if [[ "$exclude" = ""  ||  $(echo $exclude | grep -c $dateiname) = 0 ]]
1417             then
1418                cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1419                source_list=$source_list"$dateiname "
1420             fi
1421          fi
1422       done
1423
1424       cd -  > /dev/null
1425
1426
1427    elif [[ "$source_list" = LOCALLY_MODIFIED ]]
1428    then
1429
1430          # MODIFIZIERTE DATEIEN DER SVN-ARBEITSKOPIE BESTIMMEN
1431       source_list=""
1432       cd  $source_path
1433
1434
1435          # PRUEFEN, OB VERZEICHNIS UEBERHAUPT UNTER SVN-KONTROLLE STEHT
1436       if [[ ! -d .svn ]]
1437       then
1438          printf "\n\n  +++ source directory"
1439          printf "\n         \"$source_path\" "
1440          printf "\n         is not under control of \"subversion\"."
1441          printf "\n         Please do not use mrun-option \"-s LOCALLY MODIFIED\"\n"
1442       fi
1443
1444
1445          # ALLE MODIFIZIERTEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1446       Filenames=""
1447       svn status  >  tmp_mrun
1448       while  read line
1449       do
1450          firstc=`echo $line | cut -c1`
1451          if [[ $firstc = M  ||  $firstc = "?" ]]
1452          then
1453             Name=`echo "$line" | cut -c8-`
1454             extension=`echo $Name | cut -d. -f2`
1455             if [[ "$extension" = f90 || "$extension" = F90 || "$extension" = f || "$extension" = F || "$extension" = c ]]
1456             then
1457                Filenames="$Filenames "$Name
1458             fi
1459          fi
1460       done < tmp_mrun
1461
1462
1463          # DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1464       for  dateiname  in  $Filenames
1465       do
1466          cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1467          source_list=$source_list"$dateiname "
1468       done
1469
1470       cd -  > /dev/null
1471
1472
1473       # MITTELS OPTION -s ANGEGEBENE DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1474       # BEI AUTOMATISCHEN FORTSETZUNGSLAEUFEN SIND DORT SCHON ALLE DATEIEN
1475       # VORHANDEN
1476    elif [[ "$source_list" != ""  &&  $restart_run != true ]]
1477    then
1478
1479       cd  $source_path
1480
1481       for  filename  in  $source_list
1482       do
1483
1484             # QUELLTEXT-DATEI DARF KEINE PFADE BEINHALTEN
1485          if [[ $(print $filename | grep -c "/") != 0 ]]
1486          then
1487             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1488             printf "\n      must not contain (\"/\") "
1489             locat=source; exit
1490          fi
1491
1492          if [[ ! -f $filename ]]
1493          then
1494             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1495             printf "\n      does not exist"
1496             locat=source; exit
1497          else
1498             cp  $filename  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1499          fi
1500
1501       done
1502
1503       cd -  > /dev/null
1504
1505    fi
1506
1507
1508       # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM VORHANDEN UND ES EVTL. IN DER
1509       # LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE MIT ENTHALTEN IST (WENN
1510       # NICHT, WIRD ES DIESER LISTE HINZUGEFUEGT)
1511    if [[ $restart_run != true ]]
1512    then
1513
1514       if [[ ! -f "$source_path/$mainprog" ]]
1515       then
1516          printf "\n\n  +++ main program:  $mainprog"
1517          printf "\n      does not exist in source directory"
1518          printf "\n      \"$source_path\"\n"
1519          locat=source; exit
1520       else
1521          if [[ $(echo $source_list | grep -c $mainprog) = 0 ]]
1522          then
1523             cp  $source_path/$mainprog  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1524             source_list=${mainprog}" $source_list"
1525          fi
1526       fi
1527    fi
1528
1529
1530       # DATEIEN AUS ZUSAETZLICHEM QUELLVERZEICHNIS HINZUFUEGEN
1531    if [[ $restart_run != true  &&  "$add_source_path" != "" ]]
1532    then
1533
1534          # GIBT ES DAS VERZEICHNIS UEBERHAUPT?
1535       if [[ ! -d $add_source_path ]]
1536       then
1537          printf "\n\n  +++ WARNING: additional source code directory"
1538          printf "\n      \"$add_source_path\" "
1539          printf "\n      does not exist or is not a directory."
1540          printf "\n      No source code will be used from this directory!\n"
1541          add_source_path=""
1542          sleep 3
1543       else
1544
1545          cd $add_source_path
1546
1547          Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1548          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$Names"
1549          Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1550          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1551          Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1552          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1553          Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1554          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1555          Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1556          [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1557
1558          cd -  > /dev/null
1559          cd  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1560
1561          for  dateiname  in  $AddFilenames
1562          do
1563             if [[ -f $dateiname ]]
1564             then
1565                printf "\n  +++ source code file \"$dateiname\" found in additional"
1566                printf "\n      source code directory \"$add_source_path\" "
1567                printf "\n      as well as in directory \"$source_path\"."
1568                locat=source; exit
1569             fi
1570
1571             cp  $add_source_path/$dateiname  .
1572             source_list="$source_list $dateiname"
1573
1574                # Default User-Interface von der Liste entfernen, falls Datei
1575                # ein User-Interface enthaelt
1576             if [[ $( cat $dateiname | grep -c "END SUBROUTINE user_parin" ) != 0 ]]
1577             then
1578                if [[ $dateiname != user_interface.f90  &&  -f user_interface.f90 ]]
1579                then
1580                   rm -rf  user_interface.f90
1581                   source_list=`echo $source_list | sed -e 's/user_interface.f90//'`
1582                   printf "\n\n  *** default \"user_interface.f90\" removed from the files to be translated"
1583                   printf "\n      since a user-interface is found in file"
1584                   printf "\n      \"$add_source_path/$dateiname\" \n"
1585                   sleep 3
1586                else
1587                   printf "\n\n  *** user-interface file \"$dateiname\" "
1588                   printf "\n      added to the files to be translated \n"
1589                   sleep 3
1590                fi
1591             fi
1592          done
1593
1594          cd -  > /dev/null
1595       fi
1596    fi
1597
1598
1599       # ALLE UNTERPROGRAMME, DIE ZU VEREINBARTEN SOFTWAREPAKETEN GEHOEREN,
1600       # DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN HINZUFUEGEN
1601    if [[ $restart_run != true  &&  -n $package_list ]]
1602    then
1603
1604       cd  $source_path
1605
1606       for  package  in  $package_list
1607       do
1608
1609          [[ $package = "dvrp_graphics+1PE" ]]  &&  package=dvrp_graphics
1610
1611             # ERMITTELE ALLE DATEIEN, DIE ZUM PAKET GEHOEREN
1612             # FEHLERMELDUNGEN WERDEN ABGEFANGEN, DA * AUCH VERZEICHNISSNAMEN
1613             # LIEFERT
1614          package_source_list=`grep "defined( __$package " * 2>/dev/null | cut -f1 -d:`
1615
1616
1617             # FUEGE DIESE DATEIEN DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN
1618             # HINZU, FALLS SIE NOCH NICHT DAZUGEHOEREN
1619          for  source_list_name  in  $package_source_list
1620          do
1621             if [[ $(echo $source_list | grep -c $source_list_name) = 0 ]]
1622             then
1623
1624                    # NUR DATEIEN MIT GUELTIGEN ENDUNGEN VERWENDEN
1625                ending=`echo $source_list_name | cut -f2 -d.`
1626                if [[ "$ending" = f90  ||  "$ending" = F90  ||  "$ending" = f  ||  "$ending" = F  ||  "$ending" = c ]]
1627                then
1628                   cp  $source_list_name  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1629                   source_list="$source_list $source_list_name"
1630                fi
1631             fi
1632          done
1633       done
1634
1635       cd -  > /dev/null
1636    fi
1637
1638
1639       # MAKEFILE AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND KOPIEREN
1640       # BEI RESTART-LAEUFEN LIEGT ES SCHON IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN...
1641    if [[ "$restart_run" != true ]]
1642    then
1643       [[ "$makefile" = "" ]]  &&  makefile=$source_path/Makefile
1644       if [[ ! -f $makefile ]]
1645       then
1646          printf "\n  +++ file \"$makefile\" does not exist"
1647          locat=make; exit
1648       else
1649          cp  $makefile  SOURCES_FOR_RUN_$fname/Makefile
1650       fi
1651    fi
1652
1653 fi  # do_compile=true
1654
1655
1656    # FALLS PROGRAMMTEILE UEBERSETZT WERDEN SOLLEN, FOLGEN JETZT EINIGE
1657    # UEBERPRUEFUNGEN UND DAS SETZEN DER PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN
1658 if [[ $do_compile = true ]]
1659 then
1660
1661       # PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN ZUM SELEKTIVEN AUSWAEHLEN VON CODETEILEN
1662       # ZUSAMMENSETZEN
1663       # DIREKTIVEN ZUM AKTIVIEREN VON RECHNERSPEZIFISCHEM CODE
1664    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1665    then
1666       cpp_options="${cpp_options},-D__ibm=__ibm"
1667    elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = nec ]]
1668    then
1669       cpp_options="$cpp_options -D__nec"
1670    elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-2) = lc ]]
1671    then
1672       cpp_options="$cpp_options -D__lc"
1673    else
1674       cpp_options="$cpp_options -D__$localhost"
1675    fi
1676
1677       # DIREKTIVEN DIE DURCH OPTION -K BESTIMMT WERDEN (Z.B. PARALLEL)
1678    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1679    then
1680       [[ -n $cond1 ]]  &&  cpp_options="${cpp_options},-D__$cond1=__$cond1"
1681       [[ -n $cond2 ]]  &&  cpp_options="${cpp_options},-D__$cond2=__$cond2"
1682    else
1683       [[ -n $cond1 ]]  &&  cpp_options="$cpp_options -D__$cond1"
1684       [[ -n $cond2 ]]  &&  cpp_options="$cpp_options -D__$cond2"
1685    fi
1686
1687       # DIREKTIVEN DIE SOFTWAREPAKETE AKTIVIEREN (OPTION -p)
1688    if [[ -n $package_list ]]
1689    then
1690       for  package  in  $package_list
1691       do
1692          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1693          then
1694             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1695             then
1696                cpp_options="${cpp_options},-D__$package=__$package"
1697             else
1698                cpp_options="${cpp_options},-D__dvrp_graphics=__dvrp_graphics"
1699                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1700             fi
1701          else
1702             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1703             then
1704                cpp_options="$cpp_options -D__$package"
1705             else
1706                cpp_options="$cpp_options -D__dvrp_graphics"
1707                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1708             fi
1709          fi
1710       done
1711    fi
1712
1713       # DIREKTIVEN DIE DURCH OPTION -D FESTGELEGT SIND
1714    if [[ -n $cpp_opts ]]
1715    then
1716       for  popts  in  $cpp_opts
1717       do
1718          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1719          then
1720             cpp_options="${cpp_options},-D__$popts=__$popts"
1721          else
1722             cpp_options="$cpp_options -D__$popts"
1723          fi
1724       done
1725    fi
1726
1727 else
1728
1729
1730       # BEI LOKALEN RECHNUNGEN PRUEFEN, OB EXECUTABLE VORHANDEN
1731    if [[ $do_remote = false ]]
1732    then
1733       if [[ ! -f $executable ]]
1734       then
1735          printf "\n  +++ executable file:  $executable"
1736          printf "\n      does not exist"
1737          locat=executable; exit
1738       fi
1739    fi
1740 fi
1741
1742
1743    # JOBMODUS FESTSTELLEN
1744 if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH  &&  $localhost != lctit  ||  "$QUEUE" != interactive  &&  $localhost = lctit ]]
1745 then
1746    jobmo=BATCH
1747 else
1748    jobmo=INTERACTIVE
1749 fi
1750
1751
1752    # HOSTSPEZIFISCHE DEFAULT-COMPILER SETZEN, FALLS NICHT BEREITS
1753    # DURCH BENUTZER ANDERWEITIG VEREINBART
1754 if [[ "$compiler_name" = "" ]]
1755 then
1756
1757    printf "\n  +++ no compiler specified for \"$localhost $cond1 $cond2\""
1758    locat=compiler_name; exit
1759
1760 fi
1761
1762
1763    # COMPILER AUF NECK UEBERSCHREIBEN
1764 [[ $localhost = neck ]]  &&  compiler_name=mpif90
1765
1766
1767
1768    # TEMPORAEREN KATALOGNAMEN BESTIMMEN
1769 kennung=$RANDOM
1770 if [[ "$tmp_user_catalog" = "" ]]
1771 then
1772    if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
1773    then
1774       tmp_user_catalog=$TMPDIR
1775    elif [[ $localhost = nech ]]
1776    then
1777       tmp_user_catalog=$WRKSHR
1778    else
1779       tmp_user_catalog=/tmp
1780    fi
1781 fi
1782 TEMPDIR=$tmp_user_catalog/${usern}.$kennung
1783
1784
1785    # KATALOGNAMEN FUER ZWISCHENSPEICHERUNG VON FORTSETZUNGSLAUFDATEIEN
1786    # BESTIMMEN
1787 if [[ "$tmp_data_catalog" = "" ]]
1788 then
1789    if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
1790    then
1791       tmp_data_catalog=$WORK/mrun_restart_data
1792    elif [[ $localhost = nech ]]
1793    then
1794       tmp_data_catalog=$WRKSHR/mrun_restart_data
1795    else
1796       tmp_data_catalog=/tmp/mrun_restart_data
1797    fi
1798 fi
1799
1800
1801    # EVENTUELL BEI LOKALEN RECHNUNGEN $-ZEICHEN IN ENVIRONMENT-VARIABLEN
1802    # ERSETZEN
1803 if [[ $do_remote = false  &&  $do_compile = true ]]
1804 then
1805    eval  fopts=\"$fopts\"
1806    eval  lopts=\"$lopts\"
1807 fi
1808
1809
1810
1811    # COMPILE- UND LINK-OPTIONEN BESTIMMEN
1812 fopts="$fopts $netcdf_inc $dvrp_inc"
1813 lopts="$lopts $netcdf_lib $dvrp_lib"
1814 ROPTS="$ropts"
1815 if [[ ( $(echo $host | cut -c1-3) = nec  ||  $(echo $host | cut -c1-3) = ibm  ||  $host = lctit  ||  $host = lcfimm )  &&  -n $numprocs ]]
1816 then
1817    XOPT="-X $numprocs"
1818 fi
1819
1820
1821
1822    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT. (CPUMAX WIRD ALS ENV-VARIABLE VOM HAUTPRO-
1823    # GRAMM BENOETIGT
1824 done=false
1825 while [[ $done = false ]]
1826 do
1827    cputime=$cpumax
1828    if (( $cputime == 0 ))
1829    then
1830       printf "\n  +++ cpu-time is undefined"
1831       printf "\n  >>> Please type CPU-time in seconds as INTEGER:"
1832       printf "\n  >>> "
1833       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
1834    else
1835       done=true
1836    fi
1837    cpumax=$cputime
1838 done
1839
1840 (( minuten = cputime / 60 ))
1841 (( sekunden = cputime - minuten * 60 ))
1842
1843
1844    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
1845 if [[ $do_batch = true ]]
1846 then
1847    done=false
1848    while [[ $done = false ]]
1849    do
1850       if (( memory == 0 ))
1851       then
1852          printf "\n  +++ memory demand is undefined"
1853          printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
1854          printf "\n  >>> "
1855          read  memory  1>/dev/null  2>&1
1856       else
1857          done=true
1858       fi
1859    done
1860 fi
1861
1862
1863    # PRUEFEN, OB FUER REMOTE-RECHNUNGEN EIN BENUTZERNAME ANGEGEBEN WURDE
1864 if [[ $do_remote = true  &&  -z $remote_username ]]
1865 then
1866    while [[ -z $remote_username ]]
1867    do
1868       printf "\n  +++ username on remote host \"$host\" is undefined"
1869       printf "\n  >>> Please type username:"
1870       printf "\n  >>> "
1871       read  remote_username
1872    done
1873    mc="$mc -u$remote_username"
1874 fi
1875
1876###########################################################################
1877# HEADER-AUSGABE
1878###########################################################################
1879
1880
1881 calltime=$(date)
1882 printf "\n"
1883# [[ $silent = false ]]  &&  clear
1884 printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
1885 printf "| $version$calltime | \n"
1886 printf "|                                                              | \n"
1887 spalte1="called on:"; spalte2=$localhost_realname
1888 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1889 if [[ $local_compile = false ]]
1890 then
1891    if [[ $do_remote = true ]]
1892    then
1893       spalte1="execution on:"; spalte2="$host (username: $remote_username)"
1894    else
1895       spalte1="execution on:"; spalte2="$host ($localhost_realname)"
1896    fi
1897 else
1898    spalte1="compiling test only!"; spalte2=""
1899 fi
1900 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1901 if [[ -n $numprocs ]]
1902 then
1903    spalte1="number of PEs:"; spalte2=$numprocs
1904    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1905 fi
1906 if [[ -n $tasks_per_node ]]
1907 then
1908    spalte1="tasks per node:"; spalte2="$tasks_per_node (number of nodes: $nodes)"
1909    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1910 fi
1911 if [[ $threads_per_task != 1 ]]
1912 then
1913    spalte1="threads per task:"; spalte2="$threads_per_task"
1914    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1915 fi
1916 printf "|                                                              | \n"
1917 if [[ $do_compile = true ]]
1918 then
1919    spalte1=cpp-directives:; spalte2=$cpp_options
1920    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1921    zeile=$(echo "$cpp_options" | cut -c41-)
1922    while [[ "$zeile" != "" ]]
1923    do
1924       spalte1=""
1925       spalte2=$zeile
1926       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1927       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
1928    done
1929
1930    spalte1=compiler-options:; spalte2="$fopts"
1931    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1932    zeile=$(echo "$fopts" | cut -c41-)
1933    while [[ "$zeile" != "" ]]
1934    do
1935       spalte1=""
1936       spalte2=$zeile
1937       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1938       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
1939    done
1940
1941    spalte1=linker-options:; spalte2=$lopts
1942    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1943    zeile=$(echo "$lopts" | cut -c41-)
1944    while [[ "$zeile" != "" ]]
1945    do
1946       spalte1=""
1947       spalte2=$zeile
1948       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1949       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
1950    done
1951
1952    spalte1="main program":; spalte2=$mainprog
1953    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1954 else
1955    spalte1=executable:; spalte2=$executable
1956    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1957 fi
1958 printf "|                                                              | \n"
1959 spalte1="base name of files":; spalte2=$fname
1960 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1961 if [[ $fname != $afname ]]
1962 then
1963    spalte1="base name of input files":; spalte2=$afname
1964    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1965 fi
1966 spalte1="INPUT control list":; spalte2=$input_list
1967 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1968 spalte1="OUTPUT control list":; spalte2=$output_list
1969 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1970
1971 if [[ $do_batch = true  ||  "$LOADLBATCH" = yes ]]
1972 then
1973    spalte1="memory demand / PE":; spalte2="$memory MB"
1974    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1975    spalte1=CPU-time:; spalte2="$minuten:$sekunden"
1976    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1977 fi
1978
1979 if [[ $do_compile = true ]]
1980 then
1981    printf "|                                                              | \n"
1982    printf "| Files to be compiled:                                        | \n"
1983    zeile=$source_list
1984    while [[ "$zeile" != "" ]]
1985    do
1986       spalte3=$zeile
1987       printf "| $spalte3 | \n"
1988       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c61-)
1989    done
1990 fi
1991 printf "#--------------------------------------------------------------#"
1992
1993
1994
1995    # BEDINGTE AUSGABE DER DATEIVERBINDUNGEN
1996 if [[ $do_trace = true ]]
1997 then
1998    (( i = 0 ))
1999    while (( i < iin ))
2000    do
2001       (( i = i + 1 ))
2002       if (( i == 1 ))
2003       then
2004          printf "\n\n >>> INPUT-file assignments:\n"
2005       fi
2006       printf "\n     ${localin[$i]} :  ${absnamein[$i]}"
2007    done
2008    (( i = 0 ))
2009    while (( i < iout ))
2010    do
2011       (( i = i + 1 ))
2012       if (( i == 1 ))
2013       then
2014          printf "\n\n >>> OUTPUT-file assignments:\n"
2015       fi
2016       printf "\n     ${localout[$i]} :  ${pathout[$i]}"
2017    done
2018    (( i = 0 ))
2019    while (( i < iic ))
2020    do
2021       (( i = i + 1 ))
2022       if (( i == 1 ))
2023       then
2024          printf "\n\n >>> INPUT-commands:\n"
2025       fi
2026       printf "\n     ${in_command[$i]}" 
2027    done
2028    (( i = 0 ))
2029    while (( i < ioc ))
2030    do
2031       (( i = i + 1 ))
2032       if (( i == 1 ))
2033       then
2034          printf "\n\n >>> OUTPUT-commands:\n"
2035       fi
2036       printf "\n     ${out_command[$i]}" 
2037    done
2038 fi
2039
2040
2041    # ABFRAGEN BEI AUFRUF AUF LOKALER MASCHINE
2042 if [[ $remotecall = false  &&  $silent = false  &&  $jobmo != BATCH ]]
2043 then
2044    antwort=dummy
2045    printf "\n\n"
2046    while [[ "$antwort" != y  &&  "$antwort" != Y  &&  "$antwort" != n  &&  "$antwort" != N ]]
2047    do
2048       printf " >>> everything o.k. (y/n) ?  "
2049       read  antwort
2050    done
2051    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
2052    then
2053       locat=user_abort; (( iec = 0 )); exit
2054    fi
2055    if [[ $do_batch = true ]]
2056    then
2057       printf " >>> batch-job will be created and submitted"
2058    else
2059       if [[ $local_compile = false ]]
2060       then
2061          printf " >>> MRUN will now continue to execute on this machine"
2062       else
2063          printf " >>> a test compilation will now be carried out on this machine"
2064       fi
2065    fi
2066 fi
2067 
2068
2069
2070
2071     # FALLS AUF DIESER MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
2072     # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
2073 if [[ $do_batch = false ]]
2074 then
2075
2076
2077       # TEMPORAEREN KATALOG ERZEUGEN
2078    mkdir -p  $TEMPDIR
2079    chmod  go+rx  $TEMPDIR
2080    tmpcreate=true
2081
2082
2083       # SAEMTLICHE QUELLTEXT-DATEIEN BZW. AUSFUEHRBARES PROGRAMM IN
2084       # TEMPORAERES VERZEICHNIS KOPIEREN
2085    if [[ $do_compile = true ]]
2086    then
2087
2088          # ON NEC, COMPILATION IS DONE ON HOST CROSS VIA CROSS COMPILING
2089          # CREATE A TEMPORARY DIRECTORY ON THAT MACHINE (HOME MOUNTED VIA NFS)
2090       if [[ $localhost = nech ]]
2091       then
2092          TEMPDIR_COMPILE=$HOME/work/${usern}.$kennung
2093          if  mkdir -p  $TEMPDIR_COMPILE
2094          then
2095             printf "\n  *** \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2096             printf "\n      is generated as temporary directory for cross compiling\n"
2097          else
2098             printf "\n  +++ creating directory \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2099             printf "\n      needed for cross compilation failed"
2100             locat=compile
2101             exit
2102          fi
2103       else
2104          TEMPDIR_COMPILE=$TEMPDIR
2105       fi
2106
2107
2108          # PFADNAMEN FUER DAS MAKE-DEPOSITORY ERMITTELN
2109       line=""
2110       grep "%depository_path" $config_file  >  tmp_mrun
2111       while read line
2112       do
2113          if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2114          then
2115             if [[ "$(echo $line | cut -d" " -s -f3)" = "" ]]
2116             then
2117                global_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2118             fi
2119          fi
2120       done < tmp_mrun
2121
2122       line=""
2123       grep  " $localhost" $config_file | grep "%depository_path"  >  tmp_mrun
2124       while read line
2125       do
2126          if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2127          then
2128             local_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2129          fi
2130       done < tmp_mrun
2131
2132       if [[ "$local_depository_path" = "" ]]
2133       then
2134          if [[ "$global_depository_path" != "" ]]
2135          then
2136             local_depository_path=$global_depository_path
2137          else
2138             printf "\n\n  +++ no depository path found in configuration file"
2139             printf "\n      for local host \"$localhost\" "
2140             printf "\n      please set \"\%depository_path\" in configuration file\n"
2141             locat=config_file; exit
2142          fi
2143       fi
2144       eval local_depository_path=$local_depository_path
2145
2146       basename=`print $mainprog | cut -f1 -d"."`
2147       eval make_depository=${local_depository_path}/${basename}_current_version.tar
2148       if [[ ! -f $make_depository ]]
2149       then
2150          printf "\n"
2151          printf "\n  *** WARNING: make depository \"$make_depository\" not found"
2152          printf "\n               \"make\" will fail, if the Makefile or other source files are missing\n"
2153       else
2154          cp  $make_depository  $TEMPDIR_COMPILE
2155          cd  $TEMPDIR_COMPILE
2156          tar -xf  $make_depository  >  /dev/null  2>&1
2157          cd -  > /dev/null
2158       fi
2159
2160       cp  SOURCES_FOR_RUN_$fname/*  $TEMPDIR_COMPILE
2161
2162          # FALLS USER-INTERFACE VORHANDEN UND AUF DATEI MIT ANDEREM NAMEN
2163          # ALS user_interface.f90 LIEGT, DIESEN GEAENDERTEN NAMEN INS
2164          # MAKEFILE EINTRAGEN
2165       cd  $TEMPDIR_COMPILE
2166       interface_file=`grep -l "END SUBROUTINE user_parin" $source_list`
2167       if [[ "$interface_file" != "" ]]
2168       then
2169          interface_file=`echo $interface_file | cut -d"." -f1`
2170          mv  Makefile  Makefile_old
2171          sed "s/user_interface/$interface_file/g"  Makefile_old  >  Makefile
2172       fi
2173       cd -  > /dev/null
2174    else
2175       cp  $executable   ${TEMPDIR}/a.out
2176    fi
2177
2178
2179       # WECHSEL IN TEMPORAEREN KATALOG
2180    cd $TEMPDIR
2181    printf "\n  *** changed to temporary directory: $TEMPDIR"
2182
2183
2184       # OUTPUT-DATEI-VERBINDUNGEN AUF TEMPORAERER DATEI ABLEGEN
2185       # DIESE DATEI KANN VON SPAETER AUFZURUFENDEN BENUTZERPROZEDUREN GELESEN
2186       # WERDEN, UM ZU LOKALEN DATEINAMEN GEHOERENDE PERMANENTE NAMEN ZU
2187       # ERMITTELN
2188    (( i = 0 ))
2189    while (( i < iout ))
2190    do
2191       (( i = i + 1 ))
2192       if [[ "${actionout[$i]}" = tr  ||  "${actionout[$i]}" = tra  ||  "${actionout[$i]}" = trpe ]]
2193       then
2194          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2195       else
2196          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${frelout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2197       fi
2198    done
2199
2200
2201       # EVTL. UEBERSETZUNGSAKTIONEN STARTEN
2202    if [[ $do_compile = true ]]
2203    then
2204
2205
2206          # COMPILING WITH MAKE (ON NEC COMPILER IS CALLED ON HOST CROSS)
2207       printf "\n\n\n  *** compilation starts \n$striche\n"
2208       printf "  *** compilation with make using following options:\n"
2209       printf "      compilername:             $compiler_name\n"
2210       printf "      options:                  $fopts\n"
2211       printf "      preprocessor-directives:  $cpp_options \n"
2212       printf "      linker-options:           $lopts \n"
2213       printf "      source code files:        $source_list \n"
2214
2215       if [[ $localhost = nech ]]
2216       then
2217          ssh  136.172.44.192 -l $usern ". /SX/opt/etc/initsx.sh; cd \$HOME/work/${usern}.$kennung; sxmake -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" "
2218          cp  $TEMPDIR_COMPILE/a.out  .
2219          [[ $? != 0 ]]  &&  compile_error=true
2220          rm -rf  $TEMPDIR_COMPILE
2221       else
2222          [[ $localhost = lctit ]]  &&  export LM_LICENSE_FILE=27050@tggls
2223          make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT="$cpp_options"  F90FLAGS="$fopts"  LDFLAGS="$lopts"
2224       fi
2225
2226       if [[ $? != 0  ||  "$compile_error" = true  ||  "$module_compile_error" = true ]]
2227       then
2228          printf "\n  +++ error occured while compiling or linking"
2229          locat=compile
2230          exit
2231       else
2232          printf "$striche\n  *** compilation finished \n"
2233       fi
2234    fi
2235
2236
2237       # FALLS NUR TESTWEISE KOMPILIERT WERDEN SOLLTE, IST MRUN JETZT FERTIG
2238    if [[ $local_compile = true ]]
2239    then
2240       cd  $HOME
2241       rm -rf $TEMPDIR
2242       locat=local_compile; exit
2243    fi
2244
2245
2246       # BEREITSTELLEN DER INPUT-DATEIEN
2247       # SCHLEIFE UEBER ALLE VOM BENUTZER ANGEGEBENEN DATEIEN
2248    (( i = 0 ))
2249    while (( i < iin ))
2250    do
2251       (( i = i + 1 ))
2252       if (( i == 1 ))
2253       then
2254          printf "\n\n  *** providing INPUT-files:\n$striche"
2255       fi
2256
2257
2258          # OPTIONALE DATEIEN BEI NICHTVORHANDENSEIN UEBERGEHEN
2259       if [[ "${transin[$i]}" = unavailable ]]
2260       then
2261          if [[ "${extin[$i]}" = ""  ||  "${extin[$i]}" = " " ]]
2262          then
2263             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}\" "
2264             printf "\n               is not available!"
2265          else
2266             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}.${extin[$i]}\" "
2267             printf "\n               is not available!"
2268          fi
2269          continue
2270       fi
2271
2272          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
2273       files_for_pes=false; datentyp=file
2274       if [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
2275       then
2276          files_for_pes=true; datentyp=directory
2277          actionin[$i]=""
2278       elif [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
2279       then
2280          actionin[$i]=""
2281       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
2282       then
2283          files_for_pes=true; datentyp=directory
2284          actionin[$i]="ar"
2285       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2286       then
2287          actionin[$i]="ar"
2288       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
2289       then
2290          files_for_pes=true; datentyp=directory
2291          actionin[$i]="fl"
2292       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2293       then
2294          actionin[$i]="fl"
2295       fi
2296
2297       if [[ $files_for_pes = true ]]
2298       then
2299          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}/....  to  ${localin[$i]}"
2300       else
2301          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}  to  ${localin[$i]}"
2302       fi
2303
2304          # INPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. ES WIRD GEPRUEFT,
2305          # OB DIESE DATEI NOCH AUF DEM TEMPORAEREN DATENKATALOG VORHANDEN
2306          # IST. FALLS NICHT, WIRD VERSUCHT, SIE ANSCHLIESSEND VOM ARCHIV-
2307          # SERVER ZU HOLEN
2308       if [[ "${actionin[$i]}" = fl ]]
2309       then
2310          printf "\n      $datentyp will be fetched from temporary directory \"${tmp_data_catalog}\" !"
2311          if [[ $files_for_pes = false ]]
2312          then
2313             if [[ -f "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2314             then
2315                ln  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2316                got_tmp[$i]=true
2317             elif [[ -f "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2318             then
2319                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2320                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2321                cp  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2322             else
2323                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2324                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2325                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2326                actionin[$i]=ar
2327             fi
2328          else
2329             if [[ -d "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2330             then
2331                mkdir  ${localin[$i]}
2332                ln  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}/*  ${localin[$i]}
2333                got_tmp[$i]=true
2334             elif [[ -d "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2335             then
2336                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2337                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2338                cp -r  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2339             else
2340                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2341                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2342                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2343                actionin[$i]=ar
2344             fi
2345          fi
2346       fi
2347
2348
2349          # DATEI LIEGT AUF ARCHIV-SERVER
2350       if [[ "${actionin[$i]}" = ar ]]
2351       then
2352
2353          if [[ $files_for_pes = false ]]
2354          then
2355             printf "\n      file will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2356          else
2357             printf "\n      directory will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2358          fi
2359
2360          file_restored=false
2361
2362          if [[ $archive_system = asterix ]]
2363          then
2364             do_stagein=true
2365             (( stagein_anz = 0 ))
2366             while [[ $do_stagein = true ]]
2367             do
2368                if [[ $files_for_pes = false ]]
2369                then
2370                   stagein  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2371                else
2372                   stagein  -t  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2373                fi
2374                cat  STAGEIN_OUTPUT
2375                if [[ $(grep -c "st.msg:i24"  STAGEIN_OUTPUT) != 0 ]]
2376                then
2377                   file_restored=true
2378                   do_stagein=false
2379                else
2380                   (( stagein_anz = stagein_anz + 1 ))
2381                   if (( stagein_anz == 10 ))
2382                   then
2383                      printf "\n  +++ stagein stoped after 10 tries"
2384                      locat=stage
2385                      exit
2386                   fi
2387                   printf "\n  +++ restoring from archive failed, trying again:"
2388                   sleep 900
2389                fi
2390             done
2391          elif [[ $archive_system = DMF ]]
2392          then
2393             if [[ $files_for_pes = false ]]
2394             then
2395                printf "\n  +++ restoring of single files impossible with $archive_system !\n"
2396                locat=DMF
2397                exit
2398             else
2399                find  $ARCHIVE/${frelin[$i]}  -type m  -print  |  dmget
2400                cp  -r $ARCHIVE/${frelin[$i]}  $PWD
2401                file_restored=true
2402             fi
2403          elif [[ $archive_system = tivoli ]]
2404          then
2405             if [[ $files_for_pes = false ]]
2406             then
2407                if [[ $localhost = ibmh ]]
2408                then
2409                   ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2410                else
2411                   ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2412                fi
2413             else
2414                (( inode = 0 ))
2415                while (( inode < nodes ))
2416                do
2417                   if [[ $localhost = ibmh ]]
2418                   then
2419                      ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2420                   else
2421                      ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2422                   fi
2423                   (( inode = inode + 1 ))
2424                done
2425             fi
2426             file_restored=true
2427          elif [[ $archive_system = ut ]]
2428          then
2429             if [[ $files_for_pes = false ]]
2430             then
2431                cp  $UT/${frelin[$i]}  .
2432             else
2433                (( inode = 0 ))
2434                while (( inode < nodes ))
2435                do
2436                   tar  xf  $UT/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar
2437                   (( inode = inode + 1 ))
2438                done
2439             fi
2440             file_restored=true
2441          else
2442             printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"   restore impossible!"
2443             locat=rearchive
2444             exit
2445          fi
2446
2447          if [[ $file_restored = true ]]
2448          then
2449
2450                # DATEI AUCH AUF TEMPORAERES DATENVERZEICHNIS LEGEN, DAMIT
2451                # SIE BEI WEITEREN ZUGRIFFEN NOCH VORHANDEN IST
2452             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog; chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
2453             if [[ $files_for_pes = false ]]
2454             then
2455                ln  -f  ${frelin[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2456             else
2457                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2458                ln  -f  ${frelin[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2459             fi
2460             got_tmp[$i]=true
2461
2462                # DATEI UNTER LOKALEM NAMEN ZUR VERFUEGUNG STELLEN
2463             mv  ${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2464
2465          fi
2466       fi
2467
2468
2469          # DATEI LIEGT IM VOM BENUTZER ANGEGEBENEN VERZEICHNIS
2470       if [[ "${actionin[$i]}" = ""  ||  "${actionin[$i]}" = "di"  ||  "${actionin[$i]}" = "npe" ]]
2471       then
2472
2473          if [[ "${actionin[$i]}" = "npe"  &&  -n $numprocs ]]
2474          then
2475
2476                # DATEI WIRD FUER DIE PROZESSOREN EINES PARALLERECHNERS BEREITGESTELLT
2477             printf "\n      file will be provided for $numprocs processors"
2478             mkdir  ${localin[$i]}
2479             ival=$numprocs
2480             (( ii = 0 ))
2481             while (( ii <= ival-1 ))
2482             do
2483                if (( ii < 10 ))
2484                then
2485                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_000$ii
2486                elif (( ii < 100 ))
2487                then
2488                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_00$ii
2489                elif (( ii < 1000 ))
2490                then
2491                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_0$ii
2492                else
2493                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_$ii
2494                fi
2495                (( ii = ii + 1 ))
2496             done
2497
2498          else
2499
2500             if [[ $files_for_pes = true ]]
2501             then
2502
2503                   # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
2504                   # DATEIEN WERDEN BEREITGESTELLT, INDEM ZUERST DER GESAMTE
2505                   # KATALOGINHALT KOPIERT UND DANN DIE EINZELNEN DATEIEN
2506                   # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
2507                printf "\n      providing $numprocs files for the respective processors"
2508                mkdir  ${localin[$i]}
2509                cp -r  ${absnamein[$i]}/*  ${localin[$i]}
2510
2511             else
2512                   # BEREITSTELLUNG AUF EINPROZESSORRECHNERN
2513                cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}
2514             fi
2515          fi
2516       fi
2517
2518    done
2519    if (( i != 0 ))
2520    then
2521       printf "\n$striche\n  *** all INPUT-files provided \n"
2522    fi
2523
2524
2525       # NAMELIST-DATEI MIT WERTEN VON ENVIRONMENT-VARIABLEN ERZEUGEN (ZU
2526       # LESEN VON PALM)
2527    cat  >  ENVPAR  <<  %%END%%
2528 &envpar  run_identifier = '$fname', host = '$localhost',
2529          write_binary = '$write_binary', tasks_per_node = $tasks_per_node,
2530          maximum_cpu_time_allowed = ${cpumax}.,
2531          revision = '$global_revision' /
2532
2533%%END%%
2534
2535
2536       # EVENTUELLE INPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
2537    (( i = 0 ))
2538    while (( i < iic ))
2539    do
2540       (( i = i + 1 ))
2541       if (( i == 1 ))
2542       then
2543          printf "\n\n  *** execution of INPUT-commands:\n$striche"
2544       fi
2545       printf "\n  >>> ${in_command[$i]}"
2546       eval  ${in_command[$i]}
2547       if (( i == iic ))
2548       then
2549          printf "\n$striche\n"
2550       fi
2551    done
2552
2553
2554       # VERBLEIBENDE CPU-ZEIT BERECHNEN
2555    cpurest=${cpumax}.
2556
2557
2558       # PROGRAMMSTART
2559    printf "\n\n  *** execution starts in directory\n      \"`pwd`\"\n$striche\n"
2560    PATH=$PATH:$TEMPDIR
2561
2562    if [[ "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ]]
2563    then
2564       if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH ]]
2565       then
2566          printf "\n  +++ debug is allowed in interactive mode only"
2567          locat=debug
2568          exit
2569       fi
2570       if [[ $localhost = decalpha ]]
2571       then
2572          dxladebug  a.out
2573       elif [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
2574       then
2575
2576             # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2577          export MP_SHARED_MEMORY=yes
2578          export AIXTHREADS_SCOPE=S
2579          export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2580          export AUTHSTATE=files
2581          export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2582
2583             # FOLLOWING OPTIONS ARE MANDATORY FOR TOTALVIEW
2584          export MP_ADAPTER_USE=shared
2585          export MP_CPU_USE=multiple
2586          export MP_TIMEOUT=1200
2587
2588          unset  MP_TASK_AFFINITY
2589
2590             # SO FAR, TOTALVIEW NEEDS HOSTFILE MECHANISM FOR EXECUTION
2591          #(( ii = 1 ))
2592          #while (( ii <= $numprocs ))
2593          #do
2594          #   echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2595          #   (( ii = ii + 1 ))
2596          #done
2597          #export MP_HOSTFILE=hostfile
2598
2599          if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2600          then
2601             totalview   poe  a.out  $ROPTS
2602          else
2603             echo totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2604             export TVDSVRLAUNCHCMD=ssh
2605             totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2606          fi
2607       else 
2608          printf "\n  +++ no debug available on \"$localhost\" "
2609          printf "\n      or not implemented in mrun so far"
2610          locat=debug
2611          exit
2612       fi
2613    else
2614       if [[ -n $numprocs ]]
2615       then
2616
2617             # RUNNING THE PROGRAM ON PARALLEL MACHINES
2618          if [[ $(echo $host | cut -c1-3) = ibm ]]
2619          then
2620                # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2621             export MP_SHARED_MEMORY=yes
2622             export AIXTHREAD_SCOPE=S
2623             export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2624             export XLSMPOPTS="spins=0:yields=0:stack=20000000"
2625             export AUTHSTATE=files
2626             export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2627             #  export MP_PRINTENV=yes
2628
2629                # TUNING-VARIABLEN ZUR VERBESSERUNG DER KOMMUNIKATION
2630                # ZEIGEN ABER DERZEIT (SEP 04, FEDERATION) KAUM WIRKUNG
2631             export MP_WAIT_MODE=poll
2632             [[ $node_usage = not_shared ]]  &&  export MP_SINGLE_THREAD=yes
2633#             export MP_EAGER_LIMIT=65535
2634
2635#                # TESTWEISE FUER TURBOMPI (JAN 05)
2636#             export MPJ_MTAB=128
2637#             export MPJ_ALLTOALL=1
2638#             export MPJ_ALLTOALLV=1
2639
2640             if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2641             then
2642                printf "\n--- Control: OMP_NUM_THREADS = \"$OMP_NUM_THREADS\" \n"
2643                if [[ "$cond1" = hpmcount  ||  "$cond2" = hpmcount ]]
2644                then
2645                   /opt/optibm/HPM_2_4_1/bin/hpmcount  a.out  $ROPTS
2646                else
2647                   poe ./a.out  $ROPTS
2648                fi
2649             else
2650                if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms ]]
2651                then
2652                   poe  a.out  -procs $numprocs  -nodes 1  -rmpool 0  $ROPTS
2653                elif [[ $localhost = ibmy ]]
2654                then
2655                   if [[ -f $hostfile ]]
2656                   then
2657                      cp  $hostfile  hostfile
2658                   else
2659                      (( ii = 1 ))
2660                      while (( ii <= $numprocs ))
2661                      do
2662                         echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2663                         (( ii = ii + 1 ))
2664                      done
2665                   fi
2666                   export MP_HOSTFILE=hostfile
2667                   ./a.out  -procs $tasks_per_node  $ROPTS
2668                else
2669                   if [[ "$host_file" = "" ]]
2670                   then
2671                      printf "\n  +++ no hostfile given in configuration file"
2672                      locat=config_file
2673                      exit
2674                   else
2675                      eval host_file=$host_file
2676                   fi
2677                   export MP_HOSTFILE=$host_file
2678                   poe  a.out  -procs $numprocs  -tasks_per_node $numprocs  $ROPTS
2679                fi
2680             fi
2681          elif [[ $host = nech  ||  $host = neck ]]
2682          then
2683             (( ii = nodes ))
2684             if [[ $ii = 1 ]]
2685             then
2686                export F_ERRCNT=0        # acceptable number of errors before program is stopped
2687                export MPIPROGINF=YES
2688                #  export F_TRACE=YES|FMT1|FMT2  # output of ftrace informations to job protocol
2689                echo "*** execution on single node with mpirun"
2690                mpirun  -np $numprocs  ./a.out  $ROPTS
2691             else
2692                (( i = 0 ))
2693                while (( i < ii ))
2694                do
2695                   echo "-h $i  -p $tasks_per_node  -e ./mpi_exec_shell"  >>  multinode_config
2696                   (( i = i + 1 ))
2697                done
2698
2699                echo "#!/bin/sh"                         >   mpi_exec_shell
2700                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
2701                echo "set -u"                            >>  mpi_exec_shell
2702                echo "F_ERRCNT=0"                        >>  mpi_exec_shell
2703                echo "MPIPROGINV=YES"                    >>  mpi_exec_shell
2704                echo "OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task" >>  mpi_exec_shell
2705                echo "cpurest=$cpurest"                  >>  mpi_exec_shell
2706                echo "fname=$fname"                      >>  mpi_exec_shell
2707                echo "localhost=$localhost"              >>  mpi_exec_shell
2708                echo "return_addres=$return_addres"      >>  mpi_exec_shell
2709                echo "return_username=$return_username"  >>  mpi_exec_shell
2710                echo "tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  mpi_exec_shell
2711                echo "write_binary=$write_binary"        >>  mpi_exec_shell
2712                echo "use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
2713                echo "  "                                >>  mpi_exec_shell
2714                echo "export F_ERRCNT"                   >>  mpi_exec_shell
2715                echo "export MPIPROGINV"                 >>  mpi_exec_shell
2716                echo "export OMP_NUM_THREADS"            >>  mpi_exec_shell
2717                echo "export cpurest"                    >>  mpi_exec_shell
2718                echo "export fname"                      >>  mpi_exec_shell
2719                echo "export localhost"                  >>  mpi_exec_shell
2720                echo "export return_addres"              >>  mpi_exec_shell
2721                echo "export return_username"            >>  mpi_exec_shell
2722                echo "export tasks_per_node"             >>  mpi_exec_shell
2723                echo "export write_binary"               >>  mpi_exec_shell
2724                echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
2725                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
2726                echo "exec  ./a.out"                     >>  mpi_exec_shell
2727
2728                chmod u+x  mpi_exec_shell
2729                export MPIPROGINF=YES
2730                mpirun  -f multinode_config  &
2731                wait
2732
2733             fi
2734          elif [[ $(echo $host | cut -c1-2) = lc  &&  $host != lctit ]]
2735          then
2736
2737                # COPY HOSTFILE FROM SOURCE DIRECTORY OR CREATE IT, IF IT
2738                # DOES NOT EXIST
2739             if [[ -f $hostfile ]]
2740             then
2741                cp  $hostfile  hostfile
2742             else
2743                (( ii = 1 ))
2744                while (( ii <= $numprocs / $threads_per_task ))
2745                do
2746                   echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2747                   (( ii = ii + 1 ))
2748                done
2749             fi
2750             (( ii = $numprocs / $threads_per_task ))
2751             eval zeile=\"`head -n $ii  hostfile`\"
2752             printf "\n  *** running on: $zeile"
2753             export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2754             if [[ $threads_per_task != 1 ]]
2755             then
2756                printf "\n      threads per task: $threads_per_task"
2757             fi
2758             if [[ $run_coupled_model = false ]]
2759             then
2760                printf "\n\n"
2761                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $ii  a.out  $ROPTS
2762             else
2763                ((  iii = ii / 2 ))
2764                printf "\n      coupled run ($iii atmosphere, $iii ocean)"
2765                printf "\n\n"
2766                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iii  -env coupling_mode atmosphere_to_ocean  a.out  $ROPTS  &
2767                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iii  -env coupling_mode ocean_to_atmosphere  a.out  $ROPTS  &
2768                wait
2769             fi
2770
2771#             if [[ $scirocco = true ]]
2772#             then
2773#                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $ii  a.out  $ROPTS
2774#             else
2775#                mpirun  -machinefile hostfile  -np $ii  a.out  $ROPTS
2776#             fi
2777
2778          elif [[ $host = decalpha ]]
2779          then
2780             dmpirun  -np $numprocs  a.out  $ROPTS
2781          elif [[ $host = lctit ]]
2782          then
2783             export runfile=runfile.$kennung
2784
2785             echo "cd $PWD"                                  >   $runfile
2786             echo "export OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS"  >>  $runfile
2787             echo "export cpurest=$cpurest"                  >>  $runfile
2788             echo "export fname=$fname"                      >>  $runfile
2789             echo "export localhost=$localhost"              >>  $runfile
2790             echo "export return_addres=$return_addres"      >>  $runfile
2791             echo "export return_username=$return_username"  >>  $runfile
2792             echo "export tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  $runfile
2793             echo "export write_binary=$write_binary"        >>  $runfile
2794             echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  $runfile
2795             echo "./a.out"                                  >>  $runfile
2796             chmod  u+x  $runfile
2797
2798             if [[ "$QUEUE" = interactive ]]
2799             then
2800                mpirun  -np $numprocs  a.out  $ROPTS
2801             else
2802                 (( mem_tsubame = $memory / 1024.0 ))
2803                 echo "Memory for Tsubame for each process in GB:", $mem_tsubame
2804#                n1ge  -fore  -g 1S060156  -mpi $numprocs  -mem 4  -N palm  -q $queue  a.out  $ROPTS
2805               /n1ge/TITECH_GRID/tools/bin/n1ge -fore -g $group_number -mpi ${numprocs}:$tasks_per_node -mem $mem_tsubame -N palm -rt $minuten -q $queue  a.out  $ROPTS
2806             fi
2807
2808             rm  $runfile
2809          else
2810             mpprun  -n $numprocs  a.out  $ROPTS
2811          fi
2812          [[ $? != 0 ]]  &&  execution_error=true
2813
2814
2815             # PERFORMANCE-AUSWERTUNG MIT APPRENTICE
2816          if [[ "$cond1" = apprentice  ||  "$cond2" = apprentice ]]
2817          then
2818             apprentice
2819          fi
2820       else
2821          a.out  $ROPTS
2822       fi
2823    fi
2824    if [[ $? != 0  ||  $execution_error = true ]]
2825    then
2826
2827          # ABBRUCH BEI LAUFZEITFEHLER
2828#       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output*
2829       printf "\n  +++ runtime error occured"
2830       locat=execution
2831       exit
2832    else
2833#       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output*
2834       printf "\n$striche\n  *** execution finished \n"
2835    fi
2836
2837
2838
2839       # EVENTUELLE OUTPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
2840    (( i = 0 ))
2841    while (( i < ioc ))
2842    do
2843       (( i = i + 1 ))
2844       if (( i == 1 ))
2845       then
2846          printf "\n\n  *** execution of OUTPUT-commands:\n$striche"
2847       fi
2848       printf "\n  >>> ${out_command[$i]}"
2849       eval  ${out_command[$i]}
2850       if (( i == ioc ))
2851       then
2852          printf "\n$striche\n"
2853       fi
2854    done
2855
2856
2857       # EVTL. INHALT DES AKTUELLEN VERZEICHNISSES AUSGEBEN
2858    if [[ $do_trace = true ]]
2859    then
2860       printf "\n\n"
2861       ls -al
2862    fi
2863
2864
2865
2866       # OUTPUT-DATEIEN AN IHRE ZIELORTE KOPIEREN
2867    (( i = 0 ))
2868    while (( i < iout ))
2869    do
2870       (( i = i + 1 ))
2871       if (( i == 1 ))
2872       then
2873          printf "\n\n  *** saving OUTPUT-files:\n$striche"
2874       fi
2875
2876          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
2877       files_for_pes=false; filetyp=file
2878       if [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
2879       then
2880          files_for_pes=true; filetyp=directory
2881          actionout[$i]=""
2882       elif [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
2883       then
2884          actionout[$i]=""
2885       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
2886       then
2887          files_for_pes=true; filetyp=directory
2888          actionout[$i]="ar"
2889       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2890       then
2891          actionout[$i]="ar"
2892       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
2893       then
2894          files_for_pes=true; filetyp=directory
2895          actionout[$i]="fl"
2896       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2897       then
2898          actionout[$i]="fl"
2899       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  -n $numprocs ]]
2900       then
2901          files_for_pes=true; filetyp=directory
2902          actionout[$i]="tr"
2903       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2904       then
2905          actionout[$i]="tr"
2906       fi
2907
2908       if [[ ! -f ${localout[$i]}  &&  $files_for_pes = false ]]
2909       then
2910          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}  does not exist\n"
2911       elif [[ ! -f ${localout[$i]}/_0000  &&  $files_for_pes = true ]]
2912       then
2913          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}/....  does not exist\n"
2914       else
2915
2916
2917             # KOPIEREN PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
2918             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
2919             # REMOTE-RECHNUNGEN
2920          if [[ "${actionout[$i]}" = tr ]]
2921          then
2922             if [[ $localhost != $fromhost ]]
2923             then
2924                if [[ $files_for_pes = false ]]
2925                then
2926                   cps=""
2927                   cst=""
2928                else
2929                   cps=-c
2930                   cst="/"
2931                fi
2932                if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
2933                then
2934
2935                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
2936                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
2937                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
2938                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
2939                   if [[ $files_for_pes = false ]]
2940                   then
2941                      ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
2942                   else
2943                      mkdir  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
2944                      ln  ${localout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
2945                   fi
2946
2947                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
2948                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
2949
2950                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP in seperate job to"
2951                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst"
2952                   printf "\n              or higher cycle\n"
2953                   echo "batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
2954
2955                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
2956
2957                   if [[ $localhost = nech ]]
2958                   then
2959                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
2960                   else
2961                      if [[ "$LOGNAME" = b323013 ]]
2962                      then
2963                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
2964                      else
2965                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
2966                      fi
2967                   fi
2968
2969                else
2970
2971                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
2972                   transfer_failed=false
2973                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP to"
2974                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst\n"
2975                   batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
2976                   [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
2977
2978                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
2979                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
2980                   if [[ $transfer_failed = true ]]
2981                   then
2982                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
2983                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
2984
2985                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
2986                         # ANLEGEN.
2987                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
2988                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
2989                      then
2990                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
2991                         printf "      $local_catalog \n"
2992                         mkdir -p  $local_catalog
2993                      fi
2994                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
2995                      transfer_problems=true
2996                   fi
2997                fi
2998             else
2999
3000                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR KOPIERT WIRD
3001                actionout[$i]=""
3002             fi
3003          fi
3004
3005
3006             # APPEND PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
3007             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
3008             # REMOTE-RECHNUNGEN
3009          if [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
3010          then
3011             if [[ $localhost != $fromhost ]]
3012             then
3013                if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
3014                then
3015
3016                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
3017                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3018                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
3019                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
3020                   ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3021
3022                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
3023                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
3024
3025                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP in seperate job to"
3026                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}"
3027                   printf "\n              or higher cycle\n"
3028                   echo "batch_scp -A -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3029
3030                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
3031
3032                   if [[ $localhost = nech ]]
3033                   then
3034                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3035                   else
3036                      if [[ $LOGNAME = b323013 ]]
3037                      then
3038                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3039                      else
3040                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3041                      fi
3042                   fi
3043
3044                else
3045
3046                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
3047                   transfer_failed=false
3048                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP to"
3049                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n"
3050                   batch_scp -A -b -m -u $return_username  $return_addres ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3051                   [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3052
3053                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
3054                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
3055                   if [[ $transfer_failed = true ]]
3056                   then
3057                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
3058                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
3059
3060                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
3061                         # ANLEGEN
3062                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
3063                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
3064                      then
3065                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
3066                         printf "      $local_catalog \n"
3067                         mkdir -p  $local_catalog
3068                      fi
3069
3070                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
3071                      transfer_problems=true
3072                   fi
3073                fi
3074             else
3075
3076                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR APPEND AUF
3077                   # LOKALER MASCHINE DURCHGEFUEHRT WIRD
3078                actionout[$i]=a
3079             fi
3080          fi
3081
3082
3083             # OUTPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. DATEI WIRD PER
3084             # LINK AUF DEN TEMPORAEREN DATENKATALOG GELEGT. OPTION -f WIRD
3085             # VERWENDET, FALLS DORT NOCH EINE DATEI GLEICHEN NAMENS VORHANDEN
3086             # SEIN SOLLTE. ANSCHLIESSEND WIRD SEINE ARCHIVIERUNG ANGESTOSSEN
3087          if [[ "${actionout[$i]}" = fl ]]
3088          then
3089             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3090             chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3091             if [[ $files_for_pes = false ]]
3092             then
3093                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3094                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3095                ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3096             else
3097                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/....  to"
3098                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3099                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3100                ln -f  ${localout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3101             fi
3102
3103
3104                # ARCHIVIERUNGSJOB WIRD ERZEUGT UND ABGESCHICKT
3105             if [[ $store_on_archive_system = true ]]
3106             then
3107
3108                if [[ $archive_system = asterix ]]
3109                then
3110                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3111                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3112                   then
3113                      echo "stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3114                   else
3115                      echo "stageout -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3116                   fi
3117                   echo "cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"               >> archive_${frelout[$i]}
3118                   echo "if [[ \$(grep -c \"st.msg:150\"  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung) != 0 ]]" >> archive_${frelout[$i]}
3119                   echo "then"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3120                   echo "   do_stageout=false"                       >> archive_${frelout[$i]}
3121                   echo "else"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3122                   echo "   echo \"  +++ $filetyp ${frelout[$i]}  could not be stored on archive-system\" " >> archive_${frelout[$i]}
3123                   echo "   cat  /dev/null  >  ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname" >> archive_${frelout[$i]}
3124                   echo "   cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung  >  ~/job_queue/archive_${frelout[$i]}_error" >> archive_${frelout[$i]}
3125                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} will be copied to \$WORK as backup\" " >> archive_${frelout[$i]}
3126                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3127                   then
3128                      echo "   cp   ${frelout[$i]}  \$WORK"                    >> archive_${frelout[$i]}
3129                   else
3130                      echo "   cp -r  ${frelout[$i]}  \$WORK/${frelout[$i]}"   >> archive_${frelout[$i]}
3131                   fi
3132                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} saved\" " >> archive_${frelout[$i]}
3133                   echo "fi"                                         >> archive_${frelout[$i]}
3134                   echo "rm  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"              >> archive_${frelout[$i]}
3135                elif [[ $archive_system = DMF ]]
3136                then
3137                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3138                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3139                   then
3140                      printf "\n  +++ archiving of single files impossible with $archive_system !\n"
3141                      locat=DMF
3142                      exit
3143                   else
3144                         # FUER RECHNER IN JUELICH. DORT KOENNTEN AUCH
3145                         # EINZELNE DATEIEN GESICHERT WERDEN (SPAETER KORR.)
3146                      echo "rm -rf  \$ARCHIVE/${frelout[$i]}"     >> archive_${frelout[$i]}
3147                      echo "cp -r  ${frelout[$i]}  \$ARCHIVE"     >> archive_${frelout[$i]}
3148                   fi
3149                elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3150                then
3151                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3152                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3153                   then
3154                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3155                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3156                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3157                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3158                   else
3159
3160                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3161                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3162                      echo "[[ ! -d \$PERM/${frelout[$i]} ]] && mkdir $PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3163                      cd  $tmp_data_catalog
3164                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3165                      cd -  > /dev/null
3166                      (( inode = 0 ))
3167                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3168                      while (( inode < nodes ))
3169                      do
3170#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3171                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3172                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3173#                         echo "*** tasks_per_node = \"$tasks_per_node\" "
3174#                         echo "*** files = \"$files\" "
3175#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3176                         echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3177                         echo "dsmc incremental  \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar" >> archive_${frelout[$i]}
3178                         echo "dsmmigrate \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar"        >> archive_${frelout[$i]}
3179                         (( inode = inode + 1 ))
3180                      done
3181#                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3182#                      echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3183                   fi
3184                elif [[ $archive_system = ut ]]
3185                then
3186                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3187                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3188                   then
3189                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3190                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3191                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3192                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3193                   else
3194
3195                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3196                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3197                      echo "[[ ! -d \$UT/${frelout[$i]} ]] && mkdir $UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3198                      cd  $tmp_data_catalog
3199                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3200                      cd -  > /dev/null
3201                      (( inode = 0 ))
3202                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3203                      while (( inode < nodes ))
3204                      do
3205                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3206                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3207                         echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3208                         (( inode = inode + 1 ))
3209                      done
3210                   fi
3211                elif [[ $archive_system = none ]]
3212                then
3213                   printf "              +++ archiving on $localhost not available!\n"
3214                fi
3215
3216                if [[ $archive_system != none ]]
3217                then
3218                   if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb ]]
3219                   then
3220#                      subjob  -d  -v  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  archive_${frelout[$i]}
3221                      subjob   -v  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  archive_${frelout[$i]}
3222                   elif [[ $localhost = nech ]]
3223                   then
3224                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  archive_${frelout[$i]}
3225                   fi
3226                   printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3227                fi
3228             else
3229                printf "              +++ caution: option -A is switched on. No archiving on $archive_system!\n"
3230             fi
3231
3232
3233                # LEERDATEI IM BENUTZERVERZEICHNIS ANLEGEN, DAMIT BEKANNT IST,
3234                # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3235             if [[ $files_for_pes = false ]]
3236             then
3237                cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3238             else
3239                mkdir -p  ${pathout[$i]}
3240             fi
3241
3242          fi
3243
3244
3245             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE ZUM ARCHIV-SYSTEM
3246             # AUSSERDEM MUSS LEERDATEI ANGELEGT WERDEN, DAMIT BEKANNT IST,
3247             # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3248             # FALLS IRGENDEINE (VON MEHREREN) ARCHIVIERUNGEN SCHIEF GEHT,
3249             # WIRD FLAG GESETZT UND BLEIBT AUCH BEI WEITEREN ORDNUNGS-
3250             # GEMAESSEN ARCHIVIERUNGEN GESETZT
3251          if [[ "${actionout[$i]}" = ar ]]
3252          then
3253             if [[ $files_for_pes = false ]]
3254             then
3255                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3256                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3257                printf "\n              File will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3258             else
3259                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to"
3260                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3261                printf "\n              Directory will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3262             fi
3263             mv  ${localout[$i]}  ${frelout[$i]}
3264
3265             file_saved=false
3266
3267             if [[ $archive_system = asterix ]]
3268             then
3269                do_stageout=true
3270                (( stageout_anz = 0 ))
3271                while [[ $do_stageout = true ]]
3272                do
3273                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3274                   then
3275                      stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3276                   else
3277                      stageout  -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3278                   fi
3279                   cat  STAGE_OUTPUT
3280                   if [[ $(grep -c "st.msg:150"  STAGE_OUTPUT) != 0 ]]
3281                   then
3282                      file_saved=true
3283                      do_stageout=false
3284                   else
3285                      if [[ $files_for_pes = false ]]
3286                      then
3287                         printf "\n  +++ file ${frelout[$i]}  could not be saved on archive-system"
3288                      else
3289                         printf "\n  +++ directory ${frelout[$i]} could not be saved on archive-system"
3290                      fi
3291                      (( stageout_anz = stageout_anz + 1 ))
3292                      if (( stageout_anz == 10 ))
3293                      then
3294                         printf "\n  +++ stoped after 10 unsuccessful tries!"
3295                         archive_save=false
3296                         do_stageout=false
3297                      else
3298                         printf "\n  *** new try to store on archive after 15 min:"
3299                         sleep 900
3300                      fi
3301                   fi
3302                done
3303             elif [[ $archive_system = DMF ]]
3304             then
3305                if [[ $files_for_pes = false ]]
3306                then
3307                   printf "\n  +++ archiving of single files impossible on $archive_system!\n"
3308                   locat=DMF
3309                   exit
3310                else
3311                   rm -rf  $ARCHIVE/${frelout[$i]}
3312                   cp -r  ${frelout[$i]}  $ARCHIVE
3313                fi
3314                file_saved=true
3315             elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3316             then
3317                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3318                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3319                   # GELEGT WERDEN
3320                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3321                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3322                if [[ $files_for_pes = false ]]
3323                then
3324                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3325                else
3326                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3327                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3328                fi
3329
3330                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3331                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3332                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3333                if [[ $files_for_pes = false ]]
3334                then
3335                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3336                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3337                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3338                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3339                else
3340                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3341                   echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3342                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3343                fi
3344
3345                subjob  -v  -d  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  archive_${frelout[$i]}
3346                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3347                file_saved=true
3348
3349             elif [[ $archive_system = ut ]]
3350             then
3351                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3352                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3353                   # GELEGT WERDEN
3354                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3355                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3356                if [[ $files_for_pes = false ]]
3357                then
3358                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3359                else
3360                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3361                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3362                fi
3363
3364                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3365                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3366                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3367                if [[ $files_for_pes = false ]]
3368                then
3369                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3370                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3371                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3372                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3373                else
3374                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3375                   echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3376                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3377                fi
3378
3379                subjob  -v  -c /pf/b/$usern/job_queue  -d  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  archive_${frelout[$i]}
3380                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3381                file_saved=true
3382
3383             else
3384                printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"  archiving impossible!"
3385                archive_save=false
3386             fi
3387             if [[ $file_saved = true ]]
3388             then
3389                if [[ $files_for_pes = false ]]
3390                then
3391                   cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3392                else
3393                   mkdir -p  ${pathout[$i]}
3394                fi
3395             fi
3396          fi
3397
3398             # APPEND AUF LOKALER MASCHINE
3399          if [[ "${actionout[$i]}" = "a" ]]
3400          then
3401             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append to  ${pathout[$i]}\n"
3402             cat  ${localout[$i]}  >>  ${pathout[$i]}
3403          fi
3404
3405             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE
3406             # ES MUSS KOPIERT WERDEN, DA MOVE NICHT UEBER FILESYSTEM HINAUS MOEGLICH
3407          if [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = false ]]
3408          then
3409
3410                # KOPIEREN AUF EINPROZESSORMASCHINE
3411             if [[ "${extout[$i]}" != " "  &&  "${extout[$i]}" != "" ]]
3412             then
3413                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}\n"
3414                cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}
3415             else
3416                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}\n"
3417                cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3418             fi
3419
3420          elif [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = true ]]
3421          then
3422
3423                # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
3424                # DATEIEN WERDEN ERST IN EINEM KATALOG GESAMMELT UND DIESER
3425                # WIRD DANN KOPIERT
3426                # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
3427             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to  ${pathout[$i]}\n"
3428             cp -r  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3429
3430          fi
3431       fi
3432    done
3433    if (( i != 0 ))
3434    then
3435       if [[ $transfer_problems = true ]]
3436       then
3437          printf "\n$striche\n  *** OUTPUT-files saved"
3438          printf "\n  +++ WARNING: some data transfers failed! \n"
3439       else
3440          printf "\n$striche\n  *** all OUTPUT-files saved \n"
3441       fi
3442    fi
3443
3444
3445       # EVENTUELL FOLGEJOB STARTEN
3446       # DATEI CONTINUE_RUN MUSS VOM BENUTZERPROGRAMM AUS ERZEUGT WERDEN
3447    if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
3448    then
3449
3450       if [[ $archive_save = true ]]
3451       then
3452
3453             # ZUERST IN MRUN-AUFRUF OPTIONEN FUER FORTSETZUNGSLAUF, FUER
3454             # STILLES ABARBEITEN (OHNE INTERAKTIVE RUECKFAGEN) UND FUER
3455             # BATCH-BETRIEB (NUR WICHTIG, FALLS BATCH AUF LOKALER MASCHINE
3456             # DURCHGEFUEHRT WERDEN SOLL) EINFUEGEN, FALLS NICHT BEREITS VOR-
3457             # HANDEN
3458          [[ $(echo $mc | grep -c "\-C") = 0 ]]  &&  mc="$mc -C"
3459          [[ $(echo $mc | grep -c "\-v") = 0 ]]  &&  mc="$mc -v"
3460          [[ $(echo $mc | grep -c "\-b") = 0 ]]  &&  mc="$mc -b"
3461          if [[ $(echo $mc | grep -c "#") != 0 ]]
3462          then
3463             mc=`echo $mc | sed 's/#/f/g'`
3464          fi
3465
3466
3467             # JOB STARTEN
3468          printf "\n\n  *** initiating restart-run on \"$return_addres\" using command:\n"
3469          echo "      $mc"
3470          printf "\n$striche\n"
3471          if [[ $localhost != $fromhost ]]
3472          then
3473
3474             if [[ $localhost = nech  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms  ||  $localhost = lctit ]]
3475             then
3476                echo "*** ssh will be used to initiate restart-runs!"
3477                echo "    return_addres=\"$return_addres\" "
3478                echo "    return_username=\"$return_username\" "
3479                if [[ $return_addres = 172.20.25.41 ]]
3480                then
3481                      # WORKAROUND AUF SCIROCCO AM TIT
3482                   print  "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "  |  ssh $return_addres -l $return_username 
3483                else
3484                   ssh $return_addres -l $return_username "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "
3485                fi
3486             else
3487                printf "\n  +++ no restart mechanism available for host \"$localhost\" "
3488                locat=restart; exit
3489             fi
3490
3491                # WARTEN, DAMIT SICH RESTART JOB IN QUEUE EINREIHEN KANN, BEVOR
3492                # DER AKTUELLE JOB ENDET
3493             sleep 30
3494
3495          else
3496
3497                # BEI RECHNUNGEN AUF LOKALER MASCHINE KANN MRUN DIREKT AUFGE-
3498                # RUFEN WERDEN, AUSSER AUF lcfimm
3499             cd $LOCAL_PWD
3500             if [[ $localhost = lcfimm ]]
3501             then
3502                ssh $return_addres -l $return_username "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc " 
3503             else
3504                eval  $mc                # ' MUESSEN AUSGEWERTET WERDEN
3505             fi
3506             cd -  > /dev/null
3507          fi
3508          printf "\n$striche\n  *** restart-run initiated \n"
3509
3510
3511             # EVENTUELL INPUT-DATEIEN, DIE VON TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS
3512             # GEHOLT WORDEN SIND, LOESCHEN
3513          (( i = 0 ))
3514          while (( i < iin ))
3515          do
3516             (( i = i + 1 ))
3517             if [[ "${got_tmp[$i]}" = true   &&  $keep_data_from_previous_run = false ]]
3518             then
3519                rm -r  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
3520             fi
3521          done
3522
3523       else
3524
3525          printf "\n  +++ no restart-run possible, since errors occured"
3526          printf "\n      during the archive process"
3527       fi
3528
3529    fi
3530
3531
3532   
3533       # EVTL. EMAIL-BENACHRICHTIGUNG UEBER ABGESCHLOSSENEN LAUF
3534    if [[ "$email_notification" != "" ]]
3535    then
3536
3537       if [[ $localhost != $fromhost ]]
3538       then
3539          if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
3540          then
3541             echo "PALM restart run necessary"        >   email_text
3542             echo "description header of actual run:" >>  email_text
3543             cat  CONTINUE_RUN                        >>  email_text
3544             echo "mrun-command to restart:"          >>  email_text
3545             echo "$mc"                               >>  email_text
3546          else
3547             echo "PALM run with base filename \"$fname\" on host \"$localhost\" finished"  >  email_text
3548          fi
3549          mail  $email_notification  <  email_text
3550          printf "\n  *** email notification sent to \"$email_notification\" "
3551       fi
3552    fi
3553
3554
3555
3556       # ALLE ARBEITEN BEENDET. TEMPORAERER KATALOG KANN GELOESCHT WERDEN
3557    cd  $HOME
3558    [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
3559
3560 else
3561
3562
3563       # FALLS AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
3564       # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
3565
3566       # MRUN-BEFEHL FUER REMOTE-MASCHINE ZUSAMMENSTELLEN
3567    mrun_com="$mrun_script_name -a $afname -c $config_file -d $fname -h $host -H $fromhost -m $memory -t $cpumax -q $queue -R $return_addres -U $return_username -u $remote_username"
3568    [[ "$cpp_opts" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -D \"$cpp_opts\""
3569    [[ "$global_revision" != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -G \"$global_revision\""
3570    [[ $group_number != none ]]   &&  mrun_com=${mrun_com}" -g $group_number"
3571    [[ $do_compile = true ]]      &&  mrun_com=${mrun_com}" -s \"$source_list\""
3572    [[ "$input_list" != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -i \"$input_list\""
3573    [[ $ignore_archive_error = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -I"
3574    [[ $keep_data_from_previous_run = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -k"
3575    [[ "$additional_conditions" != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -K \"$additional_conditions\""
3576#    [[ "$makefile" != "$source_path/Makefile" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -M \"$makefile\""
3577    [[ "$output_list" != "" ]]    &&  mrun_com=${mrun_com}" -o \"$output_list\""
3578    [[ "$read_from_config" = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -S"
3579    [[ $do_trace = true ]]        &&  mrun_com=${mrun_com}" -x"
3580    [[ "$numprocs" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -X $numprocs"
3581    if [[ $use_openmp = true ]]
3582    then
3583       mrun_com=${mrun_com}" -O"
3584       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $threads_per_task"
3585    else
3586       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $tasks_per_node"
3587    fi
3588    [[ $store_on_archive_system = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -A"
3589    [[ $package_list != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -p \"$package_list\""
3590    [[ $return_password != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -P $return_password"
3591    [[ $delete_temporary_catalog = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -B"
3592    [[ $node_usage != default  &&  "$(echo $node_usage | cut -c1-3)" != "sla"  &&  $node_usage != novice ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -n $node_usage"
3593    [[ $run_coupled_model = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -Y"
3594    if [[ $do_remote = true ]]
3595    then
3596       printf "\n>>>> MRUN-command on execution host:\n>>>> $mrun_com \n"
3597    fi
3598
3599
3600       # ZUSAMMENSTELLUNG DES JOBSCRIPTS AUF DATEI jobfile
3601    jobfile=jobfile.$RANDOM
3602
3603
3604       # TEMPORAERES VERZEICHNIS GENERIEREN UND NACH DORT WECHSELN
3605    echo  "mkdir  $TEMPDIR"      >>  $jobfile
3606    echo  "cd  $TEMPDIR"         >>  $jobfile
3607
3608
3609       # EVENTUELL FEHLERVERFOLGUNG AKTIVIEREN
3610    if [[ $do_trace = true ]]
3611    then
3612       echo  "set -x"                                    >>  $jobfile
3613    else
3614       echo  "set +vx"                                   >>  $jobfile
3615    fi
3616
3617
3618       # ABSPEICHERN DER QUELLTEXTE (NUR FALLS UEBERSETZT WERDEN SOLL)
3619       # SOWIE GEGEBENENFALLS DES MAKEFILES
3620    if [[ $do_compile = true ]]
3621    then
3622
3623       source_catalog=SOURCES_FOR_RUN_$fname
3624
3625           # UNTERVERZEICHNIS FUER QUELLTEXTE UND MAKEFILE ANLEGEN
3626           # MRUN WIRD DIESES VRZEICHNIS UEBER ENVIRONMENT VARIABLE
3627           # MITGETEILT (UEBERSTEUERT ANGABE IN KONFIGURATIONSDATEI)
3628       echo  "mkdir  SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
3629       echo  "export SOURCES_COMPLETE=true"                 >>  $jobfile
3630       echo  "cd     SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
3631
3632       for  filename  in  $source_list
3633       do
3634             # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3635          echo  "cat > $filename << \"%END%\""              >>  $jobfile
3636          cat   $source_catalog/$filename                   >>  $jobfile
3637          echo  " "                                         >>  $jobfile
3638          echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
3639          echo  " "                                         >>  $jobfile
3640       done
3641
3642          # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3643       echo  "cat > Makefile << \"%END%\""               >>  $jobfile
3644       cat   $source_catalog/Makefile                    >>  $jobfile
3645       echo  " "                                         >>  $jobfile
3646       echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
3647       echo  " "                                         >>  $jobfile
3648
3649       echo  "cd -  > /dev/null"                         >>  $jobfile
3650
3651    fi
3652
3653
3654       # ABSPEICHERN DER KONFIGURATIONSDATEI
3655       # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3656    echo  "cat > $config_file << \"%END%\""      >>  $jobfile
3657    cat   $config_file                           >>  $jobfile
3658    echo  "%END%"                                >>  $jobfile
3659    echo  " "                                    >>  $jobfile
3660
3661
3662       # ABSPEICHERN DER AKTUELLEN MRUN-VERSION
3663       # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3664    echo  "cat > $mrun_script_name <<\"%END%\""  >>  $jobfile
3665    cat   ${PALM_BIN}/$mrun_script_name          >>  $jobfile
3666    echo  "%END%"                                >>  $jobfile
3667    if [[ $host = lctit ]]
3668    then
3669       echo "sed 's/bin\/ksh/home2\/usr5\/mkanda\/pub\/ksh/' < $mrun_script_name > mrun_new" >>  $jobfile
3670       echo "mv  mrun_new  $mrun_script_name"    >>  $jobfile
3671    fi
3672    echo  "chmod u+x $mrun_script_name"          >>  $jobfile
3673    echo  "execute_mrun=true"                    >>  $jobfile
3674    echo  " "                                    >>  $jobfile
3675
3676       # EVTL. BENOETIGTE INPUT-DATEIEN PER FTP HOLEN ODER DEM JOB DIREKT
3677       # MITGEBEN UND AUF DEM REMOTE-RECHNER IM BENUTZERVERZEICHNIS ABLEGEN
3678       # FALLS DIESES NICHT EXISTIERT, WIRD VERSUCHT, DAS JEWEILS LETZTE
3679       # UNTERVERZEICHNIS DES PFADNAMENS ANZULEGEN
3680    if [[ $do_remote = true ]]
3681    then
3682       (( i = 0 ))
3683       while (( i < iin ))
3684       do
3685          (( i = i + 1 ))
3686          echo  "[[ ! -d ${pathin[$i]} ]]  &&  mkdir -p  ${pathin[$i]}"  >>  $jobfile
3687          if [[ "${transin[$i]}" = job ]]
3688          then
3689             echo  "cat > ${remotepathin[$i]} <<\"%END%\""    >>  $jobfile
3690             eval cat   ${pathin[$i]}/${frelin[$i]}           >>  $jobfile
3691             echo  " "                                        >>  $jobfile
3692             echo  "%END%"                                    >>  $jobfile
3693          else
3694             echo  "batch_scp -b -o -g -s -u $return_username $return_addres ${remotepathin[$i]} \"${pathin[$i]}\" ${frelin[$i]}" >>  $jobfile
3695          fi
3696
3697             # UEBERPRUEFEN, OB DATEI ANGELEGT WERDEN KONNTE
3698          echo  "if [[ \$? = 1 ]]"                    >>  $jobfile
3699          echo  "then"                                >>  $jobfile
3700          echo  "   echo \" \" "                      >>  $jobfile
3701          echo  "   echo \"+++ file ${remotepathin[$i]} could not be created\" "   >>  $jobfile
3702          echo  "   echo \"    please check, if directory exists on $host!\" "  >>  $jobfile
3703          echo  "   echo \"+++ MRUN will not be continued\" "  >>  $jobfile
3704          echo  "   execute_mrun=false"               >>  $jobfile
3705          echo  "fi"                                  >>  $jobfile
3706       done
3707    fi
3708
3709       # ARBEITSKATALOG AUF DER LOKALEN MASCHINE FUER EVENTUELLE
3710       # FORTSETZUNGSLAUEFE PER ENV-VARIABLE UEBERGEBEN
3711    echo  "LOCAL_PWD=$working_directory"                >>  $jobfile
3712    echo  "export LOCAL_PWD"                            >>  $jobfile
3713
3714       # EBENSO LOKALEN MRUN-KATALOG UEBERGEBEN
3715    echo  "LOCAL_MRUN_PATH=$PALM_BIN"                   >>  $jobfile
3716    echo  "export LOCAL_MRUN_PATH"                      >>  $jobfile
3717
3718       # WORKAROUND FUER RIAM-NEC-JOBS WEGEN PROFILE-SCHWIERIGKEITEN
3719    if [[ $localhost_realname = "gate"  ||  $localhost = lctit ]]
3720    then
3721       echo  "export PALM_BIN=$PALM_BIN"                >>  $jobfile
3722    fi
3723
3724       # MRUN AUF ZIELRECHNER AUFRUFEN
3725    echo  "set -x"                                      >>  $jobfile
3726    echo  "[[ \$execute_mrun = true ]]  &&  ./$mrun_com"  >>  $jobfile
3727
3728    echo  'ls -al; echo `pwd`'                          >>  $jobfile
3729    echo  "cd \$HOME"                                   >>  $jobfile
3730    echo  "rm -rf  $TEMPDIR"                            >>  $jobfile
3731
3732
3733
3734
3735       # JOB PER SUBJOB STARTEN
3736    if [[ $silent = false ]]
3737    then
3738       printf "\n     "
3739    else
3740       printf "\n\n"
3741    fi
3742
3743    subjob  $job_on_file  -h $host  -u $remote_username -g $group_number -q $queue  -m $memory  -N $node_usage -t $cpumax  $XOPT  $TOPT  $OOPT  -n $fname  -v   $jobfile
3744    rm -rf  $jobfile
3745
3746
3747 fi  # ENDE REMOTE-TEIL
3748
3749
3750
3751     # ENDE DER PROZEDUR
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.