source: palm/tags/release-3.4/SCRIPTS/mrun @ 4355

Last change on this file since 4355 was 109, checked in by letzel, 14 years ago
  • Bugfix in surface_coupler
  • mrun: completely remove workaround on lcfimm to propagate environment

variables out to the nodes in coupled mode

  • Property svn:keywords set to Rev
File size: 138.7 KB
Line 
1#!/bin/ksh
2# mrun - Plot-Shellskript
3# $Id: mrun 61 2007-03-12 05:42:06Z raasch $
4
5     # Prozedur zum Starten von Modellaeufen
6
7     # letzte Aenderung:
8     # 03/03/94 - Siggi - Entwicklungsbeginn
9     # 21/03/94 - Siggi - Entwicklungsabschluss (Version 1.0)
10     # 09/12/94 - Siggi - allexport unterbunden; statt dessen werden jetzt ein-
11     #                    zelne Variable exportiert. Dies ist noetig, weil an-
12     #                    sonsten irgendein Speicher ueberlaeuft und von mrun
13     #                    aufgerufene Programme (z.B. stageout) mit Fehlern
14     #                    abbrechen (too many arguments)
15     # 20/06/95 - Siggi - noclobber muss explizit abgeschaltet, da jetzt
16     #                    defaultmaessig im RRZN-Profile eingeschaltet
17     # 10/06/97 - Siggi - Zusaetzliche Option -C bei cpp, damit // nicht
18     #                    wegfallen
19     # 25/04/00 - Siggi - Version 1.5
20     #                    remote_addres und remote_user in return_addres bzw.
21     #                    return_username umbenannt, return_username wird dem
22     #                    mrun-Aufruf im Job ueber Option -U mitgegeben.
23     #                    Neue Variable remote_username, die beim interaktiven
24     #                    mrun-Aufruf zwingend ueber die neue Option -u oder
25     #                    in der Konfigurationsdatei angegeben werden muss.
26     # 08/02/01 - Siggi - Alle mrun-Meldungen ins englische uebersetzt,
27     #                    Version 1.7
28     # 05/05/02 - Siggi - Uebersetzungen mittels make-Mechanismus moeglich
29     # 21/11/02 - Siggi - ENV-Variable XLFRTEOPTS wird vor Ausfuehrung auf
30     #                    IBM gesetzt, um Record-Laenge der NAMELIST-Dateien,
31     #                    zu bestimmen; Praeprozessoroptionen haben nun alle
32     #                    die Form -Dtext=text, weil auf IBM sonst text durch
33     #                    die leere Zeichenkette ersetzt wird
34     # 01/08/03 - Siggi  - Test of implementing dvrp+1PE on ibm
35     # 07/01/04 - Siggi  - additional preprocessor directive for ibm included
36     #                     (-D$OMP=OMP) in order to avoid problems with
37     #                     OMP_NUM_THREADS
38     # 04/01/05 - Siggi  - archiving on hanni and berni is done in separate
39     #                     tar files, one for each node used
40     # 07/01/04 - Siggi  - old code for t3e, vpp and hpcs eliminated
41     # 09/01/05 - Siggi  - workaround for getting the IP address on gfdl3
42     # 17/01/05 - Siggi  - job for data transfer to local machine now within
43     #                     job class c1 (HLRN)
44     # 27/01/05 - Siggi  - IP address workaround for gfdl3 removed
45     # 28/01/05 - Siggi  - tar-filenames on $PERM (HLRN) now include the
46     #                     base filename and cycle number
47     # 16/02/05 - Gerald - hababai validated
48     # 14/03/05 - Siggi  - abort on NEC after first runtime error (F_ERRCNT)
49     # 29/03/05 - Marcus - berni*-en0 validated
50     # 21/04/05 - Siggi  - transfer-job-protocol for avs-data is no more stored
51     # 24/04/05 - Siggi  - netcdf support on lcmuk
52     # 25/04/05 - Siggi  - netcdf support on gfld3 (decalpha)
53     # 11/05/05 - Siggi  - files with non-numeric extensions (.xxx after cycle
54     #                     number) can now be used within interactive runs
55     # 12/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibm
56     # 13/05/05 - Siggi  - error in tar-filenames on $PERM (HLRN) removed
57     # 18/05/05 - Siggi  - netcdf support on nec
58     # 24/05/05 - Siggi  - netcdf support on ibms
59     # 14/06/05 - Siggi  - sleep interval after submit of restart job increased
60     #                     to 30 seconds
61     # 28/06/05 - Siggi  - bora adjusted to new intel compiler (LD_LIBRARY_
62     #                     PATH is temporarily set)
63     # 07/09/05 - Siggi  - setting of MP_EAGER_LIMIT switched off because it
64     #                     caused warnings in the job protocol
65     # 20/10/05 - Siggi  - update of netcdf-version on decalpha (gfdl3)
66     # 25/10/05 - Siggi  - error in listing files for getting the cycle number
67     #                     removed
68     # 26/10/05 - Siggi  - new paths for dvrp-library, transfer of catalogs
69     #                     realized by file attribute trpe
70     # 28/10/05 - Siggi  - if existing, the file extension is output in case
71     #                     of missing input file - no job abort in case of
72     #                     missing input files with file extensions
73     #                     (preliminary solution)
74     # 31/10/05 - Siggi  - data transfer from nech now within seperate job
75     # 04/11/05 - Siggi  - netcdf 3.6.0-p1 on ibmh/ibmb
76     # 07/12/05 - Siggi  - gallego and elephanta admitted
77     # 30/12/05 - Siggi  - gfdl5 (ibmy) admitted
78     # 10/01/06 - Siggi  - cpp directive for NetCDF 64bit support
79     # 20/01/06 - Siggi  - cpp directive for ibmy
80     # 09/02/06 - Siggi  - ibmy admitted for batch mode
81     # 13/04/06 - Siggi  - ostria admitted
82     # 18/04/06 - Siggi  - usage of OpenMP implemented (additional option -O)
83     # 10/05/06 - Siggi  - environment variable XLSMPOPTS set on IBM for
84     #                     optimization of OpenMP runs (option stacksize is
85     #                     necessary for large gridpoint numbers because
86     #                     otherwise a segmentation fault occurs)
87     # 23/05/05 - Siggi  - lctit (SUN Fire X4600) admitted
88     # 21/08/06 - Siggi  - standard mrun path on scirocco is as on bora
89     # 23/08/06 - Siggi  - netcdf support for scirocco (notebook)
90     # 20/09/06 - Marcus - add DVRP library on nech
91     # 24/10/06 - Siggi  - Environment variables for PALM steering are written
92     #                     on local NAMELIST file ENVPAR
93     # 24/11/06 - Siggi  - levanto admitted, maestro switched to ifc 9.1
94     # 28/11/06 - Siggi  - call to interpret_config.x_levanto because of SuSe 10
95     # 06/02/07 - Siggi  - add DVRP library on lcmuk
96     # 07/02/07 - Siggi  - revision of source code handling, source code is
97     #                     now expected in directory given by source_path and
98     #                     not in the current working directory, source code
99     #                     files provided in add_source_path are allways
100     #                     compiled, source code to be compiled is allways
101     #                     sampled in SOURCES_FOR_RUN_$fname which is a
102     #                     subdirectory of the current working directory,
103     #                     -s TEST  changed to  -s WRITE_PERMIT  or -s WP,
104     #                     adapted for RIAM (neck)
105     #                     bugfix for cycle number of output file (extout)
106     #                     all hpmuk-related code removed
107     # 14/02/07 - Siggi  - dvrp support for neck added
108     # 28/02/07 - Siggi  - empty lines in configuration file are accepted
109     #                     mrun_path replaced by PALM_BIN,
110     #                     all machines are calling interpret_config.x
111     # 14/03/07 - Siggi  - fimm admitted, revision number added to terminal
112     #                     output
113     # 16/03/07 - Siggi  - adjustments for lctit
114     # 29/03/07 - Siggi  - global revision transfered to batch job by new
115     #                     option -G
116     # 30/03/07 - Siggi  - compilation "by hand" removed, cpp-directives/options
117     #                     + netcdf/dvrp-options are read from configuration
118     #                     file, host identifier (local_host) is read from
119     #                     config file, code related to ftp filetransfer
120     #                     removed (incl. option -f)
121     # 19/06/07 - Siggi  - time limit for cdata jobs increased
122     # 25/07/07 - Siggi  - two sets of executables can be started on lcmuk,
123     #                     if new option -Y (coupling) is given,
124     #                     output of executables to aout_output removed,
125     #                     messages are immediately written to stdout instead
126     # 03/08/07 - Marcus - add XOPT="-X $numprocs" for lcfimm
127     # 09/08/07 - Marcus - workaround on lcfimm to propagate environment
128     #                     variables out to the nodes in coupled mode -disabled-
129     # 13/08/07 - Marcus - start local restart jobs per ssh on lcfimm
130     # 28/08/07 - Marcus - completely remove workaround on lcfimm to propagate
131     #                     environment variables out to the nodes in coupled mode
132
133 
134    # VARIABLENVEREINBARUNGEN + DEFAULTWERTE
135
136 set +o allexport    # SICHERHEITSHALBER UNTERBINDEN, DA SONST EVTL. STAGEOUT
137                     # NICHT LAUEFT (TOO MANY ARGUMENTS - PROBLEM)
138 set +o noclobber    # EXISTIERENDE DATEIEN DUERFEN UEBERSCHRIEBEN WERDEN
139
140 AddFilenames=""
141 additional_conditions=""
142 add_source_path=""
143 afname=""
144 archive_save=true
145 archive_system=none
146 compiler_name=""
147 cond1=""
148 cond2="" 
149 config_file=.mrun.config
150 cpp_opts=""
151 cpp_options=""
152 cpumax=0
153 cpurest=0
154 delete_temporary_catalog=true
155 do_batch=false
156 do_compile=true
157 do_remote=false
158 do_stagein=true
159 do_stageout=true
160 do_trace=false
161 email_notification=""
162 exclude=""
163 executable=""
164 execution_error=false
165 fimm=false
166 fname=test
167 fromhost=""
168 global_revision=""
169 host=""
170 host_file=""
171 hp=""
172 ignore_archive_error=false
173 input_list=""
174 interpreted_config_file=""
175 job_on_file=""
176 keep_data_from_previous_run=false
177 localhost_realname=$(hostname)
178 local_compile=false
179 locat=normal
180 mainprog=""
181 makefile=""
182 mc=$0
183 while [[ $(echo $mc | grep -c "/") != 0 ]]
184 do
185    mc=`echo $mc | cut -f2- -d"/"`
186 done
187 module_files=""
188 mrun_script_name=$mc
189 netcdf_inc=""
190 netcdf_lib=""
191 netcdf_support=false
192 node_usage=default
193 numprocs=""
194 OOPT=""
195 openmp=false
196 output_list=""
197 package_list=""
198 punkte="..........................................................."
199 queue=none
200 read_from_config=""
201 restart_run=false
202 return_addres=$(nslookup `hostname` 2>&1 | grep "Address:" | tail -1 | awk '{print $2}')
203 if [[ $return_addres = 130.75.105.158 ]]
204 then
205    return_addres=172.20.25.41
206    echo "+++ WARNING: return_addres changed to $return_addres !!!!!"
207 fi
208# if [[ $return_addres = 210.117.65.1 ]]
209# if [[ $(nslookup `hostname` 2>&1 | grep -c 210.117.65.1) = 1 ]]
210# then
211#    [[ $localhost_realname = gfdl3.yonsei.ac.kr ]]  &&  return_addres=165.132.26.56
212# fi
213 return_password=""
214 return_username=$LOGNAME
215 remotecall=false
216 remote_username=""
217 run_coupled_model=false
218 run_mode=""
219 scirocco=false
220 store_on_archive_system=true
221 striche="  ----------------------------------------------------------------------------"
222 silent=false
223 source_list=""
224 source_path=SOURCE
225 tasks_per_node=""
226 threads_per_task=1
227 tmpcreate=false
228 tmp_data_catalog=""
229 transfer_problems=false
230 usern=$LOGNAME
231 working_directory=`pwd`
232 TOPT=""
233 XOPT=""
234 zeit=$( date | cut -c 12-19 )
235
236 typeset -i  iec=0 iic=0 iin=0 ioc=0 iout=0 memory=0 stagein_anz=0 stageout_anz=0
237 typeset -i  cputime i ii iii icycle inode ival jobges jobsek maxcycle minuten nodes pes sekunden tp1
238
239 typeset  -R30 calltime
240 typeset  -L20 spalte1
241 typeset  -L40 spalte2
242 typeset  -L60 spalte3
243 typeset  -L35 string1=`date`
244 typeset  -L12 string2=$usern
245 typeset  -L12 string3=$localhost_realname
246 typeset  -L12 string4
247 typeset  -L12 string5
248 typeset  -L30 version="MRUN  2.0 Rev$Rev: 109 $"
249
250
251
252    # EINZELNE VARIABLE FUER HAUPTPROGRAMM EXPORTIEREN
253 export  cpurest fname host localhost return_addres return_username remotecall tasks_per_node
254
255    # FOLGENDE VARIABLEN MUESSEN FUER DIE INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI
256    # EXPORTIERT WERDEN
257 export  afname config_file cpp_opts cpumax do_batch do_trace fname fromhost
258 export  input_list memory numprocs output_list queue run_mode
259
260
261 
262    # FEHLERBEHANDLUNG
263    # BEI EXIT:
264 trap 'rm -rf  $working_directory/tmp_mrun
265       if [[ $locat != localhost ]]
266       then
267#          if [[ ! -f ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik ]]
268#          then
269#             cat  >  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik  <<  %STATEND%
270#MRUN-calls on $localhost
271#
272#date and time                      user        localhost   remotehost  termination mrun-command
273#--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
274#%STATEND%
275#             chmod  666  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
276#          fi
277#
278#             # EINTRAG IN DIE STATISTIK-DATEI
279#          string4=$host
280#          string5=$locat
281#          if [[ "$job_on_file" = ""  &&  $locat != control_c  &&  $locat != user_abort ]]
282#          then
283#             if [[ $do_batch = true ]]
284#             then
285#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mrun_com \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
286#             else
287#                printf "$string1$string2$string3$string4$string5$mc \n"  >>  ${mrun_path}/statistik/mrun_statistik
288#             fi
289#          fi
290          echo " " > /dev/null
291       fi
292
293       if [[ $locat != normal  &&  $locat != control_c  &&  $locat != local_compile ]]
294       then
295
296              # EVENTUELLE ERROR-KOMMANDOS ABARBEITEN
297          (( i = 0 ))
298          while (( i < iec ))
299          do
300             (( i = i + 1 ))
301             printf "\n  *** Execution of ERROR-command:\n"
302             printf "  >>> ${err_command[$i]}\n"
303             eval  ${err_command[$i]}
304          done
305          if [[ -n $interpreted_config_file ]]  then
306             rm -rf  $interpreted_config_file
307          fi
308          if [[ -n .mrun_environment ]]  then
309             rm -rf  .mrun_environment
310          fi
311          if [[ $tmpcreate = true ]]
312          then
313             printf "\n  *** Contents of \"$TEMPDIR\":\n"
314             ls -al; cd
315             [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
316          fi
317          if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
318          then
319             rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
320          fi
321          printf "\n\n+++ MRUN killed \n\n"
322       elif [[ $locat != control_c ]]
323       then
324          printf "\n\n --> all actions finished\n\n"
325          printf "     Bye, bye $usern !!\n\n"
326       fi' exit
327
328
329    # BEI TERMINAL-BREAK:
330 trap 'rm -rf  $working_directory/tmp_mrun
331       [[ $tmpcreate = true ]]  &&  (cd; rm -rf $TEMPDIR)
332       if [[ -f ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID ]]
333       then
334          rm -rf  ~/job_queue/JOBINFO.$QSUB_REQID
335       fi
336       printf "\n+++ MRUN killed by \"^C\" \n\n"
337       locat=control_c
338       exit
339      ' 2
340
341
342    # CHECK IF THE PATH FOR THE PALM BINARIES (SCRIPTS+UTILITY-PROGRAMS) HAS
343    # BEEN SET
344 if [[ "$PALM_BIN" = "" ]]
345 then
346    printf "\n  +++ environment variable PALM_BIN has not been set"
347    printf "\n      please set it to the directory where the PALM scripts are located"
348    locat=palm_bin; exit
349 fi
350
351
352
353    # SHELLSCRIPT-OPTIONEN EINLESEN UND KOMMANDO NEU ZUSAMMENSETZEN, FALLS ES
354    # FUER FOLGEJOBS BENOETIGT WIRD
355 while  getopts  :a:AbBc:Cd:D:FG:h:H:i:IkK:m:M:n:o:Op:P:q:r:R:s:St:T:u:U:vxX:Y option
356 do
357   case  $option  in
358       (a)   afname=$OPTARG;;
359       (A)   store_on_archive_system=false; mc="$mc -A";;
360       (b)   do_batch=true; mc="$mc -b";;
361       (B)   delete_temporary_catalog=false; mc="$mc -B";;
362       (c)   config_file=$OPTARG; mc="$mc -c$OPTARG";;
363       (C)   restart_run=true; mc="$mc -C";;
364       (d)   fname=$OPTARG; mc="$mc -d$OPTARG";;
365       (D)   cpp_opts="$cpp_opts $OPTARG"; mc="$mc -D$OPTARG";;
366       (F)   job_on_file="-D"; mc="$mc -F";;
367       (G)   global_revision=$OPTARG; mc="$mc -G'$OPTARG'";;
368       (h)   host=$OPTARG; mc="$mc -h$OPTARG";;
369       (H)   fromhost=$OPTARG; mc="$mc -H$OPTARG";;
370       (i)   input_list=$OPTARG; mc="$mc -i'$OPTARG'";;
371       (I)   ignore_archive_error=true; mc="$mc -I";;
372       (k)   keep_data_from_previous_run=true; mc="$mc -k";;
373       (K)   additional_conditions="$OPTARG"; mc="$mc -K$OPTARG";;
374       (m)   memory=$OPTARG; mc="$mc -m$OPTARG";;
375       (M)   makefile=$OPTARG; mc="$mc -M$OPTARG";;
376       (n)   node_usage=$OPTARG; mc="$mc -n$OPTARG";; 
377       (o)   output_list=$OPTARG; mc="$mc -o'$OPTARG'";;
378       (O)   use_openmp=true; mc="$mc -O";;
379       (p)   package_list=$OPTARG; mc="$mc -p'$OPTARG'";;
380       (P)   return_password=$OPTARG; mc="$mc -P$OPTARG";;
381       (q)   queue=$OPTARG; mc="$mc -q$OPTARG";;
382       (r)   run_mode=$OPTARG; mc="$mc -r'$OPTARG'";;
383       (R)   remotecall=true;return_addres=$OPTARG; mc="$mc -R$OPTARG";;
384       (s)   source_list=$OPTARG; mc="$mc -s'$OPTARG'";;
385       (S)   read_from_config=false; mc="$mc -S";;
386       (t)   cpumax=$OPTARG; mc="$mc -t$OPTARG";;
387       (T)   tasks_per_node=$OPTARG; mc="$mc -T$OPTARG";;
388       (u)   remote_username=$OPTARG; mc="$mc -u$OPTARG";;
389       (U)   return_username=$OPTARG; mc="$mc -U$OPTARG";;
390       (v)   silent=true; mc="$mc -v";;
391       (x)   do_trace=true;set -x; mc="$mc -x";;
392       (X)   numprocs=$OPTARG; mc="$mc -X$OPTARG";;
393       (Y)   run_coupled_model=true; mc="$mc -Y";;
394       (\?)  printf "\n  +++ unknown option $OPTARG \n"
395             printf "\n  --> type \"$0 ?\" for available options \n"
396             locat=parameter;exit;;
397   esac
398 done
399
400
401    # EVTL. POSITIONSPARAMETER EINLESEN
402    # ZUR ZEIT GIBT ES NUR DEN PARAMETER ? (=KURZINFO)
403 shift OPTIND-1
404
405
406    # KURZE AUFRUFBESCHREIBUNG WIRD HIER AUSGEGEBEN
407 if [[ "$1" = "?" ]]
408 then
409   (printf "\n  *** mrun can be called as follows:\n"
410    printf "\n      $mrun_script_name  -b -c.. -d.. -D.. -f.. -F -h.. -i.. -I -K.. -m.. -o.. -p.. -r.. -R -s.. -t.. -T.. -v -x -X..  <modus>\n"
411    printf "\n      Description of available options:\n"
412    printf "\n      Option  Description                              Default-Value"
413    printf "\n        -a    base name of input files                 equiv. -d"
414    printf "\n        -A    no archiving when using file-attribute fl"
415    printf "\n        -b    batch-job on local machine               ---"
416    printf "\n        -B    do not delete temporary directory at end ---"
417    printf "\n        -c    configuration file                       .mrun.config"
418    printf "\n        -d    base name of files attached to program   test"
419    printf "\n        -D    preprocessor(cpp)-directives             \"\" "
420    printf "\n        -F    create remote job file only              ---"
421    printf "\n        -h    execution host                           $localhost_realname"
422    printf "\n        -i    INPUT control list                       \"\" "
423    printf "\n        -I    archiving errors of previous batch-jobs"
424    printf "\n              will be ignored"
425    printf "\n        -k    keep data from previous run"
426    printf "\n        -K    additional conditions for controling"
427    printf "\n              usage of conditional code and"
428    printf "\n              env-variables in configuration file      \"\" "
429    printf "\n        -m    memory demand in MB (batch-jobs)         0 MB"
430    printf "\n        -M    Makefile name                            Makefile"
431    printf "\n        -n    node usage (shared/not_shared)           depending on -h"
432    printf "\n        -o    OUTPUT control list                      \"\" "
433    printf "\n        -O    use OpenMP                               ---"
434    printf "\n        -p    software package list                    \"\" "
435    printf "\n        -q    queue                                    \"$queue\" "
436    printf "\n        -r    run control list (combines -i -o)        \"\" "
437    printf "\n        -s    filenames of routines to be compiled     \"\" "
438    printf "\n              must end with .f, .f90, .F, or .c !"
439    printf "\n              use \"..\" for more than one file and wildcards"
440    printf "\n              -s TEST compiles all files with w-permit"
441    printf "\n        -S    config file interpreted by shellscript   ---"
442    printf "\n        -t    allowed cpu-time in seconds (batch)      0"
443    printf "\n        -T    tasks per node                           depending on -h"
444    printf "\n        -u    username on remote machine               \"\" "
445    printf "\n        -v    no prompt for confirmation               ---"
446    printf "\n        -x    tracing of mrun for debug purposes       ---"
447    printf "\n        -X    # of processors (on parallel machines)   1"
448    printf "\n        -Y    run coupled model                        ---"
449    printf "\n "
450    printf "\n      Possible values of positional parameter <modus>:"
451    printf "\n        \"?\"       -  this outline \n\n") | more
452    exit
453 elif [[ "$1" != "" ]]
454 then
455    printf "\n  +++ positional parameter $1 unknown \n"
456    locat=parameter; exit
457 fi
458
459
460
461    # KURZE STARTMELDUNG
462 printf "\n*** $version "
463 printf "\n    will be executed.     Please wait ..."
464
465
466
467    # PRUEFEN, OB KONFIGURATIONS-DATEI VORHANDEN
468 if [[ ! -f $config_file ]]
469 then
470    printf "\n\n  +++ configuration file: "
471    printf "\n           $config_file"
472    printf "\n      does not exist"
473    locat=connect; exit 
474 fi
475
476
477    # HOST-IDENTIFIER (local_host) AUS KONFIGURATIONSDATEI BESTIMMEN
478 line=""
479 grep  "%host_identifier"  $config_file  >  tmp_mrun
480 while read line
481 do
482    if [[ "$line" != ""  ||  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
483    then
484       HOSTNAME=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
485       host_identifier=`echo $line | cut -d" " -s -f3`
486       if [[ $localhost_realname = $HOSTNAME ]]
487       then
488          localhost=$host_identifier
489          break
490       fi
491    fi
492 done < tmp_mrun
493
494 if [[ "$localhost" = "" ]]
495 then
496    printf "\n\n  +++ no host identifier found in configuration file \"$config_file\""
497    printf "\n      for local host \"$localhost_realname\"."
498    printf "\n      Please add line"
499    printf "\n      \"\%host_identifier $localhost_realname <identifier>\""
500    printf "\n      to the configuration file."
501    locat=localhost; exit
502 fi
503
504
505
506    # HOSTSPEZIFISCHE VARIABLEN SETZEN
507 case  $localhost_realname  in
508     (breg*-en0|berni*-en0)  archive_system=tivoli;;
509     (cs*)                   archive_system=ut;;
510     (fimm.bccs.uib.no)      fimm=true;;
511     (gate|n-sx)             PATH=$PALM_BIN:$PATH:/usr/bin/nqsII;;
512     (hreg*-en0|hanni*-en0)  archive_system=tivoli;;
513     (scirocco)              scirocco=true;;
514 esac
515
516
517 
518    # BASISNAME DER INPUT-DATEIEN GLEICH ALLGEMEINEM BASISNAMEN SETZEN,
519    # WENN NICHT VOM BENUTZER ANDERS BESTIMMT
520 [[ "$afname" = "" ]]  &&  afname=$fname
521
522
523    # EVTL. RUN-MODUS DEN I/O-LISTEN HINZUFUEGEN
524 if [[ "$run_mode" != "" ]]
525 then
526    input_list="$input_list $run_mode"
527    output_list="$output_list $run_mode"
528 fi
529
530
531    # RECHNERNAMEN ABSPEICHERN, VON DEM AUS JOB GESTARTET WIRD,
532    # ALLERDINGS NUR DANN, WENN NICHT PER OPTION -H BEREITS EIN WERT
533    # ZUGEWIESEN WURDE (MRUN MACHT DIES IMMER, WENN ES SELBST BATCH-JOBS
534    # STARTET)
535 if [[ "$fromhost" = "" ]]
536 then
537    fromhost=$localhost
538 fi
539
540
541     # PRUEFEN, OB MRUN NUR TESTWEISE AUF DER LOKALEN MASCHINE KOMPILIEREN SOLL
542 if [[ "$source_list" = LOCAL_COMPILE_TEST ]]
543 then
544    source_list=TEST
545    local_compile=true
546    host=$localhost
547 fi
548   
549
550    # PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
551    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
552    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
553    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
554 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
555 then
556    do_batch=true
557    do_remote=true
558    case  $host  in
559        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|nech|neck|lctit|unics)  true;;
560        (*)  printf "\n"
561             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
562             printf "\n      is not available"
563             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
564    esac
565 else
566    host=$localhost
567 fi
568
569
570     # ZUSATZBEDINGUNGEN (OPTION -K) AUSWERTEN
571 if [[ -n $additional_conditions ]]
572 then
573#    echo $additional_conditions | cut -d" " -f1-3 | read  cond1  cond2  dummy
574    cond1=`echo $additional_conditions | cut -d" " -f1`
575    cond2=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f2`
576    dummy=`echo $additional_conditions | cut -d" " -s -f3`
577    if [[ -n $dummy ]]
578    then
579       printf "\n  +++ more than 2 additional conditions given for Option \"-K\""
580       locat=options; exit
581    fi
582 fi
583
584
585    # PRUEFEN, OB EVTL. BEI VORHERGEHENDEM LAUF (KETTENJOB) EINE
586    # ARCHIVIERUNG FEHLGESCHLAGEN IST
587 if [[ -f ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname ]]
588 then
589    if [[ $ignore_archive_error = false ]]
590    then
591       printf "\n  +++ data archiving of previous run failed"
592       printf "\n      see directory \~/job_queue on remote machine"
593       locat=archive; exit
594    else
595       printf "\n  +++ warning: data archiving in a previous run failed"
596       printf "\n      MRUN continues, trying to get backup copy"
597    fi
598 fi
599
600
601
602    # LESEN UND INTERPRETIEREN DER KONFIGURATIONS-DATEI VOM SHELLSCRIPT AUS
603    # VORUEBERGEHEND ZWINGEND AUF LINUX-RECHNERN
604 if [[ "$read_from_config" = false ]]
605 then
606
607    [[ $silent = false ]]  &&  printf "\n    Reading the configuration file... "
608    while  read zeile
609    do
610        [[ $silent = false ]]  &&  printf "."
611
612
613          # ZUERST EVENTUELL VORKOMMENDE ENVIRONMENT-VARIABLEN DURCH IHRE WERTE
614          # ERSETZEN
615       eval  zeile=\"$zeile\"
616
617
618          # INTERPRETATION DER ZEILE
619       if [[ "$(echo $zeile)" = "" ]]
620       then
621             # LEERZEILE, KEINE AKTION
622          continue
623
624       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "#" ]]
625       then
626
627             # ZEILE IST KOMMENTARZEILE
628          true
629
630       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1)"  =  "%" ]]
631       then
632
633             # ZEILE DEFINIERT ENVIRONMENT-VARIABLE
634          zeile=$(echo $zeile | cut -c2-)
635#          echo $zeile | cut -d" " -f1-5 | read  var  value  for_host  for_cond1  for_cond2
636          var=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
637          value=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
638          for_host=`echo $zeile | cut -d" " -s -f3`
639          for_cond1=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
640          for_cond2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
641
642          if [[ "$for_host" = ""  ||  ( "$for_host" = $host  &&  "$for_cond1" = "$cond1"  &&  "$for_cond2" = "$cond2" )  ||  $(echo "$input_list$output_list"|grep -c "$for_host") != 0 ]]
643          then
644
645                # BEI COMPILER- CPP- ODER LINKEROPTIONEN EVTL ":" DURCH " "
646                # ERSETZEN. "::" WIRD DURCH ":" ERSETZT.
647             value=`echo $value | sed 's/::/%DUM%/g' | sed 's/:/ /g' | sed 's/%DUM%/:/g'`
648
649
650                # ENVIRONMENT-VARIABLE WIRD WERT AUS KONFIGURATIONSDATEI
651                # ZUGEWIESEN, WENN SIE SELBST NOCH KEINEN WERT UEBER DIE
652                # ENTSPRECHENDE SCRIPT-OPTION ERHALTEN HAT. SOLCHE
653                # VARIABLEN HAETTEN DANN DEN WERT "" ODER IM INTEGER-FALL DEN
654                # WERT 0.  ALLGEMEINE REGEL ALSO: SCRIPT-OPTION GEHT UEBER
655                # KONFIGURATIONSDATEI
656             if [[ "$(eval echo \$$var)" = ""  ||  "$(eval echo \$$var)" = "0" ]]
657             then
658                eval  $var=\$value
659
660                   # EVTL. BILDSCHIRMAUSGABEN DER ENVIRONMENT-VARIABLEN
661                if [[ $do_trace = true ]]
662                then
663                   printf "\n*** ENVIRONMENT-VARIABLE $var = $value"
664                fi
665             fi
666
667                # WENN ENVIRONMENT-VARIABLE HOST VEREINBART, DANN SOFORT AUSWERTEN
668                # WERT VON do-remote WIRD BEI DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT
669                # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
670                # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
671             if [[ $var = host ]]
672             then
673                if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
674                then
675                   do_batch=true
676                   do_remote=true
677                   case  $host  in
678                       (ibm|ibms|ibmy|lctit|nech|neck|unics)  true;;
679                       (*)  printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
680                            printf "\n      is not available"
681                            locat=nqs; exit;;
682                   esac
683                else
684                   host=$localhost
685                fi
686             fi
687
688                # VOM BENUTZER DEFINIERTE ENVIRONMENT VARIABLEN MUESSEN PRINZIPIELL
689                # EXPORTIERT WERDEN, DA SIE VIELLEICHT IN WEITER UNTEN AUFZURUFEN-
690                # DEN PROGRAMMEN BENOETIGT WERDEN
691             export  $var
692          fi
693
694
695
696
697       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "EC:" ]]
698       then
699
700             # ZEILE DEFINIERT ERROR-KOMMANDO
701          (( iec = iec + 1 ))
702          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
703          err_command[$iec]="$zeile"
704
705       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "IC:" ]]
706       then
707
708             # ZEILE DEFINIERT INPUT-KOMMANDO
709          (( iic = iic + 1 ))
710          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
711          in_command[$iic]="$zeile"
712
713       elif [[ "$(echo $zeile | cut -c1-3)" = "OC:" ]]
714       then
715
716             # ZEILE DEFINIERT OUTPUT-KOMMANDO
717          (( ioc = ioc + 1 ))
718          zeile=$(echo $zeile | cut -c4-)
719          out_command[$ioc]="$zeile"
720
721       else
722
723             # ZEILE DEFINIERT DATEIVERBINDUNG. EINLESEN DER DATEIEIGENSCHAFTEN
724             # s2a: in/out - Feld
725             # s2b: loc    - Feld (optional)
726             # s2c: tr/ar  - Feld (optional)
727#          echo $zeile | cut -d" " -f1-2 | read  s1  s2
728          s1=`echo $zeile | cut -d" " -f1`
729          s2=`echo $zeile | cut -d" " -s -f2`
730          s2a=$(echo $s2 | cut -d":" -f1)
731          if [[ $(echo $s2 | grep -c ":") = 0 ]]
732          then
733             s2b=""
734             s2c=""
735          else
736#             echo $s2 | cut -d":" -f2-3 | sed 's/:/ /g' | read  s2b  s2c
737             s2b=`echo $s2 | cut -d":" -f2 | sed 's/:/ /g'`
738             s2c=`echo $s2 | cut -d":" -s -f3 | sed 's/:/ /g'`
739          fi
740#          echo $zeile | cut -d" " -f3-6 | read  s3  s4  s5  s6
741          s3=`echo $zeile | cut -d" " -f3`
742          s4=`echo $zeile | cut -d" " -s -f4`
743          s5=`echo $zeile | cut -d" " -s -f5`
744          s6=`echo $zeile | cut -d" " -s -f6`
745
746       
747             # ABSPEICHERN DER DATEIVERBINDUNG, FALLS IN INPUT- ODER OUTPUT-LIST
748             # VERMERKT. VARIABLE S3 KANN AUCH LISTE ENTHALTEN (FELDTRENNER ":")
749             # DATEIVERBINDUNG WIRD DANN NICHT ABGESPEICHERT UND GEPRUEFT, WENN
750             # PROGRAMMLAUF AUF REMOTE-MASCHINE ERFOLGT UND DATEI NUR LOKAL VOR-
751             # HANDEN SEIN MUSS (D.H. s2b = loc)
752          IFSALT="$IFS"; IFS="$IFS:"
753          if [[ "$s2a" = in  &&  ! ( $do_remote = true  &&  ( "$s2b" = loc  ||  "$s2b" = locopt ) ) ]]
754          then
755             found=false
756             for  actual  in  $input_list
757             do
758                for  formal  in  $s3
759                do
760                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-" ]]  &&  found=true
761                done
762             done
763             if [[ $found = true ]]
764             then
765                (( iin = iin + 1 ))
766                localin[$iin]=$s1; transin[$iin]=$s2b; actionin[$iin]=$s2c;
767                typein[$iin]=$s3; pathin[$iin]=$s4; endin[$iin]=$s5;
768                extin[$iin]=$s6
769             fi
770          elif [[ "$s2a" = out  &&  ! ( $do_remote = true  &&  "$s2b" = loc ) ]]
771          then
772             found=false
773             for  actual  in  $output_list
774             do
775                for  formal  in  $s3 
776                do
777                   [[ $actual = $formal  ||  "$formal" = "-"  ]]  &&  found=true
778                done
779             done
780             if [[ $found = true ]]
781             then
782                (( iout = iout + 1 ))
783                localout[$iout]=$s1; actionout[$iout]=$s2c; typeout[$iout]=$s3;
784                pathout[$iout]=$s4; endout[$iout]=$s5; extout[$iout]=$s6
785             fi
786          elif [[ "$s2a" != in  &&  "$s2a" != out ]]
787          then
788             printf "\n  +++ I/O-attribute in configuration file $config_file has the invalid"
789             printf "\n      value \"$s2\". Only \"in\" and \"out\" are allowed!"
790             locat=connect; exit
791          fi
792          IFS="$IFSALT"
793       fi
794    done < $config_file
795
796 else
797
798
799       # INTERPRETATION DER KONFIGURATIONSDATEI MITTELS FORTRAN 90 - PROGRAMM
800    [[ $silent = false ]]  &&  printf "..."
801    export  cond1 cond2 config_file do_remote do_trace input_list localhost output_list
802    export  interpreted_config_file=.icf.$RANDOM
803
804
805
806       # ENVIRONMENT-VARIABLEN FUER INTERPRET_CONFIG UEBER NAMELIST_DATEI ZUR
807       # VERFUEGUNG STELLEN
808    cat  >  .mrun_environment  <<  %%END%%
809 &mrun_environment  cond1 = '$cond1', cond2 = '$cond2',
810                    config_file = '$config_file', do_remote = '$do_remote',
811                    do_trace = '$do_trace', host = '$host',
812                    input_list = '$input_list', icf = '$interpreted_config_file',
813                    localhost = '$localhost', output_list = '$output_list' /
814
815%%END%%
816
817       # WERTE VON MRUN-OPTIONEN SICHERN UND DAMIT GEGEBENENFALLS SPAETER DIE
818       # IN DER KONFIGURAIONSDATEI ANGEGEBENEN WERTE UEBERSTEUERN
819    mrun_memory=$memory
820    mrun_cpumax=$cpumax
821    mrun_numprocs=$numprocs
822
823    if [[ $localhost_realname = "gate" ]]
824    then
825       interpret_config_gate.x
826    else
827       interpret_config.x
828    fi
829    rm .mrun_environment
830
831
832       # AUSFUEHRUNG DER GENERIERTEN SHELL-KOMMANDOS IN DIESER SHELL
833    chmod  u+x  $interpreted_config_file
834    export PATH=$PATH:.
835    . $interpreted_config_file
836    rm  $interpreted_config_file
837
838
839       # OPTIONSWERTE UEBERSTEUERN KONFIGURATIONSDATEI
840    [[ $mrun_memory     != 0  ]]  &&  memory=$mrun_memory
841    [[ $mrun_cpumax     != 0  ]]  &&  cpumax=$mrun_cpumax
842    [[ "$mrun_numprocs" != "" ]]  &&  numprocs=$mrun_numprocs
843
844 fi
845
846
847    # QUELLTEXTVERZEICHNIS AUF LOKALER MASCHINE AUS KONFIGURATIONSDATEI
848    # BESTIMMEN (WUERDE SONST EVTL. DAS VERZEICHNIS DES JEWEILS UNTER -h
849    # ANGEGEBENEN REMOTE-RECHNERS SEIN)
850    # BEI BATCH-JOBS SIND DIE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE SCHON KOMPLETT
851 if [[ "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
852 then
853
854       # ZUERST PRUEFEN, OB EIN GLOBALER QUELLTEXTPFAD FUER ALLE RECHNER
855       # VEREINBART WURDE
856    source_path=""
857    line=""
858    grep "%source_path" $config_file  >  tmp_mrun
859    while read line
860    do
861       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
862       then
863          if [[ "$(echo $line | cut -d" " -f3)" = "" ]]
864          then
865             global_source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
866          fi
867       fi
868    done  <  tmp_mrun
869
870    line=""
871    found=false
872    grep  " $localhost" $config_file | grep "%source_path"  >  tmp_mrun
873    while read line
874    do
875       if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
876       then
877          if [[ $found = true ]]
878          then
879             printf "\n\n  +++ more than one source path found in configuration file"
880             printf "\n      for local host \"$localhost\" "
881             locat=source_path; exit
882          fi
883          source_path=`echo $line | cut -d" " -f2`
884          found=true
885       fi
886    done  <  tmp_mrun
887    rm  tmp_mrun
888
889    if [[ "$source_path" = "" ]]
890    then
891       if [[ "$global_source_path" != "" ]]
892       then
893          source_path=$global_source_path
894       else
895          printf "\n\n  +++ no source path found in configuration file"
896          printf "\n      for local host \"$localhost\" "
897          locat=source_path; exit
898       fi
899    fi
900    eval source_path=$source_path
901
902    if [[ ! -d $source_path ]]
903    then
904       printf "\n\n  +++ source path \"$source_path\" on local host"
905       printf "\n      \"$localhost\" does not exist"
906       locat=source_path; exit
907    fi
908
909 fi
910
911
912    # GLOBALE REVISIONSNUMMER ERMITTELN (FORTSETZUNGSLAEUFEN WIRD DIESE
913    # DURCH OPTION -G MITGETEILT)
914 if [[ "$global_revision" = "" ]]
915 then
916    global_revision=`svnversion $source_path  2>/dev/null`
917    global_revision="Rev: $global_revision"
918 fi
919
920
921    # NOCHMAL PRUEFEN, OB AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL
922    # (HOST KANN IN KONFIGURATIONSDATEI ANDERS FESTGELEGT WORDEN SEIN)
923    # WERT VON do_remote WIRD FUER DATEIVERBINDUNGEN BENOETIGT.
924    # WENN AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WIRD, IST GLEICHZEITIG KLAR,
925    # DASS EIN BATCH-JOB GESTARTET WERDEN MUSS
926 if [[ -n $host  &&  "$host" != $localhost ]]
927 then
928    do_batch=true
929    do_remote=true
930    case  $host  in
931        (ibm|ibmb|ibmh|ibms|ibmy|lctit|nech|neck|unics)  true;;
932        (*)  printf "\n"
933             printf "\n  +++ sorry: execution of batch jobs on remote host \"$host\""
934             printf "\n      is not available"
935             locat=nqs; (( iec = 0 )); exit;;
936    esac
937 else
938    host=$localhost
939 fi
940
941
942    # PRUEFUNG EINIGER PROZESSORZAHLANGABEN BEI RECHNUNGEN AUF PARALLELRECHNERN
943 if [[ "$cond1" = parallel  ||  "$cond2" = parallel ]]
944 then
945
946       # PRUEFEN, OB DIE ANZAHL DER ZU VERWENDENDEN PES ANGEGEBEN WURDE
947    if [[ ! -n $numprocs ]]
948    then
949       printf "\n"
950       printf "\n  +++ option \"-K parallel\" requires additional specification"
951       printf "\n      of the number of processors to be used by"
952       printf "\n      mrun-option \"-X\" or by environment-variable"
953       printf "\n      \"numprocs\" in the configuration file"
954       locat=numprocs; (( iec = 0 )); exit 
955    fi
956
957       # PRUEFEN, OB DIE PROZESSORANZAHL PRO KNOTEN ANGEGEBEN WURDE (GGF.
958       # DEFAULT-WERT SETZEN) UND OB SIE EIN GANZZAHLIGER TEILER DER
959       # GESAMTPROZESSORANZAHL IST
960    if [[ $host = nech  ||  $host = neck  ||  $host = ibmh  ||  $host = ibmb  ||  $host = ibms ]]
961    then
962       [[ "$tasks_per_node" = "" ]]  &&  tasks_per_node=6
963       (( ival = $tasks_per_node ))
964       (( pes = numprocs ))
965#       if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics+1PE) = 1 ]]
966#       then
967#          (( pes = pes - 1 ))
968#       fi
969       (( ii = pes / ival ))
970       if (( pes - ii * ival > 0 ))
971       then
972          printf "\n"
973          printf "\n  +++ tasks per node (option \"-T\") must be an integral"
974          printf "\n      divisor of the total number of processors (option \"-X\")"
975          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
976          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
977       fi
978    fi
979
980       # IBMY HAT NUR EINEN KNOTEN
981    if [[ $host = ibmy ]]
982    then
983       if [[ "$tasks_per_node" != ""  &&  "$tasks_per_node" != "$numprocs" ]]
984       then
985          printf "\n"
986          printf "\n  +++ on ibmy, tasks per node (option \"-T\") must be equal to the"
987          printf "\n      total number of processors (option \"-X\")"
988          printf "\n      values of this mrun-call: \"-T $tasks_per_node\" \"-X $numprocs\""
989          locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
990       fi
991    fi
992
993       # FALLS OPENMP PARALLELISIERUNG VERWENDET WERDEN SOLL, ANZAHL VON THREADS
994       # SETZEN UND ZAHL DER TASKS PRO KNOTEN AUF 1 SETZEN
995    if [[ $use_openmp = true ]]
996    then
997       threads_per_task=$tasks_per_node
998       tasks_per_node=1
999    fi
1000    OOPT="-O $threads_per_task"
1001    TOPT="-T $tasks_per_node"
1002
1003       # GESAMTZAHL DER KNOTEN BESTIMMEN
1004    if [[ "$tasks_per_node" != "" ]]
1005    then
1006       (( nodes = numprocs / ( tasks_per_node * threads_per_task ) ))
1007    fi
1008
1009       # PRUEFEN, OB NODE USAGE EINEN ERLAUBTEN WERT HAT BZW. DEN DEFAULT
1010       # SETZEN
1011    if [[ $node_usage = default ]]
1012    then
1013       if [[ $host = ibms ]]
1014       then
1015          node_usage=shared
1016       else
1017          node_usage=not_shared
1018       fi
1019    fi
1020    if [[ $node_usage != shared  &&  $node_usage != not_shared ]]
1021    then
1022       printf "\n"
1023       printf "\n  +++ node usage (option \"-n\") is only allowed to be set"
1024       printf "\n      \"shared\" or \"not_shared\""
1025       locat=tasks_per_node; (( iec = 0 )); exit 
1026    fi
1027
1028 fi
1029
1030    # PRUEFEN, OB HOSTFILE EXISTIERT
1031 if [[ -n $hostfile ]]
1032 then
1033    if [[ ! -f $hostfile ]]
1034    then
1035       printf "\n"
1036       printf "\n  +++ hostfile \"$hostfile\" does not exist"
1037       locat=hostfile; exit
1038    fi
1039 fi
1040
1041    # PRUEFEN, OB RHOSTS DATEI EXISTIERT. GEGEBENENFALLS ANLEGEN BZW. ERWEITERN
1042 if [[ $host = ibmy  &&  $do_remote = false ]]
1043 then
1044    if [[ ! -f $HOME/.rhosts ]]
1045    then
1046       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >  $HOME/.rhosts
1047       printf "\n\n  *** file:"
1048       printf "\n           $HOME/.rhosts"
1049       printf "\n      was created\n"
1050    fi
1051    if [[ $(grep -c gfdl5.yonsei.ac.kr $HOME/.rhosts) = 0 ]]
1052    then
1053       echo  "gfdl5.yonsei.ac.kr"  >>  $HOME/.rhosts
1054       printf "\n\n  *** file:"
1055       printf "\n           $HOME/.rhosts"
1056       printf "\n      was extended by the name of the current host\n"
1057    fi
1058 fi
1059
1060
1061
1062    # FALLS NICHT VORGEGEBEN, DEFAULT-QUEUE AUF DER ZIELMASCHINE FESTLEGEN
1063 if [[ $queue = none ]]
1064 then
1065    case  $host  in
1066        (ibmb)       if [[ $node_usage = shared ]]
1067                     then
1068                        queue=cshare
1069                     else
1070                        queue=csolo
1071                     fi;;
1072        (ibmh)       if [[ $node_usage = shared ]]
1073                     then
1074                        queue=cshare
1075                     else
1076                        queue=csolo
1077                     fi;;
1078        (ibmy)       queue=parallel;;
1079        (lctit)      queue=default;;
1080        (nech)       queue=none;;
1081        (neck)       queue=P;;
1082        (unics)      queue=unics;;
1083    esac
1084 fi
1085
1086
1087    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN DER INPUT-FILES BILDEN,
1088    # INPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1089    # ERMITTELN
1090 (( i = 0 ))
1091 while (( i < iin ))
1092 do
1093    (( i = i + 1 ))
1094    (( maxcycle = 0 ))
1095
1096       # NAMENSBILDUNG (EVTL. IST FESTER DATEINAME VORGEGEBEN)
1097    if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1098    then
1099       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1100                                                    # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1101       eval filename=${pathin[$i]}/${endin[$i]}
1102    else
1103       remotepathin[$i]=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}  # REMOTE-PFAD ERST AUF
1104                                                             # REM-MASCHINE AUSWERTEN
1105       eval filename=${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}
1106    fi
1107
1108       # PRUEFEN AUF VORHANDENSEIN
1109    if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1110          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1111          $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1112    then
1113          # DATEIEN MIT EXTENSION (Z.B. NC) MUESSEN NICHT ZWINGEND VORHANDEN
1114          # SEIN, DESHALB IN SOLCHEN FAELLEN KEIN ABBRUCH. DIES IST NUR EINE
1115          # VORUEBERGEHENDE LOESUNG (OKT 05). NICHT ZWINGEND BENOETIGTE
1116          # EINGABEDATEIEN SOLLTEN EINE SPEZIELLE OPTION IN DER DATEI-
1117          # VERBINDUNGSANWEISUNG BEKOMMEN (Z.B. inopt?)
1118       if [[ "${transin[$i]}" != "locopt" ]]
1119       then
1120          printf "\n\n  +++ INPUT-file: "
1121          if [[ "${extin[$i]}" = "" ]]
1122          then
1123             printf "\n           $filename"
1124          else
1125             printf "\n           $filename.${extin[$i]}"
1126          fi
1127          printf "\n      does not exist\n"
1128          locat=input; exit
1129       else
1130          transin[$i]="unavailable"
1131       fi
1132    else
1133
1134          # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1135       ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1136       ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1137       while  read zeile
1138       do
1139          cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1140          if [[ "$cycle" = "$zeile" ]]
1141          then
1142             (( icycle = 0 ))
1143          elif [[ "$cycle" = "${extin[$i]}" ]]
1144          then
1145             (( icycle = 0 ))
1146          else
1147             (( icycle = $cycle ))
1148          fi
1149          if (( icycle > maxcycle ))
1150          then
1151             (( maxcycle = icycle ))
1152             file_to_be_used=$zeile
1153          fi
1154       done <filelist
1155       rm filelist
1156
1157          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN
1158       if (( maxcycle > 0 ))
1159       then
1160          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1161          then
1162             filename=${filename}.$maxcycle.${extin[$i]}
1163          else
1164             filename=${filename}.$maxcycle
1165          fi
1166       else
1167          if [[ "${extin[$i]}" != " "  &&   "${extin[$i]}" != "" ]]
1168          then
1169             filename=${filename}.${extin[$i]}
1170          fi
1171       fi
1172       
1173          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1174          # DA SPAETER BEI RUECKSPEICHERN VOM ARCHIVSYSTEM EVTL. BENOETIGT
1175       absnamein[$i]=$filename
1176       if (( maxcycle > 0 ))
1177       then
1178          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1179          then
1180             frelin[$i]=${endin[$i]}.$maxcycle
1181          else
1182             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}.$maxcycle
1183          fi
1184       else
1185          if [[ "${actionin[$i]}" = di ]]
1186          then
1187             frelin[$i]=${endin[$i]}
1188          else
1189             frelin[$i]=${afname}${endin[$i]}
1190          fi
1191       fi
1192
1193    fi
1194 done
1195       
1196
1197    # VOLLSTAENDIGE DATEINAMEN (OHNE $ ODER ~) DER OUTPUT-FILES BILDEN,
1198    # OUTPUT-DATEIEN AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND EVTL. HOECHSTE ZYKLUSNUMMER
1199    # ERMITTELN ODER, FALLS NICHT VORHANDEN, PRUEFEN, OB SIE SICH ANLEGEN LASSEN
1200    # DIESE AKTIONEN FINDEN NICHT STATT, WENN PROGRAMM AUF REMOTE-MASCHINE
1201    # RECHNET UND DATEI ANSCHLIESSEND TRANSFERIERT WERDEN SOLL!
1202 (( i = 0 ))
1203 while (( i < iout ))
1204 do
1205    (( i = i + 1 ))
1206    if [[ ! ( $fromhost != $localhost  &&  ( "${actionout[$i]}" = tr || "${actionout[$i]}" = tra || "${actionout[$i]}" = trpe ) ) ]]
1207    then
1208       if [[ "${actionout[$i]}" = tr  ||  "${actionout[$i]}" = trpe ]]
1209       then
1210          actionout[$i]=""
1211       elif [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
1212       then
1213          actionout[$i]=a
1214       fi
1215       (( maxcycle = 0 ))
1216       eval filename=${pathout[$i]}/${fname}${endout[$i]}
1217       eval catalogname=${pathout[$i]}
1218       if [[ $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "not found") = 1  || \
1219             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "No such file") = 1  || \
1220             $(ls $filename* 2>&1 | grep -c "does not exist") = 1 ]]
1221       then
1222     
1223             # OUTPUT-DATEI NICHT VORHANDEN. PRUEFEN, OB ANLEGEN MOEGLICH.
1224          if  cat /dev/null > $filename 
1225          then
1226             rm  $filename
1227          else
1228
1229                # PRUEFEN, OB KATALOG VORHANDEN UND EVTL. DIESEN ANLEGEN
1230             if [[ ! -d $catalogname ]]
1231             then
1232                if  mkdir -p  $catalogname
1233                then
1234                   printf "\n\n  *** directory:"
1235                   printf "\n           $catalogname"
1236                   printf "\n      was created\n"
1237                else
1238                   printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1239                   printf "\n           $filename"
1240                   printf "\n      cannot be created, because directory does not exist"
1241                   printf "\n      and cannot be created either"
1242                   printf "\n"
1243                   locat=output  ; exit
1244                fi 2>/dev/null
1245             else
1246                printf "\n\n  +++ OUTPUT-file:"
1247                printf "\n           $filename"
1248                printf "\n      cannot be created, although directory exists"
1249                printf "\n"
1250                locat=output  ; exit
1251             fi
1252          fi 2>/dev/null
1253       else
1254
1255             # ZYKLUSNUMMER FESTSTELLEN
1256          ls -1 -d $filename    >   filelist  2>/dev/null
1257          ls -1 -d $filename.*  >>  filelist  2>/dev/null
1258          while  read zeile
1259          do
1260             cycle=$(print $zeile | cut -f2 -d".")
1261             if [[ "$cycle" = "$zeile"  ||  "$cycle" = ${extout[$i]} ]]
1262             then
1263                (( icycle = 1 ))
1264             else
1265                (( icycle = $cycle + 1 ))
1266             fi
1267             if (( icycle > maxcycle ))
1268             then
1269                (( maxcycle = icycle ))
1270             fi
1271          done <filelist
1272          rm filelist
1273       fi
1274
1275          # EVTL. ZYKLUSNUMMER AN DATEINAMEN ANFUEGEN UND PRUEFEN, OB SICH
1276          # DATEI AUCH WIRKLICH ANLEGEN LAESST. IM APPEND-FALL MUSS AN DEN
1277          # HOECHSTEN VORHANDENEN ZYKLUS-ANGEHAENGT WERDEN. ANLAGEPRUEFUNG
1278          # IST DANN NATUERLICH NICHT ZULAESSIG BZW. MOEGLICH
1279       if [[ "${actionout[$i]}" != a ]]
1280       then
1281          if (( maxcycle > 0 ))
1282          then
1283             filename=${filename}.$maxcycle
1284             if  cat /dev/null > $filename 
1285             then
1286                rm  $filename
1287             else
1288                printf "\n  +++ OUTPUT-file:"
1289                printf "\n           $filename"
1290                printf "\n      cannot be created"
1291                locat=output  ; exit
1292             fi
1293          fi
1294       else
1295          (( maxcycle = maxcycle - 1 ))
1296          if (( maxcycle > 0 ))
1297          then
1298             filename=${filename}.$maxcycle
1299          fi
1300       fi
1301       
1302          # DATEINAMEN OHNE PFAD ABER MIT ZYKLUSNUMMER ABSPEICHERN,
1303          # DA SPAETER BEI ABLAGE AUF ARCHIVSYSTEM BZW. FUER
1304          # DATEI OUTPUT_FILE_CONNECTIONS EVTL. BENOETIGT
1305       pathout[$i]=$filename
1306       if (( maxcycle > 0 ))
1307       then
1308          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}.$maxcycle
1309       else
1310          frelout[$i]=${fname}${endout[$i]}
1311       fi
1312
1313    fi
1314 done
1315
1316
1317     # DAS DVRP-PAKET ERFORDERT EINE ENTSPRECHENDE BIBLIOTHEK
1318 if [[ $(echo $package_list | grep -c dvrp_graphics) != 0 ]]
1319 then
1320    if [[ "$dvrp_inc" = "" ]]
1321    then
1322       printf "\n\n  +++ no value for \"dvrp_inc\" given in configuration file"
1323       printf "\n      This is required for the dvrp_graphics package.\n"
1324       locat=dvrp; exit
1325    fi
1326    if [[ "$dvrp_lib" = "" ]]
1327    then
1328       printf "\n\n  +++ no value for \"dvrp_lib\" given in configuration file"
1329       printf "\n      This is required for the dvrp_graphics package.\n"
1330       locat=dvrp; exit
1331    fi
1332 fi
1333
1334
1335     # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM ODER NUR EIN AUSFUEHRBARES
1336     # PROGRAMM VEREINBART WURDE (IN DIESEM FALL BRAUCHT IM WEITEREN NICHT
1337     # UEBERSETZT ZU WERDEN)
1338 if [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" = "" ]]
1339 then
1340    printf "\n  +++ neither main program nor executable defined"
1341    locat=source; exit
1342 elif [[ "$mainprog" != ""  &&  "$executable" != "" ]]
1343 then
1344    printf "\n  +++ main program as well as executable defined"
1345    locat=source; exit
1346 elif [[ "$mainprog" = ""  &&  "$executable" != "" ]]
1347 then
1348    do_compile=false
1349 fi
1350
1351
1352    # ALLE ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE ZUSAMMENSAMMELN
1353    # BEI BATCH-JOBS IST DIES NICHT NOETIG, WEIL DIE PROGRAMMTEILE BEREITS DURCH
1354    # DEN MRUN-AUFRUF ERMITTELT SIND, DER DEN BATCH-JOB GENERIERT HAT, UND
1355    # IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_... ABGELEGT SIND
1356 if [[ $do_compile = true  &&  "$SOURCES_COMPLETE" = "" ]]
1357 then
1358
1359    [[ "$source_list" = LM ]]  &&  source_list=LOCALLY_MODIFIED
1360    [[ "$source_list" = WP ]]  &&  source_list=WRITE_PERMIT
1361
1362    if [[ $restart_run != true ]]
1363    then
1364       rm -rf  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1365       mkdir   SOURCES_FOR_RUN_$fname
1366    fi
1367
1368
1369       # EVTL. ZU UEBERSETZENDE PROGRAMMTEILE DADURCH BESTIMMEN, DASS GEPRUEFT
1370       # WIRD, WELCHE DATEIEN WRITE-PERMIT BESITZEN (DATEIEN SOLLTEN DESHALB
1371       # UNTER RCS-KONTROLLE STEHEN). MIT DER VARIABLEN EXCLUDE KOENNEN
1372       # BESTIMMTE DATEIEN GRUNDSAETZLICH VON DER UEBERSETZUNG AUSGESCHLOSSEN
1373       # WERDEN. DIES IST NUR BEI MANUELLEM START VON MRUN DURCH DEN BENUTZER
1374       # MOEGLICH, DA BEI AUTOMATISCHEN RESTARTS TEST DURCH DIE TATSAECHLICH
1375       # ZU UBERSETZENDEN DATEIEN ERSETZT IST.
1376       # ALLE ERMITTELTEN DATEIEN WERDEN IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN_...
1377       # GESAMMELT
1378    if [[ "$source_list" = WRITE_PERMIT ]]
1379    then
1380
1381       source_list=""
1382       cd  $source_path
1383
1384
1385          # ALLE MOEGLICHEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1386       Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1387       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Names"
1388       Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1389       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1390       Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1391       [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1392       Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1393       [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1394       Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1395       [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  Filenames="$Filenames $Names"
1396
1397
1398          # DATEIEN MIT WRITE-PERMIT NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1399       for  dateiname  in  $Filenames
1400       do
1401          if [[ -w $dateiname ]]
1402          then
1403             if [[ "$exclude" = ""  ||  $(echo $exclude | grep -c $dateiname) = 0 ]]
1404             then
1405                cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1406                source_list=$source_list"$dateiname "
1407             fi
1408          fi
1409       done
1410
1411       cd -  > /dev/null
1412
1413
1414    elif [[ "$source_list" = LOCALLY_MODIFIED ]]
1415    then
1416
1417          # MODIFIZIERTE DATEIEN DER SVN-ARBEITSKOPIE BESTIMMEN
1418       source_list=""
1419       cd  $source_path
1420
1421
1422          # PRUEFEN, OB VERZEICHNIS UEBERHAUPT UNTER SVN-KONTROLLE STEHT
1423       if [[ ! -d .svn ]]
1424       then
1425          printf "\n\n  +++ source directory"
1426          printf "\n         \"$source_path\" "
1427          printf "\n         is not under control of \"subversion\"."
1428          printf "\n         Please do not use mrun-option \"-s LOCALLY MODIFIED\"\n"
1429       fi
1430
1431
1432          # ALLE MODIFIZIERTEN QUELLCODEDATEIEN AUFLISTEN
1433       Filenames=""
1434       svn status  >  tmp_mrun
1435       while  read line
1436       do
1437          firstc=`echo $line | cut -c1`
1438          if [[ $firstc = M  ||  $firstc = "?" ]]
1439          then
1440             Name=`echo "$line" | cut -c8-`
1441             extension=`echo $Name | cut -d. -f2`
1442             if [[ "$extension" = f90 || "$extension" = F90 || "$extension" = f || "$extension" = F || "$extension" = c ]]
1443             then
1444                Filenames="$Filenames "$Name
1445             fi
1446          fi
1447       done < tmp_mrun
1448
1449
1450          # DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1451       for  dateiname  in  $Filenames
1452       do
1453          cp  $dateiname  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1454          source_list=$source_list"$dateiname "
1455       done
1456
1457       cd -  > /dev/null
1458
1459
1460       # MITTELS OPTION -s ANGEGEBENE DATEIEN NACH SOURCES_FOR_RUN_... KOPIEREN
1461       # BEI AUTOMATISCHEN FORTSETZUNGSLAEUFEN SIND DORT SCHON ALLE DATEIEN
1462       # VORHANDEN
1463    elif [[ "$source_list" != ""  &&  $restart_run != true ]]
1464    then
1465
1466       cd  $source_path
1467
1468       for  filename  in  $source_list
1469       do
1470
1471             # QUELLTEXT-DATEI DARF KEINE PFADE BEINHALTEN
1472          if [[ $(print $filename | grep -c "/") != 0 ]]
1473          then
1474             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1475             printf "\n      must not contain (\"/\") "
1476             locat=source; exit
1477          fi
1478
1479          if [[ ! -f $filename ]]
1480          then
1481             printf "\n  +++ source code file:  $filename"
1482             printf "\n      does not exist"
1483             locat=source; exit
1484          else
1485             cp  $filename  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1486          fi
1487
1488       done
1489
1490       cd -  > /dev/null
1491
1492    fi
1493
1494
1495       # PRUEFEN, OB ENTWEDER HAUPTPROGRAMM VORHANDEN UND ES EVTL. IN DER
1496       # LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN PROGRAMMTEILE MIT ENTHALTEN IST (WENN
1497       # NICHT, WIRD ES DIESER LISTE HINZUGEFUEGT)
1498    if [[ $restart_run != true ]]
1499    then
1500
1501       if [[ ! -f "$source_path/$mainprog" ]]
1502       then
1503          printf "\n\n  +++ main program:  $mainprog"
1504          printf "\n      does not exist in source directory"
1505          printf "\n      \"$source_path\"\n"
1506          locat=source; exit
1507       else
1508          if [[ $(echo $source_list | grep -c $mainprog) = 0 ]]
1509          then
1510             cp  $source_path/$mainprog  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1511             source_list=${mainprog}" $source_list"
1512          fi
1513       fi
1514    fi
1515
1516
1517       # DATEIEN AUS ZUSAETZLICHEM QUELLVERZEICHNIS HINZUFUEGEN
1518    if [[ $restart_run != true  &&  "$add_source_path" != "" ]]
1519    then
1520
1521          # GIBT ES DAS VERZEICHNIS UEBERHAUPT?
1522       if [[ ! -d $add_source_path ]]
1523       then
1524          printf "\n\n  +++ WARNING: additional source code directory"
1525          printf "\n      \"$add_source_path\" "
1526          printf "\n      does not exist or is not a directory."
1527          printf "\n      No source code will be used from this directory!\n"
1528          add_source_path=""
1529          sleep 3
1530       else
1531
1532          cd $add_source_path
1533
1534          Names=$(ls -1 *.f90 2>&1)
1535          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$Names"
1536          Names=$(ls -1 *.F90 2>&1)
1537          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F90') = 0 ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1538          Names=$(ls -1 *.F 2>&1)
1539          [[ $(echo $Names | grep -c '*.F') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1540          Names=$(ls -1 *.f 2>&1)
1541          [[ $(echo $Names | grep -c '*.f') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1542          Names=$(ls -1 *.c 2>&1)
1543          [[ $(echo $Names | grep -c '*.c') = 0   ]]  &&  AddFilenames="$AddFilenames $Names"
1544
1545          cd -  > /dev/null
1546          cd  SOURCES_FOR_RUN_$fname
1547
1548          for  dateiname  in  $AddFilenames
1549          do
1550             if [[ -f $dateiname ]]
1551             then
1552                printf "\n  +++ source code file \"$dateiname\" found in additional"
1553                printf "\n      source code directory \"$add_source_path\" "
1554                printf "\n      as well as in directory \"$source_path\"."
1555                locat=source; exit
1556             fi
1557
1558             cp  $add_source_path/$dateiname  .
1559             source_list="$source_list $dateiname"
1560
1561                # Default User-Interface von der Liste entfernen, falls Datei
1562                # ein User-Interface enthaelt
1563             if [[ $( cat $dateiname | grep -c "END SUBROUTINE user_parin" ) != 0 ]]
1564             then
1565                if [[ $dateiname != user_interface.f90  &&  -f user_interface.f90 ]]
1566                then
1567                   rm -rf  user_interface.f90
1568                   source_list=`echo $source_list | sed -e 's/user_interface.f90//'`
1569                   printf "\n\n  *** default \"user_interface.f90\" removed from the files to be translated"
1570                   printf "\n      since a user-interface is found in file"
1571                   printf "\n      \"$add_source_path/$dateiname\" \n"
1572                   sleep 3
1573                else
1574                   printf "\n\n  *** user-interface file \"$dateiname\" "
1575                   printf "\n      added to the files to be translated \n"
1576                   sleep 3
1577                fi
1578             fi
1579          done
1580
1581          cd -  > /dev/null
1582       fi
1583    fi
1584
1585
1586       # ALLE UNTERPROGRAMME, DIE ZU VEREINBARTEN SOFTWAREPAKETEN GEHOEREN,
1587       # DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN HINZUFUEGEN
1588    if [[ $restart_run != true  &&  -n $package_list ]]
1589    then
1590
1591       cd  $source_path
1592
1593       for  package  in  $package_list
1594       do
1595
1596          [[ $package = "dvrp_graphics+1PE" ]]  &&  package=dvrp_graphics
1597
1598             # ERMITTELE ALLE DATEIEN, DIE ZUM PAKET GEHOEREN
1599             # FEHLERMELDUNGEN WERDEN ABGEFANGEN, DA * AUCH VERZEICHNISSNAMEN
1600             # LIEFERT
1601          package_source_list=`grep "defined( __$package " * 2>/dev/null | cut -f1 -d:`
1602
1603
1604             # FUEGE DIESE DATEIEN DER LISTE DER ZU UEBERSETZENDEN DATEIEN
1605             # HINZU, FALLS SIE NOCH NICHT DAZUGEHOEREN
1606          for  source_list_name  in  $package_source_list
1607          do
1608             if [[ $(echo $source_list | grep -c $source_list_name) = 0 ]]
1609             then
1610
1611                    # NUR DATEIEN MIT GUELTIGEN ENDUNGEN VERWENDEN
1612                ending=`echo $source_list_name | cut -f2 -d.`
1613                if [[ "$ending" = f90  ||  "$ending" = F90  ||  "$ending" = f  ||  "$ending" = F  ||  "$ending" = c ]]
1614                then
1615                   cp  $source_list_name  $working_directory/SOURCES_FOR_RUN_$fname
1616                   source_list="$source_list $source_list_name"
1617                fi
1618             fi
1619          done
1620       done
1621
1622       cd -  > /dev/null
1623    fi
1624
1625
1626       # MAKEFILE AUF VORHANDENSEIN PRUEFEN UND KOPIEREN
1627       # BEI RESTART-LAEUFEN LIEGT ES SCHON IM VERZEICHNIS SOURCES_FOR_RUN...
1628    if [[ "$restart_run" != true ]]
1629    then
1630       [[ "$makefile" = "" ]]  &&  makefile=$source_path/Makefile
1631       if [[ ! -f $makefile ]]
1632       then
1633          printf "\n  +++ file \"$makefile\" does not exist"
1634          locat=make; exit
1635       else
1636          cp  $makefile  SOURCES_FOR_RUN_$fname/Makefile
1637       fi
1638    fi
1639
1640 fi  # do_compile=true
1641
1642
1643    # FALLS PROGRAMMTEILE UEBERSETZT WERDEN SOLLEN, FOLGEN JETZT EINIGE
1644    # UEBERPRUEFUNGEN UND DAS SETZEN DER PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN
1645 if [[ $do_compile = true ]]
1646 then
1647
1648       # PRAEPROZESSOR-DIREKTIVEN ZUM SELEKTIVEN AUSWAEHLEN VON CODETEILEN
1649       # ZUSAMMENSETZEN
1650       # DIREKTIVEN ZUM AKTIVIEREN VON RECHNERSPEZIFISCHEM CODE
1651    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1652    then
1653       cpp_options="${cpp_options},-D__ibm=__ibm"
1654    elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = nec ]]
1655    then
1656       cpp_options="$cpp_options -D__nec"
1657    elif [[ $(echo $localhost | cut -c1-2) = lc ]]
1658    then
1659       cpp_options="$cpp_options -D__lc"
1660    else
1661       cpp_options="$cpp_options -D__$localhost"
1662    fi
1663
1664       # DIREKTIVEN DIE DURCH OPTION -K BESTIMMT WERDEN (Z.B. PARALLEL)
1665    if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1666    then
1667       [[ -n $cond1 ]]  &&  cpp_options="${cpp_options},-D__$cond1=__$cond1"
1668       [[ -n $cond2 ]]  &&  cpp_options="${cpp_options},-D__$cond2=__$cond2"
1669    else
1670       [[ -n $cond1 ]]  &&  cpp_options="$cpp_options -D__$cond1"
1671       [[ -n $cond2 ]]  &&  cpp_options="$cpp_options -D__$cond2"
1672    fi
1673
1674       # DIREKTIVEN DIE SOFTWAREPAKETE AKTIVIEREN (OPTION -p)
1675    if [[ -n $package_list ]]
1676    then
1677       for  package  in  $package_list
1678       do
1679          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1680          then
1681             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1682             then
1683                cpp_options="${cpp_options},-D__$package=__$package"
1684             else
1685                cpp_options="${cpp_options},-D__dvrp_graphics=__dvrp_graphics"
1686                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1687             fi
1688          else
1689             if [[ $package != "dvrp_graphics+1PE" ]]
1690             then
1691                cpp_options="$cpp_options -D__$package"
1692             else
1693                cpp_options="$cpp_options -D__dvrp_graphics"
1694                export use_seperate_pe_for_dvrp_output=true
1695             fi
1696          fi
1697       done
1698    fi
1699
1700       # DIREKTIVEN DIE DURCH OPTION -D FESTGELEGT SIND
1701    if [[ -n $cpp_opts ]]
1702    then
1703       for  popts  in  $cpp_opts
1704       do
1705          if [[ $(echo $localhost | cut -c1-3) = ibm ]]
1706          then
1707             cpp_options="${cpp_options},-D__$popts=__$popts"
1708          else
1709             cpp_options="$cpp_options -D__$popts"
1710          fi
1711       done
1712    fi
1713
1714 else
1715
1716
1717       # BEI LOKALEN RECHNUNGEN PRUEFEN, OB EXECUTABLE VORHANDEN
1718    if [[ $do_remote = false ]]
1719    then
1720       if [[ ! -f $executable ]]
1721       then
1722          printf "\n  +++ executable file:  $executable"
1723          printf "\n      does not exist"
1724          locat=executable; exit
1725       fi
1726    fi
1727 fi
1728
1729
1730    # JOBMODUS FESTSTELLEN
1731 if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH  &&  $localhost != lctit  ||  "$QUEUE" != interactive  &&  $localhost = lctit ]]
1732 then
1733    jobmo=BATCH
1734 else
1735    jobmo=INTERACTIVE
1736 fi
1737
1738
1739    # HOSTSPEZIFISCHE DEFAULT-COMPILER SETZEN, FALLS NICHT BEREITS
1740    # DURCH BENUTZER ANDERWEITIG VEREINBART
1741 if [[ "$compiler_name" = "" ]]
1742 then
1743
1744    printf "\n  +++ no compiler specified for \"$localhost $cond1 $cond2\""
1745    locat=compiler_name; exit
1746
1747 fi
1748
1749
1750    # COMPILER AUF NECK UEBERSCHREIBEN
1751 [[ $localhost = neck ]]  &&  compiler_name=mpif90
1752
1753
1754
1755    # TEMPORAEREN KATALOGNAMEN BESTIMMEN
1756 kennung=$RANDOM
1757 if [[ "$tmp_user_catalog" = "" ]]
1758 then
1759    if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
1760    then
1761       tmp_user_catalog=$TMPDIR
1762    elif [[ $localhost = nech ]]
1763    then
1764       tmp_user_catalog=$WRKSHR
1765    else
1766       tmp_user_catalog=/tmp
1767    fi
1768 fi
1769 TEMPDIR=$tmp_user_catalog/${usern}.$kennung
1770
1771
1772    # KATALOGNAMEN FUER ZWISCHENSPEICHERUNG VON FORTSETZUNGSLAUFDATEIEN
1773    # BESTIMMEN
1774 if [[ "$tmp_data_catalog" = "" ]]
1775 then
1776    if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
1777    then
1778       tmp_data_catalog=$WORK/mrun_restart_data
1779    elif [[ $localhost = nech ]]
1780    then
1781       tmp_data_catalog=$WRKSHR/mrun_restart_data
1782    else
1783       tmp_data_catalog=/tmp/mrun_restart_data
1784    fi
1785 fi
1786
1787
1788    # EVENTUELL BEI LOKALEN RECHNUNGEN $-ZEICHEN IN ENVIRONMENT-VARIABLEN
1789    # ERSETZEN
1790 if [[ $do_remote = false  &&  $do_compile = true ]]
1791 then
1792    eval  fopts=\"$fopts\"
1793    eval  lopts=\"$lopts\"
1794 fi
1795
1796
1797
1798    # COMPILE- UND LINK-OPTIONEN BESTIMMEN
1799 fopts="$fopts $netcdf_inc $dvrp_inc"
1800 lopts="$lopts $netcdf_lib $dvrp_lib"
1801 ROPTS="$ropts"
1802 if [[ ( $(echo $host | cut -c1-3) = nec  ||  $(echo $host | cut -c1-3) = ibm  ||  $host = lctit  ||  $host = lcfimm )  &&  -n $numprocs ]]
1803 then
1804    XOPT="-X $numprocs"
1805 fi
1806
1807
1808
1809    # PRUEFEN DER CPU-ZEIT. (CPUMAX WIRD ALS ENV-VARIABLE VOM HAUTPRO-
1810    # GRAMM BENOETIGT
1811 done=false
1812 while [[ $done = false ]]
1813 do
1814    cputime=$cpumax
1815    if (( $cputime == 0 ))
1816    then
1817       printf "\n  +++ cpu-time is undefined"
1818       printf "\n  >>> Please type CPU-time in seconds as INTEGER:"
1819       printf "\n  >>> "
1820       read  cputime  1>/dev/null  2>&1
1821    else
1822       done=true
1823    fi
1824    cpumax=$cputime
1825 done
1826
1827 (( minuten = cputime / 60 ))
1828 (( sekunden = cputime - minuten * 60 ))
1829
1830
1831    # PRUEFEN DER KERNSPEICHERANFORDERUNG
1832 if [[ $do_batch = true ]]
1833 then
1834    done=false
1835    while [[ $done = false ]]
1836    do
1837       if (( memory == 0 ))
1838       then
1839          printf "\n  +++ memory demand is undefined"
1840          printf "\n  >>> Please type memory in  MByte per process  as INTEGER:"
1841          printf "\n  >>> "
1842          read  memory  1>/dev/null  2>&1
1843       else
1844          done=true
1845       fi
1846    done
1847 fi
1848
1849
1850    # PRUEFEN, OB FUER REMOTE-RECHNUNGEN EIN BENUTZERNAME ANGEGEBEN WURDE
1851 if [[ $do_remote = true  &&  -z $remote_username ]]
1852 then
1853    while [[ -z $remote_username ]]
1854    do
1855       printf "\n  +++ username on remote host \"$host\" is undefined"
1856       printf "\n  >>> Please type username:"
1857       printf "\n  >>> "
1858       read  remote_username
1859    done
1860    mc="$mc -u$remote_username"
1861 fi
1862
1863###########################################################################
1864# HEADER-AUSGABE
1865###########################################################################
1866
1867
1868 calltime=$(date)
1869 printf "\n"
1870# [[ $silent = false ]]  &&  clear
1871 printf "#--------------------------------------------------------------# \n"
1872 printf "| $version$calltime | \n"
1873 printf "|                                                              | \n"
1874 spalte1="called on:"; spalte2=$localhost_realname
1875 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1876 if [[ $local_compile = false ]]
1877 then
1878    if [[ $do_remote = true ]]
1879    then
1880       spalte1="execution on:"; spalte2="$host (username: $remote_username)"
1881    else
1882       spalte1="execution on:"; spalte2="$host ($localhost_realname)"
1883    fi
1884 else
1885    spalte1="compiling test only!"; spalte2=""
1886 fi
1887 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1888 if [[ -n $numprocs ]]
1889 then
1890    spalte1="number of PEs:"; spalte2=$numprocs
1891    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1892 fi
1893 if [[ -n $tasks_per_node ]]
1894 then
1895    spalte1="tasks per node:"; spalte2="$tasks_per_node (number of nodes: $nodes)"
1896    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1897 fi
1898 if [[ $threads_per_task != 1 ]]
1899 then
1900    spalte1="threads per task:"; spalte2="$threads_per_task"
1901    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1902 fi
1903 printf "|                                                              | \n"
1904 if [[ $do_compile = true ]]
1905 then
1906    spalte1=cpp-directives:; spalte2=$cpp_options
1907    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1908    zeile=$(echo "$cpp_options" | cut -c41-)
1909    while [[ "$zeile" != "" ]]
1910    do
1911       spalte1=""
1912       spalte2=$zeile
1913       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1914       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
1915    done
1916
1917    spalte1=compiler-options:; spalte2="$fopts"
1918    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1919    zeile=$(echo "$fopts" | cut -c41-)
1920    while [[ "$zeile" != "" ]]
1921    do
1922       spalte1=""
1923       spalte2=$zeile
1924       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1925       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
1926    done
1927
1928    spalte1=linker-options:; spalte2=$lopts
1929    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1930    zeile=$(echo "$lopts" | cut -c41-)
1931    while [[ "$zeile" != "" ]]
1932    do
1933       spalte1=""
1934       spalte2=$zeile
1935       printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1936       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c41-)
1937    done
1938
1939    spalte1="main program":; spalte2=$mainprog
1940    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1941 else
1942    spalte1=executable:; spalte2=$executable
1943    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1944 fi
1945 printf "|                                                              | \n"
1946 spalte1="base name of files":; spalte2=$fname
1947 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1948 if [[ $fname != $afname ]]
1949 then
1950    spalte1="base name of input files":; spalte2=$afname
1951    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1952 fi
1953 spalte1="INPUT control list":; spalte2=$input_list
1954 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1955 spalte1="OUTPUT control list":; spalte2=$output_list
1956 printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1957
1958 if [[ $do_batch = true  ||  "$LOADLBATCH" = yes ]]
1959 then
1960    spalte1="memory demand / PE":; spalte2="$memory MB"
1961    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1962    spalte1=CPU-time:; spalte2="$minuten:$sekunden"
1963    printf "| $spalte1$spalte2 | \n"
1964 fi
1965
1966 if [[ $do_compile = true ]]
1967 then
1968    printf "|                                                              | \n"
1969    printf "| Files to be compiled:                                        | \n"
1970    zeile=$source_list
1971    while [[ "$zeile" != "" ]]
1972    do
1973       spalte3=$zeile
1974       printf "| $spalte3 | \n"
1975       zeile=$(echo "$zeile" | cut -c61-)
1976    done
1977 fi
1978 printf "#--------------------------------------------------------------#"
1979
1980
1981
1982    # BEDINGTE AUSGABE DER DATEIVERBINDUNGEN
1983 if [[ $do_trace = true ]]
1984 then
1985    (( i = 0 ))
1986    while (( i < iin ))
1987    do
1988       (( i = i + 1 ))
1989       if (( i == 1 ))
1990       then
1991          printf "\n\n >>> INPUT-file assignments:\n"
1992       fi
1993       printf "\n     ${localin[$i]} :  ${absnamein[$i]}"
1994    done
1995    (( i = 0 ))
1996    while (( i < iout ))
1997    do
1998       (( i = i + 1 ))
1999       if (( i == 1 ))
2000       then
2001          printf "\n\n >>> OUTPUT-file assignments:\n"
2002       fi
2003       printf "\n     ${localout[$i]} :  ${pathout[$i]}"
2004    done
2005    (( i = 0 ))
2006    while (( i < iic ))
2007    do
2008       (( i = i + 1 ))
2009       if (( i == 1 ))
2010       then
2011          printf "\n\n >>> INPUT-commands:\n"
2012       fi
2013       printf "\n     ${in_command[$i]}" 
2014    done
2015    (( i = 0 ))
2016    while (( i < ioc ))
2017    do
2018       (( i = i + 1 ))
2019       if (( i == 1 ))
2020       then
2021          printf "\n\n >>> OUTPUT-commands:\n"
2022       fi
2023       printf "\n     ${out_command[$i]}" 
2024    done
2025 fi
2026
2027
2028    # ABFRAGEN BEI AUFRUF AUF LOKALER MASCHINE
2029 if [[ $remotecall = false  &&  $silent = false  &&  $jobmo != BATCH ]]
2030 then
2031    antwort=dummy
2032    printf "\n\n"
2033    while [[ "$antwort" != y  &&  "$antwort" != Y  &&  "$antwort" != n  &&  "$antwort" != N ]]
2034    do
2035       printf " >>> everything o.k. (y/n) ?  "
2036       read  antwort
2037    done
2038    if [[ $antwort = n  ||  $antwort = N ]]
2039    then
2040       locat=user_abort; (( iec = 0 )); exit
2041    fi
2042    if [[ $do_batch = true ]]
2043    then
2044       printf " >>> batch-job will be created and submitted"
2045    else
2046       if [[ $local_compile = false ]]
2047       then
2048          printf " >>> MRUN will now continue to execute on this machine"
2049       else
2050          printf " >>> a test compilation will now be carried out on this machine"
2051       fi
2052    fi
2053 fi
2054 
2055
2056
2057
2058     # FALLS AUF DIESER MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
2059     # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
2060 if [[ $do_batch = false ]]
2061 then
2062
2063
2064       # TEMPORAEREN KATALOG ERZEUGEN
2065    mkdir -p  $TEMPDIR
2066    chmod  go+rx  $TEMPDIR
2067    tmpcreate=true
2068
2069
2070       # SAEMTLICHE QUELLTEXT-DATEIEN BZW. AUSFUEHRBARES PROGRAMM IN
2071       # TEMPORAERES VERZEICHNIS KOPIEREN
2072    if [[ $do_compile = true ]]
2073    then
2074
2075          # ON NEC, COMPILATION IS DONE ON HOST CROSS VIA CROSS COMPILING
2076          # CREATE A TEMPORARY DIRECTORY ON THAT MACHINE (HOME MOUNTED VIA NFS)
2077       if [[ $localhost = nech ]]
2078       then
2079          TEMPDIR_COMPILE=$HOME/work/${usern}.$kennung
2080          if  mkdir -p  $TEMPDIR_COMPILE
2081          then
2082             printf "\n  *** \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2083             printf "\n      is generated as temporary directory for cross compiling\n"
2084          else
2085             printf "\n  +++ creating directory \"$TEMPDIR_COMPILE\" "
2086             printf "\n      needed for cross compilation failed"
2087             locat=compile
2088             exit
2089          fi
2090       else
2091          TEMPDIR_COMPILE=$TEMPDIR
2092       fi
2093
2094
2095          # PFADNAMEN FUER DAS MAKE-DEPOSITORY ERMITTELN
2096       line=""
2097       grep "%depository_path" $config_file  >  tmp_mrun
2098       while read line
2099       do
2100          if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2101          then
2102             if [[ "$(echo $line | cut -d" " -s -f3)" = "" ]]
2103             then
2104                global_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2105             fi
2106          fi
2107       done < tmp_mrun
2108
2109       line=""
2110       grep  " $localhost" $config_file | grep "%depository_path"  >  tmp_mrun
2111       while read line
2112       do
2113          if [[ "$line" != ""  &&  $(echo $line | cut -c1) != "#" ]]
2114          then
2115             local_depository_path=`echo $line | cut -d" " -s -f2`
2116          fi
2117       done < tmp_mrun
2118
2119       if [[ "$local_depository_path" = "" ]]
2120       then
2121          if [[ "$global_depository_path" != "" ]]
2122          then
2123             local_depository_path=$global_depository_path
2124          else
2125             printf "\n\n  +++ no depository path found in configuration file"
2126             printf "\n      for local host \"$localhost\" "
2127             printf "\n      please set \"\%depository_path\" in configuration file\n"
2128             locat=config_file; exit
2129          fi
2130       fi
2131       eval local_depository_path=$local_depository_path
2132
2133       basename=`print $mainprog | cut -f1 -d"."`
2134       eval make_depository=${local_depository_path}/${basename}_current_version.tar
2135       if [[ ! -f $make_depository ]]
2136       then
2137          printf "\n"
2138          printf "\n  *** WARNING: make depository \"$make_depository\" not found"
2139          printf "\n               \"make\" will fail, if the Makefile or other source files are missing\n"
2140       else
2141          cp  $make_depository  $TEMPDIR_COMPILE
2142          cd  $TEMPDIR_COMPILE
2143          tar -xf  $make_depository  >  /dev/null  2>&1
2144          cd -  > /dev/null
2145       fi
2146
2147       cp  SOURCES_FOR_RUN_$fname/*  $TEMPDIR_COMPILE
2148
2149          # FALLS USER-INTERFACE VORHANDEN UND AUF DATEI MIT ANDEREM NAMEN
2150          # ALS user_interface.f90 LIEGT, DIESEN GEAENDERTEN NAMEN INS
2151          # MAKEFILE EINTRAGEN
2152       cd  $TEMPDIR_COMPILE
2153       interface_file=`grep -l "END SUBROUTINE user_parin" $source_list`
2154       if [[ "$interface_file" != "" ]]
2155       then
2156          interface_file=`echo $interface_file | cut -d"." -f1`
2157          mv  Makefile  Makefile_old
2158          sed "s/user_interface/$interface_file/g"  Makefile_old  >  Makefile
2159       fi
2160       cd -  > /dev/null
2161    else
2162       cp  $executable   ${TEMPDIR}/a.out
2163    fi
2164
2165
2166       # WECHSEL IN TEMPORAEREN KATALOG
2167    cd $TEMPDIR
2168    printf "\n  *** changed to temporary directory: $TEMPDIR"
2169
2170
2171       # OUTPUT-DATEI-VERBINDUNGEN AUF TEMPORAERER DATEI ABLEGEN
2172       # DIESE DATEI KANN VON SPAETER AUFZURUFENDEN BENUTZERPROZEDUREN GELESEN
2173       # WERDEN, UM ZU LOKALEN DATEINAMEN GEHOERENDE PERMANENTE NAMEN ZU
2174       # ERMITTELN
2175    (( i = 0 ))
2176    while (( i < iout ))
2177    do
2178       (( i = i + 1 ))
2179       if [[ "${actionout[$i]}" = tr  ||  "${actionout[$i]}" = tra  ||  "${actionout[$i]}" = trpe ]]
2180       then
2181          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2182       else
2183          printf "${localout[$i]} ${actionout[$i]}\n${pathout[$i]}\n${frelout[$i]}\n" >> OUTPUT_FILE_CONNECTIONS
2184       fi
2185    done
2186
2187
2188       # EVTL. UEBERSETZUNGSAKTIONEN STARTEN
2189    if [[ $do_compile = true ]]
2190    then
2191
2192
2193          # COMPILING WITH MAKE (ON NEC COMPILER IS CALLED ON HOST CROSS)
2194       printf "\n\n\n  *** compilation starts \n$striche\n"
2195       printf "  *** compilation with make using following options:\n"
2196       printf "      compilername:             $compiler_name\n"
2197       printf "      options:                  $fopts\n"
2198       printf "      preprocessor-directives:  $cpp_options \n"
2199       printf "      linker-options:           $lopts \n"
2200       printf "      source code files:        $source_list \n"
2201
2202       if [[ $localhost = nech ]]
2203       then
2204          ssh  136.172.44.192 -l $usern ". /SX/opt/etc/initsx.sh; cd \$HOME/work/${usern}.$kennung; sxmake -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT=\"$cpp_options\"  F90FLAGS=\"$fopts\"  LDFLAGS=\"$lopts\" "
2205          cp  $TEMPDIR_COMPILE/a.out  .
2206          [[ $? != 0 ]]  &&  compile_error=true
2207          rm -rf  $TEMPDIR_COMPILE
2208       else
2209          make -f Makefile PROG=a.out  F90=$compiler_name  COPT="$cpp_options"  F90FLAGS="$fopts"  LDFLAGS="$lopts"
2210       fi
2211
2212       if [[ $? != 0  ||  "$compile_error" = true  ||  "$module_compile_error" = true ]]
2213       then
2214          printf "\n  +++ error occured while compiling or linking"
2215          locat=compile
2216          exit
2217       else
2218          printf "$striche\n  *** compilation finished \n"
2219       fi
2220    fi
2221
2222
2223       # FALLS NUR TESTWEISE KOMPILIERT WERDEN SOLLTE, IST MRUN JETZT FERTIG
2224    if [[ $local_compile = true ]]
2225    then
2226       cd  $HOME
2227       rm -rf $TEMPDIR
2228       locat=local_compile; exit
2229    fi
2230
2231
2232       # BEREITSTELLEN DER INPUT-DATEIEN
2233       # SCHLEIFE UEBER ALLE VOM BENUTZER ANGEGEBENEN DATEIEN
2234    (( i = 0 ))
2235    while (( i < iin ))
2236    do
2237       (( i = i + 1 ))
2238       if (( i == 1 ))
2239       then
2240          printf "\n\n  *** providing INPUT-files:\n$striche"
2241       fi
2242
2243
2244          # OPTIONALE DATEIEN BEI NICHTVORHANDENSEIN UEBERGEHEN
2245       if [[ "${transin[$i]}" = unavailable ]]
2246       then
2247          if [[ "${extin[$i]}" = ""  ||  "${extin[$i]}" = " " ]]
2248          then
2249             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}\" "
2250             printf "\n               is not available!"
2251          else
2252             printf "\n  +++ WARNING: input file \"${pathin[$i]}/${afname}${endin[$i]}.${extin[$i]}\" "
2253             printf "\n               is not available!"
2254          fi
2255          continue
2256       fi
2257
2258          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
2259       files_for_pes=false; datentyp=file
2260       if [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
2261       then
2262          files_for_pes=true; datentyp=directory
2263          actionin[$i]=""
2264       elif [[ "${actionin[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
2265       then
2266          actionin[$i]=""
2267       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
2268       then
2269          files_for_pes=true; datentyp=directory
2270          actionin[$i]="ar"
2271       elif [[ "${actionin[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2272       then
2273          actionin[$i]="ar"
2274       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
2275       then
2276          files_for_pes=true; datentyp=directory
2277          actionin[$i]="fl"
2278       elif [[ "${actionin[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2279       then
2280          actionin[$i]="fl"
2281       fi
2282
2283       if [[ $files_for_pes = true ]]
2284       then
2285          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}/....  to  ${localin[$i]}"
2286       else
2287          printf "\n  >>> INPUT: ${absnamein[$i]}  to  ${localin[$i]}"
2288       fi
2289
2290          # INPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. ES WIRD GEPRUEFT,
2291          # OB DIESE DATEI NOCH AUF DEM TEMPORAEREN DATENKATALOG VORHANDEN
2292          # IST. FALLS NICHT, WIRD VERSUCHT, SIE ANSCHLIESSEND VOM ARCHIV-
2293          # SERVER ZU HOLEN
2294       if [[ "${actionin[$i]}" = fl ]]
2295       then
2296          printf "\n      $datentyp will be fetched from temporary directory \"${tmp_data_catalog}\" !"
2297          if [[ $files_for_pes = false ]]
2298          then
2299             if [[ -f "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2300             then
2301                ln  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2302                got_tmp[$i]=true
2303             elif [[ -f "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2304             then
2305                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2306                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2307                cp  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2308             else
2309                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2310                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2311                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2312                actionin[$i]=ar
2313             fi
2314          else
2315             if [[ -d "$tmp_data_catalog/${frelin[$i]}" ]]
2316             then
2317                mkdir  ${localin[$i]}
2318                ln  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}/*  ${localin[$i]}
2319                got_tmp[$i]=true
2320             elif [[ -d "$WORK/${frelin[$i]}"  &&  $ignore_archive_error = true ]]
2321             then
2322                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" !"
2323                printf "\n  *** trying to use backup copy in \"$WORK\" "
2324                cp -r  $WORK/${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2325             else
2326                printf "\n  +++ $datentyp not found in \"$tmp_data_catalog\" "
2327                printf "\n      or \"$tmp_data_catalog\" does not exist!"
2328                printf "\n  *** trying to get copy from archive"
2329                actionin[$i]=ar
2330             fi
2331          fi
2332       fi
2333
2334
2335          # DATEI LIEGT AUF ARCHIV-SERVER
2336       if [[ "${actionin[$i]}" = ar ]]
2337       then
2338
2339          if [[ $files_for_pes = false ]]
2340          then
2341             printf "\n      file will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2342          else
2343             printf "\n      directory will be restored from archive-system ($archive_system)!"
2344          fi
2345
2346          file_restored=false
2347
2348          if [[ $archive_system = asterix ]]
2349          then
2350             do_stagein=true
2351             (( stagein_anz = 0 ))
2352             while [[ $do_stagein = true ]]
2353             do
2354                if [[ $files_for_pes = false ]]
2355                then
2356                   stagein  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2357                else
2358                   stagein  -t  -O  ${frelin[$i]}  >  STAGEIN_OUTPUT
2359                fi
2360                cat  STAGEIN_OUTPUT
2361                if [[ $(grep -c "st.msg:i24"  STAGEIN_OUTPUT) != 0 ]]
2362                then
2363                   file_restored=true
2364                   do_stagein=false
2365                else
2366                   (( stagein_anz = stagein_anz + 1 ))
2367                   if (( stagein_anz == 10 ))
2368                   then
2369                      printf "\n  +++ stagein stoped after 10 tries"
2370                      locat=stage
2371                      exit
2372                   fi
2373                   printf "\n  +++ restoring from archive failed, trying again:"
2374                   sleep 900
2375                fi
2376             done
2377          elif [[ $archive_system = DMF ]]
2378          then
2379             if [[ $files_for_pes = false ]]
2380             then
2381                printf "\n  +++ restoring of single files impossible with $archive_system !\n"
2382                locat=DMF
2383                exit
2384             else
2385                find  $ARCHIVE/${frelin[$i]}  -type m  -print  |  dmget
2386                cp  -r $ARCHIVE/${frelin[$i]}  $PWD
2387                file_restored=true
2388             fi
2389          elif [[ $archive_system = tivoli ]]
2390          then
2391             if [[ $files_for_pes = false ]]
2392             then
2393                if [[ $localhost = ibmh ]]
2394                then
2395                   ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2396                else
2397                   ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cp  $PERM/${frelin[$i]}  $PWD"
2398                fi
2399             else
2400                (( inode = 0 ))
2401                while (( inode < nodes ))
2402                do
2403                   if [[ $localhost = ibmh ]]
2404                   then
2405                      ssh  $usern@hdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2406                   else
2407                      ssh  $usern@bdata.hlrn.de  "cd $PWD; tar  xf  $PERM/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar"
2408                   fi
2409                   (( inode = inode + 1 ))
2410                done
2411             fi
2412             file_restored=true
2413          elif [[ $archive_system = ut ]]
2414          then
2415             if [[ $files_for_pes = false ]]
2416             then
2417                cp  $UT/${frelin[$i]}  .
2418             else
2419                (( inode = 0 ))
2420                while (( inode < nodes ))
2421                do
2422                   tar  xf  $UT/${frelin[$i]}/${frelin[$i]}.node_$inode.tar
2423                   (( inode = inode + 1 ))
2424                done
2425             fi
2426             file_restored=true
2427          else
2428             printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"   restore impossible!"
2429             locat=rearchive
2430             exit
2431          fi
2432
2433          if [[ $file_restored = true ]]
2434          then
2435
2436                # DATEI AUCH AUF TEMPORAERES DATENVERZEICHNIS LEGEN, DAMIT
2437                # SIE BEI WEITEREN ZUGRIFFEN NOCH VORHANDEN IST
2438             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog; chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
2439             if [[ $files_for_pes = false ]]
2440             then
2441                ln  -f  ${frelin[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2442             else
2443                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2444                ln  -f  ${frelin[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
2445             fi
2446             got_tmp[$i]=true
2447
2448                # DATEI UNTER LOKALEM NAMEN ZUR VERFUEGUNG STELLEN
2449             mv  ${frelin[$i]}  ${localin[$i]}
2450
2451          fi
2452       fi
2453
2454
2455          # DATEI LIEGT IM VOM BENUTZER ANGEGEBENEN VERZEICHNIS
2456       if [[ "${actionin[$i]}" = ""  ||  "${actionin[$i]}" = "di"  ||  "${actionin[$i]}" = "npe" ]]
2457       then
2458
2459          if [[ "${actionin[$i]}" = "npe"  &&  -n $numprocs ]]
2460          then
2461
2462                # DATEI WIRD FUER DIE PROZESSOREN EINES PARALLERECHNERS BEREITGESTELLT
2463             printf "\n      file will be provided for $numprocs processors"
2464             mkdir  ${localin[$i]}
2465             ival=$numprocs
2466             (( ii = 0 ))
2467             while (( ii <= ival-1 ))
2468             do
2469                if (( ii < 10 ))
2470                then
2471                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_000$ii
2472                elif (( ii < 100 ))
2473                then
2474                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_00$ii
2475                elif (( ii < 1000 ))
2476                then
2477                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_0$ii
2478                else
2479                   cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}/_$ii
2480                fi
2481                (( ii = ii + 1 ))
2482             done
2483
2484          else
2485
2486             if [[ $files_for_pes = true ]]
2487             then
2488
2489                   # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
2490                   # DATEIEN WERDEN BEREITGESTELLT, INDEM ZUERST DER GESAMTE
2491                   # KATALOGINHALT KOPIERT UND DANN DIE EINZELNEN DATEIEN
2492                   # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
2493                printf "\n      providing $numprocs files for the respective processors"
2494                mkdir  ${localin[$i]}
2495                cp -r  ${absnamein[$i]}/*  ${localin[$i]}
2496
2497             else
2498                   # BEREITSTELLUNG AUF EINPROZESSORRECHNERN
2499                cp  ${absnamein[$i]}  ${localin[$i]}
2500             fi
2501          fi
2502       fi
2503
2504    done
2505    if (( i != 0 ))
2506    then
2507       printf "\n$striche\n  *** all INPUT-files provided \n"
2508    fi
2509
2510
2511       # NAMELIST-DATEI MIT WERTEN VON ENVIRONMENT-VARIABLEN ERZEUGEN (ZU
2512       # LESEN VON PALM)
2513    cat  >  ENVPAR  <<  %%END%%
2514 &envpar  run_identifier = '$fname', host = '$localhost',
2515          write_binary = '$write_binary', tasks_per_node = $tasks_per_node,
2516          maximum_cpu_time_allowed = ${cpumax}.,
2517          revision = '$global_revision' /
2518
2519%%END%%
2520
2521
2522       # EVENTUELLE INPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
2523    (( i = 0 ))
2524    while (( i < iic ))
2525    do
2526       (( i = i + 1 ))
2527       if (( i == 1 ))
2528       then
2529          printf "\n\n  *** execution of INPUT-commands:\n$striche"
2530       fi
2531       printf "\n  >>> ${in_command[$i]}"
2532       eval  ${in_command[$i]}
2533       if (( i == iic ))
2534       then
2535          printf "\n$striche\n"
2536       fi
2537    done
2538
2539
2540       # VERBLEIBENDE CPU-ZEIT BERECHNEN
2541    cpurest=${cpumax}.
2542
2543
2544       # PROGRAMMSTART
2545    printf "\n\n  *** execution starts in directory\n      \"`pwd`\"\n$striche\n"
2546    PATH=$PATH:$TEMPDIR
2547
2548    if [[ "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ]]
2549    then
2550       if [[ "$ENVIRONMENT" = BATCH ]]
2551       then
2552          printf "\n  +++ debug is allowed in interactive mode only"
2553          locat=debug
2554          exit
2555       fi
2556       if [[ $localhost = decalpha ]]
2557       then
2558          dxladebug  a.out
2559       elif [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh ]]
2560       then
2561
2562             # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2563          export MP_SHARED_MEMORY=yes
2564          export AIXTHREADS_SCOPE=S
2565          export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2566          export AUTHSTATE=files
2567          export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2568
2569             # FOLLOWING OPTIONS ARE MANDATORY FOR TOTALVIEW
2570          export MP_ADAPTER_USE=shared
2571          export MP_CPU_USE=multiple
2572          export MP_TIMEOUT=1200
2573
2574          unset  MP_TASK_AFFINITY
2575
2576             # SO FAR, TOTALVIEW NEEDS HOSTFILE MECHANISM FOR EXECUTION
2577          #(( ii = 1 ))
2578          #while (( ii <= $numprocs ))
2579          #do
2580          #   echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2581          #   (( ii = ii + 1 ))
2582          #done
2583          #export MP_HOSTFILE=hostfile
2584
2585          if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2586          then
2587             totalview   poe  a.out  $ROPTS
2588          else
2589             echo totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2590             export TVDSVRLAUNCHCMD=ssh
2591             totalview   poe  -a a.out  -procs $numprocs  -rmpool 0  -nodes 1   $ROPTS
2592          fi
2593       else 
2594          printf "\n  +++ no debug available on \"$localhost\" "
2595          printf "\n      or not implemented in mrun so far"
2596          locat=debug
2597          exit
2598       fi
2599    else
2600       if [[ -n $numprocs ]]
2601       then
2602
2603             # RUNNING THE PROGRAM ON PARALLEL MACHINES
2604          if [[ $(echo $host | cut -c1-3) = ibm ]]
2605          then
2606                # SETUP THE IBM MPI ENVIRONMENT
2607             export MP_SHARED_MEMORY=yes
2608             export AIXTHREAD_SCOPE=S
2609             export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2610             export XLSMPOPTS="spins=0:yields=0:stack=20000000"
2611             export AUTHSTATE=files
2612             export XLFRTEOPTS="nlwidth=132:err_recovery=no"    # RECORD-LENGTH OF NAMELIST-OUTPUT
2613             #  export MP_PRINTENV=yes
2614
2615                # TUNING-VARIABLEN ZUR VERBESSERUNG DER KOMMUNIKATION
2616                # ZEIGEN ABER DERZEIT (SEP 04, FEDERATION) KAUM WIRKUNG
2617             export MP_WAIT_MODE=poll
2618             [[ $node_usage = not_shared ]]  &&  export MP_SINGLE_THREAD=yes
2619#             export MP_EAGER_LIMIT=65535
2620
2621#                # TESTWEISE FUER TURBOMPI (JAN 05)
2622#             export MPJ_MTAB=128
2623#             export MPJ_ALLTOALL=1
2624#             export MPJ_ALLTOALLV=1
2625
2626             if [[ "$LOADLBATCH" = yes ]]
2627             then
2628                printf "\n--- Control: OMP_NUM_THREADS = \"$OMP_NUM_THREADS\" \n"
2629                if [[ "$cond1" = hpmcount  ||  "$cond2" = hpmcount ]]
2630                then
2631                   /opt/optibm/HPM_2_4_1/bin/hpmcount  a.out  $ROPTS
2632                else
2633                   poe ./a.out  $ROPTS
2634                fi
2635             else
2636                if [[ $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms ]]
2637                then
2638                   poe  a.out  -procs $numprocs  -nodes 1  -rmpool 0  $ROPTS
2639                elif [[ $localhost = ibmy ]]
2640                then
2641                   if [[ -f $hostfile ]]
2642                   then
2643                      cp  $hostfile  hostfile
2644                   else
2645                      (( ii = 1 ))
2646                      while (( ii <= $numprocs ))
2647                      do
2648                         echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2649                         (( ii = ii + 1 ))
2650                      done
2651                   fi
2652                   export MP_HOSTFILE=hostfile
2653                   ./a.out  -procs $tasks_per_node  $ROPTS
2654                else
2655                   if [[ "$host_file" = "" ]]
2656                   then
2657                      printf "\n  +++ no hostfile given in configuration file"
2658                      locat=config_file
2659                      exit
2660                   else
2661                      eval host_file=$host_file
2662                   fi
2663                   export MP_HOSTFILE=$host_file
2664                   poe  a.out  -procs $numprocs  -tasks_per_node $numprocs  $ROPTS
2665                fi
2666             fi
2667          elif [[ $host = nech  ||  $host = neck ]]
2668          then
2669             (( ii = nodes ))
2670             if [[ $ii = 1 ]]
2671             then
2672                export F_ERRCNT=0        # acceptable number of errors before program is stopped
2673                export MPIPROGINF=YES
2674                #  export F_TRACE=YES|FMT1|FMT2  # output of ftrace informations to job protocol
2675                echo "*** execution on single node with mpirun"
2676                mpirun  -np $numprocs  ./a.out  $ROPTS
2677             else
2678                (( i = 0 ))
2679                while (( i < ii ))
2680                do
2681                   echo "-h $i  -p $tasks_per_node  -e ./mpi_exec_shell"  >>  multinode_config
2682                   (( i = i + 1 ))
2683                done
2684
2685                echo "#!/bin/sh"                         >   mpi_exec_shell
2686                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
2687                echo "set -u"                            >>  mpi_exec_shell
2688                echo "F_ERRCNT=0"                        >>  mpi_exec_shell
2689                echo "MPIPROGINV=YES"                    >>  mpi_exec_shell
2690                echo "OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task" >>  mpi_exec_shell
2691                echo "cpurest=$cpurest"                  >>  mpi_exec_shell
2692                echo "fname=$fname"                      >>  mpi_exec_shell
2693                echo "localhost=$localhost"              >>  mpi_exec_shell
2694                echo "return_addres=$return_addres"      >>  mpi_exec_shell
2695                echo "return_username=$return_username"  >>  mpi_exec_shell
2696                echo "tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  mpi_exec_shell
2697                echo "write_binary=$write_binary"        >>  mpi_exec_shell
2698                echo "use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
2699                echo "  "                                >>  mpi_exec_shell
2700                echo "export F_ERRCNT"                   >>  mpi_exec_shell
2701                echo "export MPIPROGINV"                 >>  mpi_exec_shell
2702                echo "export OMP_NUM_THREADS"            >>  mpi_exec_shell
2703                echo "export cpurest"                    >>  mpi_exec_shell
2704                echo "export fname"                      >>  mpi_exec_shell
2705                echo "export localhost"                  >>  mpi_exec_shell
2706                echo "export return_addres"              >>  mpi_exec_shell
2707                echo "export return_username"            >>  mpi_exec_shell
2708                echo "export tasks_per_node"             >>  mpi_exec_shell
2709                echo "export write_binary"               >>  mpi_exec_shell
2710                echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  mpi_exec_shell
2711                echo " "                                 >>  mpi_exec_shell
2712                echo "exec  ./a.out"                     >>  mpi_exec_shell
2713
2714                chmod u+x  mpi_exec_shell
2715                export MPIPROGINF=YES
2716                mpirun  -f multinode_config  &
2717                wait
2718
2719             fi
2720          elif [[ $(echo $host | cut -c1-2) = lc  &&  $host != lctit ]]
2721          then
2722
2723                # COPY HOSTFILE FROM SOURCE DIRECTORY OR CREATE IT, IF IT
2724                # DOES NOT EXIST
2725             if [[ -f $hostfile ]]
2726             then
2727                cp  $hostfile  hostfile
2728             else
2729                (( ii = 1 ))
2730                while (( ii <= $numprocs / $threads_per_task ))
2731                do
2732                   echo  $localhost_realname  >>  hostfile
2733                   (( ii = ii + 1 ))
2734                done
2735             fi
2736             (( ii = $numprocs / $threads_per_task ))
2737             eval zeile=\"`head -n $ii  hostfile`\"
2738             printf "\n  *** running on: $zeile"
2739             export OMP_NUM_THREADS=$threads_per_task
2740             if [[ $threads_per_task != 1 ]]
2741             then
2742                printf "\n      threads per task: $threads_per_task"
2743             fi
2744             if [[ $run_coupled_model = false ]]
2745             then
2746                printf "\n\n"
2747                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $ii  a.out  $ROPTS
2748             else
2749                ((  iii = ii / 2 ))
2750                printf "\n      coupled run ($iii atmosphere, $iii ocean)"
2751                printf "\n\n"
2752                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iii  -env coupling_mode atmosphere_to_ocean  a.out  $ROPTS  &
2753                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $iii  -env coupling_mode ocean_to_atmosphere  a.out  $ROPTS  &
2754                wait
2755             fi
2756
2757#             if [[ $scirocco = true ]]
2758#             then
2759#                mpiexec  -machinefile hostfile  -n $ii  a.out  $ROPTS
2760#             else
2761#                mpirun  -machinefile hostfile  -np $ii  a.out  $ROPTS
2762#             fi
2763
2764          elif [[ $host = decalpha ]]
2765          then
2766             dmpirun  -np $numprocs  a.out  $ROPTS
2767          elif [[ $host = lctit ]]
2768          then
2769             export runfile=runfile.$kennung
2770
2771             echo "cd $PWD"                                  >   $runfile
2772             echo "export OMP_NUM_THREADS=$OMP_NUM_THREADS"  >>  $runfile
2773             echo "export cpurest=$cpurest"                  >>  $runfile
2774             echo "export fname=$fname"                      >>  $runfile
2775             echo "export localhost=$localhost"              >>  $runfile
2776             echo "export return_addres=$return_addres"      >>  $runfile
2777             echo "export return_username=$return_username"  >>  $runfile
2778             echo "export tasks_per_node=$tasks_per_node"    >>  $runfile
2779             echo "export write_binary=$write_binary"        >>  $runfile
2780             echo "export use_seperate_pe_for_dvrp_output=$use_seperate_pe_for_dvrp_output"  >>  $runfile
2781             echo "./a.out"                                  >>  $runfile
2782             chmod  u+x  $runfile
2783
2784             if [[ "$QUEUE" = interactive ]]
2785             then
2786                mpirun  -np $numprocs  a.out  $ROPTS
2787             else
2788                n1ge  -fore  -g 1S060156  -mpi $numprocs  -mem 4  -N palm  -q $queue  a.out  $ROPTS
2789             fi
2790
2791             rm  $runfile
2792          else
2793             mpprun  -n $numprocs  a.out  $ROPTS
2794          fi
2795          [[ $? != 0 ]]  &&  execution_error=true
2796
2797
2798             # PERFORMANCE-AUSWERTUNG MIT APPRENTICE
2799          if [[ "$cond1" = apprentice  ||  "$cond2" = apprentice ]]
2800          then
2801             apprentice
2802          fi
2803       else
2804          a.out  $ROPTS
2805       fi
2806    fi
2807    if [[ $? != 0  ||  $execution_error = true ]]
2808    then
2809
2810          # ABBRUCH BEI LAUFZEITFEHLER
2811#       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output*
2812       printf "\n  +++ runtime error occured"
2813       locat=execution
2814       exit
2815    else
2816#       [[ ! ( "$cond1" = debug  ||  "$cond2" = debug ) ]]  &&  cat  aout_output*
2817       printf "\n$striche\n  *** execution finished \n"
2818    fi
2819
2820
2821
2822       # EVENTUELLE OUTPUT-KOMMANDOS ABARBEITEN
2823    (( i = 0 ))
2824    while (( i < ioc ))
2825    do
2826       (( i = i + 1 ))
2827       if (( i == 1 ))
2828       then
2829          printf "\n\n  *** execution of OUTPUT-commands:\n$striche"
2830       fi
2831       printf "\n  >>> ${out_command[$i]}"
2832       eval  ${out_command[$i]}
2833       if (( i == ioc ))
2834       then
2835          printf "\n$striche\n"
2836       fi
2837    done
2838
2839
2840       # EVTL. INHALT DES AKTUELLEN VERZEICHNISSES AUSGEBEN
2841    if [[ $do_trace = true ]]
2842    then
2843       printf "\n\n"
2844       ls -al
2845    fi
2846
2847
2848
2849       # OUTPUT-DATEIEN AN IHRE ZIELORTE KOPIEREN
2850    (( i = 0 ))
2851    while (( i < iout ))
2852    do
2853       (( i = i + 1 ))
2854       if (( i == 1 ))
2855       then
2856          printf "\n\n  *** saving OUTPUT-files:\n$striche"
2857       fi
2858
2859          # PRUEFEN, OB EINZELDATEI ODER DATEI PRO PROZESSOR
2860       files_for_pes=false; filetyp=file
2861       if [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  -n $numprocs ]]
2862       then
2863          files_for_pes=true; filetyp=directory
2864          actionout[$i]=""
2865       elif [[ "${actionout[$i]}" = pe  &&  ! -n $numprocs ]]
2866       then
2867          actionout[$i]=""
2868       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  -n $numprocs ]]
2869       then
2870          files_for_pes=true; filetyp=directory
2871          actionout[$i]="ar"
2872       elif [[ "${actionout[$i]}" = arpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2873       then
2874          actionout[$i]="ar"
2875       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  -n $numprocs ]]
2876       then
2877          files_for_pes=true; filetyp=directory
2878          actionout[$i]="fl"
2879       elif [[ "${actionout[$i]}" = flpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2880       then
2881          actionout[$i]="fl"
2882       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  -n $numprocs ]]
2883       then
2884          files_for_pes=true; filetyp=directory
2885          actionout[$i]="tr"
2886       elif [[ "${actionout[$i]}" = trpe  &&  ! -n $numprocs ]]
2887       then
2888          actionout[$i]="tr"
2889       fi
2890
2891       if [[ ! -f ${localout[$i]}  &&  $files_for_pes = false ]]
2892       then
2893          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}  does not exist\n"
2894       elif [[ ! -f ${localout[$i]}/_0000  &&  $files_for_pes = true ]]
2895       then
2896          printf "\n  +++ temporary OUTPUT-file  ${localout[$i]}/....  does not exist\n"
2897       else
2898
2899
2900             # KOPIEREN PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
2901             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
2902             # REMOTE-RECHNUNGEN
2903          if [[ "${actionout[$i]}" = tr ]]
2904          then
2905             if [[ $localhost != $fromhost ]]
2906             then
2907                if [[ $files_for_pes = false ]]
2908                then
2909                   cps=""
2910                   cst=""
2911                else
2912                   cps=-c
2913                   cst="/"
2914                fi
2915                if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
2916                then
2917
2918                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
2919                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
2920                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
2921                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
2922                   if [[ $files_for_pes = false ]]
2923                   then
2924                      ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
2925                   else
2926                      mkdir  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
2927                      ln  ${localout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
2928                   fi
2929
2930                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
2931                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
2932
2933                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP in seperate job to"
2934                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst"
2935                   printf "\n              or higher cycle\n"
2936                   echo "batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
2937
2938                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
2939
2940                   if [[ $localhost = nech ]]
2941                   then
2942                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
2943                   else
2944                      if [[ "$LOGNAME" = b323013 ]]
2945                      then
2946                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
2947                      else
2948                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
2949                      fi
2950                   fi
2951
2952                else
2953
2954                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
2955                   transfer_failed=false
2956                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}$cst  by SCP to"
2957                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}$cst\n"
2958                   batch_scp $cps -b -m -u $return_username $return_addres  ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
2959                   [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
2960
2961                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
2962                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
2963                   if [[ $transfer_failed = true ]]
2964                   then
2965                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
2966                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
2967
2968                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
2969                         # ANLEGEN.
2970                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
2971                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
2972                      then
2973                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
2974                         printf "      $local_catalog \n"
2975                         mkdir -p  $local_catalog
2976                      fi
2977                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
2978                      transfer_problems=true
2979                   fi
2980                fi
2981             else
2982
2983                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR KOPIERT WIRD
2984                actionout[$i]=""
2985             fi
2986          fi
2987
2988
2989             # APPEND PER FTP/SCP (IMMER IM BINAERMODUS, -M: FALLS ZIELKATALOG
2990             # NICHT VORHANDEN, WIRD VERSUCHT, IHN ANZULEGEN), ABER NUR BEI
2991             # REMOTE-RECHNUNGEN
2992          if [[ "${actionout[$i]}" = tra ]]
2993          then
2994             if [[ $localhost != $fromhost ]]
2995             then
2996                if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = nech ]]
2997                then
2998
2999                      # TRANSFER IN EIGENSTAENDIGEM JOB
3000                      # ZUERST KOPIE DER DATEI INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3001                   [[ ! -d $tmp_data_catalog/TRANSFER ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog/TRANSFER
3002                   file_to_transfer=${fname}_${localout[$i]}_to_transfer_$kennung
3003                   ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/TRANSFER/$file_to_transfer
3004
3005                   echo "set -x"                                    >    transfer_${localout[$i]}
3006                   echo "cd  $tmp_data_catalog/TRANSFER"            >>   transfer_${localout[$i]}
3007
3008                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP in seperate job to"
3009                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}"
3010                   printf "\n              or higher cycle\n"
3011                   echo "batch_scp -A -b -m -u $return_username $return_addres  $file_to_transfer \"${pathout[$i]}\" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}"  >>  transfer_${localout[$i]}
3012
3013                   echo "[[ \$? = 0 ]]  &&  rm  $file_to_transfer"  >>  transfer_${localout[$i]}
3014
3015                   if [[ $localhost = nech ]]
3016                   then
3017                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3018                   else
3019                      if [[ $LOGNAME = b323013 ]]
3020                      then
3021                         subjob  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3022                      else
3023                         subjob  -d  -v  -q c1  -X 0  -m 1000  -t 900  transfer_${localout[$i]}
3024                      fi
3025                   fi
3026
3027                else
3028
3029                      # TRANSFER INNERHALB DIESES JOBS
3030                   transfer_failed=false
3031                   printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append by SCP to"
3032                   printf "\n              ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}\n"
3033                   batch_scp -A -b -m -u $return_username  $return_addres ${localout[$i]} "${pathout[$i]}" ${localhost}_${fname}${endout[$i]}  ${extout[$i]}
3034                   [[ $? != 0 ]]  &&  transfer_failed=true
3035
3036                      # BEI FEHLGESCHLAGENEM TRANSFER SICHERUNGSKOPIE AUF
3037                      # LOKALER MASCHINE ANLEGEN
3038                   if [[ $transfer_failed = true ]]
3039                   then
3040                      printf "  +++ transfer failed. Trying to save a copy on the local host under:\n"
3041                      printf "      ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung\n"
3042
3043                         # ERSTMAL PRUEFEN, OB VERZEICHNIS EXISTIERT. GEGEBENENFALLS
3044                         # ANLEGEN
3045                      eval  local_catalog=${pathout[$i]}
3046                      if [[ ! -d $local_catalog ]]
3047                      then
3048                         printf "  *** local directory does not exist. Trying to create:\n"
3049                         printf "      $local_catalog \n"
3050                         mkdir -p  $local_catalog
3051                      fi
3052
3053                      eval  cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}/${localhost}_${fname}${endout[$i]}_$kennung
3054                      transfer_problems=true
3055                   fi
3056                fi
3057             else
3058
3059                   # WERTZUWEISUNG, SO DASS WEITER UNTEN NUR APPEND AUF
3060                   # LOKALER MASCHINE DURCHGEFUEHRT WIRD
3061                actionout[$i]=a
3062             fi
3063          fi
3064
3065
3066             # OUTPUT-DATEI FUER EINEN FORTSETZUNGSLAUF. DATEI WIRD PER
3067             # LINK AUF DEN TEMPORAEREN DATENKATALOG GELEGT. OPTION -f WIRD
3068             # VERWENDET, FALLS DORT NOCH EINE DATEI GLEICHEN NAMENS VORHANDEN
3069             # SEIN SOLLTE. ANSCHLIESSEND WIRD SEINE ARCHIVIERUNG ANGESTOSSEN
3070          if [[ "${actionout[$i]}" = fl ]]
3071          then
3072             [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3073             chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3074             if [[ $files_for_pes = false ]]
3075             then
3076                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3077                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3078                ln -f  ${localout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3079             else
3080                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/....  to"
3081                printf "\n              $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} (temporary data catalog)\n"
3082                mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3083                ln -f  ${localout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3084             fi
3085
3086
3087                # ARCHIVIERUNGSJOB WIRD ERZEUGT UND ABGESCHICKT
3088             if [[ $store_on_archive_system = true ]]
3089             then
3090
3091                if [[ $archive_system = asterix ]]
3092                then
3093                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3094                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3095                   then
3096                      echo "stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3097                   else
3098                      echo "stageout -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT${i}_$kennung" >> archive_${frelout[$i]}
3099                   fi
3100                   echo "cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"               >> archive_${frelout[$i]}
3101                   echo "if [[ \$(grep -c \"st.msg:150\"  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung) != 0 ]]" >> archive_${frelout[$i]}
3102                   echo "then"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3103                   echo "   do_stageout=false"                       >> archive_${frelout[$i]}
3104                   echo "else"                                       >> archive_${frelout[$i]}
3105                   echo "   echo \"  +++ $filetyp ${frelout[$i]}  could not be stored on archive-system\" " >> archive_${frelout[$i]}
3106                   echo "   cat  /dev/null  >  ~/job_queue/ARCHIVE_ERROR_$fname" >> archive_${frelout[$i]}
3107                   echo "   cat  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung  >  ~/job_queue/archive_${frelout[$i]}_error" >> archive_${frelout[$i]}
3108                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} will be copied to \$WORK as backup\" " >> archive_${frelout[$i]}
3109                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3110                   then
3111                      echo "   cp   ${frelout[$i]}  \$WORK"                    >> archive_${frelout[$i]}
3112                   else
3113                      echo "   cp -r  ${frelout[$i]}  \$WORK/${frelout[$i]}"   >> archive_${frelout[$i]}
3114                   fi
3115                   echo "   echo \"  *** $filetyp ${frelout[$i]} saved\" " >> archive_${frelout[$i]}
3116                   echo "fi"                                         >> archive_${frelout[$i]}
3117                   echo "rm  STAGE_OUTPUT${i}_$kennung"              >> archive_${frelout[$i]}
3118                elif [[ $archive_system = DMF ]]
3119                then
3120                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                      >> archive_${frelout[$i]}
3121                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3122                   then
3123                      printf "\n  +++ archiving of single files impossible with $archive_system !\n"
3124                      locat=DMF
3125                      exit
3126                   else
3127                         # FUER RECHNER IN JUELICH. DORT KOENNTEN AUCH
3128                         # EINZELNE DATEIEN GESICHERT WERDEN (SPAETER KORR.)
3129                      echo "rm -rf  \$ARCHIVE/${frelout[$i]}"     >> archive_${frelout[$i]}
3130                      echo "cp -r  ${frelout[$i]}  \$ARCHIVE"     >> archive_${frelout[$i]}
3131                   fi
3132                elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3133                then
3134                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3135                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3136                   then
3137                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3138                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3139                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3140                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3141                   else
3142
3143                      echo "set -x"                                   >> archive_${frelout[$i]}
3144                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3145                      echo "[[ ! -d \$PERM/${frelout[$i]} ]] && mkdir $PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3146                      cd  $tmp_data_catalog
3147                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3148                      cd -  > /dev/null
3149                      (( inode = 0 ))
3150                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3151                      while (( inode < nodes ))
3152                      do
3153#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3154                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3155                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3156#                         echo "*** tasks_per_node = \"$tasks_per_node\" "
3157#                         echo "*** files = \"$files\" "
3158#                         echo "*** all_files = \"$all_files\" "
3159                         echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3160                         echo "dsmc incremental  \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar" >> archive_${frelout[$i]}
3161                         echo "dsmmigrate \$PERM/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar"        >> archive_${frelout[$i]}
3162                         (( inode = inode + 1 ))
3163                      done
3164#                      echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3165#                      echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3166                   fi
3167                elif [[ $archive_system = ut ]]
3168                then
3169                   echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >> archive_${frelout[$i]}
3170                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3171                   then
3172                         # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3173                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3174                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3175                      echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3176                   else
3177
3178                      echo "set -x"                                 >> archive_${frelout[$i]}
3179                      echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}/*"         >> archive_${frelout[$i]}
3180                      echo "[[ ! -d \$UT/${frelout[$i]} ]] && mkdir $UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3181                      cd  $tmp_data_catalog
3182                      all_files=`ls -1 ${frelout[$i]}/*`
3183                      cd -  > /dev/null
3184                      (( inode = 0 ))
3185                      (( tp1   = tasks_per_node + 1 ))
3186                      while (( inode < nodes ))
3187                      do
3188                         files=`echo $all_files | cut -d" " -f1-$tasks_per_node`
3189                         all_files=`echo $all_files | cut -d" " -f$tp1-`
3190                         echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}/${frelout[$i]}.node_$inode.tar $files"   >> archive_${frelout[$i]}
3191                         (( inode = inode + 1 ))
3192                      done
3193                   fi
3194                elif [[ $archive_system = none ]]
3195                then
3196                   printf "              +++ archiving on $localhost not available!\n"
3197                fi
3198
3199                if [[ $archive_system != none ]]
3200                then
3201                   if [[ $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibmb ]]
3202                   then
3203#                      subjob  -d  -v  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  archive_${frelout[$i]}
3204                      subjob   -v  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  archive_${frelout[$i]}
3205                   elif [[ $localhost = nech ]]
3206                   then
3207                      subjob  -d  -c /pf/b/$usern/job_queue  -v  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  archive_${frelout[$i]}
3208                   fi
3209                   printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3210                fi
3211             else
3212                printf "              +++ caution: option -A is switched on. No archiving on $archive_system!\n"
3213             fi
3214
3215
3216                # LEERDATEI IM BENUTZERVERZEICHNIS ANLEGEN, DAMIT BEKANNT IST,
3217                # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3218             if [[ $files_for_pes = false ]]
3219             then
3220                cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3221             else
3222                mkdir -p  ${pathout[$i]}
3223             fi
3224
3225          fi
3226
3227
3228             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE ZUM ARCHIV-SYSTEM
3229             # AUSSERDEM MUSS LEERDATEI ANGELEGT WERDEN, DAMIT BEKANNT IST,
3230             # WIE DIE HOECHSTE ZYKLUSNUMMER AUF DEM ARCHIV-SYSTEM LAUTET
3231             # FALLS IRGENDEINE (VON MEHREREN) ARCHIVIERUNGEN SCHIEF GEHT,
3232             # WIRD FLAG GESETZT UND BLEIBT AUCH BEI WEITEREN ORDNUNGS-
3233             # GEMAESSEN ARCHIVIERUNGEN GESETZT
3234          if [[ "${actionout[$i]}" = ar ]]
3235          then
3236             if [[ $files_for_pes = false ]]
3237             then
3238                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to"
3239                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3240                printf "\n              File will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3241             else
3242                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to"
3243                printf "\n              ${pathout[$i]}"
3244                printf "\n              Directory will be copied to archive-system ($archive_system) !\n"
3245             fi
3246             mv  ${localout[$i]}  ${frelout[$i]}
3247
3248             file_saved=false
3249
3250             if [[ $archive_system = asterix ]]
3251             then
3252                do_stageout=true
3253                (( stageout_anz = 0 ))
3254                while [[ $do_stageout = true ]]
3255                do
3256                   if [[ $files_for_pes = false ]]
3257                   then
3258                      stageout  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3259                   else
3260                      stageout  -t  ${frelout[$i]}  > STAGE_OUTPUT
3261                   fi
3262                   cat  STAGE_OUTPUT
3263                   if [[ $(grep -c "st.msg:150"  STAGE_OUTPUT) != 0 ]]
3264                   then
3265                      file_saved=true
3266                      do_stageout=false
3267                   else
3268                      if [[ $files_for_pes = false ]]
3269                      then
3270                         printf "\n  +++ file ${frelout[$i]}  could not be saved on archive-system"
3271                      else
3272                         printf "\n  +++ directory ${frelout[$i]} could not be saved on archive-system"
3273                      fi
3274                      (( stageout_anz = stageout_anz + 1 ))
3275                      if (( stageout_anz == 10 ))
3276                      then
3277                         printf "\n  +++ stoped after 10 unsuccessful tries!"
3278                         archive_save=false
3279                         do_stageout=false
3280                      else
3281                         printf "\n  *** new try to store on archive after 15 min:"
3282                         sleep 900
3283                      fi
3284                   fi
3285                done
3286             elif [[ $archive_system = DMF ]]
3287             then
3288                if [[ $files_for_pes = false ]]
3289                then
3290                   printf "\n  +++ archiving of single files impossible on $archive_system!\n"
3291                   locat=DMF
3292                   exit
3293                else
3294                   rm -rf  $ARCHIVE/${frelout[$i]}
3295                   cp -r  ${frelout[$i]}  $ARCHIVE
3296                fi
3297                file_saved=true
3298             elif [[ $archive_system = tivoli ]]
3299             then
3300                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3301                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3302                   # GELEGT WERDEN
3303                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3304                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3305                if [[ $files_for_pes = false ]]
3306                then
3307                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3308                else
3309                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3310                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3311                fi
3312
3313                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3314                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3315                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3316                if [[ $files_for_pes = false ]]
3317                then
3318                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3319                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3320                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$PERM/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3321                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3322                else
3323                   echo "rm  -rf  \$PERM/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3324                   echo "tar  cvf \$PERM/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3325                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                  >> archive_${frelout[$i]}
3326                fi
3327
3328                subjob  -v  -d  -q cdata  -X 0  -m 1000  -t 43200  archive_${frelout[$i]}
3329                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3330                file_saved=true
3331
3332             elif [[ $archive_system = ut ]]
3333             then
3334                   # ARCHIVIERUNG NUR PER BATCH-JOB MOEGLICH
3335                   # DATEI MUSS ZWISCHENZEITLICH INS TEMPORAERE DATENVERZEICHNIS
3336                   # GELEGT WERDEN
3337                [[ ! -d $tmp_data_catalog ]]  &&  mkdir -p  $tmp_data_catalog
3338                chmod  g+rx  $tmp_data_catalog
3339                if [[ $files_for_pes = false ]]
3340                then
3341                   ln -f  ${frelout[$i]}  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3342                else
3343                   mkdir  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3344                   ln -f  ${frelout[$i]}/*  $tmp_data_catalog/${frelout[$i]}
3345                fi
3346
3347                   # BATCH JOB GENERIEREN UND ABSCHICKEN; DATEI MUSS WIEDER
3348                   # AUS TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS ENTFERNT WERDEN
3349                echo "cd  $tmp_data_catalog"                       >  archive_${frelout[$i]}
3350                if [[ $files_for_pes = false ]]
3351                then
3352                      # EVENTUELL NOCH VORHANDENE DATEI IM ARCHIV LOSCHEN
3353                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}"           >> archive_${frelout[$i]}
3354                   echo "cp  ${frelout[$i]} \$UT/${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3355                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3356                else
3357                   echo "rm  -rf  \$UT/${frelout[$i]}.tar"       >> archive_${frelout[$i]}
3358                   echo "tar  cvf \$UT/${frelout[$i]}.tar ${frelout[$i]}" >> archive_${frelout[$i]}
3359                   echo "rm  -rf  ${frelout[$i]}"                >> archive_${frelout[$i]}
3360                fi
3361
3362                subjob  -v  -c /pf/b/$usern/job_queue  -d  -q pp  -X 0  -m 1000  -t 7200  archive_${frelout[$i]}
3363                printf "              Archiving of $tmp_data_catalog/${frelout[$i]} initiated (batch job submitted)\n"
3364                file_saved=true
3365
3366             else
3367                printf "\n  +++ archive_system=\"$archive_system\"  archiving impossible!"
3368                archive_save=false
3369             fi
3370             if [[ $file_saved = true ]]
3371             then
3372                if [[ $files_for_pes = false ]]
3373                then
3374                   cat  /dev/null  >  ${pathout[$i]}
3375                else
3376                   mkdir -p  ${pathout[$i]}
3377                fi
3378             fi
3379          fi
3380
3381             # APPEND AUF LOKALER MASCHINE
3382          if [[ "${actionout[$i]}" = "a" ]]
3383          then
3384             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  append to  ${pathout[$i]}\n"
3385             cat  ${localout[$i]}  >>  ${pathout[$i]}
3386          fi
3387
3388             # KOPIEREN AUF LOKALER MASCHINE
3389             # ES MUSS KOPIERT WERDEN, DA MOVE NICHT UEBER FILESYSTEM HINAUS MOEGLICH
3390          if [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = false ]]
3391          then
3392
3393                # KOPIEREN AUF EINPROZESSORMASCHINE
3394             if [[ "${extout[$i]}" != " "  &&  "${extout[$i]}" != "" ]]
3395             then
3396                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}\n"
3397                cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}.${extout[$i]}
3398             else
3399                printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}  to  ${pathout[$i]}\n"
3400                cp  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3401             fi
3402
3403          elif [[ "${actionout[$i]}" = ""  &&  $files_for_pes = true ]]
3404          then
3405
3406                # DIE DEN PROZESSOREN EINES PARALLELRECHNERS ZUGEHOERIGEN
3407                # DATEIEN WERDEN ERST IN EINEM KATALOG GESAMMELT UND DIESER
3408                # WIRD DANN KOPIERT
3409                # PER MOVE UMBENANNT WERDEN
3410             printf "\n  >>> OUTPUT: ${localout[$i]}/_....  to  ${pathout[$i]}\n"
3411             cp -r  ${localout[$i]}  ${pathout[$i]}
3412
3413          fi
3414       fi
3415    done
3416    if (( i != 0 ))
3417    then
3418       if [[ $transfer_problems = true ]]
3419       then
3420          printf "\n$striche\n  *** OUTPUT-files saved"
3421          printf "\n  +++ WARNING: some data transfers failed! \n"
3422       else
3423          printf "\n$striche\n  *** all OUTPUT-files saved \n"
3424       fi
3425    fi
3426
3427
3428       # EVENTUELL FOLGEJOB STARTEN
3429       # DATEI CONTINUE_RUN MUSS VOM BENUTZERPROGRAMM AUS ERZEUGT WERDEN
3430    if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
3431    then
3432
3433       if [[ $archive_save = true ]]
3434       then
3435
3436             # ZUERST IN MRUN-AUFRUF OPTIONEN FUER FORTSETZUNGSLAUF, FUER
3437             # STILLES ABARBEITEN (OHNE INTERAKTIVE RUECKFAGEN) UND FUER
3438             # BATCH-BETRIEB (NUR WICHTIG, FALLS BATCH AUF LOKALER MASCHINE
3439             # DURCHGEFUEHRT WERDEN SOLL) EINFUEGEN, FALLS NICHT BEREITS VOR-
3440             # HANDEN
3441          [[ $(echo $mc | grep -c "\-C") = 0 ]]  &&  mc="$mc -C"
3442          [[ $(echo $mc | grep -c "\-v") = 0 ]]  &&  mc="$mc -v"
3443          [[ $(echo $mc | grep -c "\-b") = 0 ]]  &&  mc="$mc -b"
3444          if [[ $(echo $mc | grep -c "#") != 0 ]]
3445          then
3446             mc=`echo $mc | sed 's/#/f/g'`
3447          fi
3448
3449
3450             # JOB STARTEN
3451          printf "\n\n  *** initiating restart-run on \"$return_addres\" using command:\n"
3452          echo "      $mc"
3453          printf "\n$striche\n"
3454          if [[ $localhost != $fromhost ]]
3455          then
3456
3457             if [[ $localhost = nech  ||  $localhost = ibmb  ||  $localhost = ibmh  ||  $localhost = ibms  ||  $localhost = lctit ]]
3458             then
3459                echo "*** ssh will be used to initiate restart-runs!"
3460                echo "    return_addres=\"$return_addres\" "
3461                echo "    return_username=\"$return_username\" "
3462                if [[ $return_addres = 172.20.25.41 ]]
3463                then
3464                      # WORKAROUND AUF SCIROCCO AM TIT
3465                   print  "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "  |  ssh $return_addres -l $return_username 
3466                else
3467                   ssh $return_addres -l $return_username "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc "
3468                fi
3469             else
3470                printf "\n  +++ no restart mechanism available for host \"$localhost\" "
3471                locat=restart; exit
3472             fi
3473
3474                # WARTEN, DAMIT SICH RESTART JOB IN QUEUE EINREIHEN KANN, BEVOR
3475                # DER AKTUELLE JOB ENDET
3476             sleep 30
3477
3478          else
3479
3480                # BEI RECHNUNGEN AUF LOKALER MASCHINE KANN MRUN DIREKT AUFGE-
3481                # RUFEN WERDEN, AUSSER AUF lcfimm
3482             cd $LOCAL_PWD
3483             if [[ $localhost = lcfimm ]]
3484             then
3485                ssh $return_addres -l $return_username "PATH=\$PATH:$LOCAL_MRUN_PATH;export PALM_BIN=$LOCAL_MRUN_PATH;cd $LOCAL_PWD; $mc " 
3486             else
3487                eval  $mc                # ' MUESSEN AUSGEWERTET WERDEN
3488             fi
3489             cd -  > /dev/null
3490          fi
3491          printf "\n$striche\n  *** restart-run initiated \n"
3492
3493
3494             # EVENTUELL INPUT-DATEIEN, DIE VON TEMPORAEREM DATENVERZEICHNIS
3495             # GEHOLT WORDEN SIND, LOESCHEN
3496          (( i = 0 ))
3497          while (( i < iin ))
3498          do
3499             (( i = i + 1 ))
3500             if [[ "${got_tmp[$i]}" = true   &&  $keep_data_from_previous_run = false ]]
3501             then
3502                rm -r  $tmp_data_catalog/${frelin[$i]}
3503             fi
3504          done
3505
3506       else
3507
3508          printf "\n  +++ no restart-run possible, since errors occured"
3509          printf "\n      during the archive process"
3510       fi
3511
3512    fi
3513
3514
3515   
3516       # EVTL. EMAIL-BENACHRICHTIGUNG UEBER ABGESCHLOSSENEN LAUF
3517    if [[ "$email_notification" != "" ]]
3518    then
3519
3520       if [[ $localhost != $fromhost ]]
3521       then
3522          if [[ -f CONTINUE_RUN ]]
3523          then
3524             echo "PALM restart run necessary"        >   email_text
3525             echo "description header of actual run:" >>  email_text
3526             cat  CONTINUE_RUN                        >>  email_text
3527             echo "mrun-command to restart:"          >>  email_text
3528             echo "$mc"                               >>  email_text
3529          else
3530             echo "PALM run with base filename \"$fname\" on host \"$localhost\" finished"  >  email_text
3531          fi
3532          mail  $email_notification  <  email_text
3533          printf "\n  *** email notification sent to \"$email_notification\" "
3534       fi
3535    fi
3536
3537
3538
3539       # ALLE ARBEITEN BEENDET. TEMPORAERER KATALOG KANN GELOESCHT WERDEN
3540    cd  $HOME
3541    [[ $delete_temporary_catalog = true ]]  &&  rm -rf $TEMPDIR
3542
3543 else
3544
3545
3546       # FALLS AUF REMOTE-MASCHINE GERECHNET WERDEN SOLL, WERDEN JETZT ENTSPRE-
3547       # CHENDE AKTIONEN DURCHGEFUEHRT
3548
3549       # MRUN-BEFEHL FUER REMOTE-MASCHINE ZUSAMMENSTELLEN
3550    mrun_com="$mrun_script_name -a $afname -c $config_file -d $fname -h $host -H $fromhost -m $memory -t $cpumax -q $queue -R $return_addres -U $return_username -u $remote_username"
3551    [[ "$cpp_opts" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -D \"$cpp_opts\""
3552    [[ "$global_revision" != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -G \"$global_revision\""
3553    [[ $do_compile = true ]]      &&  mrun_com=${mrun_com}" -s \"$source_list\""
3554    [[ "$input_list" != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -i \"$input_list\""
3555    [[ $ignore_archive_error = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -I"
3556    [[ $keep_data_from_previous_run = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -k"
3557    [[ "$additional_conditions" != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -K \"$additional_conditions\""
3558#    [[ "$makefile" != "$source_path/Makefile" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -M \"$makefile\""
3559    [[ "$output_list" != "" ]]    &&  mrun_com=${mrun_com}" -o \"$output_list\""
3560    [[ "$read_from_config" = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -S"
3561    [[ $do_trace = true ]]        &&  mrun_com=${mrun_com}" -x"
3562    [[ "$numprocs" != "" ]]       &&  mrun_com=${mrun_com}" -X $numprocs"
3563    if [[ $use_openmp = true ]]
3564    then
3565       mrun_com=${mrun_com}" -O"
3566       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $threads_per_task"
3567    else
3568       [[ "$tasks_per_node" != "" ]] &&  mrun_com=${mrun_com}" -T $tasks_per_node"
3569    fi
3570    [[ $store_on_archive_system = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -A"
3571    [[ $package_list != "" ]]     &&  mrun_com=${mrun_com}" -p \"$package_list\""
3572    [[ $return_password != "" ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -P $return_password"
3573    [[ $delete_temporary_catalog = false ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -B"
3574    [[ $node_usage != default ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -n $node_usage"
3575    [[ $run_coupled_model = true ]]  &&  mrun_com=${mrun_com}" -Y"
3576    if [[ $do_remote = true ]]
3577    then
3578       printf "\n>>>> MRUN-command on execution host:\n>>>> $mrun_com \n"
3579    fi
3580
3581
3582       # ZUSAMMENSTELLUNG DES JOBSCRIPTS AUF DATEI jobfile
3583    jobfile=jobfile.$RANDOM
3584
3585
3586       # TEMPORAERES VERZEICHNIS GENERIEREN UND NACH DORT WECHSELN
3587    echo  "mkdir  $TEMPDIR"      >>  $jobfile
3588    echo  "cd  $TEMPDIR"         >>  $jobfile
3589
3590
3591       # EVENTUELL FEHLERVERFOLGUNG AKTIVIEREN
3592    if [[ $do_trace = true ]]
3593    then
3594       echo  "set -x"                                    >>  $jobfile
3595    else
3596       echo  "set +vx"                                   >>  $jobfile
3597    fi
3598
3599
3600       # ABSPEICHERN DER QUELLTEXTE (NUR FALLS UEBERSETZT WERDEN SOLL)
3601       # SOWIE GEGEBENENFALLS DES MAKEFILES
3602    if [[ $do_compile = true ]]
3603    then
3604
3605       source_catalog=SOURCES_FOR_RUN_$fname
3606
3607           # UNTERVERZEICHNIS FUER QUELLTEXTE UND MAKEFILE ANLEGEN
3608           # MRUN WIRD DIESES VRZEICHNIS UEBER ENVIRONMENT VARIABLE
3609           # MITGETEILT (UEBERSTEUERT ANGABE IN KONFIGURATIONSDATEI)
3610       echo  "mkdir  SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
3611       echo  "export SOURCES_COMPLETE=true"                 >>  $jobfile
3612       echo  "cd     SOURCES_FOR_RUN_$fname"                >>  $jobfile
3613
3614       for  filename  in  $source_list
3615       do
3616             # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3617          echo  "cat > $filename << \"%END%\""              >>  $jobfile
3618          cat   $source_catalog/$filename                   >>  $jobfile
3619          echo  " "                                         >>  $jobfile
3620          echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
3621          echo  " "                                         >>  $jobfile
3622       done
3623
3624          # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3625       echo  "cat > Makefile << \"%END%\""               >>  $jobfile
3626       cat   $source_catalog/Makefile                    >>  $jobfile
3627       echo  " "                                         >>  $jobfile
3628       echo  "%END%"                                     >>  $jobfile
3629       echo  " "                                         >>  $jobfile
3630
3631       echo  "cd -  > /dev/null"                         >>  $jobfile
3632
3633    fi
3634
3635
3636       # ABSPEICHERN DER KONFIGURATIONSDATEI
3637       # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3638    echo  "cat > $config_file << \"%END%\""      >>  $jobfile
3639    cat   $config_file                           >>  $jobfile
3640    echo  "%END%"                                >>  $jobfile
3641    echo  " "                                    >>  $jobfile
3642
3643
3644       # ABSPEICHERN DER AKTUELLEN MRUN-VERSION
3645       # ABDECKZEICHEN VERHINDERN, DASS ERSETZUNGEN ERFOLGEN
3646    echo  "cat > $mrun_script_name <<\"%END%\""  >>  $jobfile
3647    cat   ${PALM_BIN}/$mrun_script_name          >>  $jobfile
3648    echo  "%END%"                                >>  $jobfile
3649    if [[ $host = lctit ]]
3650    then
3651       echo "sed 's/bin\/ksh/home2\/usr5\/mkanda\/pub\/ksh/' < $mrun_script_name > mrun_new" >>  $jobfile
3652       echo "mv  mrun_new  $mrun_script_name"    >>  $jobfile
3653    fi
3654    echo  "chmod u+x $mrun_script_name"          >>  $jobfile
3655    echo  "execute_mrun=true"                    >>  $jobfile
3656    echo  " "                                    >>  $jobfile
3657
3658       # EVTL. BENOETIGTE INPUT-DATEIEN PER FTP HOLEN ODER DEM JOB DIREKT
3659       # MITGEBEN UND AUF DEM REMOTE-RECHNER IM BENUTZERVERZEICHNIS ABLEGEN
3660       # FALLS DIESES NICHT EXISTIERT, WIRD VERSUCHT, DAS JEWEILS LETZTE
3661       # UNTERVERZEICHNIS DES PFADNAMENS ANZULEGEN
3662    if [[ $do_remote = true ]]
3663    then
3664       (( i = 0 ))
3665       while (( i < iin ))
3666       do
3667          (( i = i + 1 ))
3668          echo  "[[ ! -d ${pathin[$i]} ]]  &&  mkdir -p  ${pathin[$i]}"  >>  $jobfile
3669          if [[ "${transin[$i]}" = job ]]
3670          then
3671             echo  "cat > ${remotepathin[$i]} <<\"%END%\""    >>  $jobfile
3672             eval cat   ${pathin[$i]}/${frelin[$i]}           >>  $jobfile
3673             echo  " "                                        >>  $jobfile
3674             echo  "%END%"                                    >>  $jobfile
3675          else
3676             echo  "batch_scp -b -o -g -s -u $return_username $return_addres ${remotepathin[$i]} \"${pathin[$i]}\" ${frelin[$i]}" >>  $jobfile
3677          fi
3678
3679             # UEBERPRUEFEN, OB DATEI ANGELEGT WERDEN KONNTE
3680          echo  "if [[ \$? = 1 ]]"                    >>  $jobfile
3681          echo  "then"                                >>  $jobfile
3682          echo  "   echo \" \" "                      >>  $jobfile
3683          echo  "   echo \"+++ file ${remotepathin[$i]} could not be created\" "   >>  $jobfile
3684          echo  "   echo \"    please check, if directory exists on $host!\" "  >>  $jobfile
3685          echo  "   echo \"+++ MRUN will not be continued\" "  >>  $jobfile
3686          echo  "   execute_mrun=false"               >>  $jobfile
3687          echo  "fi"                                  >>  $jobfile
3688       done
3689    fi
3690
3691       # ARBEITSKATALOG AUF DER LOKALEN MASCHINE FUER EVENTUELLE
3692       # FORTSETZUNGSLAUEFE PER ENV-VARIABLE UEBERGEBEN
3693    echo  "LOCAL_PWD=$working_directory"                >>  $jobfile
3694    echo  "export LOCAL_PWD"                            >>  $jobfile
3695
3696       # EBENSO LOKALEN MRUN-KATALOG UEBERGEBEN
3697    echo  "LOCAL_MRUN_PATH=$PALM_BIN"                   >>  $jobfile
3698    echo  "export LOCAL_MRUN_PATH"                      >>  $jobfile
3699
3700       # WORKAROUND FUER RIAM-NEC-JOBS WEGEN PROFILE-SCHWIERIGKEITEN
3701    if [[ $localhost_realname = "gate"  ||  $localhost = lctit ]]
3702    then
3703       echo  "export PALM_BIN=$PALM_BIN"                >>  $jobfile
3704    fi
3705
3706       # MRUN AUF ZIELRECHNER AUFRUFEN
3707    echo  "set -x"                                      >>  $jobfile
3708    echo  "[[ \$execute_mrun = true ]]  &&  ./$mrun_com"  >>  $jobfile
3709
3710    echo  'ls -al; echo `pwd`'                          >>  $jobfile
3711    echo  "cd \$HOME"                                   >>  $jobfile
3712    echo  "rm -rf  $TEMPDIR"                            >>  $jobfile
3713
3714
3715
3716
3717       # JOB PER SUBJOB STARTEN
3718    if [[ $silent = false ]]
3719    then
3720       printf "\n     "
3721    else
3722       printf "\n\n"
3723    fi
3724
3725    subjob  $job_on_file  -h $host  -u $remote_username  -q $queue  -m $memory  -N $node_usage -t $cpumax  $XOPT  $TOPT  $OOPT  -n $fname  -v   $jobfile
3726    rm -rf  $jobfile
3727
3728
3729 fi  # ENDE REMOTE-TEIL
3730
3731
3732
3733     # ENDE DER PROZEDUR
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.